Entry information : LeRboh08(Solyc06g075570.1)
Entry ID 15934
Creation 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeRboh08(Solyc06g075570.1)
Name LeRboh08(Solyc06g075570.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeRboh08
start..stop
S start..stop
LeRboh04 1279 0 65..830 15..816
EgrRboh06 1261 0 13..830 3..857
EglRboh06 1259 0 13..830 3..857
EguRboh06 1256 0 13..830 3..857
Literature and cross-references LeRboh08(Solyc06g075570.1)
Protein sequence: LeRboh08(Solyc06g075570.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   830
PWM (Da):   %s   95331.47  
PI (pH):   %s   9.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVPIDDGDLS RDNSVKWILE NAEKDSTSDI HENRNGANGL QELANQKSFK KNFSISRRRN GVVPRMGRME SGATRGLKSL RFLDRSTTGK EGDAWRSVEK RFNQNAVNGR IFREKFGTCI  GMGESKEFAG ELFDTLARRR KINTENGITI DEVKGFWEDI STQSLDARLH IFFDMCDKNG DGKLSEEEVK EVLVMSASAN KLSKFKQHAP TYAALIMEEL DPDHLGYIEM WQLEALLRGM  VGSEEGEKTL KRSQTLAKTM IPKEYRTPVS KFFYKTSEKI QENWKRIWVL TLWLCINMIL FTWKFQQFKR KSAFQIMGYC VCIAKGAGET LKFNMALVLF PVCRRTLTKL RETFLGSIFP  FDDNINFHKI IALGIAVATF IHALFHTSCN FVKLTTCPQS KFMTFLGSNF DYHQPSYLDL VASIPGVTGI LMTLFMLFSF TLATHSFRRN VIKLPWPFHH LAGFNAFWYA HHLLVLVYIL  LVLHGYFIYL TKEWYKKTTW MYLAVPVLAY ATERTLIVYE HSYNVNIIKA VTYTGNVLAL YMSKPPGFKY KSGMYLFVKC PDISTFEWHP FSITSAPDDN YLSVHIRTLG DWTTELKTRF  EKACEPDQVA QSRKGSLVRM ETKAYSDVEQ AQSEFPKIMI KGPYGAPAQN YKKYDILLLI GLGIGATPFI SILKDLLNNE SQSNGELSSN RRGPDRAYFY WVTREQGSFD WFKGVMDDIA 
EYDHNEMMEM HNYLTSVYEE GDARSALIAM VQSLQHAKNG VDVVSDSRIR THFARPNWRK VFSRLAAAHP SSRIGVFYCG SPTLTKPLRR LCQEFSLNSS TRFNFHKENF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. No EST found.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCCCA TTGACGATGG AGATTTATCT AGAGACAATT CAGTGAAATG GATTCTTGAA AATGCTGAAA AAGATAGTAC GAGCGATATC CATGAGAATA GAAATGGTGC AAATGGTTTA  CAAGAGCTTG CAAATCAAAA ATCTTTCAAG AAAAATTTCA GCATTTCAAG ACGAAGAAAT GGTGTTGTAC CAAGAATGGG GCGGATGGAA TCAGGCGCTA CTAGAGGGCT AAAGAGCTTA  CGATTTCTTG ATAGATCAAC CACAGGTACT GAATTGTGTG ACCATCTCAT TTTTAAAAAA