Entry information : LePrx82(Solyc10g084240.1.1 [2.3])
Entry ID 15834
Creation 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx82(Solyc10g084240.1.1 [2.3])
Name LePrx82(Solyc10g084240.1.1 [2.3])
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx199]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx82
start..stop
S start..stop
StPrx03 629 0 1..308 1..308
NtPrx19-1A 513 0 28..308 6..286
VvPrx38 454 3e-162 28..308 27..307
BvPrx46 452 6e-162 26..308 20..304
Literature and cross-references LePrx82(Solyc10g084240.1.1 [2.3])
EST ref. GenBank:   FS201901.1 [5' end]
Protein sequence: LePrx82(Solyc10g084240.1.1 [2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   308
PWM (Da):   %s   34802.45  
PI (pH):   %s   6.9
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATKTQHFGP SSTFITLFLV LLLHIHYAKS DLRLNYYSES CPRAEEIIKE QVNKLYHKHG NTAVSWIRNL FHDCMVKSCD ASILLDKTKE QTSEKTSQRN FGMRNFKYIE TIKEALENEC  PNIVSCADIV ALAARDGIVM LGGPQIEMKT GRWDSKDSYL AEVESFIPNH NDSMSLVLSR FNSVGVDTQG TVALLGAHTV GRVHCVNIVH RLYPTVDPTL DPDFAKYLKT RCPSAEPDPK 
AVEYARNDHV NPMVWDNLYY KNIMSNKGLL IVDQQLVSDP TTYPFVEKFA ANNSYFNDQF AKSFIILS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. 3 introns and one extra in 5' (confirmed with EST)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACAA AAACCCAACA TTTTGGTCCC TCATCAACAT TCATCACTCT ATTTTTAGTA TTGCTCCTCC ACATTCATTA TGGTACTTCT CCCTTAATAT TTATCTATTT GTTCTTTAAT  TTGGAAACAT ATTAAATTAT ATACATCGAT AATATAACAG AGTTATAATT TATATTTTCA GTGTGTGTGT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATGCTCTCTG TTTTAATTTA  TGTAAAGGTG TTACTGTTTC AGAATCGGAG TCAAATAATT TTTTTTTACT ATAATTTTTC AAGGTGTGTA GAAAATATTT TAGTCTATTA TTTACGTTGA CTTATATTAT GTAAGTTTAA  TTTTTCAAAC TTGAGTGTTT TGACTTGCGT AATTCGAACC CCTTTACATA AATTAGGACA GAGAAAATAA CTCATTAAAA TAGGTTACTT ACCATTTATT CCAGATTATC AATTAATGCT  ATTAAATAGA TTTACTTACA TGTGAATTTA AAGTGGCATG ATATTATGTA AATAATCTGA GATTTTTCTA AAGCTTCATT TTCATAATTT ATATTTCAAT ATTTTTCTGT TTTTGTGTGA  GTGCTTAGTT TTTTTTTTTT CTAGTGGTGA TTATTATGAA CAATATATAT GTGCTAATTA TTGATTTAAT GACAGCAAAA AGTGATCTAA GGTTAAATTA CTACTCAGAG AGTTGTCCAA  GAGCTGAAGA AATCATTAAA GAACAAGTAA ACAAGTTGTA CCACAAGCAT GGGAATACTG CAGTTTCTTG GATAAGAAAT CTATTTCATG ATTGCATGGT TAAGGTAATA TATATTTCAT  ACGATTATGT TTGACTGAAC GTGAAATTTA AAAGATAATT TTTGTAAAAA GGAAACTTTG AGCACGTATA ACGAAAGTAC CTTAAAAGAA CTTGTGATCT TTATACATAT CATGTCATAT  CAATTTTATG GCTAAGCTCA TGTCATGAAG GGGTTCATTT GATCTGGAAT AAGGTTATTT TACGATTATA ATTTCACATC GAATATGAAA TAAAATTATT TCAATATTAT AATACCAATA  GGTTCAAATT TTATATCTAG ATACATATCC TGATCCCAAT GACAAAATGA CCTCAGTTTA TCAAATATAG AAATGTGACT TTTTTTCTGA TTATGTTAAT TGGTGAATAT TGTTGTTGAA  GTCATGTGAT GCATCAATAT TGTTGGACAA AACAAAGGAA CAAACATCAG AGAAGACATC TCAAAGAAAC