Entry information : LeGOX03(Solyc03g122170.2)
Entry ID 15916
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX03(Solyc03g122170.2)
Name LeGOX03(Solyc03g122170.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX03
start..stop
S start..stop
LeGOX04 585 0 1..343 1..343
HaGOX07 573 0 1..343 1..343
LeGOX09 566 0 3..343 24..363
HaGOX06 548 0 1..335 26..360
Literature and cross-references LeGOX03(Solyc03g122170.2)
EST ref. GenBank:   DB723008.1 [5' end]
Protein sequence: LeGOX03(Solyc03g122170.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343
PWM (Da):   %s   37509.6  
PI (pH):   %s   7.53
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYYDYYTGGA EDQHTLKENV EAFSRIIIRP RILVDVSKID MSTTILGHKT SAPIMIAPTA MHKLAHHEGE VATARGAAAC DIIMGLSYMS TCTVEEIASS CNAVRFFQIY VYKRRDITAL  MVHRAEKNGF GAIILTADTP RLGRREADIK NKMIAPQLKN FEGLISTEYV SDKGSNIEAL AAVTFDASLC WKDIEWLKSI TKLPILIKGV LTSEDAIKAI EAGVAGIIVS NHGARQLDYA 
PATISVLEEV VHAVQGKVPV FFDGGVRRGT DIFKALALGA KAVLIGRAVI YGLAAKGEVG VKQVIQMLRD ELELTMALSG CCSVEDITRN HVITEKERFI CRM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATTACG ACTACTATAC TGGAGGAGCT GAGGATCAGC ACACCCTTAA AGAAAATGTA GAAGCATTTA GTAGAATCAT GTAAGTTTGA AATTTCTCGC TGTTGATTTA GCCACAAACA  TATATCTATC ACTAACTTCT TAAAAACTCA GTATTCGGCC TAGAATACTT GTTGACGTGA GCAAGATAGA TATGTCAACT ACTATTCTAG GTCACAAGAC GTCAGCCCCT ATTATGATTG  CCCCAACGGC CATGCATAAA TTGGCACATC ATGAAGGTTT GTATTAAATC AATTAGCGCC CTAGTCACTT AGCTGAAAAT ACAATGTAGC TCTGATTCTA TCAAACCGAG ATGTATTTAT  GCCAGGAGAA GTTGCAACAG CGAGAGGAGC TGCAGCATGT GATATTATTA TGGTACTCCC TCCATGTTTG TCTTGCTCTC CCTTTGTCCA TTTCAAAAAA AATACATCTA CAAGATTAAA  GGACATTTTA GTAAATTCTA CATATCTTTA GTGTAAGACT ACACCATTCA AGAGTCTTCT CTATTTTCTT AAACTTCGTG CCAAGTCAAA ACCAGTCAAA CAAATTAGAA AGGAGGGAGT  AATATTTTTC CAAAGAGGAT CAATTTCCAA TTCTGGCGTG TGGATGCTGA GTTCTCTTGG TTATAGGGAC TGTCGTACAT GTCAACCTGC ACAGTGGAGG AGATTGCTTC CAGCTGCAAT  GCTGTTCGCT TTTTCCAAAT ATACGTAAAA TTTCTTTCTT AACTATCATG ATCTCCATGT ATGTTTACTG GTTTTCTAAT GTATTGAAAC GGAATGTTAC ATTTCATCTG TCAATAGGTT  TACAAAAGAA GGGATATAAC AGCACTTATG GTACATAGAG CTGAGAAGAA TGGATTTGGA GCTATTATTC TTACAGCTGA TACTCCGAGG CTTGGTAGAA GGGAGGCAGA TATAAAGAAT  AAGTAAGCTA TATATCCTTT TGATGTCATT CAAGGCTAGC TATAATCCTT TGTGCCGTTG TTCTTCAATC TTATCTGGTG CTGATCAAGA AAGAAAAGAG TCACAATTGC AGGATGATTG  CACCTCAGTT GAAGAACTTC GAAGGTCTTA TATCAACTGA ATATGTTTCT GTAAGTACAA CCATAAATTC TGGCTTTACA GACAAATCAT TTATTAAACT GAAAGAGGAG AATTTGGAAC  TCTCTTAGGA AACAAAATTT ATTCTCTGAC TAAATGTCCA TAATTTGCTG TTTTTTCCTA CTAAATCTGG TGTTCTTGCT GAATGATTCA TTCCTTTCAT CCTTCCATTT GTTCGGGGTG  GGTGTTGACG CTTGGATTAG CTTCAAAAAT TGCCATGCCA GAATACATGC