Entry information : LeRboh06(Solyc01g099620.2)
Entry ID 15931
Creation 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeRboh06(Solyc01g099620.2)
Name LeRboh06(Solyc01g099620.2)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeRboh06
start..stop
S start..stop
StRboh02 1760 0 1..865 1..867
CcaRboh04 1481 0 12..865 18..887
CsRboh03 1457 0 7..865 14..889
CclRboh03 1457 0 7..865 14..889
Literature and cross-references LeRboh06(Solyc01g099620.2)
EST ref. GenBank:   BI204949.1 [3' end]
Protein sequence: LeRboh06(Solyc01g099620.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   865
PWM (Da):   %s   98667.55  
PI (pH):   %s   9.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIENTTDSV RGSRVGFSGS LVSGKKSARF KDDESYVEIT LDVRDDSVLV QNIKGADHEA ALLASKLEKR PNHTLGSQLS FHLKQVSKEL KRMTSSNKFQ KIDRSKSGAA RALRGLQFMN  RNVGTEGWSE VESRFDQLAV DGMLAKTLFG QCIGMKESSE FAEELFDALA RKRCITSPAV TKDELHEFWE QITDTSFDAR LQTFFDMVDK DADGRITEEE VKEIISLSAS ANKLSKIEDN  SDEYAALIME ELDPGNVGYI ELYNLETLLL QAPSHSMNLS TNSRVLSQML SQKLKPTKER NPFKRCKRRL DYFIEDNWKR IWVMVLWLSI CAGLFTWKFI QYKRRAVFDV MGYCVSVAKG  GAETTKFNMA LVLLPVCRNT ITWLRSRTKL GKIIPFDDNI NFHKVIAFGV AVGVGLHAIS HLTCDFPRLL HATDEEYEPM KPFFGDERPN NYWWFVKGTE GWTGVVMVVL MIIAYVLAQP  WFRRNRLNLP STIKKLTGFN AFWYSHHLFV IVYVLFIIHG YFLYLSKKWY KKTTWMYIAV PMILYACERL LRAFRSGYKA VRILKVAVYP GNVMAVHMSK PQGFKYTSGQ YIFVNCSDVS  SFQWHPFTIS SAPGDDYLSV HIRTLGDWTS QLKTLFSKVC EPPTGDQSGL LRADIGKADY KPRLPKLLID GPYGAPAQDY KKYDVVLLVG LGIGATPLIS IVKDVLNNIN QQKDIEDGTK  GSKKSPFATK RAYFYWVTRE QGSFEWFKGV MDEVSENDQE GLIELHNYCT SVYEEGDARS ALITMLQSIH QAKSGVDIVS GTRVKTHFAR PNWRQVFKRV TINHPDQKIG VFYCGPQGLV 
GELRHLSQDF SHKTDTKFEF HKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequenc efrom genomic and ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCG AAAACACGAC AGATAGTGTG AGAGGATCGA GAGTAGGATT CAGCGGTTCA TTAGTTAGTG GGAAGAAAAG TGCAAGGTTC AAAGATGATG AATCGTATGT AGAGATCACT  CTTGATGTTC GCGATGATTC TGTTTTGGTT CAAAACATTA AAGGTGCTGA TCATGAAGCT GCATTGTTAG CTAGCAAGCT CGAAAAGAGG CCTAACCATA CGCTTGGCTC