Entry information : LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Entry ID 15918
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Name LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX05
start..stop
S start..stop
ThasGOX06 538 0 1..331 1..331
BstrGOX02 535 0 1..333 1..333
AtGOX06 463 5e-166 44..335 2..293
MpGOX03 366 4e-127 1..331 1..336
Literature and cross-references LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Protein sequence: LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338
PWM (Da):   %s   36789.56  
PI (pH):   %s   7.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLRGILGFE YGIVQAPLGP DISSPQLVAA VANAGALGFL RVPDWEDPDY VRELIRKTRT LTNKPFGIGV ILAFPHKENV KAILDEKVAV LQLYWGECSK ELVLKAHKAG VKVVPQIGSY  EEAKKAADAG VDAIIVQGRD AGGHVIGQDG LITLLPRVVD LVRGRDIAVI AAGGIVDERG YVAALALGAQ GVSLGTRFLA TEESYAHPTY KRKLIEFDQT EYTDVFGRAR WPGAPQRVLA 
TPFFMEWKAL PSHENESNQP VIGRTIIHGR EIEVRRFAGT VPNATTTGDI ESMAMYAGES IGLIKEILPA GEVIKRIVER AQRLIDQQFA QVSRTQNN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (highly expressed)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCATATTTC ACAAGAGTAG ACAACTTTGT TGCGAATTCT ATTAAAAAAA AGAAAAGAAA AAGTGCACAT GACATAAGGC CGTTAAAAAT GTGAAATAAT TGGTGCCAGA AACATTGAAT  TTCGTTTATA GAAATGGGTT TGAGAGGAAT ATTGGGTTTT GAGTATGGGA TTGTTCAAGC ACCCTTGGGA CCTGATATCT CAAGTCCACA ACTTGTTGCT GCTGTTGCTA ATGCTGGTGC  TCTTGGTTTC CTCAGAGTCC CTGATTGGGT ATATTTATTC TTCTCAACTT AAAATGCATC TAAGAAAAAG CTTGGCTTGT TTTTCTTATT TATTGATGTG AGATTTGTCA TAATAAAACC  CTTCAAATGT AAAGACTTTA CCGAAATTTC AGATTGTTTT ATGTCTTTTT TACTAGCTAT ATTCCTAATT TAATTTGTCA CCGTACAGAA TTTGAGAGCT TAATTATAAT CCCCTCTTCT  TACCATCCCC CAATAAGTTG TGTAGTGAAC TTGTTTTTAT AGGTCAACAT CTCCGCTCAT AGCATGCTGG AAGTGTCTGA TTATAGCAAA ACGCGCTGTT GAAACTATAG TGTTAAGGGT  GTGAACCCTT CTTCAGAAAA TATATATTAG CAAAATGATA TATGAAATGA TTAAATAATA TATTTTGGAC ATTGATAAAA TAAGGTGATC TATCCTAGTT GTTTTAGACG CCATGAAAGA  GCCACTATTT TCACTTTTTT TGGACATCCT CTGTGGGGTG CTCACATGTT CGAATCTCAC TAGCAACCCC TTTAATTTTA GTTCACTTTT TTTTGGACAC CCTCCATGAA AAGCCACTGA  TAGTCCTACT GAAGGCAGTG GAGTCTAAAA GTGTTAACCT TTTTATTGGT GTGGCAGGAA GATCCTGATT ATGTGAGAGA GCTCATAAGA AAGACTAGAA CCTTAACTAA CAAGCCATTT  GGGATAGGTG TTATTCTTGC ATTTCCTCAC AAGGAAAATG TAAAAGCTAT ACTGGATGAG AAGGTTGCAG TATTGCAGCT TTATTGGGGT GAATGTTCAA AGGAGTTGGT TCTTAAAGCT  CATAAAGCTG GGGTCAAAGT TGTACCACAA GTAAGTTTTC AACACAACTA TTTCACGTTT TCAAAAATTC ACTATTTGTC ATTGGAATCA CTAGCATCAT TAACCTGTCG CATTACATGA  TGTTGGATCA TTTTTGTCAA TTTATTTAGC TGGATTAGAG TGGGGTTTTG CTTTAAATTG CTCTATACTG CTCACGAACT TCTATTCTTC TTGTTCTAGT AGAGTTCATC AATGAAGGTG  ACTATTCACC ATAATGATAC AAAAATTCCT TGAAATGAGC AAAGTACAAG ATACTCCTGT TTTTATCATG