Entry information : LeGPx09 (Solyc08g068800.2)
Entry ID 15928
Creation 2019-10-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LeGPx09 (Solyc08g068800.2)
Name (synonym) LeGPx09 (Solyc08g068800.2)
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGPx09
start..stop
S start..stop
LuGPx211 105 5e-28 41..245 39..239
PtGPx01 105 9e-28 25..245 15..230
NtGPx01-1B 101 2e-26 2..245 1..232
GhGPx01 100 1e-25 47..245 43..237
Literature and cross-references LeGPx09 (Solyc08g068800.2)
Protein sequence: LeGPx09 (Solyc08g068800.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27938.3  
PI (pH):   %s   9.95
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMSSMVLSSP LSGLSHSKLI IFSNKYSSSP SKAHCIYFSN KISLESSSKS SFIHGDFTVP SPNLSTFVSK SSSSNTITAQ TSPLGEHVIY DFQAKEKKRG LSLGCFRGKV FLIVNIPEQG  SIWTVSQYEL LHYLYDKYKS QGFEIAAFRY NKKETDKAGY SNAQKAPSGG QQQIKAAKFR VFDKVKINGR RAHPLFVHLR SKFGMGEAIT TEFHKFLVDR NGVPYKSFGL DTPCNVIEEE 
VKHLILEDAD * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from gtenomic. No EST found. Orthologs specific to solenaceae!!!!
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGCT CTATGGTTCT TTCATCACCT TTGAGTGGTC TATCACATTC CAAATTAATA ATATTTTCCA ACAAATACTC TTCTTCACCC TCTAAGGCTC ATTGTATTTA TTTTTCAAAC  AAGATTTCTC TTGAATCCAG CTCCAAATCA TCATTTATAC ATGGTGATTT CACTGTTCCT TCACCAAATC TCTCAACATT TGTATCAAAA TCTTCTTCTT CCAATACTAT CACTGCCCAA  ACCTCTCCAC TTGGTGAACA TGTCATCTAT GATTTTCAAG CTAAGGTATA GTTTTCTTGC TACTTCTTTG TGTTTATAAT ATTTGAAGGT TACTACACCA AAATAGCTTT TAGCGACAAT  AAATATACAT ATTAACAAAG AGTGTTAAAA CTCTTACCAG CATTAGTTAA TGTAAAGATT ATACATCTGG ACCTAACTCA ACCACTAAAC TAGCTCACGA GGGGAGGATT GTCCATATAC  ATATAACGAG ACTAATAGTC AGTTCGCCAA CCGACCAATT TGGGACTTCA ACCGACTATT CTAACATTTC CCTTTACGCC CGATTGGAGC GTGGACCGGG AGAGCGAAGA AGGATAAACC  TAGCTCCGTA AAGATATAAT GCCTAAACCT AATCCACAGG AGACCATCAA TCTATTTTCC AATTATTGTG GAACTTTTAC CCAATAATTA ATTGTTATTT AGATCAAATA TCGCTAAGGG  CTTTCAGAAT ATTTTTCGAA ATGTTATATA TATTTATAAC TAAAATATTA TTCTTCATCA CATACATATG CAGGAAAAGA AAAGAGGTCT CTCTCTCGGT TGCTTTAGAG GAAAAGTTTT  TCTGATTGTC AATATTCCTG AGCAAGGGTA TCCTCTCTTG TCTTGTTTTC ACTTTAATTT TCTTACTTAT GCTTTAAATT ATATTTTTCT TTCAAGTATA