ACAGCTTTCG  TTTCATTTGA AACAAGTTTC AAAGGAATTG AAAAGAATGA CTTCTTCTAA TAAGTTTCAG AAAATTGATA GGAGTAAGTC TGGTGCTGCT CGTGCTCTAC GTGGACTTCA GTTCATGAAC  AGGAATGTAG GAACTGAAGG ATGGTCTGAA GTTGAATCGC GATTCGATCA ACTTGCTGTT GATGGAATGC TAGCAAAAAC ATTGTTTGGT CAATGCATAG GTTTGTTCAT TACACAAATT  CTTTTGGATT TATACAATAA AAGTTTCTAA TAATTAGCAT TTTTGCAATT GTAATTAAGG TATGAAGGAA TCAAGTGAGT TTGCTGAGGA ATTATTTGAT GCTCTAGCTA GGAAGAGATG  CATCACATCT CCTGCGGTGA CTAAGGATGA ACTGCACGAA TTCTGGGAAC AAATAACTGA TACTAGCTTT GATGCCCGGC TTCAAACTTT CTTCGACATG TAAGATTATG ATCACTCAAC  TAAATAGTTA TATTGTGGTT TTCTGAGATA ATAACTATAT GATGAATCAA CCCTACAACA TAATGAATGC TAAATTGCTA ATGATGTCTT GAACTGTTAC ACTAGTCTAT TACATGCAAC  CTATCGCTCC TACTTTGAAC ATTCTCGATT AAGTTAGAAC TTTGTCATCA GATTCTCAAT AGGATAGATT GTTGATAAAA TGGTATAAGA TATTGTTGAT AGCTCATAAT GGTATGATGA  AAAAAAAATA GGGTGGATAA AGATGCAGAT GGGAGAATTA CTGAAGAAGA GGTGAAAGAG GTGAGAGCTT AAGATGATTA TTGAATTAAT TCATGAAATT ATACAAATTC GAAGAGCTCA  AAACTCATAC TTCGTTGATA TGCTTATAGA TCATCAGTCT TAGTGCTTCT GCAAATAAGC TGTCAAAAAT CGAGGACAAT TCAGATGAAT ATGCAGCTCT CATCATGGAA GAACTAGATC  CAGGCAATGT TGGATACATT GAGGTTCGTT TTGAAACAAG AATTTAAGTT ATATACACTG ACAGTATAAA ACAAATTCTT AGACAAGGAC ATGAGCTTAT AAATGATTGT GTTTGATACA  GCTGTACAAC TTGGAGACTT TGCTTCTTCA GGCCCCGAGC CACTCGATGA ATCTTTCAAC TAACAGCAGA GTTCTGAGTC AGATGCTAAG TCAGAAGCTT AAGCCAACGA AAGAGCGAAA  TCCCTTTAAA AGATGCAAAA GAAGGCTGGA CTATTTCATT GAGGACAATT GGAAGAGGAT TTGGGTGATG GTTTTGTGGC TATCAATCTG TGCAGGACTC TTTACATGGA AATTTATTCA  ATATAAACGT CGCGCTGTCT TTGATGTTAT GGGCTATTGT GTCTCTGTAG CTAAAGGAGG TGCTGAAACA ACAAAATTTA ACATGGCTCT AGTTCTTTTG CCAGTATGCA GAAACACCAT  AACTTGGCTA AGAAGTAGGA CTAAGCTCGG GAAAATAATT CCTTTTGATG ATAACATCAA TTTCCACAAG GTATATAGCC TGAGAATATA AATGGAAACA CGAAATCGTT GAACTTAAAT  GTCTGATTTT TTTCGTGTTC TTTGTTGCAA TCTTTTTTAG GTAATTGCAT TTGGAGTAGC AGTTGGTGTA GGCTTACATG CAATTTCACA CTTAACATGT GATTTTCCCC GGCTGTTACA  TGCCACGGAT GAGGAATACG AGCCAATGAA GCCATTTTTT GGAGATGAAA GACCAAACAA CTACTGGTGG TTTGTGAAAG GCACGGAAGG ATGGACCGGT GTTGTGATGG TTGTCCTTAT  GATCATAGCG TATGTACTAG CCCAACCATG