Entry information : RsolCcP01
Entry ID 15347
Creation 2018-06-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-06-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: RsolCcP01
Name RsolCcP01
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Fungi; Basidiomycota; Basidiomycota
Organism Rhizoctonia solani    [TaxId: 1108050 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value RsolCcP01
start..stop
S start..stop
CagiCcP01 573 0 5..366 4..368
ScomCcP 510 0 1..359 1..361
PoCcP_PC9 499 3e-178 2..371 4..371
SnivCcP01 497 1e-177 12..371 4..365
Literature and cross-references RsolCcP01
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   3472
Protein sequence: RsolCcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372
PWM (Da):   %s   41016.66  
PI (pH):   %s   9.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSFAAAFRRS VVRTAPRVTR PQTRLPVSSA RAYSTGGASS GGASWAQLGL AVALGAAGGA GVLSLLGGDA SSLGREASTA AKGAAQSVKV AANFTPKKED YQKVYNRIAE MLDADYDDGS  YGPVFVRLAW HSSGTYDKDT KTGGSNYATM RFEPEALHGA NNGLNIARAK MEEVKKEFPW ISYGDLWTLG GVAALQEMDG PKIPWRPGRI DGYAKDATPD GRLPDATQGA DHLRNIFYRM  GFNDQEIVAL SGAHALGRCH RDRSGFDGPW TFSPTTLTNE FYRLLLNEKW QWRKWDGPKQ LEDKSTKSLM MLPTDMVLVQ DKKFKPWVQK YADDKELFFK DFSEVVNRLF ELGVPPSQFG 
ETILFKKLEE QS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (8 introns). incorrect prediction from JGI (extra intron in 5'=> extra seq wo match: MGILGPAELDLRFGPSYCTPQPQRLLA))
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTCG CTGCCGCTTT CCGTCGCTCT GTCGTCCGCA CCGCTCCTCG GGTCACCCGT CCCCAGACAC GGCTCCCAGT TTCATCTGCA CGCGCCTACT CGACAGGTGG AGCCTCCTCG  GGTGGGGCTT CCTGGGCCCA GCTAGGGCTT GCAGTTGCGC TCGGAGCAGC TGGAGGAGCC GGTGTGCTTA GCCTTTTGGG TGGCGATGCG TCCTCTCTTG GGCGCGAGGC TTCAACTGCA  GCCAAGGGCG CCGCACAGAG CGTAAAGGTC GCCGCCAACT TTACCCCCAA GAAGGAGGAC TACCAAAAGG TCTACAACAG GATTGCCGAG ATGCTCGATG CCGACTATGA TGGTAAGTGT  CGATGCGAGC AGCTTACATG TGTATATATG CTAACCACGA ATCGATTTGT CTAACCTAGA CGGTTCGTAT GGTCCTGTAT TCGTCCGTCT TGCATGGCAC TCGTCCGGAA CTTACGACAA  GGACACCAAG ACTGGCGGAA GGTACGCTCT CCCCGCTCAT CCAATCGAAT TAATCTCATT TCATTGTGAT TCCCTATCAC AGCAACTACG CGACTATGCG TTTCGAGCCT GAAGCCCTTC  ACGGCGCCAA CAATGGCTTG AACATTGCTC GCGCCAAGAT GGAGGAAGTC AAGAAAGAGT TCCCCTGGAT CTCCTATGGT GATCTGTGGA CTCTTGGAGG CGTAGCTGCT CTCCAGGTGA  GCGTCTTTCA CCCTTTCTCC GCCAAGTGAG GCCCGCACGC AATAGCCCAA AGAAAAACGC GAACGCAATG CTTGCTTCCC TATTGGGCTA AGAATCCCCT TGATTTACAA AGCCAAGTTC  ATCCCAACAC CCCTCGACCT TGCCGTTCCT GGTCCGAACT CGTGTATGCT GACACAGCCT GATATATAGG AAATGGACGG ACCCAAGATC CCATGGCGCC CTGGACGCAT TGACGGCTAC  GCAAAGGACG CAACTCCCGA TGGCCGTCTG CCCGATGCCA CTCAAGGCGC GGACCACCTG CGAAACGTGA GCCGGGTCGC ATACATTCGC ATGGATCTTC ATGACCAAAT GACGTAAACA  CAAAACAGAT CTTCTATCGC ATGGGCTTCA ACGACCAGGA AATTGTCGCA CTCTCCGGTG CGCACGCTTT GGGACGATGC CATCGTGATC GGTAGGTTCC TCTAGCTTCC CCACATCCTT  TCATTCGAGG CTAATTTCCA ATATAGCTCC GGATTTGACG GTCCTTGGAC CTTCTCCCCT ACCACTTTGA CCAATGAGTT CTACAGGCTG CTCTTGAATG AGAAGTGGCA ATGGCGTAAG  TGGGATGGTC CCAAGCAATT GGAGGACAAG TCCACCAAGT CCTTGATGAT GCTTCCGTAT GTTGTTCACC TTTGACCTTG TATCTGGAAC TAACATGTGG ACATTTGCAG TACCGACATG  GTCCTCGTCC AAGACAAGAA GTTCAAGCCT TGGGTACAGA AATACGCTGA CGACAAGGAA CTGTTCTTCA AGGAGTAAGT TTTTAATTTA AACCATTCAT CGATAGTAAC TAATCAGCAC 
