Entry information : LeRboh04(Solyc11g072800.1)
Entry ID 15933
Creation 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeRboh04(Solyc11g072800.1)
Name LeRboh04(Solyc11g072800.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeRboh04
start..stop
S start..stop
LeRboh08 1236 0 15..816 65..830
EgrRboh06 1141 0 14..816 67..857
EglRboh06 1140 0 14..816 67..857
EguRboh06 1138 0 9..816 62..857
Literature and cross-references LeRboh04(Solyc11g072800.1)
Protein sequence: LeRboh04(Solyc11g072800.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   816
PWM (Da):   %s   93609.78  
PI (pH):   %s   9.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGETPIENGG GGRTKMVRIE SGAARGFKSL HFLDNTTGKE ADAWKNVEKR FHINAVNGIL FKDKFGPSIG MKSFFFKKNK IGARGKKGFL STELLNLCDI VFLFFSEMKG MESKEFAEEL  FDTMARRKKI NAENGITIEE LKEFWDDIST HCPDTRLHIF FDMCDKNGDG KLSEEEVKEV LVMSASANKL TNFKKHAATY AALIMEEFDP DHLGYIEIWQ LESLLRGMVG SEDGQNNMKR  SQTLAKTMIP RQYRTPVSKF LSKTSEKIYD NWKRIWVVTL WLSINFILFI WKIEQFKRRE AFKIMGYCVC LAKAAGETLK FNMALILIPV CRRTLTQIRE SFLGYIIPFD DNINFHKMVA  VGITVGAFIH ILFHTSCNFV KLASCPESKF MTALGSNFGY QQPTYMDLVV SVPGVTGILM TLFMLFSFTL ATHSFRRNII KLPGSFHHLA GFNAFWYAHH LLIFVYVLLI LHGCFIFLTN  EWYKKTTWMY LAVPVVLYST ERVLIINENR YHVNIQKAVI YAGNVLALYM TKPPGFKYKS GMYLFVKCPD ISNFEWHPFS ITSAPDEDYL SVHIRTLGDW TTELRTRFEK ACQEAPSKTR  NLVRMETKAY NQKDAEQSQA ENPMIIIKGP YGAPAQNYKK YDILLLVGLG IGATPFISII KDILNQKSGY NQQDDGKKGP QRAYFYWVTR EQGSFDWFKG VMDDIAEHDE NEVIEMHNYL 
TSVYEEGDAR SALITMVQSL QHAKNGVDVV SESRIRTHFS RPNWKRVFAQ LAVTHPSSRI GVFYCGSPTL TKPLKKLCQE FSLNSSTRFN FHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 3 ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGAAA CCCCTATAGA AAATGGAGGA GGAGGAAGAA CAAAAATGGT TAGAATAGAA TCAGGGGCAG CAAGAGGGTT CAAGAGCCTT CATTTTCTTG ATAATACAAC AGGAAAAGAA  GCAGATGCTT GGAAAAATGT TGAGAAAAGA TTTCATATAA ATGCTGTTAA TGGCATTCTT TTTAAAGACA AATTTGGACC CTCTATAGGT ATGAAAAGTT TCTTTTTTAA AAAAAATAAA  ATCGGGGCTA GGGGAAAAAA GGGATTTTTA TCAACTGAGC TACTAAATTT ATGTGATATT GTTTTTTTAT