Entry information : LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Entry ID 15918
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Name LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX05
start..stop
S start..stop
ThasGOX06 538 0 1..331 1..331
BstrGOX02 535 0 1..333 1..333
AtGOX06 463 5e-166 44..335 2..293
MpGOX03 366 5e-127 1..331 1..336
Literature and cross-references LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Protein sequence: LeGOX05(Solyc01g105370.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338
PWM (Da):   %s   36789.56  
PI (pH):   %s   7.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLRGILGFE YGIVQAPLGP DISSPQLVAA VANAGALGFL RVPDWEDPDY VRELIRKTRT LTNKPFGIGV ILAFPHKENV KAILDEKVAV LQLYWGECSK ELVLKAHKAG VKVVPQIGSY  EEAKKAADAG VDAIIVQGRD AGGHVIGQDG LITLLPRVVD LVRGRDIAVI AAGGIVDERG YVAALALGAQ GVSLGTRFLA TEESYAHPTY KRKLIEFDQT EYTDVFGRAR WPGAPQRVLA 
TPFFMEWKAL PSHENESNQP VIGRTIIHGR EIEVRRFAGT VPNATTTGDI ESMAMYAGES IGLIKEILPA GEVIKRIVER AQRLIDQQFA QVSRTQNN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (highly expressed)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGA GAGGAATATT GGGTTTTGAG TATGGGATTG TTCAAGCACC CTTGGGACCT GATATCTCAA GTCCACAACT TGTTGCTGCT GTTGCTAATG CTGGTGCTCT TGGTTTCCTC  AGAGTCCCTG ATTGGGTATA TTTATTCTTC TCAACTTAAA ATGCATCTAA GAAAAAGCTT GGCTTGTTTT TCTTATTTAT TGATGTGAGA TTTGTCATAA TAAAACCCTT CAAATGTAAA  GACTTTACCG AAATTTCAGA TTGTTTTATG TCTTTTTTAC TAGCTATATT CCTAATTTAA TTTGTCACCG TACAGAATTT GAGAGCTTAA TTATAATCCC CTCTTCTTAC CATCCCCCAA  TAAGTTGTGT AGTGAACTTG TTTTTATAGG TCAACATCTC CGCTCATAGC ATGCTGGAAG TGTCTGATTA TAGCAAAACG CGCTGTTGAA ACTATAGTGT TAAGGGTGTG AACCCTTCTT  CAGAAAATAT ATATTAGCAA AATGATATAT GAAATGATTA AATAATATAT TTTGGACATT GATAAAATAA GGTGATCTAT CCTAGTTGTT TTAGACGCCA TGAAAGAGCC ACTATTTTCA  CTTTTTTTGG ACATCCTCTG TGGGGTGCTC ACATGTTCGA ATCTCACTAG CAACCCCTTT AATTTTAGTT CACTTTTTTT TGGACACCCT CCATGAAAAG CCACTGATAG TCCTACTGAA  GGCAGTGGAG TCTAAAAGTG TTAACCTTTT TATTGGTGTG GCAGGAAGAT CCTGATTATG TGAGAGAGCT CATAAGAAAG ACTAGAACCT TAACTAACAA GCCATTTGGG ATAGGTGTTA  TTCTTGCATT TCCTCACAAG GAAAATGTAA AAGCTATACT GGATGAGAAG GTTGCAGTAT TGCAGCTTTA TTGGGGTGAA TGTTCAAAGG AGTTGGTTCT TAAAGCTCAT AAAGCTGGGG  TCAAAGTTGT ACCACAAGTA AGTTTTCAAC ACAACTATTT CACGTTTTCA AAAATTCACT ATTTGTCATT GGAATCACTA GCATCATTAA CCTGTCGCAT TACATGATGT TGGATCATTT  TTGTCAATTT ATTTAGCTGG ATTAGAGTGG GGTTTTGCTT TAAATTGCTC TATACTGCTC ACGAACTTCT ATTCTTCTTG TTCTAGTAGA GTTCATCAAT GAAGGTGACT ATTCACCATA  ATGATACAAA AATTCCTTGA AATGAGCAAA GTACAAGATA