Entry information : LeGOX04(Solyc03g122130.2)
Entry ID 15917
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX04(Solyc03g122130.2)
Name LeGOX04(Solyc03g122130.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Fruits
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX04
start..stop
S start..stop
LeGOX09 586 0 3..343 24..363
LeGOX03 585 0 1..343 1..343
HaGOX07 548 0 1..343 1..343
HaGOX06 546 0 1..335 26..360
Literature and cross-references LeGOX04(Solyc03g122130.2)
Protein sequence: LeGOX04(Solyc03g122130.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343
PWM (Da):   %s   37479.52  
PI (pH):   %s   7.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYYDFFAGGA EDEYTLKENV EAFHRITIQP RILVDVSRID MSTVILGHKT SAPIILAPSS AHQLAHPEGE VATARGAAAC NVIMGLSFMS TCTVEEVASS CNAVRFFQIY VFKKRDVTEF  MVRRAEKNGF RAIILTADTP RLGRREADIK NKMISFRLRN FEGFISTDVV SDKGSNLAAY AEETLDPSLC WKDIAWLKSI TKLPILIKGV LNGEDAMKAI EAGVVGIIVS NHGARQLDYS 
PATISVLEEV VQAVQGKVPV LLDGGIRRGT DIFKALALGA KAVMIGRPVI YGLAAKGESG VKQVIEMLKN ELELTMALAG CCTVDDITRS HVKTEKERCL CKM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete seuquence from genomic and 4 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTACTATG ACTTCTTTGC TGGAGGAGCT GAGGATGAGT ACACACTCAA AGAAAATGTC GAAGCATTTC ATAGAATCAC GTAAGTTTGT AATTTCTTGC TCTTGATTAA TTTTGGCAAA  AAAAAATAAA ATGGTAGCAA TACTAACATT TCAGAAACTC AGTATTCAGC CAAGAATACT AGTTGATGTG AGCAGAATAG ACATGTCAAC TGTCATACTT GGTCACAAGA CATCAGCTCC  AATTATACTT GCCCCTTCTT CTGCGCATCA ATTGGCACAT CCTGAAGGTT CGGATTAAAT CAATTAGTAA AAACTAGTCT GTTAGCTTAA GGTACCCCCA CCGCGTACTT CTTACTCTAA  CAAGCTATTG TATTTATGCC AGGAGAAGTT GCAACAGCTA GAGGTGCTGC AGCATGTAAT GTTATCATGG TAAAATATCT GTTTCCAATT CTGGTGTGTG GAATGTTAAG ACGATTTCTC  AGATAATCAT TAACTAATTG ATTATTATCT CAAAACTCAC TTTCTTTTTT GAAAACTGAA ATCAAGAACA TTGGTGATTT TCTGAGATAA TACTACTAGT TGAGAAATCA ACTCATGGAT  TATTGAAATT GTATGACTTT TTCATCTAAA TAAAAGCTTA CGTTGTTATT ACTTAATTAT AATATGTTTC AACAAAGATG TTGAGTTTTC TTGAATATAG GGACTGTCAT TTATGTCTAC  CTGCACAGTG GAGGAGGTTG CTTCAAGCTG CAATGCTGTT CGCTTCTTTC AAATATATGT AACTTCTATT ATTCCAAACT CTGATCATTG TTATATATAT ATATATATAG TGTTCTGTTA  TCAGATAGGT AATTTATTCT TTGTCAATAG