Entry information : LePrxQ01(Solyc07g042440.2)
Entry ID 15919
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrxQ01(Solyc07g042440.2)
Name LePrxQ01(Solyc07g042440.2)
Class Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type Q)    [Orthogroup: PrxQ001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrxQ01
start..stop
S start..stop
NtPrxQ01-1B 365 1e-130 1..213 1..214
NtPrxQ01-1A 365 1e-130 1..213 1..216
NtPrxQ02-1B 359 2e-128 1..213 1..210
PtPrxQ01 325 6e-115 1..213 1..213
Literature and cross-references LePrxQ01(Solyc07g042440.2)
Protein sequence: LePrxQ01(Solyc07g042440.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   213
PWM (Da):   %s   23525.28  
PI (pH):   %s   9.96
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLSVSVKH TLPSLLQYAQ TPKKPISQNL TIVSRSSQSH FYGLEVLHSP SFSTPSSSRT SIVAKVNKGS APPPFTLKDQ DGKNVSLSKF KGKPVVVYFY PADETPGCTK QACAFRDSYE 
KFKKAGAQVV GISGDDIESH KAFAKKYRLP FTLLCDEGNK VRKEWGIPGD LFGTLPGRQT YVLDKNGVVQ LIYNNQFQPE KHIDETLKLL QSL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTC TATCGGTCTC TGTAAAACAC ACTCTTCCTT CTCTGCTCCA ATATGCTCAA ACCCCAAAAA AACCCATCTC CCAAAACCTT ACCATTGTCT CCAGATCATC ACAATCCCAT  TTTTATGGCC TTGAAGTCCT TCATTCACCT TCTTTTTCAA CCCCATCTTC TTCAAGAACT TCAATTGTTG CTAAGGTAAA TTGCATTGCA TTTGTCTTGC ATCTTCCGTT TTTCATGCGG  ATAAAATTTT GTTTTGATAT TTGTAGGTGA ATAAAGGTTC AGCGCCTCCA CCATTCACAT TGAAAGATCA AGATGGAAAA AATGTGAGTC TCTCCAAGTT TAAAGGAAAG CCTGTGGTGG  TTTATTTCTA CCCTGCTGAT GAAACTCCTG GTTGCACCAA ACAGGTATAG ATAGACAATT TGATTTTCCA GTTCCCTGTT ACCTGTGAAA TTTCACTTTC ATGGAGAAAA CAGTTATGCT  TTATTCATAG TGTACTGATG AATTTATTCT TGAAAATAAT GAATTGTAGA TTAAAATTAG GTACATGGTT AAGGATAATA TGAAGCTTAA GGTACTTGAA TTGCAAGAAT GACCTGACCT  ATTTGTAGCT TGCCAATACA TTAGGTCCGT GTTTCAGAAT CAATTATTGC AACCTTTGAA ATGACATTGT TATGAGATGT TGATTTGAAG TAGAAACCAA ACATGGATAT AGACGAACGA  TTTGAACAAT GGAGTTGTGT TTCTAAACAC CTTTATAGGC TAGCGTAGAA AACGAGTTTC CTTTTAATGG TTCTGGTGGC ACATCCTCTT AAAAGTTATA AGATAGACTT ACTGTTTGAA  CCATCATACG GAAATCACTG GAGAATTGCT TCATCCTTCT TAATTTATAT AGTTTTATTA AATTTCTATT ATCCTGACCA ACTGTTTTGT TCGTTTCTAG TTTATAGTGG TTGAAAATTG  AAGTTGTGGA GTTACAGCAA GTCAGCAACA ACTTCATGAA TAGTTGATAG ATTACATTGA ACTATTATTT TCAATTTCAC AACTTTGTAG CAATGATCTT CAGAAGTTAC CTGGAGCTAA  CCAATATGTA AAAACTGTCT GCAGGCATGT GCCTTCAGGG ACTCTTATGA AAAATTCAAG AAAGCAGGGG CTCAAGTTGT TGGAATTAGT GGTGATGATA TTGAATCCCA CAAGGTATTA  CAGATTGACT TGCTCAATGC ATTAAACAGC TAAATATTCT GTTGTCTGGA ACTTTATTTC TATTGCAGGT TAACTGGAGA ATGCTAGTTC TCCTAAACCA AATTACATTA TTCTTGCTCT  TCCTTCGTGT CCTTATGTAG GACGAATTGA CTATTTGAAA TACCTATTCT GTTCCACAGA GTATTATAAA TACGAATAAC TAGAAGTAAT TTTATAGTTT CTTTCAAAGA CAATCTCAGG  TAGAGGTAAG GTTTGTATAC TATCTACTCT CCCAGACTCC ACTTGAGGGA CTATACTAGG TATGCTATAG TTGTAGAGAA CTAGTAAACA ATCTGGGGCT TTAGTGTCAC AGAGCTGAAA  TACAATGTTA TTAGGAAGCT CTGGCAATAA CGTATGCATT