Entry information : LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Entry ID 15936
Creation 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Name LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Class Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type II)    [Orthogroup: PrxII001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrxII04
start..stop
S start..stop
NtPrxII06b 365 2e-131 1..190 1..193
NtPrxII06a 364 4e-131 1..190 1..193
IbPrxII06 352 3e-126 1..190 1..193
EgrPrxII02 319 4e-113 1..190 1..196
Literature and cross-references LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Protein sequence: LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   190
PWM (Da):   %s   20559.51  
PI (pH):   %s   8.65
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASAILKRTR MMAQSLRSYA SISVGSDVTV AAPNVSLQKA RSWDEGVSSK FSTTPIKDIF KGKNVVIFGL PGAYTGVCSM QHVPSYKNNI DKFKAKGIDS VICVAVNDPY TMNGWAEKLQ 
AKDAIEFYGD FDGSFHKSLD LTIDLSAALL GLRSHRWSAY VVDGNVKVLN VEEAPSDFKV SGGDVILGQI * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT  CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGTAATCA TAAATATAAT CAAAACCCCA ATTTTAAAAA TGTAATCTTT CATACCTAAA  TTTACCCTTT TCTTGATTTC TGACTGTTTG TTGTATTTTG TTTGGTGTTC AGGGCAAAAA TGTTGTAATC TTTGGACTTC CTGTAAGTTG ACTTTCTTTT ATATTTATTG CCACTGATTT  TTTAGTTAGT TGTATTGTGT GTTAGTTTTC ATTTCTGTGG TTAGGAGTAG GTTTTAGATG AATATTTTTG GTTGGTTCTC TTTTAGTTGG AATAAAGAGA GTGGGGTTGT CAAATTATGA  GAATTTGTTT GTCAACAACA ACATACTTAG TGTAATTACA CTAGTGGGGG TCTAGAGAGA TATGACGTAC GCAGACCTTA TCTTACTTAA CCTCTGGTGT GGGGTAGGTT GGTTGTTTCC  TGTACACCCC CAGCTCAAAA TTGCACCCAA AGTAGGACGT AAAGGAAAGT AGCAAGATGA ATCACTAAGT GTAAGAGCCC ACACATAAGT GTTATGTTTT GGATCTGTCT TAGAGTGAAA  CCTCAGAGGT TATGCCAAAT TAGTTCTGGG ATTGTTTATC TTGTTGTCGT TTGACCATTG TAGATTTTGT TGAGGGCCTC CAAGTTGTCA ACTTGTGCTT CATTCATGGT CTTTTTATCA  TTTATTTTTT GTTTATGATG TTTTGTGTTT GGGGCAGGGG AAAAAGTTTG TCCTTTTCAT TGGGATTTTA AAGGCAAAAA GTCCTAATAA GACATCAACA ACAACAATAA CAACTACAAT  GCGCCAATAC CAACCAAGTT GGGGTGTCCA CTATATATAT GAATCCTCAC GGACCATGTA GCTTCATTTA AGTCTAATAA GAAATCAAAG TGGAATTAGT CGAGGTGCGC GAAAGCTGGT  TCAGACACCT AGTCATAAAA ATAGAGAAGA AATCAAAGTG GTAACTTTTT CTCTTCTTCG TTTTACTTTT AGTACAAATA ATAAATTGGT CTTTTGTACT TTCAATAGAA AATACTAAAT  CAAGGTGGTA TCTGATGACT TAACTGCAGT GAGCAGCTTT ATTTGTCTAA TATTTTATCT TCCTGGGAGT ACAAATGAAT ATTGTTATTA CGAATCCAAA TTTTCAGAAT ACTTTAATCT  TGTTACATGC TACTGAATTA ACATTGCCAC TTGGTTGGTT GCACATATTT GCTTCTGGAG GAAAGATACA ACGGGACACA TTTAAATATT TAATACCATT CTTTCTATTT TTTTCTTTTA  TTTTATACAT AGAAGGAGGG GAAGCAGAAG GGGAAATGAG GAATTGAACC TTCAGTAGCA ATGTGAAAGT TCAGGTAGCC GTAGCCAACT AAATGGACTA CCATGATTCA TCAATTGAAT  TATAATAGAA AAGGGTGTTC CCTAGTTTTT TATAGAAGGT TGAATAAACT GACGCTTTTA AATGAATAAA ATGACGCTTA GAAATGATGA AAGAAAGAAA GGCTTCATTT TTTCTTTGAT  GGTTGTGGTA GGAAATTTGC CTCATAGGAG GCTGCGTTAT TGCATAGCCA TTTTATATCC AACCATTTGT TTAATATCTG GTTCTCTTTG TTTTCTTAGG TTTATATCTT CTAAAGATGT  TACTTGTACA ATTTTCAGGG TGCTTACACT GGAGTGTGTT CAATGCAACA TGTACCTAGC TACAAGAATA ACATTGATAA GTTCAAGGCC AAAGGAATCG ACTCAGTGAT CTGTGTTGCT  GTGAATGATC CATACACTAT GAACGGTTGG GCAGAAAAAT TACAAGCCAA AGATGCTGTA AGTCGCTCTG CCCTGCCTCG TCATCCTGTA