GTTTTCAAAA AGAGAGATGT AACAGAATTT ATGGTACGTC GAGCTGAGAA GAATGGGTTC AGGGCAATAA TTCTCACTGC TGATACTCCA  AGGCTTGGCA GAAGGGAGGC TGATATAAAG AATAAGTAAG CTGTATATCT TTTATACTTA AATTCTTTAC ATACGAATCC GGAATAAGTT GGTTTCACTA ATTTAGCTCT TAAAGAATTT  CTTTTTAGTA ATACTGTGTT AATCTACTAA GAGTGGGAAT TGCAGGATGA TATCATTTCG GCTGAGGAAT TTTGAAGGTT TTATATCAAC TGATGTTGTT TCTGTAAGTA AAACCATAAA  AATTTCTGCT AATCATCGAA GATAAGGTTG ATTTCTTAGA TGCGACATTC TGAGATAATA ACTATTAGTT GAGTGACCCT AACAAATCCA ACTTGTGATA GATATATTAA CTTGAAACTA  GTGTAGACTA TGCTTACTAA TCCACTTACA AAACTCTGCA GGACAAAGGC TCAAATCTTG CAGCATATGC TGAAGAAACT CTTGATCCGT CGCTTTGCTG GAAGGTACAA GATTTAAAAG  TTAAATGCAT CCGTTCCTTA TTATATGATG AAATACAATC TTTGATACAC GAACTCAAAT TTCTCGAGTG TAGACAGTAT GTTAAAATAT GTGAAATTGC TGATCTACAA ATAGAGTTGA  AGTCAAATAT GATCATTATG TAATCCTCAC ACTCACTGAA AACTTTGCAG GATATCGCGT GGCTAAAATC AATTACTAAG TTGCCAATTT TGATTAAGGG TGTTCTCAAT GGTGAAGATG  GTACTAGTAT TATCAGTGAA CCTTAGCTAT TTGCATATAA AACCTCAGAT TTCCTACAAG TTGACTGGCA TATACTTTTT TTTTCAGCAA TGAAAGCAAT TGAAGCAGGA GTTGTAGGAA  TTATCGTCTC TAATCATGGA GCTCGACAAC TAGATTACTC TCCAGCTACT ATTTCTGTTC TTGAAGAGGT GATTTCCTTC CTCACATGTT TAAATTGGAA GTTGAAATAT GTTATTTGAA  ATCTTCTTAG CTTGTCCATT GACTTCCATA TATCCCTCCT TAATTTTCAA TGGTTTTAGG TGGTCCAAGC TGTTCAAGGT AAAGTTCCAG TTCTTCTAGA TGGAGGAATT AGGCGAGGAA  CAGATATATT CAAGGCGTTA GCACTAGGGG CAAAAGCTGT CATGGTAAAC TTAATGATTT AAAGGAATGG ATTTAACTTA TATACGCTGA TAGTGTAAAT AGTTTATATT TTCTTTCTGT  ATATTCGTGC AGATTGGTCG ACCAGTTATC TATGGCCTGG CTGCTAAGGG AGAATCTGGG GTAAAGCAAG TTATTGAAAT GCTAAAGAAT GAACTTGAGC TGACCATGGC TCTTGCTGGC  TGCTGCACTG TGGATGATAT TACGAGAAGC CATGTTAAGA CAGAAAAAGA GAGGTGCCTC TGTAAGATGT AATTCTGTTT CTTAAACGAA TGGCCTAGCC CCAACAATTC TACAATCATG 
TGACATCTTG CTTGTAATGT TGTTCAATTG CGATATTGCT ATTTAAAGCA TCGATTTCAG ATGTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTACTATG ACTTCTTTGC TGGAGGAGCT GAGGATGAGT ACACACTCAA AGAAAATGTC GAAGCATTTC ATAGAATCAC TATTCAGCCA AGAATACTAG TTGATGTGAG CAGAATAGAC  ATGTCAACTG TCATACTTGG TCACAAGACA TCAGCTCCAA TTATACTTGC CCCTTCTTCT GCGCATCAAT TGGCACATCC TGAAGGAGAA GTTGCAACAG CTAGAGGTGC TGCAGCATGT  AATGTTATCA TGGGACTGTC ATTTATGTCT ACCTGCACAG TGGAGGAGGT TGCTTCAAGC