Entry information : ScocAPx-CcP01
Entry ID 15228
Creation 2018-05-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-05-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: ScocAPx-CcP01
Name ScocAPx-CcP01
Class Hybrid Ascorbate-Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: APx-CcP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Pezizomycetes Sarcoscyphaceae Sarcoscypha
Organism Sarcoscypha coccinea    [TaxId: 51139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ScocAPx-CcP01
start..stop
S start..stop
PmelaAPx-CcP01 642 0 14..460 53..504
BfuAPx-CcP01 415 6e-142 14..460 51..501
HanAPx-CcP04 353 3e-117 16..441 53..490
ShirAPx-CcP 345 4e-114 16..444 52..499
Literature and cross-references ScocAPx-CcP01
Protein sequence: ScocAPx-CcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   466 (450)
PWM (Da):   %s   49128.18 (47258.1)  
PI (pH):   %s   4.41 (4.31) Peptide Signal:   %s   cut: 17 range:17-466
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRRLSTSLLT TVGLNAITPC SNYINGDDND GEQSAAQWIR VAFHDMATAD VAAGTGGIDA SVGFESNRAE NPELFINQTL PFFNPDISAY VSIADMIAVG VVTSVATCGG STTDIPLRTG  RIDATAAGPE GVLEPGTDIE TTLAQFTKAR FNQADAIALT ACGHTVGRTH YVNFPEIVDE SYVTNTNRDG GQPFDSSFDE FNSNVVTEYL DRTGEMGGPL VTTANVSQRS DFRLYNSDGN  ATMESLAVSE TGFQSKCNEL FGKMLDTVPA NVELSDPIVP MEWKGVDIQL GITSAGVVSV SGLIRYLYAS VSAPSSVQYT TTSNGIVSSK VTTTGSGGTG TSLYGSTSYY RFNKTLASPG 
TTANSINESI DYPINDQLFL VPSRSSSRSG RITALTSLSG TSMSAVLYVP RTQTGSRSLR VSNTTITMTK NGTAGDYTLW SGTTTGVTSI GPIVAKVLFG SLFATR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks estExt_Genemark1.C_2210007
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAGAT TGAGCACATC GTTGTTGACA ACCGTGGGAC TAAATGCTAT CACTCCGTGC TCGTAAGCTG TGCTCCATGG CCTTGCAATT ATGATGAACG GTCTGCTGAT GTGATCAGAA  ACTACATCAA TGGCGACGAC AATGATGGAG AACAGAGTGC AGCACAGTGG ATCCGCGTTG CGTTTCATGA TATGGCGACT GCAGATGTTG CTGCTGGGAC TGGGTAGGTC TTAATGGTTT  GATCGATTGC GGATTGCGGA TTGCTGATGA TCAAGAGCAG TGGCATTGAT GCTTCTGTTG GGTTTGAGTC GAATCGCGCG GAGAATCCGG AGCTTTTCAT CAGTACGTTC TTATGGATTG  GGACAGTCTT TGCGATTCGC TGACTTTTCT CAAGACCAGA CACTGCCATT CGTACGAGCC CACAAGTGTG AGAACTCAAG AATTGTCCGA CTGATTTGGC CAATACATAG TTCAATCCAG  ACATCTCAGC ATACGTCAGT ATAGCCGACA TGATTGCGGT AGTAAGTCGC ATCCAAGCCA TAACTTGAGA ACCAAGATGC TGATGCAGAT CTCTCAGGGC GTAGTTACGT CTGTCGCTAC  CTGTGGCGGA TCCACAACGG ACATTCCGCT GCGGACTGGA AGAATTGATG CTACCGCAGC TGGGCCAGAG GGTGTGCTTG AGCCTGGCAC CGATATCGAG ACTACGTTGG CTCAGTTCAC  TAAAGCGAGA TTCAACCAGG CGGATGCCAT CGCTTTGACG TGAGCCAATA GATTGGTTTG GGACTAGTGA ATGAATGACA CTGACGAACC TTAGGGCTTG CGGTCACACG GTTGGCCGGA  CTCACTACGT GAATTTCCCT GAGATTGGTA GGTTGAGAGC ATTTTTTGAC GGTACAGAAC GAGGCTCACT TTTTGATAGT CGACGAGAGC TATGTCACGA ACACCAAGTG CGTGCCCTGG  CCATGAAGTT