Entry information : LeGOX02(Solyc07g056540.2)
Entry ID 15915
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX02(Solyc07g056540.2)
Name LeGOX02(Solyc07g056540.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX02
start..stop
S start..stop
HaGOX09 708 0 3..371 2..369
HaGOX08 697 0 3..371 2..369
BstrGOX03 696 0 3..371 2..369
ThasGOX11 689 0 3..371 2..367
Literature and cross-references LeGOX02(Solyc07g056540.2)
Protein sequence: LeGOX02(Solyc07g056540.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   371
PWM (Da):   %s   40581.34  
PI (pH):   %s   9.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEEVTNVTEY QEIAKKKLPK MVYDYYASGA EDQWTLAENR NAFSRILFRP RILIDVSKID MTTTVLGFKI SMPIMIAPTA MQKMAHPEGE YATARAASAA GTIMTLSSWA TSSVEEVAST  GPGIRFFQLY VYKDRNVVAQ LVRRAEKAGF KAIALTVDTP RLGRREADIK NRFVLPPFLT LKNFEGLDLG KMDQANDSGL ASYVAGQIDR TLSWKDVQWL QTITSMPILV KGVITAEDAR  LAVQAGAAGI IVSNHGARQL DYVPATISAL EEVVKGAQGR IPVFLDGGVR RGTDVFKALA LGASGIFIGR PVVFSLAAEG EAGVKKVLQM LRDEFELTMA LSGCRSLKEI TRNHIVTEWD 
TPHAALPAPR L* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (highly expressed)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGAAG TAACCAATGT TACGGAGTAT CAGGAGATCG CCAAGAAAAA GTTGCCAAAG ATGGTTTATG ACTACTATGC CTCGGGAGCT GAGGACCAGT GGACTCTGGC TGAGAACAGA  AACGCCTTCT CAAGAATTCT GTAAGTAGCT CTAGCTCTAG CTCTAAGACC TGAATTACAT AATATATGAC TCTTAAGTTA TATTCACATG TATAATTCTG TTCTTTTATA ACCGATACAG  GTTTAGGCCC CGTATTCTCA TTGATGTGAG CAAAATTGAC ATGACCACCA CAGTGCTAGG ATTCAAGATT TCAATGCCTA TCATGATTGC ACCAACAGCC ATGCAGAAAA TGGCACATCC  TGAAGGTATA TCTTGCACTC ATACAAGTTT TTAACTGTAT AATCTTATTA TCTGGACTCG TTGGGTGTAA CCATGAATTT ATATCATGTT ATCGTAACTA ACCTCAAAGG ACATAAGTAA  TATGTTAATG GACTGTTTCA AATAAACTGA AGATTTGTGA ATTTTCATCC ATGCATATTT GAGAGGCTTT GAGCTCTGTC TACTTGAGAA ACTTGTTGGT CACATTTGGT TTAACTATTA  ATTATTAGAA GTGATTCTAG AATTCAGATG GCAATGGTTT TACGTGTAGT ACTAAACATC TTTTTTGAAG GCTCGAGTAT TCTTTATGTG GAAAAACTCT AAGGTGTTTC GGAAGTCTGA  TTACTTGGTT GCTTTATGCA GGGGAGTATG