Entry information : LeGOX09(Solyc03g122140.2)
Entry ID 15922
Creation 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGOX09(Solyc03g122140.2)
Name LeGOX09(Solyc03g122140.2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGOX09
start..stop
S start..stop
LeGOX04 586 0 24..363 3..343
HaGOX06 570 0 1..363 5..369
LeGOX03 566 0 24..363 3..343
HaGOX05 562 0 1..363 1..364
Literature and cross-references LeGOX09(Solyc03g122140.2)
mRNA ref. GenBank:   DB688486.1 [5' end]
Protein sequence: LeGOX09(Solyc03g122140.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   363
PWM (Da):   %s   39382.62  
PI (pH):   %s   7.85
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGEPVNVNE FEELARQVLP KISYDFFSGG AEDQHTLKQN IEAFRRITIR PRILVDVSKI DMSTIILGHK TSAPIIVAPT SSHQLAHPEG EVATARGAAA CNVIMGVAFT STCTMEEVAS  SCKAVRFIQT FAFKREITAN MVQRAERNGF RAIILTADTP RLGRKEADIK NKMIAPPFKN FEGLISTVAV SDKGSNVEAY AAETLDPSFC WKDIAWLKSI TKLPILIKGV LTGEDATKAI  EAGVAGIIVS NHGARQLDYT PATISALEEV VHAVQVKVPV LFDGGIRRGT DIFKALALGA KAVLIGRPVI YGLAAKGETG VKQVIEMLKN ELEQTMALAG CRTVDDITRS HVNTETERME 
CRM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGGTG AACCAGTTAA CGTGAATGAA TTTGAAGAGC TAGCTAGGCA AGTTCTTCCA AAGATATCCT ATGACTTCTT TTCTGGAGGA GCTGAGGACC AGCACACACT CAAACAAAAT  ATTGAAGCAT TTCGTAGAAT CACGTAAGTT TGTAACTTCT TGCTCTTGAT TAGGTAATAG AGATCACAGC ACTAACCTTT TAGAAACTCA GTATCCGGCC AAGAATACTA GTTGATGTGA  GCAAAATTGA TATGTCAACT ATTATACTCG GTCACAAGAC ATCAGCTCCA ATTATAGTTG CCCCAACTTC GTCGCATCAA TTGGCACATC CTGAAGGTTC GGATAAATCA ATTAGTAAAA  CCTAGTATGT TAGCTTAAGG TACCCCCACC GCGTAGTTCT TACTCCAAAA AGCTGTTGTA TTTATGCCAG GAGAAGTTGC AACAGCTAGA GGTGCTGCAG CATGTAATGT TATCATGGTA  ATGGTTTTGG TTTGGTAAAA AACATACCTA AAGTATCTAC TTTGAGTTCC ATACTTGAAC TACCATGTGT GCAAGTTTAC CAACTATTTA ACAAAAAACA ATTCAACTAT CAGGTAGGAA  TATGGAACAT TTGATAGTTG AGGTATCTTT TGATACATAG TTGGTGATAG TTTAAGTAGG AAACTCACAC ACATAATAGT TCAGTTATTG AACTCAAAAA AGCAGGATAC TTGTAGCTAT  ATTTTTGACC CTTCCGTCTA ATATTTTCTA AAAAAACAGA TCAAGTTCGA ATTCTGGTAT GTGAATGCTA AATTCTCTTG GATGTAGGGA GTGGCATTTA CGTCAACATG CACAATGGAG  GAGGTTGCTT CAAGCTGCAA GGCTGTTCGC TTCATTCAGA CTTTCGTAAC TTACTATCCC CAACTCTCAC ATCCCGGTAC ATATTTACTG ATTTTTGTGT TCTACAAAAG ATAGGTAATT  TTTTTTTCTT TGAAAATAGG CTTTCAAGAG AGAGATAACA GCAAATATGG TACAGAGAGC TGAACGCAAT GGGTTCAGGG CTATAATACT CACTGCTGAT ACTCCCAGGC