CTTGCTTAAC ATGACTTACG CTTCCCGCTA TTGCAGCCGC GATGGAGGAC AGCCTTTCGA CAGCAGCTTT GATGAGTTCA ACAGCAATGT CGTGACCGAG TATCTCGACC  GCACAGGAGA AATGGGAGGA CCGCTGGTAA CCACAGCAAA TGTCTCGCAG AGATCAGATT TCCGTCTCTA CAATTCGGAT GGCAATGCCA CGATGGAGAG GTAAGAGAGC TTGCTCAACC  GCCCCGGGTC CCACTATCTA GCTGACGATA TGAAGTCTCG CTGTGTCGGA GACTGGTTTC CAGAGTAAAT GTAACGAGCT CTTCGGAAAA ATGCTAGACA CGGTTCCAGC CAATGTGGAA  CTTTCAGATC CCATCGTTCC GATGGAATGG AAAGGCGTTG ATATTCAACT TGGGATCACC TCCGCGGGTG TCGTCTCAGT ATCAGGTCTT ATTCGCTACC TCTACGCCTC AGTCTCAGCT  CCTAGCAGTG TTCAATACAC CACCACCTCA AATGGCATCG TTTCTTCCAA GGTGACAACT ACGGGATCTG GCGGAACTGG GACTTCGCTT TATGGAAGCA CGTCGTATTA CAGATTCAAC  AAGACCCTGG CATCCCCAGG AACCACTGCG AACTCGATCA ATGAGTCTAT TGATTACCCG ATCAACGACC AGCTCTTCCT TGTGCCCTCG CGATCTTCCT CGAGATCCGG CAGAATCACA  GTAACAGCAG CGATTGGTCT CTTGCAATGG TATAAGCTGC TTGACTGATG ATATTGCAGG CCCTCACCTC ACTCTCTGGC ACGTCCATGT CTGCTGTTCT GTACGTTCCT AGAACACAGA  CGGGATCGCG GTCGCTACGA GTGTCGAATA CAACAATTAC AATGACAAAG AACGGCACTG CTGGGGATTA CACGCTGTGG TCGGGGACCA CGACGGGCGT CACTTCGATC GGGCCAATCG 
TTGCAAAAGT GCTTTTCGGG AGTTTGTTTG CTACTAGATA G 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAGAT TGAGCACATC GTTGTTGACA ACCGTGGGAC TAAATGCTAT CACTCCGTGC TCAAACTACA TCAATGGCGA CGACAATGAT GGAGAACAGA GTGCAGCACA GTGGATCCGC  GTTGCGTTTC ATGATATGGC GACTGCAGAT GTTGCTGCTG GGACTGGTGG CATTGATGCT TCTGTTGGGT TTGAGTCGAA TCGCGCGGAG AATCCGGAGC TTTTCATCAA CCAGACACTG  CCATTCTTCA ATCCAGACAT CTCAGCATAC GTCAGTATAG CCGACATGAT TGCGGTAGGC GTAGTTACGT CTGTCGCTAC CTGTGGCGGA TCCACAACGG ACATTCCGCT GCGGACTGGA  AGAATTGATG CTACCGCAGC TGGGCCAGAG GGTGTGCTTG AGCCTGGCAC CGATATCGAG ACTACGTTGG CTCAGTTCAC TAAAGCGAGA TTCAACCAGG CGGATGCCAT CGCTTTGACG  GCTTGCGGTC ACACGGTTGG CCGGACTCAC TACGTGAATT TCCCTGAGAT TGTCGACGAG AGCTATGTCA CGAACACCAA CCGCGATGGA GGACAGCCTT TCGACAGCAG CTTTGATGAG  TTCAACAGCA ATGTCGTGAC CGAGTATCTC GACCGCACAG GAGAAATGGG AGGACCGCTG GTAACCACAG CAAATGTCTC GCAGAGATCA GATTTCCGTC TCTACAATTC GGATGGCAAT  GCCACGATGG AGAGTCTCGC TGTGTCGGAG ACTGGTTTCC AGAGTAAATG TAACGAGCTC TTCGGAAAAA TGCTAGACAC GGTTCCAGCC AATGTGGAAC TTTCAGATCC CATCGTTCCG  ATGGAATGGA AAGGCGTTGA TATTCAACTT GGGATCACCT CCGCGGGTGT CGTCTCAGTA TCAGGTCTTA TTCGCTACCT CTACGCCTCA GTCTCAGCTC CTAGCAGTGT TCAATACACC  ACCACCTCAA ATGGCATCGT TTCTTCCAAG GTGACAACTA CGGGATCTGG CGGAACTGGG ACTTCGCTTT ATGGAAGCAC GTCGTATTAC AGATTCAACA AGACCCTGGC ATCCCCAGGA  ACCACTGCGA ACTCGATCAA TGAGTCTATT GATTACCCGA TCAACGACCA GCTCTTCCTT GTGCCCTCGC GATCTTCCTC GAGATCCGGC AGAATCACAG CCCTCACCTC ACTCTCTGGC  ACGTCCATGT CTGCTGTTCT GTACGTTCCT AGAACACAGA CGGGATCGCG GTCGCTACGA GTGTCGAATA CAACAATTAC AATGACAAAG AACGGCACTG CTGGGGATTA CACGCTGTGG 
TCGGGGACCA CGACGGGCGT CACTTCGATC GGGCCAATCG TTGCAAAAGT GCTTTTCGGG AGTTTGTTTG CTACTAGATA G 

Retrieve as FASTA