Entry information : LePrx34(Solyc03g006810.2.2 [2.3])
Entry ID 15334
Creation 2018-06-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LePrx34(Solyc03g006810.2.2 [2.3])
Name LePrx34(Solyc03g006810.2.2 [2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx036]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx34
start..stop
S start..stop
StPrx74 624 0 1..317 1..317
CroPrx34 503 0 1..317 1..317
PpePrx62 491 6e-177 4..317 11..324
VvPrx22 485 1e-174 4..317 10..323
Literature and cross-references LePrx34(Solyc03g006810.2.2 [2.3])
Protein sequence: LePrx34(Solyc03g006810.2.2 [2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (297)
PWM (Da):   %s   34550.42 (32308.2)  
PI (pH):   %s   7.71 (7.75) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPFSTILFL VLLIAPLCNA TLGVQYYDQT CPHAEDIIYQ TIRNASFFDS KVPARLLRMF FHDCFIRGCD ASVLLDSTPE NKAEKDGQPN LSLGAFYVID AVKTNLEKAC PTTVSCADIV  AIAARDVVAM SGGPYWNVLK GRKDGRVSRA NETVNLPAPS FNTSQLIQSF ANRGLAVKDL VALSGGHTLG FSHCSSFEGR LHNFSSVHDT DPSLNAVFAQ SLKQKCPKPN SDRNAGQLLD 
PTSSVFDNNY YKQIISGKGV FASDQSLLND YRTGLIVKAF ANDQATFFRE FAASMIKLGN VGVLEHGEVR LNCRAVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 1EST (short)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACTAT CTTATTTCTT GTTTTGTTAA TAGCCCCTCT ATGCAATGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGACAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ACGCTTCATT TTTTGATTCT AAAGTCCCTG CACGTCTTCT CAGGATGTTC TTTCATGATT GTTTCATTAG AGTAATCTCT CTTTCTCTAT GTACAAAATT TTGGGCATCA  GGCAAGTCAT TATATTATAG ATGCATGTAA GAGATGGAAG TTGAAACTGT TTTGTTAATG ACTATTTACA GGGATGTGAT GCATCAGTTC TATTGGATTC AACACCAGAA AACAAAGCAG  AGAAAGATGG TCAGCCTAAC CTCTCTCTTG GAGCTTTCTA TGTGATTGAT GCTGTCAAAA CTAACCTCGA AAAGGCTTGC CCAACAACTG TTTCTTGTGC TGACATAGTT GCCATCGCAG  CTAGAGACGT CGTCGCCATG GTACTACTCC ATCATCCTCC CTACTAAATA GTCAATCAAT GTGCAGTAAA TAATACAATA TGACCCGTTA AAATATACTA CTAGCTACCA AGGCGTTGTC  AGTGTATATA AGTTAAATTC CACTGCTTAA ACTGCAATCA TAAGCTCATA AATACTTCAT GTTTGATCAA TTTTGTAGTC TGGAGGTCCA TACTGGAATG TACTAAAGGG AAGAAAAGAC  GGGAGAGTGT CAAGGGCTAA TGAGACAGTA AACTTACCTG CTCCATCTTT CAACACAAGC CAACTCATTC AGAGCTTTGC CAACAGGGGA CTGGCAGTGA AAGATTTGGT TGCCCTTTCT  GGTGGACACA CACTTGGATT CTCACACTGC TCTTCATTTG AAGGCAGACT TCATAACTTC AGCTCAGTGC ACGACACTGA CCCGAGTTTG AATGCAGTAT TTGCACAGAG CTTAAAGCAG  AAATGCCCGA AACCCAACAG TGATCGCAAT GCAGGACAAT TGTTGGACCC AACTTCATCA GTATTTGACA ACAACTATTA CAAGCAAATT ATTTCAGGCA AAGGTGTTTT TGCATCAGAC  CAGAGTTTGT TGAATGACTA CAGGACTGGA TTGATTGTTA AGGCATTTGC CAATGATCAA GCTACGTTCT TCAGGGAATT TGCTGCTTCA ATGATCAAGC TTGGAAATGT TGGTGTCCTT  GAACATGGAG AAGTTAGACT CAACTGCAGA GCTGTGAACT AAAAAATGAG TGTGTTTGTA CCTATGTTTG TTCTTTTTGC TGTCTAATAA TCTGAGGCTT AATGAAATAC TAGTATGAAA 