TTTTTTCTGA AATGAAAGGA ATGGAAAGCA AGGAATTTGC AGAGGAGTTG  TTTGATACAA TGGCAAGGAG AAAGAAGATT AATGCAGAAA ATGGGATAAC AATTGAGGAA CTTAAAGAAT TTTGGGATGA TATATCAACT CATTGCCCTG ATACAAGGCT TCATATTTTC  TTTGACATGT GAGAAATTTT CCATTCCTTT TTTTTTGTTT TGTTCACGAT TTGAAGCTTA TGAGTTCTGG ATTCTAATCT TTTAAAGTTA CAGAGTTGTG TGCATATTCA ATAGGATTTT  TAAATATGTA TATATGGTTT GAACTAAAGT ATGGCCTAGC TGGGGGTTAG GGAGGGAAGA AAAACTAATA ACATATGCTG GAGGGCCTAA ACTTGTCAAT CTTGTAGTAC GAATGAATTC  ATGATTTTAA CTTGATGGAT TCAATGTGTA ATGTTCTTAA GATTAAACAC GTTGTACTTT TGAAATTATG AGACCAAAAT TCGATATTTT TTCTTATTTT AGTGGTTTTT CATGCATGTG  TTCAGGGGCG AAGTCAGGTA GGGTCAAGGG TTCATCCAAA TCCCCTTAGA TGAAAACTTA CATTGTAGTA TTATTTTTTA TGCATACATT GTAACTATCG GATCCCCTTA GTGAAAATTC  TTGCTACGTA TTCTAGCTTG AAGATACGGA GTTCAGATGA ACTCGTTGTT TAAAAGCTCC ATTGTTCTTT GTTTTTCAGG TGTGACAAGA ATGGTGATGG GAAACTATCA GAAGAAGAGG  TCAAGGAGGT GAGAAAAACA TACTCACAAG TGAATTTGTT CTTTGTTTAT TTTGGGAGTC AGTCTACTTA ATACTTTTTT GTGAAAGGTT CTAGTGATGA GTGCTTCAGC CAACAAATTG  ACAAACTTCA AGAAACATGC AGCAACATAT GCAGCTTTAA TCATGGAAGA GTTCGATCCT GATCATTTAG GATATATTGA GGTAAAATTC CACTTAAAGT TGCCATCTTT CTATACGAAG  TCGTCTTCTT TTTGTTTTAA AAATTCAACT TTGAAACAGA TATGGCAACT TGAATCTCTA CTAAGAGGAA TGGTTGGATC AGAAGATGGG CAAAATAACA TGAAGAGATC ACAAACATTA  GCAAAAACCA TGATCCCTAG ACAATATAGA ACTCCAGTGA GCAAGTTTTT AAGCAAAACT TCAGAGAAGA TATACGATAA CTGGAAAAGA ATTTGGGTCG TAACGTTGTG GTTGTCCATT  AATTTCATAC TATTTATATG GAAGATTGAA CAATTTAAAA GGAGAGAAGC CTTCAAGATT ATGGGATATT GTGTCTGTTT AGCTAAAGCT GCAGGGGAAA CTCTCAAGTT CAATATGGCT  CTAATTCTCA TTCCAGTATG CCGAAGAACT CTTACTCAGA TTAGAGAAAG TTTCCTTGGT TATATTATAC CTTTTGATGA TAACATCAAT TTTCATAAAA TGGTTGCCGT AGGAATTACT  GTAGGGGCCT TTATTCATAT ATTGTTTCAC ACAAGTTGCA ACTTCGTAAA GTTAGCGTCC TGTCCAGAGA GTAAATTTAT GACAGCTCTT GGAAGCAATT TTGGCTACCA GCAACCAACT  TACATGGATC TAGTAGTATC TGTTCCAGGC GTAACGGGGA TACTAATGAC CCTTTTCATG CTTTTCTCCT TCACACTGGC AACACATTCG TTCCGAAGAA ATATCATCAA ATTGCCTGGC  TCATTTCATC ATTTGGCTGG ATTTAATGCA TTTTGGTATG CACATCATCT GCTGATATTT GTGTACGTGC TCTTGATCCT