TTTGGGATGA GAAATTTCAA GTATATTGAG ACTATCAAAG AGGCTCTTGA  GAATGAATGT CCAAATATTG TCTCTTGTGC GGATATTGTC GCTCTTGCGG CTAGGGATGG TATCGTTATG GTAAGTTAAA TGTATTTAGC CTCCCTCTTC AACTTCATTT TTTTCCTCTT  ATATTAGTAA GTATATATAC ATGGTATACA TATTAGGAGT GACCAGGTGG TTTAAATTGA ATTTGAACCG ATCAAAATAA ATTAAATCAA TAAATGAGTC ATTTAGAAAA TTACATCGAA  CGACCTTGAA AATTGGTGAT TTTAAAATTT TGACTCCCAC TTGCCACATG AGCAATTAAT ATTCTTTTTA CCAAATTTAA TTCGTTCACT AACCAAAACC AAAAATTAAT ACATTACATC  TCAAACCCTC AAAAAAGTTT TCTCTGAATT AGATTTATTG ACCTTAACTT TTAAATTAGT TAAATTTTGA CCGATCAAAA TAGGTTATTA GCGAATCATA TTTTCACGAG TTAATTTTAC  GTGTTTAATT TGACATAGTT AGGAGGGCCA CAAATTGAAA TGAAGACAGG CAGATGGGAC AGCAAAGATA GTTACTTAGC AGAAGTTGAG AGTTTCATTC CAAATCACAA TGATTCAATG  TCTTTAGTTC TTTCTCGATT TAATTCCGTT GGTGTTGATA CTCAAGGAAC TGTTGCTCTA CTAGGTAAAC CACCCTCCCT TTTACGATTT TTTCCTTCTC AAACTTATGT GACATTTTTT  CCTTTTCGAG AGTCAATCTG ACTATGAAGC AATTGAATTA TATCTATCAT CATAATATTC TAAAACTAAA ATTCAAATAT TCAAAAACTA TACAAATTAA AGCACTTCCT CACATCAATA  CATTACAATT TTACATAATC TAAATTTTGA AAAACGAAAA TTGTGACATA AAGTGAGATA ACAGTAATGG TGATCGATTG ATGATGCAGG GGCCCACACG GTCGGACGAG TTCATTGTGT  AAACATAGTC CATAGACTCT ACCCAACGGT TGACCCGACT CTTGATCCGG ACTTTGCAAA GTACTTGAAA ACCCGATGTC CATCAGCAGA ACCCGACCCG AAAGCAGTTG AATATGCTAG  AAATGACCAT GTAAATCCAA TGGTGTGGGA CAATTTGTAC TACAAAAACA TTATGAGCAA CAAAGGATTA TTAATTGTGG ACCAACAATT AGTGTCTGAT CCAACAACTT ATCCATTTGT  TGAGAAATTT GCTGCTAATA ATTCTTATTT TAATGATCAA TTTGCCAAAT CTTTCATTAT TTTGTCGGAA AATAATCCAC TTAGTGGTGA TCAAGGGGAG ATTAGAAAGG TATGTCGCCA 
TGTTAACAAG TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACAA AAACCCAACA TTTTGGTCCC TCATCAACAT TCATCACTCT ATTTTTAGTA TTGCTCCTCC ACATTCATTA TGCAAAAAGT GATCTAAGGT TAAATTACTA CTCAGAGAGT  TGTCCAAGAG CTGAAGAAAT CATTAAAGAA CAAGTAAACA AGTTGTACCA CAAGCATGGG AATACTGCAG TTTCTTGGAT AAGAAATCTA TTTCATGATT GCATGGTTAA GTCATGTGAT  GCATCAATAT TGTTGGACAA AACAAAGGAA CAAACATCAG AGAAGACATC TCAAAGAAAC TTTGGGATGA GAAATTTCAA GTATATTGAG ACTATCAAAG AGGCTCTTGA GAATGAATGT  CCAAATATTG TCTCTTGTGC GGATATTGTC GCTCTTGCGG CTAGGGATGG TATCGTTATG TTAGGAGGGC CACAAATTGA AATGAAGACA GGCAGATGGG ACAGCAAAGA TAGTTACTTA  GCAGAAGTTG AGAGTTTCAT TCCAAATCAC AATGATTCAA TGTCTTTAGT TCTTTCTCGA TTTAATTCCG TTGGTGTTGA TACTCAAGGA ACTGTTGCTC TACTAGGGGC CCACACGGTC  GGACGAGTTC ATTGTGTAAA CATAGTCCAT AGACTCTACC CAACGGTTGA CCCGACTCTT GATCCGGACT TTGCAAAGTA CTTGAAAACC CGATGTCCAT CAGCAGAACC CGACCCGAAA  GCAGTTGAAT ATGCTAGAAA TGACCATGTA AATCCAATGG TGTGGGACAA TTTGTACTAC AAAAACATTA TGAGCAACAA AGGATTATTA ATTGTGGACC AACAATTAGT GTCTGATCCA  ACAACTTATC CATTTGTTGA GAAATTTGCT GCTAATAATT CTTATTTTAA TGATCAATTT GCCAAATCTT TCATTATTTT GTCGGAAAAT AATCCACTTA GTGGTGATCA AGGGGAGATT 
AGAAAGGTAT GTCGCCATGT TAACAAGTGA 

Retrieve as FASTA