TTTAGCTTCT CTGAGGTTGT CAACCGCCTC TTCGAGCTCG GTGTACCGCC TTCCCAATTT GGCGAGACCA TCTTGTTCAA GAAGCTCGAG GAGCAGTCGT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTCG CTGCCGCTTT CCGTCGCTCT GTCGTCCGCA CCGCTCCTCG GGTCACCCGT CCCCAGACAC GGCTCCCAGT TTCATCTGCA CGCGCCTACT CGACAGGTGG AGCCTCCTCG  GGTGGGGCTT CCTGGGCCCA GCTAGGGCTT GCAGTTGCGC TCGGAGCAGC TGGAGGAGCC GGTGTGCTTA GCCTTTTGGG TGGCGATGCG TCCTCTCTTG GGCGCGAGGC TTCAACTGCA  GCCAAGGGCG CCGCACAGAG CGTAAAGGTC GCCGCCAACT TTACCCCCAA GAAGGAGGAC TACCAAAAGG TCTACAACAG GATTGCCGAG ATGCTCGATG CCGACTATGA TGACGGTTCG  TATGGTCCTG TATTCGTCCG TCTTGCATGG CACTCGTCCG GAACTTACGA CAAGGACACC AAGACTGGCG GAAGCAACTA CGCGACTATG CGTTTCGAGC CTGAAGCCCT TCACGGCGCC  AACAATGGCT TGAACATTGC TCGCGCCAAG ATGGAGGAAG TCAAGAAAGA GTTCCCCTGG ATCTCCTATG GTGATCTGTG GACTCTTGGA GGCGTAGCTG CTCTCCAGGA AATGGACGGA  CCCAAGATCC CATGGCGCCC TGGACGCATT GACGGCTACG CAAAGGACGC AACTCCCGAT GGCCGTCTGC CCGATGCCAC TCAAGGCGCG GACCACCTGC GAAACATCTT CTATCGCATG  GGCTTCAACG ACCAGGAAAT TGTCGCACTC TCCGGTGCGC ACGCTTTGGG ACGATGCCAT CGTGATCGCT CCGGATTTGA CGGTCCTTGG ACCTTCTCCC CTACCACTTT GACCAATGAG  TTCTACAGGC TGCTCTTGAA TGAGAAGTGG CAATGGCGTA AGTGGGATGG TCCCAAGCAA TTGGAGGACA AGTCCACCAA GTCCTTGATG ATGCTTCCTA CCGACATGGT CCTCGTCCAA  GACAAGAAGT TCAAGCCTTG GGTACAGAAA TACGCTGACG ACAAGGAACT GTTCTTCAAG GACTTCTCTG AGGTTGTCAA CCGCCTCTTC GAGCTCGGTG TACCGCCTTC CCAATTTGGC 
GAGACCATCT TGTTCAAGAA GCTCGAGGAG CAGTCGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTCG CTGCCGCTTT CCGTCGCTCT GTCGTCCGCA CCGCTCCTCG GGTCACCCGT CCCCAGACAC GGCTCCCAGT TTCATCTGCA CGCGCCTACT CGACAGGTGG AGCCTCCTCG  GGTGGGGCTT CCTGGGCCCA GCTAGGGCTT GCAGTTGCGC TCGGAGCAGC TGGAGGAGCC GGTGTGCTTA GCCTTTTGGG TGGCGATGCG TCCTCTCTTG GGCGCGAGGC TTCAACTGCA  GCCAAGGGCG CCGCACAGAG CGTAAAGGTC GCCGCCAACT TTACCCCCAA GAAGGAGGAC TACCAAAAGG TCTACAACAG GATTGCCGAG ATGCTCGATG CCGACTATGA TGACGGTTCG  TATGGTCCTG TATTCGTCCG TCTTGCATGG CACTCGTCCG GAACTTACGA CAAGGACACC AAGACTGGCG GAAGCAACTA CGCGACTATG CGTTTCGAGC CTGAAGCCCT TCACGGCGCC  AACAATGGCT TGAACATTGC TCGCGCCAAG ATGGAGGAAG TCAAGAAAGA GTTCCCCTGG ATCTCCTATG GTGATCTGTG GACTCTTGGA GGCGTAGCTG CTCTCCAGGA AATGGACGGA  CCCAAGATCC CATGGCGCCC TGGACGCATT GACGGCTACG CAAAGGACGC AACTCCCGAT GGCCGTCTGC CCGATGCCAC TCAAGGCGCG GACCACCTGC GAAACATCTT CTATCGCATG  GGCTTCAACG ACCAGGAAAT TGTCGCACTC TCCGGTGCGC ACGCTTTGGG ACGATGCCAT CGTGATCGCT CCGGATTTGA CGGTCCTTGG ACCTTCTCCC CTACCACTTT GACCAATGAG  TTCTACAGGC TGCTCTTGAA TGAGAAGTGG CAATGGCGTA AGTGGGATGG TCCCAAGCAA TTGGAGGACA AGTCCACCAA GTCCTTGATG ATGCTTCCTA CCGACATGGT CCTCGTCCAA  GACAAGAAGT TCAAGCCTTG GGTACAGAAA TACGCTGACG ACAAGGAACT GTTCTTCAAG GACTTCTCTG AGGTTGTCAA CCGCCTCTTC GAGCTCGGTG TACCGCCTTC CCAATTTGGC 
GAGACCATCT TGTTCAAGAA GCTCGAGGAG CAGTCGTGA 

Retrieve as FASTA