GCCTGATAAA ATAGGAAAAA ACAAAGGAAA AGTAGTAGTC TGACTGTCCC TTTAAAGTTA TGAGGATCCT TTGGGTGATT  AAACATGGTA AAAATCTTTC AAGGAGCATT TGTTGAGATT TCTGAAAATG TACACTCACT ACTAAATGTC TGAATTTGAC ATTACCAGTT TCAAAAAAAA CTAAATGTCT GAATTTGTGA  TTGTGTTTTG TTTCTTCTCA TGTCAAGGAT ATACTCCTAG TTATCCTGTA TTCTGAACTT CTTTATTAGA TATTGCCTCA CCTTTCACTA TTGTTCTCTA GATTTAGGAT GCGTAGTGTT  GTTGACCTCT TGTAAGGATA TCTGACATGT TTTATTCTGC AGGCCTTTGC AAAGAAGTAC AGGCTCCCAT TTACCTTGTT GTGTGATGAA GGCAACAAAG TTAGGAAAGA GTGGGGAATC  CCGGGAGACC TTTTTGGTAC ATTGCCTGGT AGACAGACTT ATGTGCTTGA CAAGAATGGA GTGGTTCAAC TCATATATAA TAATCAGTTC CAACCTGAAA AGCATATTGA TGAGACATTG 
AAGTTACTTC AAAGTCTTTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTC TATCGGTCTC TGTAAAACAC ACTCTTCCTT CTCTGCTCCA ATATGCTCAA ACCCCAAAAA AACCCATCTC CCAAAACCTT ACCATTGTCT CCAGATCATC ACAATCCCAT  TTTTATGGCC TTGAAGTCCT TCATTCACCT TCTTTTTCAA CCCCATCTTC TTCAAGAACT TCAATTGTTG CTAAGGTGAA TAAAGGTTCA GCGCCTCCAC CATTCACATT GAAAGATCAA  GATGGAAAAA ATGTGAGTCT CTCCAAGTTT AAAGGAAAGC CTGTGGTGGT TTATTTCTAC CCTGCTGATG AAACTCCTGG TTGCACCAAA CAGGCATGTG CCTTCAGGGA CTCTTATGAA  AAATTCAAGA AAGCAGGGGC TCAAGTTGTT GGAATTAGTG GTGATGATAT TGAATCCCAC AAGGCCTTTG CAAAGAAGTA CAGGCTCCCA TTTACCTTGT TGTGTGATGA AGGCAACAAA  GTTAGGAAAG AGTGGGGAAT CCCGGGAGAC CTTTTTGGTA CATTGCCTGG TAGACAGACT TATGTGCTTG ACAAGAATGG AGTGGTTCAA CTCATATATA ATAATCAGTT CCAACCTGAA 
AAGCATATTG ATGAGACATT GAAGTTACTT CAAAGTCTTT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATAATATTT GAATTCAAAT TGTATACTTT ATTATATCTA CACATATAGA TGGTGAATAA TGCACCACGT CAAAAACCCC ATCTCTTCTT CACCCAAACT CTATAGTCAC TGCCTCCTTA  TCTCTCTAAG TATACAAGAC CAACAATCTG CTAATAATAC AAATTTCACT ATCATCATCA CATAGTAGAA AGAGAGAAAA AAATGGCTTC TCTATCGGTC TCTGTAAAAC ACACTCTTCC  TTCTCTGCTC CAATATGCTC AAACCCCAAA AAAACCCATC TCCCAAAACC TTACCATTGT CTCCAGATCA TCACAATCCC ATTTTTATGG CCTTGAAGTC CTTCATTCAC CTTCTTTTTC  AACCCCATCT TCTTCAAGAA CTTCAATTGT TGCTAAGGTG AATAAAGGTT CAGCGCCTCC ACCATTCACA TTGAAAGATC AAGATGGAAA AAATGTGAGT CTCTCCAAGT TTAAAGGAAA  GCCTGTGGTG GTTTATTTCT ACCCTGCTGA TGAAACTCCT GGTTGCACCA AACAGGCATG TGCCTTCAGG GACTCTTATG AAAAATTCAA GAAAGCAGGG GCTCAAGTTG TTGGAATTAG  TGGTGATGAT ATTGAATCCC ACAAGGCCTT TGCAAAGAAG TACAGGCTCC CATTTACCTT GTTGTGTGAT GAAGGCAACA AAGTTAGGAA AGAGTGGGGA ATCCCGGGAG ACCTTTTTGG  TACATTGCCT GGTAGACAGA CTTATGTGCT TGACAAGAAT GGAGTGGTTC AACTCATATA TAATAATCAG TTCCAACCTG AAAAGCATAT TGATGAGACA TTGAAGTTAC TTCAAAGTCT  TTAAACGTCA AGGCTGTACA ACGACTTATA TTTCATAGAT GCCAAAGGAG CTGTTAGTTT AAAGTCATTC TACAATTTAT GTTGTAGAAT GTTGAACTCG GTCTCCCGCG AGAGATAAAT  TTGTATATGG GCCTTTGCTA TGGTTGTAGT AACTGCATAA TGGAGAATTT TCTTCAATTG GCACTTCTTA CAGTTGTTGA AACCCCAACA GTGGTGGATC ATATAGTAAA TTGTAAATGA  GAATGGAGTC ACTTGTGATG ATCTTGAAAT ATTAATCTTT ATTCATTACT TTTACTGATA AAAATAGAAG TTCTAAGTCA TAAGCTGAGG TATTTAACAT TTGTGGATAC CTTGCTTGAC 

Retrieve as FASTA