AAATATTAGA GAGTAAGCCT TTTTATCTAC TTAATTATAT GCGAGCCTGA TTGTAAAGAA  TCCATTTTGA TGATGGAACG TCGTTTGATT TGAACTCAGG ATCTCACCAT ATTGAATTCT GTGATGGTCT CGTCTTAACT TTTATTTACT TAATTATGTA TTCGATAACA GGGAAGGAGG  GAGATGCCTG GCGGAGTGTG GAGAAACGAT TCAATCAAAA TGCAGTTAAT GGGAGGATCT TCAGAGAGAA ATTTGGGACC TGTATTGGTA TTTTTGTCAA ACTTGTAGCA TTTCGTATAA  ACTTGGTTTC ATTTAGAGAA GAAAGTAGAA CAAACATTTT TTATGTTTTG CATAATAGGA ATGGGAGAAA GCAAGGAATT CGCTGGAGAG TTATTTGATA CGTTGGCTAG GCGTAGGAAG  ATCAACACAG AAAATGGCAT AACAATAGAT GAAGTGAAAG GATTTTGGGA AGACATATCA ACTCAATCTC TTGATGCAAG GCTTCATATT TTCTTTGACA TGTAAGAGAT TAAATCAATG  GGAGATGAGA ACTAAAATCC GTCTTTCCGA GTGACTAATG GTGGTGAATT TTCACAGGTG TGACAAGAAT GGTGATGGGA AACTATCAGA GGAAGAGGTA AAGGAGGTGA GAAAATTTTC  CTTAGAAAAC TTTTTTTCCT TCAATTTTCG CGTATCTATC TACTTAATAT GTTCTTTTTT TCTGAAAAAG GTTCTAGTGA TGAGTGCCTC GGCAAATAAA TTGTCAAAAT TCAAGCAACA  TGCACCCACA TACGCAGCTT TAATCATGGA AGAGCTTGAC CCTGATCATT TGGGATATAT TGAGGTAAGG ATGGCATTAA AAAGTTGTTG TCGTTTGATG GTTTGATTAT GAACCCCGAA  ATAGTCATGC TTTTAGTTTC CATTGCAATA ATTATATTAA TGGATAAACC TCCGCTAGCT TTGCCATATG AACTTATTAC AAATGAATTT ATGAAAATTC GTTTAGAGAA AGAGCGTCAA  TGCGTGGTGT TAGACTAAAA TGGATGATCC TATTGATAAT TTTCTTCTAT AATTTCTCAT TTTCTACTTA ACAGATGTGG CAACTTGAAG CTCTACTAAG AGGGATGGTG GGTTCAGAAG  AAGGGGAAAA AACCCTGAAG AGATCACAAA CACTGGCGAA AACCATGATT CCGAAAGAAT ACAGGACCCC AGTAAGCAAA TTCTTTTATA AAACATCAGA AAAAATACAA GAAAACTGGA  AAAGAATATG GGTCCTAACA TTGTGGTTGT GCATCAACAT GATACTTTTC ACTTGGAAGT TCCAACAATT TAAAAGAAAA TCAGCATTTC AGATCATGGG TTATTGCGTT TGCATCGCTA  AAGGTGCAGG AGAGACTCTT AAGTTCAACA TGGCTCTAGT TCTTTTTCCT GTCTGCAGAA GAACTCTTAC TAAGCTCAGA GAAACTTTCC TTGGTTCAAT ATTTCCCTTT GATGATAACA  TCAATTTCCA TAAGATAATT GCATTGGGAA TTGCTGTAGC AACGTTTATT CACGCACTTT TCCATACCAG CTGCAATTTT GTGAAACTAA CAACATGTCC ACAGAGTAAA TTTATGACAT  TTCTTGGAAG CAACTTCGAC TACCACCAAC CAAGTTACTT GGACCTCGTG GCATCCATTC CAGGTGTAAC AGGCATTCTG ATGACACTTT TCATGCTTTT CTCCTTCACA TTGGCTACAC  ATTCGTTTAG AAGGAACGTC ATCAAATTGC CATGGCCGTT CCATCATTTA GCAGGATTTA ACGCGTTTTG