CTACAGCAAG AGCAGCATCA GCAGCAGGCA CAATCATGGT TAGTTTCACT TGGTTCTCAA TAGTAACTCT AATTTTATAA TAATGCCTAT  GGATTGCAAA TATGATGGAT TCATAGCTGA TGTTAAATAA TGTCGTAAAG CAATTTAGGA GTCTCGATAA TACTAATATC GTTTCAGCCA ATGGTTAGTG ACTTTAAATC TTCTTTAGAA  ATGCATAGTA CAATTGAGAG AGTTGAGTCA ACTTTGGCTT TGCACTCCAT ACCTTGCATA TAATTATGTT ATAATCACAA TGAATGAAGC TTTAAGTTTC TGGAAGTGAT CAATACATCA  TATTGTTTCC CCTGCATTTA TTTATTTAAC GTGTGCGGTC AATCCTCACA AAACAAGTTC TTTTATATTT CCATTTGGTT CTCTTCTTGT GATTAGAAAC CTTGGAATTA GTTGTTCATT  ATGAATAAAT TTAAACGGGG TTCGACTTCT TGGTATTTAG AGTATTCATG AACAGAAAAA AGACGTTTCA ATGAAAAAGG AGTATATCTT GCACCCTTAG ATTTCATGTA TGATTTCTGC  CTCTTCAGTG CAGCTAATTC AAGCTTTAGT TGTTGTTTGT TACTGTAATT ACTATTCCCG GGAGGCAGAA GGATTACGTA TTAGGACAAC AATTTACTGG TTTCTCAGAA GGCTCTTGAA  GCCTCATGAG CTGTTATGAT CTAAAGTACT TGTATTTGAC TTAGAGTGTG GTGTTTTTCA CTTTGTTAAC GCTACACAAA TTTGTCTTTC AGACATTGTC ATCCTGGGCC ACTTCCAGCG  TTGAGGAGGT TGCTTCAACA GGACCTGGCA TCCGTTTCTT CCAGCTTTAT GTGAGCATGA ACTTACTGTT AAAATTTAGG AGAAATGTAC ACACACCACA TTATGCCTAA ACTGTATCTA  TCTTCTCATA TATTCAGGTC TACAAGGACA GAAATGTTGT TGCTCAACTT GTGAGGAGAG CTGAAAAGGC AGGTTTCAAG GCTATAGCCC TCACAGTTGA TACCCCAAGG CTCGGACGTA  GAGAAGCTGA TATTAAGAAC AGGTATATGT CTTAATATTA CTGTCACTCT ATTAGGTTGT GTTGCCCTTT CAACCAGATA AGGAGCTTAA TATATGAAGC TGTTCAAGTT AATTTTATCT  TCATCCCCTT GCAGATTCGT GTTGCCACCA TTTTTGACAT TGAAGAACTT TGAAGGATTG GACCTTGGCA AGATGGACCA AGTGAGTAGA CGAATAGATA TTTCTCTGAT CTGTGCATCA  AGTTCTTGTA AGAATCTGTT TATGTATAAT CTTAAATTGT CTTCTTGTTG CAGGCTAATG ACTCTGGCTT AGCTTCGTAT GTTGCTGGTC AAATTGATCG CACTTTGAGC TGGAAGGTAT  AATACCTTTC CTCGGGTCAT CCTACATATT CCATGTTTTA TTCCACTTTC CATCATTTCT TAAGAATTCA GTAGGCCAAG AACTATTCTT TAATCTTAAA ATTGGTAGAA ACAGTAAACA  TATGAAATAC ACGTATATTT TTTGGCCAAT GAGGAAAAGA ACATCAGTTT TGTCAGTAGT TCAAGTGCAC TGAGGTTAGG ATTGAAAGTT GAAACTCAAT TTGACATGAC AAAAAGAAGA  TTTGATGAAC TTGCATTGCA TTTGAAACTG TGATGGACCA TTCTGTGCTT AAAAATGAAT CTCAAGAAAA ATTTCATACG TCAATGATTT CTTTCTGGAC TTGAACAGGA TGTTCAGTGG  CTCCAGACTA