ATTTATTTCT TTCTTGCAAG TTAAATTGTT AAGGTTTAAG AATTCACAAT  TACTCATATA ATGGTGTTAC ATGTATCATA AATCTATTGA ATGATTTCTA TTAGTGTTGG TAAGAGATGA ATTTAAATGC AGATTCATGC TCATTGAGGA TTCAAATAAC TTATCTCAAC  TTGTTTTGGA CTGAGTTGTA GTTGTTGTAT GTCTTAGTGA TATATTTTGA AGTATCCCAT TCTCAGCTTC CCACTTGTCC TGTAGCATGA TTGTACATCT GTGAAAGAAT AGAGAACTTA  CCTTCACCTA CTTATTCCTG AAATATAACT TATAAAGCAT ATGTGGTGTT TTTTAAGATT GGCAGCTATG AAGAAGCAAA GAAAGCTGCT GATGCTGGTG TAGATGCAAT TATTGTCCAA  GGTCGGGACG CAGGAGGCCA TGTAATTGGC CAGGTATAAT GGTGATCATT TTCATGATAT GCATTAGTTT TTTTATCATG TTAACAATAT TTGTTCTTCC TTGAGAATAT TTCACTTCAA  GCACTTCCCC CTCCCCCCCT CTTCCCCTCA ACTCCTAATT GTTTCTGTTG GAGTCGATCT CGTCGCCATT GTAAAATTAC TTATGGAATG ATATATGACC TACTCGGTTG ATTTCCTTTT  AGGATGGTTT AATCACCTTA TTGCCTAGAG TAGTCGATCT TGTTCGTGGT CGTGACATAG CAGTAATTGC TGCTGGAGGA ATAGTGGATG AGCGTGGTTA TGTTGCTGCT CTGGCCCTTG  GTGCACAGGG TGTTTCATTA GGTACCAGGT ATGGATCTTT TCGTTGTAAC ATTTCAAAGG TGTTTAATCT ATTACCAGTA CCTGCTGCTC TCCGGCTTAT ATCCTCTTAA TATTACTGGG  CCGAAGTTAG GTATCACTTA TAAATTGCAG TTTACTATGC CCTCTTGCTT AAATAGTTTC TTATGTGCAT TTTTAGTGGA TAGATACGTA GGTTTGATGT TGTTGGTCAA TGCGGACTCT  TATTTTTCAA TAGTTTATTT TATCGTACAT TCACATGTAT GAGGCATGAA GAATGTTAAA AGAATAAGTT CAAGACATAA TTCTATTCTG AAATGTTTTG GCCCTGACAG TAAAGATGGA  ACAATGAAAT ATATGTCACA AGATGCTAAC ATATTGTGTG ATAAATAGAT GTTTCAGCGC ATCAGACAGG ACTATTTAGG AACTTCCCTT GCGTAAAAAC TATTCATGTC CTTGCGGATA  TGCAAAACAG TGACTAAGTT ATTAAAATCT TAAACCTTTT CAGGTTTCTT GCAACAGAGG AAAGCTATGC TCACCCAACG TACAAGAGGA AGCTGATTGA ATTTGATCAA ACAGAGTACA  CAGACGTATT TGGTCGTGCA AGGTGGCCAG GGGCACCACA ACGTGTTCTG GCAACCCCCT TCTTCATGGA ATGGAAGGCG CTCCCAAGTC ATGAGAATGA GTCAAATCAA CCTGTCATTG  GCCGCACAAT CATACATGGC AGGGTGAGTA TCCTAGATTA CGTTCTTCCT AACACAATCT TGAAAATTTT CCTATCCTAT ATATGACTCT TCATTCTGTG ATCAACCTTT TAATGTTGCG  AGTACTAAAA GAGTTCGTAT AGTTTTCTAT TTTACACTGA TACCAGCTTG TCTTATCATT TGATACTTGA TCCTACGCAT TATATATCGT ATGTGGACTA TAAACTTCTA TCTGTACCTC  TTTCTTAAGA ATGTACTTAG TAATTAGTTT CATTGAACAG GAAATAGAGG TTCGTCGCTT TGCTGGTACT GTACCAAATG CGACAACTAC TGGCGATATA GAAAGCATGG CGATGTATGC  TGGTGAGAGC ATTGGTCTTA TCAAGGAAAT TCTACCCGCA GGTGAAGTGA TAAAGAGGAT CGTTGAAAGG GCTCAACGAC TGATTGACCA ACAATTTGCT CAAGTCAGCA GGACACAGAA  CAACTAGGTA TCAAATTGTT ATTAGGTGGT GGACTTTACT GGTTTGTAAC CTATAAAGTT GAACCAAACA CACATTATGT GCCAAGAGTC CACTTAAATG AATCCAAAAA TGAAAAATAA  ACAACGAAAA TAAGAAATTG TACATGAATA AAGAATGGAG TGATAAGAAA TTGTACTTAG GAGTTGTGAT TTACCACCCT CCAATATGCT TTTTGTTTAC TTGATACTCC CACTCTCGAC 