GTATGCACAT CATCTTCTGG TCCTCGTCTA CATCCTCTTG GTCCTCCATG  GCTACTTCAT ATACCTTACA AAAGAATGGT ACAAAAAGAC GGTATGTATT TTCACTTGGA TTTTGAAAAC CTTTCGACGT TTCCTAACTT TGCAGTCGAG AGAAGAAATC CAACTACTGC  ATAACTTGAA AAATGCACAT ATATCAATCA TGTTGTTTCA ATATGATTAA GGGCGTTTAG TTTTTTGACA TTTAAGATCA ATTTAATCAA TCAAACTAGT GATGATGATT GAGCAATCAG  AAATATCTTT GTTATGCAGA CATGGATGTA TCTTGCAGTT CCGGTACTTG CATATGCTAC GGAAAGAACT CTCATCGTCT ACGAACACAG CTACAATGTC AATATCATAA AGGTTTTAGC  TTCAAACAAG CTTTATGTCA ATTGAAAAAT CTCTCTGAAT TTAGCTTTTG ACTTGATGCT AAAATATCGC AGGCCGTCAC ATATACAGGG AATGTACTAG CATTATACAT GAGTAAACCT  CCAGGATTCA AGTATAAGAG TGGAATGTAC CTTTTTGTTA AATGTCCTGA TATTTCAACC TTCGAATGGT AAATGAAAAC TATACAATGA TCATTTAAAG ATCTGAACGT CTATTTGCGC  TAAGGAACTT TATTAATTTT TACAGGCATC CATTCTCAAT CACTTCAGCA CCAGACGACA ACTATCTAAG TGTTCATATA CGTACATTGG GAGACTGGAC TACAGAGCTA AAAACCAGAT  TTGAGAAGGT GATAGATTTG TTAAAATTCG TGTTTCTAGA TCACTTACAT TTTCTATTCA ATGAGTTCTA GAAGTCAGAT GCGTTAAAAC TGACAAAAAT TGGTGATCCA TTCATATCAC  TAATCTTTTG AAACTCTATA TAATTCAGGT AGCCAACAAG CTGAGCTCTA CTAAGACTCC CCTTCTTTCT TCTACTTAAT TTTTCGGATT TTTAATAAGC TCTCTCACCT TTAGCAGGCT  TGTGAGCCTG ATCAAGTAGC ACAATCAAGG AAGGGAAGTC TTGTAAGAAT GGAAACTAAA GCATATTCAG ATGTTGAACA GGCTCAATCC GAGTACGTTT CCATGTTGTT CTATGTTTAC  TGATTTTCAT GTTCATGAAC CATAACAGAA CTTATATTTA CTCTTTATAT TTTCGTTGCA GATTTCCAAA GATCATGATC AAAGGACCTT ATGGAGCACC AGCTCAAAAC TACAAGAAAT  ATGATATCCT TCTACTAATT GGCTTGGGAA TAGGAGCAAC ACCATTTATC AGCATTTTAA AGGACCTTCT TAACAATGAA TCTCAATCTG TAAGTACCTA ATCTCAAATG CTAACGATTT  AAATTATATA CACTCGTAAT AGTTACCTGA TATAAAAATT CTTCTATATT ATCAGTGAAA ATAAAAACAT AACAAAATCT AATAACTGCA GAATGGTGAA TTATCAAGTA ATAGGAGAGG  TCCTGACAGA GCATATTTCT ATTGGGTGAC AAGAGAACAA GGATCATTTG ATTGGTTCAA GGGTGTTATG GATGATATTG CTGAATATGA CCATAATGTG AGTTTGATTA AATTTCAATT  TAAACATTAA CTTAAAAACA TATATAAATA TATTATAACT TGTATATATT ATACAGGAAA TGATGGAAAT GCACAACTAT TTGACTAGTG TTTATGAAGA AGGAGATGCT AGATCTGCAC  TTATTGCAAT GGTGCAATCA CTACAACATG CTAAAAATGG AGTTGATGTT GTCTCTGATA GTCGGGTATA TATATCCTAT TTTTCGCAAT TTTATGAATT TTTACACGTA AGGTTACAAA  CGTCAGTATA TATAACTTAA ATTCTTGATT TTAACACTTA CATTGTAACA GATAAGAACA CATTTTGCAA GACCAAATTG GAGAAAGGTA TTCTCTAGGT TGGCAGCAGC CCATCCATCT  TCTCGAATTG GTAAGCCTTA TAAACGAATG TGTCAATTTT AACTAATTTT TAAAGTTGAG TTACGCTCAA TTATCATATA TTTTTATAAT AAATAAATGA TATATCAATT GCAGGGGTAT 