TAGGTAGAAA  GGAGGCAGAT ATAAAGAATA AGTAAGTTGT ATATACAATT GTTGTCATTC AAGAATCAAC TCTAGCTAAA ATCCTTTTCA TGATTCATCT TCACTCTAAT CCGGAATAGT CGGTTTCATC  ATTCAGTACT TGAAAAATAT ATATAATTTT GGTAATCTAT GTTGATAAAG AGAACAAATG CAGGATGATT GCACCTCCTT TCAAGAACTT TGAAGGTCTT ATATCTACTG TAGCTGTTTC  TGTAAGTAAA AGCAATTATT AGACATATTG ACAACTTAAG CTGAAAAGCA AAACTTGAAA CTCCTCAAAG AAACTTAGTT TGCAGGACTA CAATGTGTCA AATTAGCTGG TTCCTTCTAC  TATAAGCATT AGTTTTCTTT TTTATTTTGT TATATAACAC AATTTCCATC GATATATCTA CTTGAAAAAT ACTGTACACT AGGCTTACTA ATCCACGGAT AAAATTCTGC AGGACAAAGG  CTCAAATGTT GAAGCTTACG CTGCAGAAAC TCTTGATCCT TCGTTTTGCT GGAAGGTACA AAATTTAAAA GTTTAGCATA TGTGTTCCTT AATACCACAT GAAATGATCA TATGATGAAA  TATATTCTTG GTCCTTGAAT GCAAATTATA TTGAGGCTGT CAACATTTGT TAAAAGTACA TTACGGAAGG AGCATTTCTA GTTTCATAGT CTTCTGTAAC CTCACAATCT CCAAAAACTT  TGCAGGATAT AGCATGGTTA AAATCAATTA CCAAGTTGCC AATTCTGATT AAGGGTGTTC TCACTGGTGA AGATGGTAAT AATTTTACCT TATGTCAACA GAAACTCTAA TCAGCTCTAT  ATGATTTGAC AAATATACAC TATAAACTTG ATTCTGCAAC TAAGTCTCAC CAATTGAGCA TTTCTTCCAA AGAATTTTTT TCATACAATT CTTTGCAGCA ACCAAAGCAA TTGAAGCAGG  AGTTGCAGGA ATAATTGTCT CTAACCATGG AGCTCGGCAG CTGGATTACA CTCCAGCTAC TATTTCTGCT CTTGAAGAGG TGATTTTCTT CCTTACATGT TTGATGTCCT CTTTTTAGCT  AGTGTATTGG CTTCCATATA TTCCTTCCTG AATGTCCAAA TGGTTTCAGG TGGTCCATGC TGTTCAAGTT AAAGTTCCAG TTCTTTTCGA TGGAGGAATT AGGCGAGGAA CTGACATATT  CAAGGCGTTA GCACTAGGCG CTAAAGCTGT TCTGGTGAAC TTAATGATTT ACAGAAATGT ATTTAGCTTA TATATGCTAA GAGTGTATTG AAATTAACTT AATGTTTAAA CTCTACAGAT  TGGTCGACCA GTCATCTACG GCCTAGCTGC TAAGGGGGAG ACCGGGGTAA AACAAGTTAT AGAAATGCTC AAGAATGAAT TGGAGCAGAC CATGGCTCTT GCTGGCTGCC GCACTGTGGA 
TGACATTACC AGAAGCCATG TTAATACAGA GACCGAAAGG ATGGAATGTA GGATGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGGTG AACCAGTTAA CGTGAATGAA TTTGAAGAGC TAGCTAGGCA AGTTCTTCCA AAGATATCCT ATGACTTCTT TTCTGGAGGA GCTGAGGACC AGCACACACT CAAACAAAAT  ATTGAAGCAT TTCGTAGAAT CACTATCCGG CCAAGAATAC TAGTTGATGT GAGCAAAATT GATATGTCAA CTATTATACT CGGTCACAAG ACATCAGCTC CAATTATAGT TGCCCCAACT  TCGTCGCATC AATTGGCACA TCCTGAAGGA GAAGTTGCAA CAGCTAGAGG TGCTGCAGCA TGTAATGTTA TCATGGGAGT GGCATTTACG TCAACATGCA CAATGGAGGA GGTTGCTTCA  AGCTGCAAGG CTGTTCGCTT CATTCAGACT TTCGCTTTCA AGAGAGAGAT AACAGCAAAT ATGGTACAGA GAGCTGAACG CAATGGGTTC AGGGCTATAA TACTCACTGC TGATACTCCC  AGGCTAGGTA GAAAGGAGGC AGATATAAAG AATAAGATGA TTGCACCTCC