TCACTTCAAT GCCAATCCTG GTGAAGGGTG TAATTACGGC TGAGGATGGT ATATGATTCA ATACTCTAAA AAATTTACCC TCTTTTATTA TTCAGTCCAA TTGTGTTCAT  GCATTAATGC TGAAACAATT TACCATCTTG GACTTGCAGC TAGGCTTGCA GTTCAGGCTG GAGCAGCTGG TATCATTGTG TCAAACCATG GTGCTCGCCA GCTCGATTAT GTCCCTGCAA  CAATCTCGGC TCTTGAAGAG GTATATGACT TGTTTCTAAC CGTACTTGTT CTTTTGTTGT TCCTGTTACC TGTTCTTTGC CTTCTGTTGG GAGCTTCTAC ACACATCCTG ATTTTCTCCG  TTCATGCTGT TGTTCCAGGT TGTGAAAGGT GCACAAGGCA GGATCCCCGT ATTCTTGGAT GGAGGTGTCC GCCGTGGAAC AGATGTCTTT AAAGCTTTGG CACTTGGAGC TTCAGGCATT  TTTGTAAGTA CCATATACTG ATTGGACCTA GATTGGTAGC CACATAGCTC AATCTTTTAT CTTTATGTGG TGGTTTTCGC AGATTGGAAG GCCAGTAGTT TTCTCATTGG CTGCTGAAGG  AGAAGCTGGA GTGAAAAAAG TGCTGCAAAT GTTGCGCGAT GAGTTTGAGC TAACTATGGC ATTGAGTGGC TGTCGCTCAC TGAAGGAGAT TACTAGAAAC CACATTGTCA CTGAATGGGA  CACCCCACAT GCTGCTCTTC CAGCCCCAAG GTTGTGAGCA TGTACTTGAA GTTTCATATT ATTTCATCAA AGCAATATTG CTTCACTGTC TAAGAAGCTT ATAATTTGAT TTGAATACTC  GTTTCTGTTT AATGAGTTTA CGGTTATGTT AAGCTTTTCA TGGTATTGGA AAACTGATAT ATTCTGATAA ATGGCAAGTG ATGCCTCCAC TGTACATCCT CTATTTCTAT ATATCATCAT 
ATCGTGGAAC TTTGCGCGTA AAGTTCTCTG TTCAATAGCT CAATACATAG CAGAGGTAGA ACTTGTCTAG TAGATCTACA TCTTCAAAAT CAATGCTTAA TTCAGATAAA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGAAG TAACCAATGT TACGGAGTAT CAGGAGATCG CCAAGAAAAA GTTGCCAAAG ATGGTTTATG ACTACTATGC CTCGGGAGCT GAGGACCAGT GGACTCTGGC TGAGAACAGA  AACGCCTTCT CAAGAATTCT GTTTAGGCCC CGTATTCTCA TTGATGTGAG CAAAATTGAC ATGACCACCA CAGTGCTAGG ATTCAAGATT TCAATGCCTA TCATGATTGC ACCAACAGCC  ATGCAGAAAA TGGCACATCC TGAAGGGGAG TATGCTACAG CAAGAGCAGC ATCAGCAGCA GGCACAATCA TGACATTGTC ATCCTGGGCC ACTTCCAGCG TTGAGGAGGT TGCTTCAACA  GGACCTGGCA TCCGTTTCTT CCAGCTTTAT GTCTACAAGG ACAGAAATGT TGTTGCTCAA CTTGTGAGGA GAGCTGAAAA GGCAGGTTTC AAGGCTATAG CCCTCACAGT TGATACCCCA  AGGCTCGGAC GTAGAGAAGC TGATATTAAG AACAGATTCG TGTTGCCACC ATTTTTGACA TTGAAGAACT TTGAAGGATT GGACCTTGGC AAGATGGACC AAGCTAATGA CTCTGGCTTA  GCTTCGTATG TTGCTGGTCA AATTGATCGC ACTTTGAGCT GGAAGGATGT TCAGTGGCTC CAGACTATCA CTTCAATGCC