CTCCTGTTTT TATCATGATT TATTTCTTTC TTGCAAGTTA AATTGTTAAG GTTTAAGAAT TCACAATTAC TCATATAATG  GTGTTACATG TATCATAAAT CTATTGAATG ATTTCTATTA GTGTTGGTAA GAGATGAATT TAAATGCAGA TTCATGCTCA TTGAGGATTC AAATAACTTA TCTCAACTTG TTTTGGACTG  AGTTGTAGTT GTTGTATGTC TTAGTGATAT ATTTTGAAGT ATCCCATTCT CAGCTTCCCA CTTGTCCTGT AGCATGATTG TACATCTGTG AAAGAATAGA GAACTTACCT TCACCTACTT  ATTCCTGAAA TATAACTTAT AAAGCATATG TGGTGTTTTT TAAGATTGGC AGCTATGAAG AAGCAAAGAA AGCTGCTGAT GCTGGTGTAG ATGCAATTAT TGTCCAAGGT CGGGACGCAG  GAGGCCATGT AATTGGCCAG GTATAATGGT GATCATTTTC ATGATATGCA TTAGTTTTTT TATCATGTTA ACAATATTTG TTCTTCCTTG AGAATATTTC ACTTCAAGCA CTTCCCCCTC  CCCCCCTCTT CCCCTCAACT CCTAATTGTT TCTGTTGGAG TCGATCTCGT CGCCATTGTA AAATTACTTA TGGAATGATA TATGACCTAC TCGGTTGATT TCCTTTTAGG ATGGTTTAAT  CACCTTATTG CCTAGAGTAG TCGATCTTGT TCGTGGTCGT GACATAGCAG TAATTGCTGC TGGAGGAATA GTGGATGAGC GTGGTTATGT TGCTGCTCTG GCCCTTGGTG CACAGGGTGT  TTCATTAGGT ACCAGGTATG GATCTTTTCG TTGTAACATT TCAAAGGTGT TTAATCTATT ACCAGTACCT GCTGCTCTCC GGCTTATATC CTCTTAATAT TACTGGGCCG AAGTTAGGTA  TCACTTATAA ATTGCAGTTT ACTATGCCCT CTTGCTTAAA TAGTTTCTTA TGTGCATTTT TAGTGGATAG ATACGTAGGT TTGATGTTGT TGGTCAATGC GGACTCTTAT TTTTCAATAG  TTTATTTTAT CGTACATTCA CATGTATGAG GCATGAAGAA TGTTAAAAGA ATAAGTTCAA GACATAATTC TATTCTGAAA TGTTTTGGCC CTGACAGTAA AGATGGAACA ATGAAATATA  TGTCACAAGA TGCTAACATA TTGTGTGATA AATAGATGTT TCAGCGCATC AGACAGGACT ATTTAGGAAC TTCCCTTGCG TAAAAACTAT TCATGTCCTT GCGGATATGC AAAACAGTGA  CTAAGTTATT AAAATCTTAA ACCTTTTCAG GTTTCTTGCA ACAGAGGAAA GCTATGCTCA CCCAACGTAC AAGAGGAAGC TGATTGAATT TGATCAAACA GAGTACACAG ACGTATTTGG  TCGTGCAAGG TGGCCAGGGG CACCACAACG TGTTCTGGCA ACCCCCTTCT TCATGGAATG GAAGGCGCTC CCAAGTCATG AGAATGAGTC AAATCAACCT GTCATTGGCC GCACAATCAT  ACATGGCAGG GTGAGTATCC TAGATTACGT TCTTCCTAAC ACAATCTTGA AAATTTTCCT ATCCTATATA TGACTCTTCA TTCTGTGATC AACCTTTTAA TGTTGCGAGT ACTAAAAGAG  TTCGTATAGT TTTCTATTTT ACACTGATAC CAGCTTGTCT TATCATTTGA TACTTGATCC TACGCATTAT ATATCGTATG TGGACTATAA ACTTCTATCT GTACCTCTTT CTTAAGAATG  TACTTAGTAA TTAGTTTCAT TGAACAGGAA ATAGAGGTTC GTCGCTTTGC TGGTACTGTA CCAAATGCGA CAACTACTGG CGATATAGAA AGCATGGCGA TGTATGCTGG TGAGAGCATT 
GGTCTTATCA AGGAAATTCT ACCCGCAGGT GAAGTGATAA AGAGGATCGT TGAAAGGGCT CAACGACTGA TTGACCAACA ATTTGCTCAA GTCAGCAGGA CACAGAACAA CTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGA GAGGAATATT GGGTTTTGAG TATGGGATTG TTCAAGCACC CTTGGGACCT GATATCTCAA GTCCACAACT TGTTGCTGCT GTTGCTAATG CTGGTGCTCT TGGTTTCCTC  AGAGTCCCTG ATTGGGAAGA TCCTGATTAT GTGAGAGAGC TCATAAGAAA GACTAGAACC TTAACTAACA AGCCATTTGG GATAGGTGTT ATTCTTGCAT TTCCTCACAA