Entry information : LpaluCcP02
Entry ID 15299
Creation 2018-06-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LpaluCcP02
Name LpaluCcP02
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Fungi; Ascomycota; Ascomycota
Organism Lepidopterella palustris    [TaxId: 741139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LpaluCcP02
start..stop
S start..stop
GsteCcP02 671 0 1..373 1..373
CgeoCcP01 662 0 1..373 1..373
HpulCcP02 605 0 1..373 1..369
RrufCcP02 598 0 1..372 1..371
Literature and cross-references LpaluCcP02
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   403552 [5' end]   315843 [3' end]
Protein sequence: LpaluCcP02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   374
PWM (Da):   %s   41957.7  
PI (pH):   %s   8.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATAARCFTR SALRSSPATF KTTTTRNARF IIPRQAFRQQ SRRGYADSGA PKSGSSGLLW GGVGLAALGG GYWYYTQNPG AFSKADEKAK GPFVPTFEDY QKVYNAVAKA LEEHDNYDDG  SYGPVLVRLA WHCSGTYDKE TGTGGSNGAT MRFSPESDHG ANAGLKAARD FLEPIKEQFP WITYSDLWIL SGVCAIQEMQ GPHIPFRPGR VDRDVSFCTP DGRLPDASKE QKHLRAIFGR  MGFNDQEIVA LSGAHALGRC HTDRSGYDGP WTFSPTTLTN DYYKLLLEEK WAWKKWDGPK QYEDVKTKSL MMLPTDMVLI KDKSFKQYVE KYAKDNDAFF KDFSDVVLRL FELGVPFTQG 
EDARWTFKSS FDEK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction from JGI: two partial predictions due to scaffold border: scaffold_106:84212-84798 (5'end) and scaffold_2684:766-1362 (3'end).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACCG CAGCCAGGTG TTTCACCCGC AGTGCTCTGC GCTCTTCCCC GGCAACCTTC AAGACCACCA CCACCCGTAA CGCCCGCTTC ATCATCCCCC GCCAGGCCTT CCGCCAGCAA  TCCCGACGCG GATATGCTGA TAGCGGTGCA CCCAAGTCTG GCAGCAGCGG CCTCCTCTGG GGCGGCGTCG GGCTCGCAGC TCTAGGTGGA GGCTACTGGT ACTATACCCA GAACCCTGGA  GCCTTCTCCA AGGCCGACGA GAAGGCCAAG GGTCCTTTTG TCCCCACCTT CGAGGACTAT CAGAAGGTCT ACAATGCGGT GGCCAAGGCA TTGGAGGAGC ATGACAACTA TGATGATGGC  AGTTATGGCC CTGTGCTCGT GAGATTGGCA TGGCATTGCA GCGGAACGTA AGCAGAAGCA TACTCAACAG TCTTTGAAAG AAGAATGGCT ACTGATGAGA AACAGCTATG ACAAGGAAAC  CGGCACCGGA GGCTCCAACG GCGCAACCAT GAGATTCTCC CCGGAGAGTG ACCACGGCGC AAACGCCGGT CTCAAAGCTG CTCGCGACTT CCTCGAGCCC ATCAAAGGTA CACATCTCTC  ATTCCACTCC TTCCGAATCT CCTTAGTCTT CCATCAAAAT TTTGGGGTTG AGGGGGGGCC CGGCGGGAAA TTTCTCAGCT GACAATTCCT TCCAGAACAA TTCCCATGGA TCACCTACTC  CGACCTCTGG ATCCTCTCAG GAGTCTGCGC CATCCAAGAA ATGCAAGGCC CACACATCCC CTTCCGTCCC GGCCGCGTCG ACCGCGACGT TTCCTTCTGC ACACCTGACG GCCGTCTCCC  CGACGCCTCC AAGGAGCAGA AGCACCTTCG CGCCATCTTC GGCCGCATGG GTTTCAACGA TCAAGAAATC GTCGCTCTGT CCGGCGCTCA CGCCCTAGGA CGCTGCCACA CTGACCGTAG  CGGCTACGAT GGCCCTTGGA CCTTCTCTCC CACCACACTC ACAAACGACT ACTATAAGCT CCTGCTGGAG GAGAAGTGGG CGTGGAAGAA GTGGGATGGA CCCAAGCAGT ATGAGGATGT  CAAGACGAAG AGCTTGATGA TGCTGCCGAC GGATATGGTG CTCATCAAGG ATAAGAGCTT CAAGCAGTAT GTTGAAAAGT ACGCCAAGGA TAACGACGCC TTCTTCAAGG ACTTTTCAGA 