ACATCTATTA ATAAAACAAT TATTAATATA GTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGA GAGGAATATT GGGTTTTGAG TATGGGATTG TTCAAGCACC CTTGGGACCT GATATCTCAA GTCCACAACT TGTTGCTGCT GTTGCTAATG CTGGTGCTCT TGGTTTCCTC  AGAGTCCCTG ATTGGGAAGA TCCTGATTAT GTGAGAGAGC TCATAAGAAA GACTAGAACC TTAACTAACA AGCCATTTGG GATAGGTGTT ATTCTTGCAT TTCCTCACAA GGAAAATGTA  AAAGCTATAC TGGATGAGAA GGTTGCAGTA TTGCAGCTTT ATTGGGGTGA ATGTTCAAAG GAGTTGGTTC TTAAAGCTCA TAAAGCTGGG GTCAAAGTTG TACCACAAAT TGGCAGCTAT  GAAGAAGCAA AGAAAGCTGC TGATGCTGGT GTAGATGCAA TTATTGTCCA AGGTCGGGAC GCAGGAGGCC ATGTAATTGG CCAGGATGGT TTAATCACCT TATTGCCTAG AGTAGTCGAT  CTTGTTCGTG GTCGTGACAT AGCAGTAATT GCTGCTGGAG GAATAGTGGA TGAGCGTGGT TATGTTGCTG CTCTGGCCCT TGGTGCACAG GGTGTTTCAT TAGGTACCAG GTTTCTTGCA  ACAGAGGAAA GCTATGCTCA CCCAACGTAC AAGAGGAAGC TGATTGAATT TGATCAAACA GAGTACACAG ACGTATTTGG TCGTGCAAGG TGGCCAGGGG CACCACAACG TGTTCTGGCA  ACCCCCTTCT TCATGGAATG GAAGGCGCTC CCAAGTCATG AGAATGAGTC AAATCAACCT GTCATTGGCC GCACAATCAT ACATGGCAGG GAAATAGAGG TTCGTCGCTT TGCTGGTACT  GTACCAAATG CGACAACTAC TGGCGATATA GAAAGCATGG CGATGTATGC TGGTGAGAGC ATTGGTCTTA TCAAGGAAAT TCTACCCGCA GGTGAAGTGA TAAAGAGGAT CGTTGAAAGG 
GCTCAACGAC TGATTGACCA ACAATTTGCT CAAGTCAGCA GGACACAGAA CAACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCATATTTC ACAAGAGTAG ACAACTTTGT TGCGAATTCT ATTAAAAAAA AGAAAAGAAA AAGTGCACAT GACATAAGGC CGTTAAAAAT GTGAAATAAT TGGTGCCAGA AACATTGAAT  TTCGTTTATA GAAATGGGTT TGAGAGGAAT ATTGGGTTTT GAGTATGGGA TTGTTCAAGC ACCCTTGGGA CCTGATATCT CAAGTCCACA ACTTGTTGCT GCTGTTGCTA ATGCTGGTGC  TCTTGGTTTC CTCAGAGTCC CTGATTGGGA AGATCCTGAT TATGTGAGAG AGCTCATAAG AAAGACTAGA ACCTTAACTA ACAAGCCATT TGGGATAGGT GTTATTCTTG CATTTCCTCA  CAAGGAAAAT GTAAAAGCTA TACTGGATGA GAAGGTTGCA GTATTGCAGC TTTATTGGGG TGAATGTTCA AAGGAGTTGG TTCTTAAAGC TCATAAAGCT GGGGTCAAAG TTGTACCACA  AATTGGCAGC TATGAAGAAG CAAAGAAAGC TGCTGATGCT GGTGTAGATG CAATTATTGT CCAAGGTCGG GACGCAGGAG GCCATGTAAT TGGCCAGGAT GGTTTAATCA CCTTATTGCC  TAGAGTAGTC GATCTTGTTC GTGGTCGTGA CATAGCAGTA ATTGCTGCTG GAGGAATAGT GGATGAGCGT GGTTATGTTG CTGCTCTGGC CCTTGGTGCA CAGGGTGTTT CATTAGGTAC  CAGGTTTCTT GCAACAGAGG AAAGCTATGC TCACCCAACG TACAAGAGGA AGCTGATTGA ATTTGATCAA ACAGAGTACA CAGACGTATT TGGTCGTGCA AGGTGGCCAG GGGCACCACA  ACGTGTTCTG GCAACCCCCT TCTTCATGGA ATGGAAGGCG CTCCCAAGTC ATGAGAATGA GTCAAATCAA CCTGTCATTG GCCGCACAAT CATACATGGC AGGGAAATAG AGGTTCGTCG  CTTTGCTGGT ACTGTACCAA ATGCGACAAC TACTGGCGAT ATAGAAAGCA TGGCGATGTA TGCTGGTGAG AGCATTGGTC TTATCAAGGA AATTCTACCC GCAGGTGAAG TGATAAAGAG  GATCGTTGAA AGGGCTCAAC GACTGATTGA CCAACAATTT GCTCAAGTCA GCAGGACACA GAACAACTAG GTATCAAATT GTTATTAGGT GGTGGACTTT ACTGGTTTGT AACCTATAAA  GTTGAACCAA ACACACATTA TGTGCCAAGA GTCCACTTAA ATGAATCCAA AAATGAAAAA TAAACAACGA AAATAAGAAA TTGTACATGA ATAAAGAATG GAGTGATAAG AAATTGTACT 
TAGGAGTTGT GATTTACCAC CCTCCAATAT GCTTTTTGTT TACTTGATAC TCCCACTCTC GACACATCTA TTAATAAAAC AATTATTAAT ATAGTT 

Retrieve as FASTA