CCACGGCTGC TTCATATTCC TTACCAACGA ATGGTACAAA  AAGACGGTAT GTCCACTTGC ATTTTGATAA CCTTATCACA CTTGTTAACC TGGTATTGAA AGAAGTACTA GTTCAATTAT GCACACAAAT CATATCGTTG TCCAAATGTT GAGAAAAATG  TAGCATGAAT ATAAGCTCTA TACTCTTGAT ATCTAGTTCA ATGTTTCTTC AAATTAGTTA AAGAATTTTC TATCGAAAAG TCATGATTGA ATGAGCAAAA ATACCTTTAA TATGCAGACA  TGGATGTATC TTGCAGTCCC AGTAGTTCTG TATTCTACAG AAAGAGTTCT TATCATCAAT GAGAACCGCT ACCACGTGAA CATACAAAAG GTTTTAGTTC CAAGAGACTT ATATCAATTC  AAGAAAAACT CTTAGTAATT GCAAAATTTC TAAATTCAGC TTCATTTCTG TGTTGTAAAA CAAAAAATGC AGGCTGTTAT ATATGCAGGG AATGTACTAG CACTATATAT GACTAAACCT  CCAGGATTCA AGTACAAGAG CGGAATGTAC CTGTTCGTTA AATGTCCAGA TATATCAAAC TTCGAATGGT AATTAAAGCA CAAATTCTAA TCAAACATAT TCAATATTGT CAATATCCTT  GTGCTAAGAA ATTTCTATTC GTCTCTTACA GGCATCCATT CTCAATCACT TCTGCACCAG ATGAGGACTA TCTAAGTGTC CACATACGTA CATTAGGAGA CTGGACTACA GAGCTTAGAA  CCAGATTCGA AAAGGTATTA TACTATGCTA ATTTTCATTT CTTAAAACAA CTTTACTCTT CATTTTCTGT GGTGTACAAA ACTTGACCGA GTAAAGAAAG GTATCCAGCC ATATCGTTGA  CGGTTTGACA CATAATTATC ACATAGTAGG CAGATATGTA TTTTATGTCA GGTACTTCTT GCAATGTCTT TGTGTAGGAT AGTAGGAGAC AATTTACTAA GGCATGATTC GTAAAATCAA  GATACATAAT TCGCTGAAAT GAATAAGGAA TTTAAAAGGT TTTTTATTCC TATTGTTCTT TGCTCTTGGG ATCCTAAAGC TCGCATTTAC AGGCATGTCA AGAGGCACCA TCCAAGACGA  GAAATCTTGT TAGAATGGAA ACTAAAGCGT ATAATCAGAA GGATGCGGAA CAATCTCAAG CCGAGTATGC TACAATTATC TATTGCTAAT AGTATCCATC TTATGTTGCT TTGAAACTTA  TATCTTAAAT TTTGAATCAG AAATCCAATG ATCATTATCA AAGGGCCTTA TGGTGCACCA GCTCAGAACT ACAAGAAGTA TGATATCCTT CTACTAGTTG GCTTAGGAAT TGGAGCAACT  CCATTTATCA GCATTATAAA GGACATACTA AACCAGAAAT CGGGATATGT AAGAGCTTAA CCATATAGAA GTATTTTGTT AATAACAACA GCAGAGACAA AAGAAAATAT AACATAATCC  AACAACTGCA GAATCAACAA GATGACGGCA AGAAAGGTCC TCAAAGAGCA TATTTCTATT GGGTGACACG AGAACAAGGA TCATTCGACT GGTTCAAGGG TGTAATGGAT GACATTGCTG  AACACGACGA AAATGTTGGT TTTTGAACCC TGAGATTATG AATAAGTAGT TTCCTCAATT AGCATAAACT CGGACTAATA CACTTTTCAT GCTCATGAAA CTTTAATATT CTCCTGCAGG  AAGTGATAGA AATGCACAAC TACTTGACTA GTGTTTATGA AGAAGGGGAC GCACGATCAG CACTAATCAC AATGGTCCAA TCACTGCAAC