TTTACTGCGG AAGTCCTACT CTTACAAAAC CACTTAGAAG GCTGTGTCAA GAATTTAGTT TAAATTCATC CACTCGTTTC AATTTCCACA AAGAAAATTT CTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCCCA TTGACGATGG AGATTTATCT AGAGACAATT CAGTGAAATG GATTCTTGAA AATGCTGAAA AAGATAGTAC GAGCGATATC CATGAGAATA GAAATGGTGC AAATGGTTTA  CAAGAGCTTG CAAATCAAAA ATCTTTCAAG AAAAATTTCA GCATTTCAAG ACGAAGAAAT GGTGTTGTAC CAAGAATGGG GCGGATGGAA TCAGGCGCTA CTAGAGGGCT AAAGAGCTTA  CGATTTCTTG ATAGATCAAC CACAGGGAAG GAGGGAGATG CCTGGCGGAG TGTGGAGAAA CGATTCAATC AAAATGCAGT TAATGGGAGG ATCTTCAGAG AGAAATTTGG GACCTGTATT  GGAATGGGAG AAAGCAAGGA ATTCGCTGGA GAGTTATTTG ATACGTTGGC TAGGCGTAGG AAGATCAACA CAGAAAATGG CATAACAATA GATGAAGTGA AAGGATTTTG GGAAGACATA  TCAACTCAAT CTCTTGATGC AAGGCTTCAT ATTTTCTTTG ACATGTGTGA CAAGAATGGT GATGGGAAAC TATCAGAGGA AGAGGTAAAG GAGGTTCTAG TGATGAGTGC CTCGGCAAAT  AAATTGTCAA AATTCAAGCA ACATGCACCC ACATACGCAG CTTTAATCAT GGAAGAGCTT GACCCTGATC ATTTGGGATA TATTGAGATG TGGCAACTTG AAGCTCTACT AAGAGGGATG  GTGGGTTCAG AAGAAGGGGA AAAAACCCTG AAGAGATCAC AAACACTGGC GAAAACCATG ATTCCGAAAG AATACAGGAC CCCAGTAAGC AAATTCTTTT ATAAAACATC AGAAAAAATA  CAAGAAAACT GGAAAAGAAT ATGGGTCCTA ACATTGTGGT TGTGCATCAA CATGATACTT TTCACTTGGA AGTTCCAACA ATTTAAAAGA AAATCAGCAT TTCAGATCAT GGGTTATTGC  GTTTGCATCG CTAAAGGTGC AGGAGAGACT CTTAAGTTCA ACATGGCTCT AGTTCTTTTT CCTGTCTGCA GAAGAACTCT TACTAAGCTC AGAGAAACTT TCCTTGGTTC AATATTTCCC  TTTGATGATA ACATCAATTT CCATAAGATA ATTGCATTGG GAATTGCTGT AGCAACGTTT ATTCACGCAC TTTTCCATAC CAGCTGCAAT TTTGTGAAAC TAACAACATG TCCACAGAGT  AAATTTATGA CATTTCTTGG AAGCAACTTC GACTACCACC AACCAAGTTA CTTGGACCTC GTGGCATCCA TTCCAGGTGT AACAGGCATT CTGATGACAC TTTTCATGCT TTTCTCCTTC  ACATTGGCTA CACATTCGTT TAGAAGGAAC GTCATCAAAT TGCCATGGCC GTTCCATCAT TTAGCAGGAT TTAACGCGTT TTGGTATGCA