TATTTTATTT AGGAAAAATG  CACAAGTACC TCCTTAATCT ATGCTCGAAA TTTCAGAGAC ACACTTGTAC TATACTAAGG TCCTACACCC CCTTGAACTT ATTTTATAAG TAATTTTTTA TCCCTTTTTG AATTTTGTGA  CACTAACTTG AAAAAAAAAG TCGACCAGCG TTGGACCCAC AAGAGAGTGT CACGTAGGCC AAAAGAAGTA AAAAATTATT AATAAAATAA GTTCAGTGAT AATAGAATAT TCGTATAGTA  TAAGCGTTTC TAAAATTTCG AACATAGATA GATACTCGTG CATTATCCCT TTTATTTAAT GAAATGTCTT GTCAAGATAA ATGTATAATT ATTCAAATTC ATTTCTCTAT TATAAAAGCA  ATTGAAATTT TGGTTATGTT GTTTTCAGTT CCATATGGAC AGTGTCGCAG TATGAATTAC TTCATTACCT ATATGACAAG TATAAATCTC AAGGTAATTA AATACATTAA TTAAATCTCA  CTTTGTTCAT ATATATTTCT ATACATTTAT TAACAATATT TTATGTGTTT AACCTCTTTA TTAAACATAA TTTACTTTAA TTCTAAATGT AGGATTTGAG ATAGCTGCAT TTCGCTATAA  TAAGAAAGAA ACAGACAAGG CAGGATATAG TAATGCACAA AAAGCACCAT CAGGGGGCCA ACAACAGATT AAAGCTGCTA AGTTCCGAGT ATTCGATAAG GTTGGTCTTT TATTTTTCTA  TTGTACGTAG TGTTTTCCTA TCACAGTATT TTCATTATAA TGATTCAAAT TTTGAAATTT TAATTAATGA TAGAAAGATA TCTAGTAATA TAGCTCAGAA TAGAAAGATA TCTAGTAATA  TGGCTCGGAA ATGATCTAAT ACGAAAATAA AGTTTTATTT GATCGATCCT TGTGTGTTAA AAATATAACT AAATAATAAA ATATGATTTT GGTCATATAT TTCTTTTCAA CATGATATTA  GAGCATCTCC GATTAAAACA AGAGACTTAA TAGGAAACTC AATATTGTAT TATTTTTTTA ATTCTTCTCG TAAGTTTATA CTAGAAATAT ATTTCCTTTT ATAAAAATTA GTATAGCCAT  TTTCATGTCA GATCACTGAA GGTCAAAATA AAAGATCAAG AAAGAGAAAA AAGAAAAAAA CAAATTTAAC TTTCCTTTTC TTCTGTGTGT TCGATGTTAT TGCAACTGAT TAGAAACACT  TGAACAAGGT TAGTTGAGGA AAATTAAAAG TTACCTAAAT TTGTCTCAAA TAAAAGATAT ATCACGTTGT ATACTAGTGT ATATTACACA TAATTTTACA AAGAGATACA AAGATATACA  AAAGACAGAT ATGTAGTGTC ATATACATGA GGATATATAT CTAAGAATCT AGTGGGGGAT ATACAGACAT TCAACTTCAA TCCATCTCAA ATCATATTCA AACACCATGA AAAATAATGT  TGAAGCTTCT TGTAATTATA ATGTTCCTAA CAAAACTCAG TATCACCAAT TTGTATCATT GACACAAATA AGAAGAGGTC AAATCAAACA TCTCTCTTTA AATATTGATG ATGTGTCTAA  TTTCTTTGAT ACGTGAAGTT AATTACTTTG AAAAAGAATT TACGACGATA TATATTATAT AAAATAAAGG GCGTATGATA TTATTATTTT TTTCTTTTGA TTTTTTTAAA ATTAATAATA  ATGACAGGTT AAAATTAATG GTAGAAGAGC ACATCCATTA TTTGTACATC TAAGGTCAAA ATTTGGTATG GGAGAAGCTA TCACTACTGA ATTCCACAAG TTTTTAGTAG ATAGAAATGG  AGTACCTTAC AAAAGCTTTG GATTGGACAC CCCATGTAAT GTGATCGAGG TATGTTTTCG TTTAATTTAT ATACATCGCG ATATTTGTAA GTGTAAAATT TTTTTAATGT ATGAATATAT 