TTTCTTTAAG CAAGTGCGAC CTTCACTAAT  TACTAATTTG AACTTTCTAC CATCCTTGAA GACTTCAAGT ACTTAATCTA TCCTTTTTGA CCAGACTTGG ACTGGCAAAA TGTTTGTTTG TGTGCTCTTT TTAGTGTTAA GAATGCATAG  AGTGGCGTGT GGGCTAAAAG CTCATATTTT GAGTTTGATT TCTGATGTAG ATTAAAAGCT AGGTGTTTTC AAGTAGTGAG GGGTAGAGGG TAGTCCAAAT ATTCAATCAC TTCCAAACTA  TGTGCTAAAA CCAGTCCTCT GGGATTTCTC GGTTATGAGG GGTGGGTTTG GCCTTGTAGG GTCAAAGATG GAGGAGCAGA TCTACTTTTA AAAAAGAAGA AGTTATCTGA TTGATTAGAA  CACTTAAGCC ACAGCTAAAG GAACGAACTA TTACACTTAC ATTCCTCTAC GTGTTCAAAG ATATTGACAC TGACCATTCA CCATATGCTA ATACATTCCA AATCAAGCTC AAAGTTTGTC  TCTGACCATA TTCTGATATT TTTCTGTTAA AATTCAACTT TCTTCCTCTA TGAGCTGGAA ATCTATACAG GTGGGCTGAA GTTGATCTCT AACTGGAATT TATTTTGTAG CATATTGAGG  ATGACATAAT TCATGAACTG TATGAAGCAT CAAAACACAA ACTTTGTAGA TTGTCATATG CTTTATGGCT AACGCTGGTA CAGGTAGGAT AGTTGATACA GATAACCAAG AGAGAGATCT  ATGATTAAGA TTCTCGTGAT CCTGTTATTA GCCATTCGGC GTTGTTCATC TCACCTTGTT TTATGACCTT TACATCTCAA ATGCCATACA TATACATATA TTGAATTGTT TCTCATGGGT  ATAAGTTTGA TAGCATCAGA AAATTTCATT TTATAAGCTG TTTTGTGATA ATTGCTCTTT ATACTTTCTC TAATAACGAG GATGAGTCTC TATTTTGCGA TGCAGATTGA GTTTTATGGT  GATTTTGATG GAAGCTTCCA CAAGAGTTTA GACTTAACAA TTGATCTCTC GGCTGCTTTG CTTGGACTTC GATCTCATAG GTAAGGGATC AGAGTCCGTG TTTTATGTCA TTCATTACTT  TGTCCTGCAA TAACTAAAGA TTCTACTTCC AACAATTGCC AATTCCAAAA TTGATAATCC CAGAGAAATG TGCAGATGTT TAACTCGTTT TAATCAAGTC TTGTTGAACT TTCTTGCATT  CCTTTTCCGA ATAACTTGGC CTTTTGAGCT CAGGCTATAT CGGAAACAAC CTGTCTATCT TCTATTAATC CGTTATTTAT CATTGTTGTT GCATAGGTGG TCGGCATATG TAGTTGATGG 
AAATGTTAAG GTTCTGAATG TTGAAGAAGC ACCTTCTGAC TTCAAGGTTT CTGGCGGAGA TGTTATCCTG GGACAAATCT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT  CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGGCAAAA ATGTTGTAAT CTTTGGACTT CCTGGTGCTT ACACTGGAGT GTGTTCAATG  CAACATGTAC CTAGCTACAA GAATAACATT GATAAGTTCA AGGCCAAAGG AATCGACTCA GTGATCTGTG TTGCTGTGAA TGATCCATAC ACTATGAACG GTTGGGCAGA AAAATTACAA  GCCAAAGATG CTATTGAGTT TTATGGTGAT TTTGATGGAA GCTTCCACAA GAGTTTAGAC TTAACAATTG ATCTCTCGGC TGCTTTGCTT GGACTTCGAT CTCATAGGTG GTCGGCATAT 
GTAGTTGATG GAAATGTTAA GGTTCTGAAT GTTGAAGAAG CACCTTCTGA CTTCAAGGTT TCTGGCGGAG ATGTTATCCT GGGACAAATC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGACACCAA ATTTAGGCCC AAGTTTAACT TTCTCGAATA AGGCCCATTC TTTCCCTGTC CATATATTCA CCAAGCAAAC ACTAAAAATG AAGGTAGCAA AAATCACTAT TCCACCACCA  AAAGCTTAGG AGATTTAGCC ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA  ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGGCAAAA ATGTTGTAAT CTTTGGACTT CCTGGTGCTT  ACACTGGAGT GTGTTCAATG CAACATGTAC CTAGCTACAA GAATAACATT GATAAGTTCA AGGCCAAAGG AATCGACTCA GTGATCTGTG TTGCTGTGAA TGATCCATAC ACTATGAACG  GTTGGGCAGA AAAATTACAA GCCAAAGATG CTATTGAGTT TTATGGTGAT TTTGATGGAA GCTTCCACAA GAGTTTAGAC TTAACAATTG ATCTCTCGGC TGCTTTGCTT GGACTTCGAT  CTCATAGGTG GTCGGCATAT GTAGTTGATG GAAATGTTAA GGTTCTGAAT GTTGAAGAAG CACCTTCTGA CTTCAAGGTT TCTGGCGGAG ATGTTATCCT GGGACAAATC TAGATTTGCC  CTATTTCTTC ATTCTCCAAT AAGTTTTGCA TACTTTAATG TATGGGTGTG TCGCAATGTT GTTAAAAAAT CAATCGAGTC GAACCATTGT CGTCCCTAGT AATTTCAGTT AATAAATATA 
AATTATATAT TCGGCTAACA AATTAACCTG AGCTATATAT ACACTATCCA CGTTTGGTAA ATTGTTAATC CATGAAAATA TCTACCATGT TGTTTCAAGC TCCAACT 

Retrieve as FASTA