GTTTCGTAGA AACCGACTCA ATCTTCCATC AACAATCAAG AAACTCACTG GATTTAACGC TTTTTGGTAC TCCCATCACT TATTCGTTAT  AGTCTATGTC CTCTTCATCA TTCACGGATA CTTCCTCTAC CTCTCGAAAA AATGGTACAA GAAGACAGTA AGTTCTTAAC AAAATAAATT ATATCTAATG CTAATCATGC CCTGCCTTGC  CATATAATGG ATCTAATATC TTTCTTTTTA CTCTGAAATA TTGAGCAGAC ATGGATGTAT ATCGCGGTGC CTATGATACT ATATGCTTGT GAACGTCTGC TTCGTGCATT TAGGTCCGGG  TACAAGGCAG TGAGGATTTT GAAGGTACAT AAGAGCTTAG ACCATTGCAA GCATTAAGAT TCCTAGTTTG ATTACATGTG CATAGAATTT TTATCTAAAA TTCGAGTTTT CAGGTAGCTG  TATATCCTGG AAATGTAATG GCAGTGCACA TGTCTAAGCC TCAGGGCTTT AAGTACACAA GTGGACAGTA CATTTTTGTG AACTGTTCTG ATGTTTCTTC ATTTCAATGG TAAATTTGAA  ATAAACCAAG CTCCTAATCA AACAAACTGT ATACAAATTA TTATTATTAT TATTACTGCT AAAATCATAC ATATTTTGTA CTGTAGGCAT CCTTTTACCA TCTCCTCAGC TCCGGGAGAT  GATTACCTAA GTGTGCACAT TCGAACATTG GGCGATTGGA CATCTCAGCT TAAAACTCTC TTTTCTAAGG TATCGAATTC ATTAAATCAG TTATAACACA GCAAAGACGA AATCTTTTGA  AGAAACTTTG GAAGACTAAT AATGCTTGTA CTGATCATAT TTTAGGTCTG TGAGCCTCCA ACTGGTGATC AAAGTGGCCT TTTAAGAGCA GATATAGGGA AAGCTGACTA TAAGCCTAGG  TAAGGGAGTA AAGTTTGAAA ATTTCCAAGT GCTTTTAACT TATTTTCCCC TGAATTTTGA TTCATATCAA TGTAAACAGA TTGCCAAAAC TATTGATTGA TGGCCCTTAT GGAGCACCAG  CACAGGATTA CAAGAAATAC GACGTAGTCC TCTTAGTAGG CCTTGGCATT GGAGCAACAC CTTTGATAAG CATAGTAAAA GATGTGCTCA ATAACATCAA CCAACAAAAG GACATTGAAG  ATGGTACTAA GGGTAGTAAA AAAAGTCCTT TTGCAACTAA ACGAGCTTAC TTCTATTGGG TAACACGCGA GCAAGGCTCG TTTGAGTGGT TTAAGGGTGT GATGGATGAG GTCTCGGAGA  ACGATCAAGA AGGCCTAATT GAGCTTCACA ACTACTGCAC CAGCGTTTAT GAAGAAGGCG ATGCCCGGTC TGCACTAATC ACAATGCTTC AATCAATCCA CCAAGCTAAG AGTGGCGTAG  ACATTGTCTC TGGGACAAGA GTCAAGACTC ATTTTGCTAG ACCAAATTGG CGCCAAGTTT TCAAACGTGT TACAATTAAT CATCCTGATC AAAAAATTGG TTAGTACGCA TCTTTGATTA  CTATTCATTA AAATTAAACC GCCTCTCTAC TTCACAAACT AGGGGTAAGG TCGATCTTTC TGGACTATAT TATATCCAGA CCTCACTTAT GAAATTATAC GTGTTAAATT GACATTCTTA  TTTTGAATTT ATGATATTAC AGGTGTGTTT TATTGTGGCC CACAAGGTCT AGTTGGAGAA CTAAGACATC TATCTCAAGA TTTCTCACAC AAGACAGACA CAAAGTTTGA ATTTCATAAA 