ATGCTAAAAA TGGAGTTGAT GTTGTCTCAG  AAAGCCGGGT ATTTTGTTAA GATCTAATGA TCACTACACT ACTAGCTTCA ACTTTTTTAT TAGAACTGTT CTAACACTTG ATTCTCCGAC AGATAAGAAC ACATTTCTCT AGACCAAATT  GGAAAAGAGT GTTTGCTCAA TTAGCTGTTA CACATCCATC ATCTCGCATT GGTAAGCCTC TATTTTTGAA CTACTTCAAG GTTGATTTCA CGGATGGACA CTCAACTACT GTATCATTCA  GTCTATAAAA ACATGTTTAA AACATCACGA TATATTGCAC AGGTGTTTTT TACTGTGGAA GTCCAACACT TACCAAACCA CTCAAAAAGT TGTGTCAAGA ATTTAGCTTA AATTCGTCCA 
CGCGCTTCAA CTTCCACAAA GAGAACTTCT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGAAA CCCCTATAGA AAATGGAGGA GGAGGAAGAA CAAAAATGGT TAGAATAGAA TCAGGGGCAG CAAGAGGGTT CAAGAGCCTT CATTTTCTTG ATAATACAAC AGGAAAAGAA  GCAGATGCTT GGAAAAATGT TGAGAAAAGA TTTCATATAA ATGCTGTTAA TGGCATTCTT TTTAAAGACA AATTTGGACC CTCTATAGGT ATGAAAAGTT TCTTTTTTAA AAAAAATAAA  ATCGGGGCTA GGGGAAAAAA GGGATTTTTA TCAACTGAGC TACTAAATTT ATGTGATATT GTTTTTTTAT TTTTTTCTGA AATGAAAGGA ATGGAAAGCA AGGAATTTGC AGAGGAGTTG  TTTGATACAA TGGCAAGGAG AAAGAAGATT AATGCAGAAA ATGGGATAAC AATTGAGGAA CTTAAAGAAT TTTGGGATGA TATATCAACT CATTGCCCTG ATACAAGGCT TCATATTTTC  TTTGACATGT GTGACAAGAA TGGTGATGGG AAACTATCAG AAGAAGAGGT CAAGGAGGTT CTAGTGATGA GTGCTTCAGC CAACAAATTG ACAAACTTCA AGAAACATGC AGCAACATAT  GCAGCTTTAA TCATGGAAGA GTTCGATCCT GATCATTTAG GATATATTGA GATATGGCAA CTTGAATCTC TACTAAGAGG AATGGTTGGA TCAGAAGATG GGCAAAATAA CATGAAGAGA  TCACAAACAT TAGCAAAAAC CATGATCCCT AGACAATATA GAACTCCAGT GAGCAAGTTT TTAAGCAAAA CTTCAGAGAA GATATACGAT AACTGGAAAA GAATTTGGGT CGTAACGTTG  TGGTTGTCCA TTAATTTCAT ACTATTTATA TGGAAGATTG AACAATTTAA AAGGAGAGAA GCCTTCAAGA TTATGGGATA TTGTGTCTGT TTAGCTAAAG CTGCAGGGGA AACTCTCAAG  TTCAATATGG CTCTAATTCT CATTCCAGTA TGCCGAAGAA CTCTTACTCA GATTAGAGAA AGTTTCCTTG GTTATATTAT ACCTTTTGAT GATAACATCA ATTTTCATAA AATGGTTGCC  GTAGGAATTA CTGTAGGGGC CTTTATTCAT ATATTGTTTC ACACAAGTTG CAACTTCGTA AAGTTAGCGT CCTGTCCAGA GAGTAAATTT ATGACAGCTC TTGGAAGCAA TTTTGGCTAC  CAGCAACCAA CTTACATGGA TCTAGTAGTA TCTGTTCCAG GCGTAACGGG GATACTAATG ACCCTTTTCA TGCTTTTCTC CTTCACACTG GCAACACATT CGTTCCGAAG AAATATCATC  AAATTGCCTG GCTCATTTCA TCATTTGGCT