TATCAGTTTG TCTATGAAGT AGAATGTATA AAGTAGTACT TCTTGTGCTT CCCAGTAGGT AGAACCTAAG  TTTCCATCAA TGGGAGTACA GCTTTGACTT GTAAATTAAC TGATCTCTTC ACCAGTTGTT AACTTGCTAT TAAGCACGAC TTTGACAAAA GATACTTCTG CGTATTACAA TGTATTTGGT  TACGACTGAC ACAGGCTTTT CCTTAAACAT TGCTTCTCTT TTTCCCCCCT TTTTTCTCGT TTGAACGATA ACATCTTCAT CAGTAAGATA TTTGTCTAGA GAAGTTGCTC TATTTGACTG  CACTGGTGTG CTACTTCAAT TTGTTGAATA TGTTGCACAA CGTTTCTGTT TTCATCTATG TGCTGCTACT TTATATGCTT TCACGTTCTT ATTCATTAAT TTGATGTGCA GAACATCATA  AATCTATCAA CTTGAAAATG GTGTAGTTCA TGCTTACTGA TCGATCTACT ATTAAAACTC TACAGGACAA GGGCTCAAAT ATTGAAGCCT TAGCAGCAGT AACTTTTGAT GCTTCTCTTT  GTTGGAAGGT ACAAAGTTTA AAGTTTATTC ATGTTTTTTC TTAATACCAC ATGAGAACAC AGGATGATAT TATATCATTG ATATACTGTA TACACTCTTG GTCCTAGAAC AAACATTTTG  GTTGAGGATG TCAACGTATG TCAAAATAAG TAAATTGTTG AGCTACAAAG TATATGTAGA AGAATAAGAT TCTCATATTT TTTTCCAGAA CTTCAAATAT GGTCAACTGC ATTCCTTTTT  TGAACCTTTT ATATCCAAAA ACTTTGCAGG ATATAGAGTG GTTAAAATCA ATTACCAAGT TGCCAATTCT GATTAAGGGC GTTCTGACTT CTGAAGATGG TATCTATTAC TGAACCCTCG  ATGTCTGCAT AGTTTACTTT TGTGCACTGA TTATGTATAT ACGAGCATGT ACAAAGCAAA TGGCCATGAA AGCTGAAGGT TGATATTTAG TCTTAAATCG TACGTAGGGA AATTCAGAAG  GGAGCTGGTT AATGCAAAAA TCTGATAGTA ACTGCAGTCA AGTAAGGAAA ATAGGTACAA GCAAACATCA TGAAGAACAT AGTCACAATT TCTTTAGGAA GAAATTCTTA TGAATATGAA  TTCTAAGTAG TTAAGCTAGA CAAAAAAGAG GTTTCTTCCA GAATACTTGC CATCATCCTC CAAAATAAAC TGTCCTTTTT TTTCAGTCAA CTTTTGTTTT TCTAAGACAT AGGAGGGTGG  TAGAGGTGGA TCTTAAGCTT CTTACAACAA TCCAAATTCT CCTAACTTAA GGGTCTCACT GATTACCTTT TTAGTACATG CTAGGGGTCT TTTTAATCTT GTTAGCTATT TGTATGTCAA  TAGGATATAC AGAGAACTCT TAGTGATAGA GATTACTGAT ATTGGAATGG GATCGGTTCA AATTGAGCAA AACTGATAGT GAGATGCATA TAGCTGACTC TGATTAACTT GTGATTGTGG  CGTTGTTGTT GTTCTCACTA ATTGATCATC TATTCTAAAA ACTTGGCATA TGCTTCTGTT TTGCAGCAAT AAAAGCGATT GAAGCAGGAG TTGCAGGAAT CATTGTCTCT AACCATGGAG  CTCGGCAACT AGATTATGCT CCAGCTACTA TATCTGTTCT TGAAGAGGTT ATTCCCTATG TTGCTGATAT GTTTAATGTG GTCTCTCATA GAATGTAGAT AAATTCAATG GATTAGCTTC  TTAGACTTTT TTAACAGTAA TGTTAGGCAT AGCACAAAAG TTTGTCAGTA CAGAACTCTC AATTTTTGTT TACAAAAAAT TAAACCACAG ATACAACATA CCTTGGAGGA AATATGTAAA  TTCAACTTCC TGCCATGTTT GAGTTACTCA GCAAGATCAA TTGGGTACTT AGACCTTACA TCAAGCTAGT TATTGGAGTC AACTATGTGT TTCGCATTCA TAAATATTTG ATTAGACATA  GAAACAAATC TTTTTGCATG TGTATTATAT CCACATATCT CAATGGTTTC ACCATTTCAG GTTGTCCATG CTGTTCAAGG TAAAGTTCCA GTATTTTTCG ATGGAGGAGT GAGGCGAGGA  ACAGACATAT TCAAGGCCTT AGCTCTTGGT GCAAAAGCTG TTCTGGTGAA CTTATTTGAA AATTTTTACT TCAACTTCTA AGCTTTACGT TGTTCCTACC AGGGATTTGG CCTTCTGTTG  AGTAAAATGT ATTCCTGCAG ATTGGTCGAG CAGTTATTTA TGGCCTGGCA GCTAAGGGAG AGGTGGGGGT AAAGCAGGTT ATTCAAATGC TCAGGGATGA ATTGGAGTTA ACAATGGCCC  TTTCTGGCTG CTGCAGTGTC GAAGACATAA CAAGAAACCA TGTGATAACA GAGAAAGAAA GGTTCATTTG TAGGATGTAG TTTCATCCTG AAAGCAGCTA AAAGTATATA CAGGACCGGC 