GAAAATTTCT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCG AAAACACGAC AGATAGTGTG AGAGGATCGA GAGTAGGATT CAGCGGTTCA TTAGTTAGTG GGAAGAAAAG TGCAAGGTTC AAAGATGATG AATCGTATGT AGAGATCACT  CTTGATGTTC GCGATGATTC TGTTTTGGTT CAAAACATTA AAGGTGCTGA TCATGAAGCT GCATTGTTAG CTAGCAAGCT CGAAAAGAGG CCTAACCATA CGCTTGGCTC ACAGCTTTCG  TTTCATTTGA AACAAGTTTC AAAGGAATTG AAAAGAATGA CTTCTTCTAA TAAGTTTCAG AAAATTGATA GGAGTAAGTC TGGTGCTGCT CGTGCTCTAC GTGGACTTCA GTTCATGAAC  AGGAATGTAG GAACTGAAGG ATGGTCTGAA GTTGAATCGC GATTCGATCA ACTTGCTGTT GATGGAATGC TAGCAAAAAC ATTGTTTGGT CAATGCATAG GTATGAAGGA ATCAAGTGAG  TTTGCTGAGG AATTATTTGA TGCTCTAGCT AGGAAGAGAT GCATCACATC TCCTGCGGTG ACTAAGGATG AACTGCACGA ATTCTGGGAA CAAATAACTG ATACTAGCTT TGATGCCCGG  CTTCAAACTT TCTTCGACAT GGTGGATAAA GATGCAGATG GGAGAATTAC TGAAGAAGAG GTGAAAGAGA TCATCAGTCT TAGTGCTTCT GCAAATAAGC TGTCAAAAAT CGAGGACAAT  TCAGATGAAT ATGCAGCTCT CATCATGGAA GAACTAGATC CAGGCAATGT TGGATACATT GAGCTGTACA ACTTGGAGAC TTTGCTTCTT CAGGCCCCGA GCCACTCGAT GAATCTTTCA  ACTAACAGCA GAGTTCTGAG TCAGATGCTA AGTCAGAAGC TTAAGCCAAC GAAAGAGCGA AATCCCTTTA AAAGATGCAA AAGAAGGCTG GACTATTTCA TTGAGGACAA TTGGAAGAGG  ATTTGGGTGA TGGTTTTGTG GCTATCAATC TGTGCAGGAC TCTTTACATG GAAATTTATT CAATATAAAC GTCGCGCTGT CTTTGATGTT ATGGGCTATT GTGTCTCTGT AGCTAAAGGA  GGTGCTGAAA CAACAAAATT TAACATGGCT CTAGTTCTTT TGCCAGTATG CAGAAACACC ATAACTTGGC TAAGAAGTAG GACTAAGCTC GGGAAAATAA TTCCTTTTGA TGATAACATC  AATTTCCACA AGGTAATTGC ATTTGGAGTA GCAGTTGGTG TAGGCTTACA TGCAATTTCA CACTTAACAT GTGATTTTCC CCGGCTGTTA CATGCCACGG ATGAGGAATA CGAGCCAATG  AAGCCATTTT TTGGAGATGA AAGACCAAAC AACTACTGGT GGTTTGTGAA AGGCACGGAA GGATGGACCG GTGTTGTGAT GGTTGTCCTT ATGATCATAG CGTATGTACT AGCCCAACCA  TGGTTTCGTA GAAACCGACT CAATCTTCCA TCAACAATCA AGAAACTCAC TGGATTTAAC GCTTTTTGGT ACTCCCATCA CTTATTCGTT ATAGTCTATG TCCTCTTCAT CATTCACGGA  TACTTCCTCT ACCTCTCGAA AAAATGGTAC AAGAAGACAA CATGGATGTA TATCGCGGTG CCTATGATAC TATATGCTTG TGAACGTCTG CTTCGTGCAT TTAGGTCCGG GTACAAGGCA  GTGAGGATTT TGAAGGTAGC TGTATATCCT GGAAATGTAA TGGCAGTGCA CATGTCTAAG CCTCAGGGCT TTAAGTACAC AAGTGGACAG TACATTTTTG TGAACTGTTC TGATGTTTCT  TCATTTCAAT GGCATCCTTT TACCATCTCC TCAGCTCCGG