GGATTTAATG CATTTTGGTA TGCACATCAT CTGCTGATAT TTGTGTACGT GCTCTTGATC CTCCACGGCT GCTTCATATT CCTTACCAAC  GAATGGTACA AAAAGACGAC ATGGATGTAT CTTGCAGTCC CAGTAGTTCT GTATTCTACA GAAAGAGTTC TTATCATCAA TGAGAACCGC TACCACGTGA ACATACAAAA GGCTGTTATA  TATGCAGGGA ATGTACTAGC ACTATATATG ACTAAACCTC CAGGATTCAA GTACAAGAGC GGAATGTACC TGTTCGTTAA ATGTCCAGAT ATATCAAACT TCGAATGGCA TCCATTCTCA  ATCACTTCTG CACCAGATGA GGACTATCTA AGTGTCCACA TACGTACATT AGGAGACTGG ACTACAGAGC TTAGAACCAG ATTCGAAAAG GCATGTCAAG AGGCACCATC CAAGACGAGA  AATCTTGTTA GAATGGAAAC TAAAGCGTAT AATCAGAAGG ATGCGGAACA ATCTCAAGCC GAAAATCCAA TGATCATTAT CAAAGGGCCT TATGGTGCAC CAGCTCAGAA CTACAAGAAG  TATGATATCC TTCTACTAGT TGGCTTAGGA ATTGGAGCAA CTCCATTTAT CAGCATTATA AAGGACATAC TAAACCAGAA ATCGGGATAT AATCAACAAG ATGACGGCAA GAAAGGTCCT  CAAAGAGCAT ATTTCTATTG GGTGACACGA GAACAAGGAT CATTCGACTG GTTCAAGGGT GTAATGGATG ACATTGCTGA ACACGACGAA AATGAAGTGA TAGAAATGCA CAACTACTTG  ACTAGTGTTT ATGAAGAAGG GGACGCACGA TCAGCACTAA TCACAATGGT CCAATCACTG CAACATGCTA AAAATGGAGT TGATGTTGTC TCAGAAAGCC GGATAAGAAC ACATTTCTCT  AGACCAAATT GGAAAAGAGT GTTTGCTCAA TTAGCTGTTA CACATCCATC ATCTCGCATT GGTGTTTTTT ACTGTGGAAG TCCAACACTT ACCAAACCAC TCAAAAAGTT GTGTCAAGAA 
TTTAGCTTAA ATTCGTCCAC GCGCTTCAAC TTCCACAAAG AGAACTTCTA G 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGAAA CCCCTATAGA AAATGGAGGA GGAGGAAGAA CAAAAATGGT TAGAATAGAA TCAGGGGCAG CAAGAGGGTT CAAGAGCCTT CATTTTCTTG ATAATACAAC AGGAAAAGAA  GCAGATGCTT GGAAAAATGT TGAGAAAAGA TTTCATATAA ATGCTGTTAA TGGCATTCTT TTTAAAGACA AATTTGGACC CTCTATAGGT ATGAAAAGTT TCTTTTTTAA AAAAAATAAA  ATCGGGGCTA GGGGAAAAAA GGGATTTTTA TCAACTGAGC TACTAAATTT ATGTGATATT GTTTTTTTAT TTTTTTCTGA AATGAAAGGA ATGGAAAGCA AGGAATTTGC AGAGGAGTTG  TTTGATACAA TGGCAAGGAG AAAGAAGATT AATGCAGAAA ATGGGATAAC AATTGAGGAA CTTAAAGAAT TTTGGGATGA TATATCAACT CATTGCCCTG ATACAAGGCT TCATATTTTC  TTTGACATGT GTGACAAGAA TGGTGATGGG AAACTATCAG AAGAAGAGGT CAAGGAGGTT CTAGTGATGA GTGCTTCAGC CAACAAATTG ACAAACTTCA AGAAACATGC AGCAACATAT  GCAGCTTTAA TCATGGAAGA GTTCGATCCT GATCATTTAG GATATATTGA GATATGGCAA