ATAAATACTT AATTACTTGT AATATTTTCT TCATTAATCA GGAAGAGGTT AAGCACTTAA TCTTGGAGGA TGCAGATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGCT CTATGGTTCT TTCATCACCT TTGAGTGGTC TATCACATTC CAAATTAATA ATATTTTCCA ACAAATACTC TTCTTCACCC TCTAAGGCTC ATTGTATTTA TTTTTCAAAC  AAGATTTCTC TTGAATCCAG CTCCAAATCA TCATTTATAC ATGGTGATTT CACTGTTCCT TCACCAAATC TCTCAACATT TGTATCAAAA TCTTCTTCTT CCAATACTAT CACTGCCCAA  ACCTCTCCAC TTGGTGAACA TGTCATCTAT GATTTTCAAG CTAAGGAAAA GAAAAGAGGT CTCTCTCTCG GTTGCTTTAG AGGAAAAGTT TTTCTGATTG TCAATATTCC TGAGCAAGGT  TCCATATGGA CAGTGTCGCA GTATGAATTA CTTCATTACC TATATGACAA GTATAAATCT CAAGGATTTG AGATAGCTGC ATTTCGCTAT AATAAGAAAG AAACAGACAA GGCAGGATAT  AGTAATGCAC AAAAAGCACC ATCAGGGGGC CAACAACAGA TTAAAGCTGC TAAGTTCCGA GTATTCGATA AGGTTAAAAT TAATGGTAGA AGAGCACATC CATTATTTGT ACATCTAAGG  TCAAAATTTG GTATGGGAGA AGCTATCACT ACTGAATTCC ACAAGTTTTT AGTAGATAGA AATGGAGTAC CTTACAAAAG CTTTGGATTG GACACCCCAT GTAATGTGAT CGAGGAAGAG 
GTTAAGCACT TAATCTTGGA GGATGCAGAT TGA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGCT CTATGGTTCT TTCATCACCT TTGAGTGGTC TATCACATTC CAAATTAATA ATATTTTCCA ACAAATACTC TTCTTCACCC TCTAAGGCTC ATTGTATTTA TTTTTCAAAC  AAGATTTCTC TTGAATCCAG CTCCAAATCA TCATTTATAC ATGGTGATTT CACTGTTCCT TCACCAAATC TCTCAACATT TGTATCAAAA TCTTCTTCTT CCAATACTAT CACTGCCCAA  ACCTCTCCAC TTGGTGAACA TGTCATCTAT GATTTTCAAG CTAAGGAAAA GAAAAGAGGT CTCTCTCTCG GTTGCTTTAG AGGAAAAGTT TTTCTGATTG TCAATATTCC TGAGCAAGGT  TCCATATGGA CAGTGTCGCA GTATGAATTA CTTCATTACC TATATGACAA GTATAAATCT CAAGGATTTG AGATAGCTGC ATTTCGCTAT AATAAGAAAG AAACAGACAA GGCAGGATAT  AGTAATGCAC AAAAAGCACC ATCAGGGGGC CAACAACAGA TTAAAGCTGC TAAGTTCCGA GTATTCGATA AGGTTAAAAT TAATGGTAGA AGAGCACATC CATTATTTGT ACATCTAAGG  TCAAAATTTG GTATGGGAGA AGCTATCACT ACTGAATTCC ACAAGTTTTT AGTAGATAGA AATGGAGTAC CTTACAAAAG CTTTGGATTG GACACCCCAT GTAATGTGAT CGAGGAAGAG  GTTAAGCACT TAATCTTGGA GGATGCAGAT TGACAAAGTT TAAGCATCGA TCTCACGTAG GATGGATGAG TACAAATTCT TTTTAATTAC TTTGACTTCA TGGTGTTTTC TGTTTTTAAC  ATATATACAT TTTCTCTAAC AAATAATAGT TTATTTCTTT GAGAACACAT GTTGAAAATA GGCAAAACTT TGTGTCTGAA TTAGGTTAAT GATGATTTGT TCAAGTTATT ATTCCAGTGC 
AACTGACATA TGCATGCTCC AAGTGTTAAA TTACATATAT AAAATGTTGC GA 

Retrieve as FASTA