GGAAAATGTA  AAAGCTATAC TGGATGAGAA GGTTGCAGTA TTGCAGCTTT ATTGGGGTGA ATGTTCAAAG GAGTTGGTTC TTAAAGCTCA TAAAGCTGGG GTCAAAGTTG TACCACAAAT TGGCAGCTAT  GAAGAAGCAA AGAAAGCTGC TGATGCTGGT GTAGATGCAA TTATTGTCCA AGGTCGGGAC GCAGGAGGCC ATGTAATTGG CCAGGATGGT TTAATCACCT TATTGCCTAG AGTAGTCGAT  CTTGTTCGTG GTCGTGACAT AGCAGTAATT GCTGCTGGAG GAATAGTGGA TGAGCGTGGT TATGTTGCTG CTCTGGCCCT TGGTGCACAG GGTGTTTCAT TAGGTACCAG GTTTCTTGCA  ACAGAGGAAA GCTATGCTCA CCCAACGTAC AAGAGGAAGC TGATTGAATT TGATCAAACA GAGTACACAG ACGTATTTGG TCGTGCAAGG TGGCCAGGGG CACCACAACG TGTTCTGGCA  ACCCCCTTCT TCATGGAATG GAAGGCGCTC CCAAGTCATG AGAATGAGTC AAATCAACCT GTCATTGGCC GCACAATCAT ACATGGCAGG GAAATAGAGG TTCGTCGCTT TGCTGGTACT  GTACCAAATG CGACAACTAC TGGCGATATA GAAAGCATGG CGATGTATGC TGGTGAGAGC ATTGGTCTTA TCAAGGAAAT TCTACCCGCA GGTGAAGTGA TAAAGAGGAT CGTTGAAAGG 
GCTCAACGAC TGATTGACCA ACAATTTGCT CAAGTCAGCA GGACACAGAA CAACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCATATTTC ACAAGAGTAG ACAACTTTGT TGCGAATTCT ATTAAAAAAA AGAAAAGAAA AAGTGCACAT GACATAAGGC CGTTAAAAAT GTGAAATAAT TGGTGCCAGA AACATTGAAT  TTCGTTTATA GAAATGGGTT TGAGAGGAAT ATTGGGTTTT GAGTATGGGA TTGTTCAAGC ACCCTTGGGA CCTGATATCT CAAGTCCACA ACTTGTTGCT GCTGTTGCTA ATGCTGGTGC  TCTTGGTTTC CTCAGAGTCC CTGATTGGGA AGATCCTGAT TATGTGAGAG AGCTCATAAG AAAGACTAGA ACCTTAACTA ACAAGCCATT TGGGATAGGT GTTATTCTTG CATTTCCTCA  CAAGGAAAAT GTAAAAGCTA TACTGGATGA GAAGGTTGCA GTATTGCAGC TTTATTGGGG TGAATGTTCA AAGGAGTTGG TTCTTAAAGC TCATAAAGCT GGGGTCAAAG TTGTACCACA  AATTGGCAGC TATGAAGAAG CAAAGAAAGC TGCTGATGCT GGTGTAGATG CAATTATTGT CCAAGGTCGG GACGCAGGAG GCCATGTAAT TGGCCAGGAT GGTTTAATCA CCTTATTGCC  TAGAGTAGTC GATCTTGTTC GTGGTCGTGA CATAGCAGTA ATTGCTGCTG GAGGAATAGT GGATGAGCGT GGTTATGTTG CTGCTCTGGC CCTTGGTGCA CAGGGTGTTT CATTAGGTAC  CAGGTTTCTT GCAACAGAGG AAAGCTATGC TCACCCAACG TACAAGAGGA AGCTGATTGA ATTTGATCAA ACAGAGTACA CAGACGTATT TGGTCGTGCA AGGTGGCCAG GGGCACCACA  ACGTGTTCTG GCAACCCCCT TCTTCATGGA ATGGAAGGCG CTCCCAAGTC ATGAGAATGA GTCAAATCAA CCTGTCATTG GCCGCACAAT CATACATGGC AGGGAAATAG AGGTTCGTCG  CTTTGCTGGT ACTGTACCAA ATGCGACAAC TACTGGCGAT ATAGAAAGCA TGGCGATGTA TGCTGGTGAG AGCATTGGTC TTATCAAGGA AATTCTACCC GCAGGTGAAG TGATAAAGAG  GATCGTTGAA AGGGCTCAAC GACTGATTGA CCAACAATTT GCTCAAGTCA GCAGGACACA GAACAACTAG GTATCAAATT GTTATTAGGT GGTGGACTTT ACTGGTTTGT AACCTATAAA  GTTGAACCAA ACACACATTA TGTGCCAAGA GTCCACTTAA ATGAATCCAA AAATGAAAAA TAAACAACGA AAATAAGAAA TTGTACATGA ATAAAGAATG GAGTGATAAG AAATTGTACT 
TAGGAGTTGT GATTTACCAC CCTCCAATAT GCTTTTTGTT TACTTGATAC TCCCACTCTC GACACATCTA TTAATAAAAC AATTATTAAT ATAGTT 

Retrieve as FASTA