GAGATGATTA CCTAAGTGTG CACATTCGAA CATTGGGCGA TTGGACATCT CAGCTTAAAA CTCTCTTTTC TAAGGTCTGT  GAGCCTCCAA CTGGTGATCA AAGTGGCCTT TTAAGAGCAG ATATAGGGAA AGCTGACTAT AAGCCTAGAT TGCCAAAACT ATTGATTGAT GGCCCTTATG GAGCACCAGC ACAGGATTAC  AAGAAATACG ACGTAGTCCT CTTAGTAGGC CTTGGCATTG GAGCAACACC TTTGATAAGC ATAGTAAAAG ATGTGCTCAA TAACATCAAC CAACAAAAGG ACATTGAAGA TGGTACTAAG  GGTAGTAAAA AAAGTCCTTT TGCAACTAAA CGAGCTTACT TCTATTGGGT AACACGCGAG CAAGGCTCGT TTGAGTGGTT TAAGGGTGTG ATGGATGAGG TCTCGGAGAA CGATCAAGAA  GGCCTAATTG AGCTTCACAA CTACTGCACC AGCGTTTATG AAGAAGGCGA TGCCCGGTCT GCACTAATCA CAATGCTTCA ATCAATCCAC CAAGCTAAGA GTGGCGTAGA CATTGTCTCT  GGGACAAGAG TCAAGACTCA TTTTGCTAGA CCAAATTGGC GCCAAGTTTT CAAACGTGTT ACAATTAATC ATCCTGATCA AAAAATTGGT GTGTTTTATT GTGGCCCACA AGGTCTAGTT 
GGAGAACTAA GACATCTATC TCAAGATTTC TCACACAAGA CAGACACAAA GTTTGAATTT CATAAAGAAA ATTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAATAATCAC AATTATTCAA AAACAATACA AAATCCGCCC CCTGATTTCC CTCTTGACTT TTCCCTTCTA CCTTAATTCC TTTTATATAT ATATACACAT CACCGTTCTT CTATAATTTC  TCAACATATT ACTATTTTTT CAATCTTTCT CAGAATTTAT TTTTTTTACA TTTTTGTTAC ATAGGTCGAT ACTAGTTATA AATTTCATTT TGAAAAAAAA CAGAGGAAAA AAGAGCGGGA  AAATCAAATG GAGATCGAAA ACACGACAGA TAGTGTGAGA GGATCGAGAG TAGGATTCAG CGGTTCATTA GTTAGTGGGA AGAAAAGTGC AAGGTTCAAA GATGATGAAT CGTATGTAGA  GATCACTCTT GATGTTCGCG ATGATTCTGT TTTGGTTCAA AACATTAAAG GTGCTGATCA TGAAGCTGCA TTGTTAGCTA GCAAGCTCGA AAAGAGGCCT AACCATACGC TTGGCTCACA  GCTTTCGTTT CATTTGAAAC AAGTTTCAAA GGAATTGAAA AGAATGACTT CTTCTAATAA GTTTCAGAAA ATTGATAGGA GTAAGTCTGG TGCTGCTCGT GCTCTACGTG GACTTCAGTT  CATGAACAGG AATGTAGGAA CTGAAGGATG GTCTGAAGTT GAATCGCGAT TCGATCAACT TGCTGTTGAT GGAATGCTAG CAAAAACATT GTTTGGTCAA TGCATAGGTA TGAAGGAATC  AAGTGAGTTT GCTGAGGAAT TATTTGATGC TCTAGCTAGG AAGAGATGCA TCACATCTCC TGCGGTGACT AAGGATGAAC TGCACGAATT CTGGGAACAA ATAACTGATA CTAGCTTTGA  TGCCCGGCTT CAAACTTTCT TCGACATGGT GGATAAAGAT GCAGATGGGA GAATTACTGA AGAAGAGGTG AAAGAGATCA TCAGTCTTAG TGCTTCTGCA AATAAGCTGT CAAAAATCGA  GGACAATTCA GATGAATATG CAGCTCTCAT CATGGAAGAA CTAGATCCAG GCAATGTTGG ATACATTGAG