CTTGAATCTC TACTAAGAGG AATGGTTGGA TCAGAAGATG GGCAAAATAA CATGAAGAGA  TCACAAACAT TAGCAAAAAC CATGATCCCT AGACAATATA GAACTCCAGT GAGCAAGTTT TTAAGCAAAA CTTCAGAGAA GATATACGAT AACTGGAAAA GAATTTGGGT CGTAACGTTG  TGGTTGTCCA TTAATTTCAT ACTATTTATA TGGAAGATTG AACAATTTAA AAGGAGAGAA GCCTTCAAGA TTATGGGATA TTGTGTCTGT TTAGCTAAAG CTGCAGGGGA AACTCTCAAG  TTCAATATGG CTCTAATTCT CATTCCAGTA TGCCGAAGAA CTCTTACTCA GATTAGAGAA AGTTTCCTTG GTTATATTAT ACCTTTTGAT GATAACATCA ATTTTCATAA AATGGTTGCC  GTAGGAATTA CTGTAGGGGC CTTTATTCAT ATATTGTTTC ACACAAGTTG CAACTTCGTA AAGTTAGCGT CCTGTCCAGA GAGTAAATTT ATGACAGCTC TTGGAAGCAA TTTTGGCTAC  CAGCAACCAA CTTACATGGA TCTAGTAGTA TCTGTTCCAG GCGTAACGGG GATACTAATG ACCCTTTTCA TGCTTTTCTC CTTCACACTG GCAACACATT CGTTCCGAAG AAATATCATC  AAATTGCCTG GCTCATTTCA TCATTTGGCT GGATTTAATG CATTTTGGTA TGCACATCAT CTGCTGATAT TTGTGTACGT GCTCTTGATC CTCCACGGCT GCTTCATATT CCTTACCAAC  GAATGGTACA AAAAGACGAC ATGGATGTAT CTTGCAGTCC CAGTAGTTCT GTATTCTACA GAAAGAGTTC TTATCATCAA TGAGAACCGC TACCACGTGA ACATACAAAA GGCTGTTATA  TATGCAGGGA ATGTACTAGC ACTATATATG ACTAAACCTC CAGGATTCAA GTACAAGAGC GGAATGTACC TGTTCGTTAA ATGTCCAGAT ATATCAAACT TCGAATGGCA TCCATTCTCA  ATCACTTCTG CACCAGATGA GGACTATCTA AGTGTCCACA TACGTACATT AGGAGACTGG ACTACAGAGC TTAGAACCAG ATTCGAAAAG GCATGTCAAG AGGCACCATC CAAGACGAGA  AATCTTGTTA GAATGGAAAC TAAAGCGTAT AATCAGAAGG ATGCGGAACA ATCTCAAGCC GAAAATCCAA TGATCATTAT CAAAGGGCCT TATGGTGCAC CAGCTCAGAA CTACAAGAAG  TATGATATCC TTCTACTAGT TGGCTTAGGA ATTGGAGCAA CTCCATTTAT CAGCATTATA AAGGACATAC TAAACCAGAA ATCGGGATAT AATCAACAAG ATGACGGCAA GAAAGGTCCT  CAAAGAGCAT ATTTCTATTG GGTGACACGA GAACAAGGAT CATTCGACTG GTTCAAGGGT GTAATGGATG ACATTGCTGA ACACGACGAA AATGAAGTGA TAGAAATGCA CAACTACTTG  ACTAGTGTTT ATGAAGAAGG GGACGCACGA TCAGCACTAA TCACAATGGT CCAATCACTG CAACATGCTA AAAATGGAGT TGATGTTGTC TCAGAAAGCC GGATAAGAAC ACATTTCTCT  AGACCAAATT GGAAAAGAGT GTTTGCTCAA TTAGCTGTTA CACATCCATC ATCTCGCATT GGTGTTTTTT ACTGTGGAAG TCCAACACTT ACCAAACCAC TCAAAAAGTT GTGTCAAGAA 
TTTAGCTTAA ATTCGTCCAC GCGCTTCAAC TTCCACAAAG AGAACTTCTA G 

Retrieve as FASTA