CATCATCTTC TGGTCCTCGT CTACATCCTC  TTGGTCCTCC ATGGCTACTT CATATACCTT ACAAAAGAAT GGTACAAAAA GACGACATGG ATGTATCTTG CAGTTCCGGT ACTTGCATAT GCTACGGAAA GAACTCTCAT CGTCTACGAA  CACAGCTACA ATGTCAATAT CATAAAGGCC GTCACATATA CAGGGAATGT ACTAGCATTA TACATGAGTA AACCTCCAGG ATTCAAGTAT AAGAGTGGAA TGTACCTTTT TGTTAAATGT  CCTGATATTT CAACCTTCGA ATGGCATCCA TTCTCAATCA CTTCAGCACC AGACGACAAC TATCTAAGTG TTCATATACG TACATTGGGA GACTGGACTA CAGAGCTAAA AACCAGATTT  GAGAAGGCTT GTGAGCCTGA TCAAGTAGCA CAATCAAGGA AGGGAAGTCT TGTAAGAATG GAAACTAAAG CATATTCAGA TGTTGAACAG GCTCAATCCG AATTTCCAAA GATCATGATC  AAAGGACCTT ATGGAGCACC AGCTCAAAAC TACAAGAAAT ATGATATCCT TCTACTAATT GGCTTGGGAA TAGGAGCAAC ACCATTTATC AGCATTTTAA AGGACCTTCT TAACAATGAA  TCTCAATCTA ATGGTGAATT ATCAAGTAAT AGGAGAGGTC CTGACAGAGC ATATTTCTAT TGGGTGACAA GAGAACAAGG ATCATTTGAT TGGTTCAAGG GTGTTATGGA TGATATTGCT  GAATATGACC ATAATGAAAT GATGGAAATG CACAACTATT TGACTAGTGT TTATGAAGAA GGAGATGCTA GATCTGCACT TATTGCAATG GTGCAATCAC TACAACATGC TAAAAATGGA  GTTGATGTTG TCTCTGATAG TCGGATAAGA ACACATTTTG CAAGACCAAA TTGGAGAAAG GTATTCTCTA GGTTGGCAGC AGCCCATCCA TCTTCTCGAA TTGGGGTATT TTACTGCGGA 
AGTCCTACTC TTACAAAACC ACTTAGAAGG CTGTGTCAAG AATTTAGTTT AAATTCATCC ACTCGTTTCA ATTTCCACAA AGAAAATTTC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCCCA TTGACGATGG AGATTTATCT AGAGACAATT CAGTGAAATG GATTCTTGAA AATGCTGAAA AAGATAGTAC GAGCGATATC CATGAGAATA GAAATGGTGC AAATGGTTTA  CAAGAGCTTG CAAATCAAAA ATCTTTCAAG AAAAATTTCA GCATTTCAAG ACGAAGAAAT GGTGTTGTAC CAAGAATGGG GCGGATGGAA TCAGGCGCTA CTAGAGGGCT AAAGAGCTTA  CGATTTCTTG ATAGATCAAC CACAGGGAAG GAGGGAGATG CCTGGCGGAG TGTGGAGAAA CGATTCAATC AAAATGCAGT TAATGGGAGG ATCTTCAGAG AGAAATTTGG GACCTGTATT  GGAATGGGAG AAAGCAAGGA ATTCGCTGGA GAGTTATTTG ATACGTTGGC TAGGCGTAGG AAGATCAACA CAGAAAATGG CATAACAATA GATGAAGTGA AAGGATTTTG GGAAGACATA  TCAACTCAAT CTCTTGATGC AAGGCTTCAT ATTTTCTTTG ACATGTGTGA CAAGAATGGT GATGGGAAAC TATCAGAGGA AGAGGTAAAG GAGGTTCTAG TGATGAGTGC CTCGGCAAAT  AAATTGTCAA AATTCAAGCA ACATGCACCC ACATACGCAG CTTTAATCAT GGAAGAGCTT GACCCTGATC ATTTGGGATA TATTGAGATG