TATCTATGCA CCTTGTATAA TTCCCTTGTA AGGTGAAGAG GTAGCAGAGG AAGAAATAAT ATC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACTAT CTTATTTCTT GTTTTGTTAA TAGCCCCTCT ATGCAATGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGACAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ACGCTTCATT TTTTGATTCT AAAGTCCCTG CACGTCTTCT CAGGATGTTC TTTCATGATT GTTTCATTAG AGGATGTGAT GCATCAGTTC TATTGGATTC AACACCAGAA  AACAAAGCAG AGAAAGATGG TCAGCCTAAC CTCTCTCTTG GAGCTTTCTA TGTGATTGAT GCTGTCAAAA CTAACCTCGA AAAGGCTTGC CCAACAACTG TTTCTTGTGC TGACATAGTT  GCCATCGCAG CTAGAGACGT CGTCGCCATG TCTGGAGGTC CATACTGGAA TGTACTAAAG GGAAGAAAAG ACGGGAGAGT GTCAAGGGCT AATGAGACAG TAAACTTACC TGCTCCATCT  TTCAACACAA GCCAACTCAT TCAGAGCTTT GCCAACAGGG GACTGGCAGT GAAAGATTTG GTTGCCCTTT CTGGTGGACA CACACTTGGA TTCTCACACT GCTCTTCATT TGAAGGCAGA  CTTCATAACT TCAGCTCAGT GCACGACACT GACCCGAGTT TGAATGCAGT ATTTGCACAG AGCTTAAAGC AGAAATGCCC GAAACCCAAC AGTGATCGCA ATGCAGGACA ATTGTTGGAC  CCAACTTCAT CAGTATTTGA CAACAACTAT TACAAGCAAA TTATTTCAGG CAAAGGTGTT TTTGCATCAG ACCAGAGTTT GTTGAATGAC TACAGGACTG GATTGATTGT TAAGGCATTT 
GCCAATGATC AAGCTACGTT CTTCAGGGAA TTTGCTGCTT CAATGATCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTCC TTGAACATGG AGAAGTTAGA CTCAACTGCA GAGCTGTGAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TTTCTACTAT CTTATTTCTT GTTTTGTTAA TAGCCCCTCT ATGCAATGCA ACTCTTGGAG TTCAATACTA TGATCAAACA TGTCCTCATG CTGAAGACAT TATTTATCAA  ACAATTCGCA ACGCTTCATT TTTTGATTCT AAAGTCCCTG CACGTCTTCT CAGGATGTTC TTTCATGATT GTTTCATTAG AGGATGTGAT GCATCAGTTC TATTGGATTC AACACCAGAA  AACAAAGCAG AGAAAGATGG TCAGCCTAAC CTCTCTCTTG GAGCTTTCTA TGTGATTGAT GCTGTCAAAA CTAACCTCGA AAAGGCTTGC CCAACAACTG TTTCTTGTGC TGACATAGTT  GCCATCGCAG CTAGAGACGT CGTCGCCATG TCTGGAGGTC CATACTGGAA TGTACTAAAG GGAAGAAAAG ACGGGAGAGT GTCAAGGGCT AATGAGACAG TAAACTTACC TGCTCCATCT  TTCAACACAA GCCAACTCAT TCAGAGCTTT GCCAACAGGG GACTGGCAGT GAAAGATTTG GTTGCCCTTT CTGGTGGACA CACACTTGGA TTCTCACACT GCTCTTCATT TGAAGGCAGA  CTTCATAACT TCAGCTCAGT GCACGACACT GACCCGAGTT TGAATGCAGT ATTTGCACAG AGCTTAAAGC AGAAATGCCC GAAACCCAAC AGTGATCGCA ATGCAGGACA ATTGTTGGAC  CCAACTTCAT CAGTATTTGA CAACAACTAT TACAAGCAAA TTATTTCAGG CAAAGGTGTT TTTGCATCAG ACCAGAGTTT GTTGAATGAC TACAGGACTG GATTGATTGT TAAGGCATTT  GCCAATGATC AAGCTACGTT CTTCAGGGAA TTTGCTGCTT CAATGATCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTCC TTGAACATGG AGAAGTTAGA CTCAACTGCA GAGCTGTGAA CTAAAAAATG  AGTGTGTTTG TACCTATGTT TGTTCTTTTT GCTGTCTAAT AATCTGAGGC TTAATGAAAT ACTAGTATGA AATATCTATG CACCTTGTAT AATTCCCTTG TAAGGTGAAG AGGTAGCAGA 
GGAAGAAATA ATATC 

Retrieve as FASTA