TGTTGTTCTG AGGCTCTTTG AGCTTGGCGT GCCGTTTACT CAGGGCGAGG ATGCGAGGTG GACGTTCAAG AGCAGCTTCG ATGAGAAATG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACCG CAGCCAGGTG TTTCACCCGC AGTGCTCTGC GCTCTTCCCC GGCAACCTTC AAGACCACCA CCACCCGTAA CGCCCGCTTC ATCATCCCCC GCCAGGCCTT CCGCCAGCAA  TCCCGACGCG GATATGCTGA TAGCGGTGCA CCCAAGTCTG GCAGCAGCGG CCTCCTCTGG GGCGGCGTCG GGCTCGCAGC TCTAGGTGGA GGCTACTGGT ACTATACCCA GAACCCTGGA  GCCTTCTCCA AGGCCGACGA GAAGGCCAAG GGTCCTTTTG TCCCCACCTT CGAGGACTAT CAGAAGGTCT ACAATGCGGT GGCCAAGGCA TTGGAGGAGC ATGACAACTA TGATGATGGC  AGTTATGGCC CTGTGCTCGT GAGATTGGCA TGGCATTGCA GCGGAACCTA TGACAAGGAA ACCGGCACCG GAGGCTCCAA CGGCGCAACC ATGAGATTCT CCCCGGAGAG TGACCACGGC  GCAAACGCCG GTCTCAAAGC TGCTCGCGAC TTCCTCGAGC CCATCAAAGA ACAATTCCCA TGGATCACCT ACTCCGACCT CTGGATCCTC TCAGGAGTCT GCGCCATCCA AGAAATGCAA  GGCCCACACA TCCCCTTCCG TCCCGGCCGC GTCGACCGCG ACGTTTCCTT CTGCACACCT GACGGCCGTC TCCCCGACGC CTCCAAGGAG CAGAAGCACC TTCGCGCCAT CTTCGGCCGC  ATGGGTTTCA ACGATCAAGA AATCGTCGCT CTGTCCGGCG CTCACGCCCT AGGACGCTGC CACACTGACC GTAGCGGCTA CGATGGCCCT TGGACCTTCT CTCCCACCAC ACTCACAAAC  GACTACTATA AGCTCCTGCT GGAGGAGAAG TGGGCGTGGA AGAAGTGGGA TGGACCCAAG CAGTATGAGG ATGTCAAGAC GAAGAGCTTG ATGATGCTGC CGACGGATAT GGTGCTCATC  AAGGATAAGA GCTTCAAGCA GTATGTTGAA AAGTACGCCA AGGATAACGA CGCCTTCTTC AAGGACTTTT CAGATGTTGT TCTGAGGCTC TTTGAGCTTG GCGTGCCGTT TACTCAGGGC 
GAGGATGCGA GGTGGACGTT CAAGAGCAGC TTCGATGAGA AATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACCG CAGCCAGGTG TTTCACCCGC AGTGCTCTGC GCTCTTCCCC GGCAACCTTC AAGACCACCA CCACCCGTAA CGCCCGCTTC ATCATCCCCC GCCAGGCCTT CCGCCAGCAA  TCCCGACGCG GATATGCTGA TAGCGGTGCA CCCAAGTCTG GCAGCAGCGG CCTCCTCTGG GGCGGCGTCG GGCTCGCAGC TCTAGGTGGA GGCTACTGGT ACTATACCCA GAACCCTGGA  GCCTTCTCCA AGGCCGACGA GAAGGCCAAG GGTCCTTTTG TCCCCACCTT CGAGGACTAT CAGAAGGTCT ACAATGCGGT GGCCAAGGCA TTGGAGGAGC ATGACAACTA TGATGATGGC  AGTTATGGCC CTGTGCTCGT GAGATTGGCA TGGCATTGCA GCGGAACCTA TGACAAGGAA ACCGGCACCG GAGGCTCCAA CGGCGCAACC ATGAGATTCT CCCCGGAGAG TGACCACGGC  GCAAACGCCG GTCTCAAAGC TGCTCGCGAC TTCCTCGAGC CCATCAAAGA ACAATTCCCA TGGATCACCT ACTCCGACCT CTGGATCCTC TCAGGAGTCT GCGCCATCCA AGAAATGCAA  GGCCCACACA TCCCCTTCCG TCCCGGCCGC GTCGACCGCG ACGTTTCCTT CTGCACACCT GACGGCCGTC TCCCCGACGC CTCCAAGGAG CAGAAGCACC TTCGCGCCAT CTTCGGCCGC  ATGGGTTTCA ACGATCAAGA AATCGTCGCT CTGTCCGGCG CTCACGCCCT AGGACGCTGC CACACTGACC GTAGCGGCTA CGATGGCCCT TGGACCTTCT CTCCCACCAC ACTCACAAAC  GACTACTATA AGCTCCTGCT GGAGGAGAAG TGGGCGTGGA AGAAGTGGGA TGGACCCAAG CAGTATGAGG ATGTCAAGAC GAAGAGCTTG ATGATGCTGC CGACGGATAT GGTGCTCATC  AAGGATAAGA GCTTCAAGCA GTATGTTGAA AAGTACGCCA AGGATAACGA CGCCTTCTTC AAGGACTTTT CAGATGTTGT TCTGAGGCTC TTTGAGCTTG GCGTGCCGTT TACTCAGGGC 
GAGGATGCGA GGTGGACGTT CAAGAGCAGC TTCGATGAGA AATGA 

Retrieve as FASTA