TGGCAACTTG AAGCTCTACT AAGAGGGATG  GTGGGTTCAG AAGAAGGGGA AAAAACCCTG AAGAGATCAC AAACACTGGC GAAAACCATG ATTCCGAAAG AATACAGGAC CCCAGTAAGC AAATTCTTTT ATAAAACATC AGAAAAAATA  CAAGAAAACT GGAAAAGAAT ATGGGTCCTA ACATTGTGGT TGTGCATCAA CATGATACTT TTCACTTGGA AGTTCCAACA ATTTAAAAGA AAATCAGCAT TTCAGATCAT GGGTTATTGC  GTTTGCATCG CTAAAGGTGC AGGAGAGACT CTTAAGTTCA ACATGGCTCT AGTTCTTTTT CCTGTCTGCA GAAGAACTCT TACTAAGCTC AGAGAAACTT TCCTTGGTTC AATATTTCCC  TTTGATGATA ACATCAATTT CCATAAGATA ATTGCATTGG GAATTGCTGT AGCAACGTTT ATTCACGCAC TTTTCCATAC CAGCTGCAAT TTTGTGAAAC TAACAACATG TCCACAGAGT  AAATTTATGA CATTTCTTGG AAGCAACTTC GACTACCACC AACCAAGTTA CTTGGACCTC GTGGCATCCA TTCCAGGTGT AACAGGCATT CTGATGACAC TTTTCATGCT TTTCTCCTTC  ACATTGGCTA CACATTCGTT TAGAAGGAAC GTCATCAAAT TGCCATGGCC GTTCCATCAT TTAGCAGGAT TTAACGCGTT TTGGTATGCA CATCATCTTC TGGTCCTCGT CTACATCCTC  TTGGTCCTCC ATGGCTACTT CATATACCTT ACAAAAGAAT GGTACAAAAA GACGACATGG ATGTATCTTG CAGTTCCGGT ACTTGCATAT GCTACGGAAA GAACTCTCAT CGTCTACGAA  CACAGCTACA ATGTCAATAT CATAAAGGCC GTCACATATA CAGGGAATGT ACTAGCATTA TACATGAGTA AACCTCCAGG ATTCAAGTAT AAGAGTGGAA TGTACCTTTT TGTTAAATGT  CCTGATATTT CAACCTTCGA ATGGCATCCA TTCTCAATCA CTTCAGCACC AGACGACAAC TATCTAAGTG TTCATATACG TACATTGGGA GACTGGACTA CAGAGCTAAA AACCAGATTT  GAGAAGGCTT GTGAGCCTGA TCAAGTAGCA CAATCAAGGA AGGGAAGTCT TGTAAGAATG GAAACTAAAG CATATTCAGA TGTTGAACAG GCTCAATCCG AATTTCCAAA GATCATGATC  AAAGGACCTT ATGGAGCACC AGCTCAAAAC TACAAGAAAT ATGATATCCT TCTACTAATT GGCTTGGGAA TAGGAGCAAC ACCATTTATC AGCATTTTAA AGGACCTTCT TAACAATGAA  TCTCAATCTA ATGGTGAATT ATCAAGTAAT AGGAGAGGTC CTGACAGAGC ATATTTCTAT TGGGTGACAA GAGAACAAGG ATCATTTGAT TGGTTCAAGG GTGTTATGGA TGATATTGCT  GAATATGACC ATAATGAAAT GATGGAAATG CACAACTATT TGACTAGTGT TTATGAAGAA GGAGATGCTA GATCTGCACT TATTGCAATG GTGCAATCAC TACAACATGC TAAAAATGGA  GTTGATGTTG TCTCTGATAG TCGGATAAGA ACACATTTTG CAAGACCAAA TTGGAGAAAG GTATTCTCTA GGTTGGCAGC AGCCCATCCA TCTTCTCGAA TTGGGGTATT TTACTGCGGA 
AGTCCTACTC TTACAAAACC ACTTAGAAGG CTGTGTCAAG AATTTAGTTT AAATTCATCC ACTCGTTTCA ATTTCCACAA AGAAAATTTC TAG 

Retrieve as FASTA