AATCCTGGTG AAGGGTGTAA TTACGGCTGA GGATGCTAGG  CTTGCAGTTC AGGCTGGAGC AGCTGGTATC ATTGTGTCAA ACCATGGTGC TCGCCAGCTC GATTATGTCC CTGCAACAAT CTCGGCTCTT GAAGAGGTTG TGAAAGGTGC ACAAGGCAGG  ATCCCCGTAT TCTTGGATGG AGGTGTCCGC CGTGGAACAG ATGTCTTTAA AGCTTTGGCA CTTGGAGCTT CAGGCATTTT TATTGGAAGG CCAGTAGTTT TCTCATTGGC TGCTGAAGGA  GAAGCTGGAG TGAAAAAAGT GCTGCAAATG TTGCGCGATG AGTTTGAGCT AACTATGGCA TTGAGTGGCT GTCGCTCACT GAAGGAGATT ACTAGAAACC ACATTGTCAC TGAATGGGAC 
ACCCCACATG CTGCTCTTCC AGCCCCAAGG TTGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGAAG TAACCAATGT TACGGAGTAT CAGGAGATCG CCAAGAAAAA GTTGCCAAAG ATGGTTTATG ACTACTATGC CTCGGGAGCT GAGGACCAGT GGACTCTGGC TGAGAACAGA  AACGCCTTCT CAAGAATTCT GTTTAGGCCC CGTATTCTCA TTGATGTGAG CAAAATTGAC ATGACCACCA CAGTGCTAGG ATTCAAGATT TCAATGCCTA TCATGATTGC ACCAACAGCC  ATGCAGAAAA TGGCACATCC TGAAGGGGAG TATGCTACAG CAAGAGCAGC ATCAGCAGCA GGCACAATCA TGACATTGTC ATCCTGGGCC ACTTCCAGCG TTGAGGAGGT TGCTTCAACA  GGACCTGGCA TCCGTTTCTT CCAGCTTTAT GTCTACAAGG ACAGAAATGT TGTTGCTCAA CTTGTGAGGA GAGCTGAAAA GGCAGGTTTC AAGGCTATAG CCCTCACAGT TGATACCCCA  AGGCTCGGAC GTAGAGAAGC TGATATTAAG AACAGATTCG TGTTGCCACC ATTTTTGACA TTGAAGAACT TTGAAGGATT GGACCTTGGC AAGATGGACC AAGCTAATGA CTCTGGCTTA  GCTTCGTATG TTGCTGGTCA AATTGATCGC ACTTTGAGCT GGAAGGATGT TCAGTGGCTC CAGACTATCA CTTCAATGCC AATCCTGGTG AAGGGTGTAA TTACGGCTGA GGATGCTAGG  CTTGCAGTTC AGGCTGGAGC AGCTGGTATC ATTGTGTCAA ACCATGGTGC TCGCCAGCTC GATTATGTCC CTGCAACAAT CTCGGCTCTT GAAGAGGTTG TGAAAGGTGC ACAAGGCAGG  ATCCCCGTAT TCTTGGATGG AGGTGTCCGC CGTGGAACAG ATGTCTTTAA AGCTTTGGCA CTTGGAGCTT CAGGCATTTT TATTGGAAGG CCAGTAGTTT TCTCATTGGC TGCTGAAGGA  GAAGCTGGAG TGAAAAAAGT GCTGCAAATG TTGCGCGATG AGTTTGAGCT AACTATGGCA TTGAGTGGCT GTCGCTCACT GAAGGAGATT ACTAGAAACC ACATTGTCAC TGAATGGGAC  ACCCCACATG CTGCTCTTCC AGCCCCAAGG TTGTGAGCAT GTACTTGAAG TTTCATATTA TTTCATCAAA GCAATATTGC TTCACTGTCT AAGAAGCTTA TAATTTGATT TGAATACTCG 
TTTCTGTTTA ATGAGTTTAC GGTTATGTTA AGCTTTTCAT GGTATTGGAA AACTGATATA TTCTGATAAA TGGCAAGTGA TGCCTCCACT ATAAAG 

Retrieve as FASTA