CTGTACAACT TGGAGACTTT GCTTCTTCAG GCCCCGAGCC ACTCGATGAA  TCTTTCAACT AACAGCAGAG TTCTGAGTCA GATGCTAAGT CAGAAGCTTA AGCCAACGAA AGAGCGAAAT CCCTTTAAAA GATGCAAAAG AAGGCTGGAC TATTTCATTG AGGACAATTG  GAAGAGGATT TGGGTGATGG TTTTGTGGCT ATCAATCTGT GCAGGACTCT TTACATGGAA ATTTATTCAA TATAAACGTC GCGCTGTCTT TGATGTTATG GGCTATTGTG TCTCTGTAGC  TAAAGGAGGT GCTGAAACAA CAAAATTTAA CATGGCTCTA GTTCTTTTGC CAGTATGCAG AAACACCATA ACTTGGCTAA GAAGTAGGAC TAAGCTCGGG AAAATAATTC CTTTTGATGA  TAACATCAAT TTCCACAAGG TAATTGCATT TGGAGTAGCA GTTGGTGTAG GCTTACATGC AATTTCACAC TTAACATGTG ATTTTCCCCG GCTGTTACAT GCCACGGATG AGGAATACGA  GCCAATGAAG CCATTTTTTG GAGATGAAAG ACCAAACAAC TACTGGTGGT TTGTGAAAGG CACGGAAGGA TGGACCGGTG TTGTGATGGT TGTCCTTATG ATCATAGCGT ATGTACTAGC  CCAACCATGG TTTCGTAGAA ACCGACTCAA TCTTCCATCA ACAATCAAGA AACTCACTGG ATTTAACGCT TTTTGGTACT CCCATCACTT ATTCGTTATA GTCTATGTCC TCTTCATCAT  TCACGGATAC TTCCTCTACC TCTCGAAAAA ATGGTACAAG AAGACAACAT GGATGTATAT CGCGGTGCCT ATGATACTAT ATGCTTGTGA ACGTCTGCTT CGTGCATTTA GGTCCGGGTA  CAAGGCAGTG AGGATTTTGA AGGTAGCTGT ATATCCTGGA AATGTAATGG CAGTGCACAT GTCTAAGCCT CAGGGCTTTA AGTACACAAG TGGACAGTAC ATTTTTGTGA ACTGTTCTGA  TGTTTCTTCA TTTCAATGGC ATCCTTTTAC CATCTCCTCA GCTCCGGGAG ATGATTACCT AAGTGTGCAC ATTCGAACAT TGGGCGATTG GACATCTCAG CTTAAAACTC TCTTTTCTAA  GGTCTGTGAG CCTCCAACTG GTGATCAAAG TGGCCTTTTA AGAGCAGATA TAGGGAAAGC TGACTATAAG CCTAGATTGC CAAAACTATT GATTGATGGC CCTTATGGAG CACCAGCACA  GGATTACAAG AAATACGACG TAGTCCTCTT AGTAGGCCTT GGCATTGGAG CAACACCTTT GATAAGCATA GTAAAAGATG TGCTCAATAA CATCAACCAA CAAAAGGACA TTGAAGATGG  TACTAAGGGT AGTAAAAAAA GTCCTTTTGC AACTAAACGA GCTTACTTCT ATTGGGTAAC ACGCGAGCAA GGCTCGTTTG AGTGGTTTAA GGGTGTGATG GATGAGGTCT CGGAGAACGA  TCAAGAAGGC CTAATTGAGC TTCACAACTA CTGCACCAGC GTTTATGAAG AAGGCGATGC CCGGTCTGCA CTAATCACAA TGCTTCAATC AATCCACCAA GCTAAGAGTG GCGTAGACAT  TGTCTCTGGG ACAAGAGTCA AGACTCATTT TGCTAGACCA AATTGGCGCC AAGTTTTCAA ACGTGTTACA ATTAATCATC CTGATCAAAA AATTGGTGTG TTTTATTGTG GCCCACAAGG 
TCTAGTTGGA GAACTAAGAC ATCTATCTCA AGATTTCTCA CACAAGACAG ACACAAAGTT TGAATTTCAT AAAGAAAATT TCTAAG 

Retrieve as FASTA