TACAATTCTA CTATTG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATTACG ACTACTATAC TGGAGGAGCT GAGGATCAGC ACACCCTTAA AGAAAATGTA GAAGCATTTA GTAGAATCAT TATTCGGCCT AGAATACTTG TTGACGTGAG CAAGATAGAT  ATGTCAACTA CTATTCTAGG TCACAAGACG TCAGCCCCTA TTATGATTGC CCCAACGGCC ATGCATAAAT TGGCACATCA TGAAGGAGAA GTTGCAACAG CGAGAGGAGC TGCAGCATGT  GATATTATTA TGGGACTGTC GTACATGTCA ACCTGCACAG TGGAGGAGAT TGCTTCCAGC TGCAATGCTG TTCGCTTTTT CCAAATATAC GTTTACAAAA GAAGGGATAT AACAGCACTT  ATGGTACATA GAGCTGAGAA GAATGGATTT GGAGCTATTA TTCTTACAGC TGATACTCCG AGGCTTGGTA GAAGGGAGGC AGATATAAAG AATAAGATGA TTGCACCTCA GTTGAAGAAC  TTCGAAGGTC TTATATCAAC TGAATATGTT TCTGACAAGG GCTCAAATAT TGAAGCCTTA GCAGCAGTAA CTTTTGATGC TTCTCTTTGT TGGAAGGATA TAGAGTGGTT AAAATCAATT  ACCAAGTTGC CAATTCTGAT TAAGGGCGTT CTGACTTCTG AAGATGCAAT AAAAGCGATT GAAGCAGGAG TTGCAGGAAT CATTGTCTCT AACCATGGAG CTCGGCAACT AGATTATGCT  CCAGCTACTA TATCTGTTCT TGAAGAGGTT GTCCATGCTG TTCAAGGTAA AGTTCCAGTA TTTTTCGATG GAGGAGTGAG GCGAGGAACA GACATATTCA AGGCCTTAGC TCTTGGTGCA  AAAGCTGTTC TGATTGGTCG AGCAGTTATT TATGGCCTGG CAGCTAAGGG AGAGGTGGGG GTAAAGCAGG TTATTCAAAT GCTCAGGGAT GAATTGGAGT TAACAATGGC CCTTTCTGGC 
TGCTGCAGTG TCGAAGACAT AACAAGAAAC CATGTGATAA CAGAGAAAGA AAGGTTCATT TGTAGGATGT AG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATTACG ACTACTATAC TGGAGGAGCT GAGGATCAGC ACACCCTTAA AGAAAATGTA GAAGCATTTA GTAGAATCAT TATTCGGCCT AGAATACTTG TTGACGTGAG CAAGATAGAT  ATGTCAACTA CTATTCTAGG TCACAAGACG TCAGCCCCTA TTATGATTGC CCCAACGGCC ATGCATAAAT TGGCACATCA TGAAGGAGAA GTTGCAACAG CGAGAGGAGC TGCAGCATGT  GATATTATTA TGGGACTGTC GTACATGTCA ACCTGCACAG TGGAGGAGAT TGCTTCCAGC TGCAATGCTG TTCGCTTTTT CCAAATATAC GTTTACAAAA GAAGGGATAT AACAGCACTT  ATGGTACATA GAGCTGAGAA GAATGGATTT GGAGCTATTA TTCTTACAGC TGATACTCCG AGGCTTGGTA GAAGGGAGGC AGATATAAAG AATAAGATGA TTGCACCTCA GTTGAAGAAC  TTCGAAGGTC TTATATCAAC TGAATATGTT TCTGACAAGG GCTCAAATAT TGAAGCCTTA GCAGCAGTAA CTTTTGATGC TTCTCTTTGT TGGAAGGATA TAGAGTGGTT AAAATCAATT  ACCAAGTTGC CAATTCTGAT TAAGGGCGTT CTGACTTCTG AAGATGCAAT AAAAGCGATT GAAGCAGGAG TTGCAGGAAT CATTGTCTCT AACCATGGAG CTCGGCAACT AGATTATGCT  CCAGCTACTA TATCTGTTCT TGAAGAGGTT GTCCATGCTG TTCAAGGTAA AGTTCCAGTA TTTTTCGATG GAGGAGTGAG GCGAGGAACA GACATATTCA AGGCCTTAGC TCTTGGTGCA  AAAGCTGTTC TGATTGGTCG AGCAGTTATT TATGGCCTGG CAGCTAAGGG AGAGGTGGGG GTAAAGCAGG TTATTCAAAT GCTCAGGGAT GAATTGGAGT TAACAATGGC CCTTTCTGGC  TGCTGCAGTG TCGAAGACAT AACAAGAAAC CATGTGATAA CAGAGAAAGA AAGGTTCATT TGTAGGATGT AGTTTCATCC TGAAAGCAGC TAAAAGTATA TACAGGACCG GCTACAATTC 
TACTATTG 

Retrieve as FASTA