TGCAATGCTG TTCGCTTCTT TCAAATATAT GTTTTCAAAA AGAGAGATGT AACAGAATTT  ATGGTACGTC GAGCTGAGAA GAATGGGTTC AGGGCAATAA TTCTCACTGC TGATACTCCA AGGCTTGGCA GAAGGGAGGC TGATATAAAG AATAAGATGA TATCATTTCG GCTGAGGAAT  TTTGAAGGTT TTATATCAAC TGATGTTGTT TCTGACAAAG GCTCAAATCT TGCAGCATAT GCTGAAGAAA CTCTTGATCC GTCGCTTTGC TGGAAGGATA TCGCGTGGCT AAAATCAATT  ACTAAGTTGC CAATTTTGAT TAAGGGTGTT CTCAATGGTG AAGATGCAAT GAAAGCAATT GAAGCAGGAG TTGTAGGAAT TATCGTCTCT AATCATGGAG CTCGACAACT AGATTACTCT  CCAGCTACTA TTTCTGTTCT TGAAGAGGTG GTCCAAGCTG TTCAAGGTAA AGTTCCAGTT CTTCTAGATG GAGGAATTAG GCGAGGAACA GATATATTCA AGGCGTTAGC ACTAGGGGCA  AAAGCTGTCA TGATTGGTCG ACCAGTTATC TATGGCCTGG CTGCTAAGGG AGAATCTGGG GTAAAGCAAG TTATTGAAAT GCTAAAGAAT GAACTTGAGC TGACCATGGC TCTTGCTGGC 
TGCTGCACTG TGGATGATAT TACGAGAAGC CATGTTAAGA CAGAAAAAGA GAGGTGCCTC TGTAAGATGT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTACTATG ACTTCTTTGC TGGAGGAGCT GAGGATGAGT ACACACTCAA AGAAAATGTC GAAGCATTTC ATAGAATCAC TATTCAGCCA AGAATACTAG TTGATGTGAG CAGAATAGAC  ATGTCAACTG TCATACTTGG TCACAAGACA TCAGCTCCAA TTATACTTGC CCCTTCTTCT GCGCATCAAT TGGCACATCC TGAAGGAGAA GTTGCAACAG CTAGAGGTGC TGCAGCATGT  AATGTTATCA TGGGACTGTC ATTTATGTCT ACCTGCACAG TGGAGGAGGT TGCTTCAAGC TGCAATGCTG TTCGCTTCTT TCAAATATAT GTTTTCAAAA AGAGAGATGT AACAGAATTT  ATGGTACGTC GAGCTGAGAA GAATGGGTTC AGGGCAATAA TTCTCACTGC TGATACTCCA AGGCTTGGCA GAAGGGAGGC TGATATAAAG AATAAGATGA TATCATTTCG GCTGAGGAAT  TTTGAAGGTT TTATATCAAC TGATGTTGTT TCTGACAAAG GCTCAAATCT TGCAGCATAT GCTGAAGAAA CTCTTGATCC GTCGCTTTGC TGGAAGGATA TCGCGTGGCT AAAATCAATT  ACTAAGTTGC CAATTTTGAT TAAGGGTGTT CTCAATGGTG AAGATGCAAT GAAAGCAATT GAAGCAGGAG TTGTAGGAAT TATCGTCTCT AATCATGGAG CTCGACAACT AGATTACTCT  CCAGCTACTA TTTCTGTTCT TGAAGAGGTG GTCCAAGCTG TTCAAGGTAA AGTTCCAGTT CTTCTAGATG GAGGAATTAG GCGAGGAACA GATATATTCA AGGCGTTAGC ACTAGGGGCA  AAAGCTGTCA TGATTGGTCG ACCAGTTATC TATGGCCTGG CTGCTAAGGG AGAATCTGGG GTAAAGCAAG TTATTGAAAT GCTAAAGAAT GAACTTGAGC TGACCATGGC TCTTGCTGGC  TGCTGCACTG TGGATGATAT TACGAGAAGC CATGTTAAGA CAGAAAAAGA GAGGTGCCTC TGTAAGATGT AATTCTGTTT CTTAAACGAA TGGCCTAGCC CCAACAATTC TACAATCATG 
TGACATCTTG CTTGTAATGT TGTTCAATTG CGATATTGCT ATTTAAAGCA TCGATTTCAG ATGTT 

Retrieve as FASTA