TTTCAAGAAC TTTGAAGGTC TTATATCTAC TGTAGCTGTT TCTGACAAAG GCTCAAATGT TGAAGCTTAC  GCTGCAGAAA CTCTTGATCC TTCGTTTTGC TGGAAGGATA TAGCATGGTT AAAATCAATT ACCAAGTTGC CAATTCTGAT TAAGGGTGTT CTCACTGGTG AAGATGCAAC CAAAGCAATT  GAAGCAGGAG TTGCAGGAAT AATTGTCTCT AACCATGGAG CTCGGCAGCT GGATTACACT CCAGCTACTA TTTCTGCTCT TGAAGAGGTG GTCCATGCTG TTCAAGTTAA AGTTCCAGTT  CTTTTCGATG GAGGAATTAG GCGAGGAACT GACATATTCA AGGCGTTAGC ACTAGGCGCT AAAGCTGTTC TGATTGGTCG ACCAGTCATC TACGGCCTAG CTGCTAAGGG GGAGACCGGG  GTAAAACAAG TTATAGAAAT GCTCAAGAAT GAATTGGAGC AGACCATGGC TCTTGCTGGC TGCCGCACTG TGGATGACAT TACCAGAAGC CATGTTAATA CAGAGACCGA AAGGATGGAA 
TGTAGGATGT AG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAGGTGGAG ATGCTGGAAA ACTAAACTCC TTTCTGTATT CTTATATTCT TGCCTCAAAA CCTCCGATTC TGCTCTCAAA AGAACCAAAA TTCAGTGATT TAACATATAA ATGCATAAAT  GGCAGGTGAA CCAGTTAACG TGAATGAATT TGAAGAGCTA GCTAGGCAAG TTCTTCCAAA GATATCCTAT GACTTCTTTT CTGGAGGAGC TGAGGACCAG CACACACTCA AACAAAATAT  TGAAGCATTT CGTAGAATCA CTATCCGGCC AAGAATACTA GTTGATGTGA GCAAAATTGA TATGTCAACT ATTATACTCG GTCACAAGAC ATCAGCTCCA ATTATAGTTG CCCCAACTTC  GTCGCATCAA TTGGCACATC CTGAAGGAGA AGTTGCAACA GCTAGAGGTG CTGCAGCATG TAATGTTATC ATGGGAGTGG CATTTACGTC AACATGCACA ATGGAGGAGG TTGCTTCAAG  CTGCAAGGCT GTTCGCTTCA TTCAGACTTT CGCTTTCAAG AGAGAGATAA CAGCAAATAT GGTACAGAGA GCTGAACGCA ATGGGTTCAG GGCTATAATA CTCACTGCTG ATACTCCCAG  GCTAGGTAGA AAGGAGGCAG ATATAAAGAA TAAGATGATT GCACCTCCTT TCAAGAACTT TGAAGGTCTT ATATCTACTG TAGCTGTTTC TGACAAAGGC TCAAATGTTG AAGCTTACGC  TGCAGAAACT CTTGATCCTT CGTTTTGCTG GAAGGATATA GCATGGTTAA AATCAATTAC CAAGTTGCCA ATTCTGATTA AGGGTGTTCT CACTGGTGAA GATGCAACCA AAGCAATTGA  AGCAGGAGTT GCAGGAATAA TTGTCTCTAA CCATGGAGCT CGGCAGCTGG ATTACACTCC AGCTACTATT TCTGCTCTTG AAGAGGTGGT CCATGCTGTT CAAGTTAAAG TTCCAGTTCT  TTTCGATGGA GGAATTAGGC GAGGAACTGA CATATTCAAG GCGTTAGCAC TAGGCGCTAA AGCTGTTCTG ATTGGTCGAC CAGTCATCTA CGGCCTAGCT GCTAAGGGGG AGACCGGGGT  AAAACAAGTT ATAGAAATGC TCAAGAATGA ATTGGAGCAG ACCATGGCTC TTGCTGGCTG CCGCACTGTG GATGACATTA CCAGAAGCCA TGTTAATACA GAGACCGAAA GGATGGAATG  TAGGATGTAG TTTAATCCTA TGTTCCTCTA AATAAACGGC TTATTAGCGC TAAACTCCAT AATCATGTCA CGTCTTGCTT TCTAATAATC CTCTGTGTAG TAGCATTTCT GCTCTTCTCC  ACTAACTAAA TCCTTGTATA GGATTGTGAT AATTTCCTTA TGGTTACTGC AGTGGCCTAG CCACATAAAA TAAAGGTTCA TCCATTGAAC ACATTTCATC GAAAAGTTAA TACTCTATAC 
ATAATACATA AATAT 

Retrieve as FASTA