Entry information : LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Entry ID 15936
Creation 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Name LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Class Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type II)    [Orthogroup: PrxII001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrxII04
start..stop
S start..stop
NtPrxII06b 365 2e-131 1..190 1..193
NtPrxII06a 364 4e-131 1..190 1..193
IbPrxII06 352 3e-126 1..190 1..193
EgrPrxII02 319 3e-113 1..190 1..196
Literature and cross-references LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Protein sequence: LePrxII04(Solyc01g079820.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   190
PWM (Da):   %s   20559.51  
PI (pH):   %s   8.65
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASAILKRTR MMAQSLRSYA SISVGSDVTV AAPNVSLQKA RSWDEGVSSK FSTTPIKDIF KGKNVVIFGL PGAYTGVCSM QHVPSYKNNI DKFKAKGIDS VICVAVNDPY TMNGWAEKLQ 
AKDAIEFYGD FDGSFHKSLD LTIDLSAALL GLRSHRWSAY VVDGNVKVLN VEEAPSDFKV SGGDVILGQI * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGACACCAA ATTTAGGCCC AAGTTTAACT TTCTCGAATA AGGCCCATTC TTTCCCTGTC CATATATTCA CCAAGCAAAC ACTAAAAATG AAGGTAGCAA AAATCACTAT TCCACCACCA  AAAGCTTAGG AGATTTAGCC ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA  ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGTAATCA TAAATATAAT CAAAACCCCA ATTTTAAAAA  TGTAATCTTT CATACCTAAA TTTACCCTTT TCTTGATTTC TGACTGTTTG TTGTATTTTG TTTGGTGTTC AGGGCAAAAA TGTTGTAATC TTTGGACTTC CTGTAAGTTG ACTTTCTTTT  ATATTTATTG CCACTGATTT TTTAGTTAGT TGTATTGTGT GTTAGTTTTC ATTTCTGTGG TTAGGAGTAG GTTTTAGATG AATATTTTTG GTTGGTTCTC TTTTAGTTGG AATAAAGAGA  GTGGGGTTGT CAAATTATGA GAATTTGTTT GTCAACAACA ACATACTTAG TGTAATTACA CTAGTGGGGG TCTAGAGAGA TATGACGTAC GCAGACCTTA TCTTACTTAA CCTCTGGTGT  GGGGTAGGTT GGTTGTTTCC TGTACACCCC CAGCTCAAAA TTGCACCCAA AGTAGGACGT AAAGGAAAGT AGCAAGATGA ATCACTAAGT GTAAGAGCCC ACACATAAGT GTTATGTTTT  GGATCTGTCT TAGAGTGAAA CCTCAGAGGT TATGCCAAAT TAGTTCTGGG ATTGTTTATC TTGTTGTCGT TTGACCATTG TAGATTTTGT TGAGGGCCTC CAAGTTGTCA ACTTGTGCTT  CATTCATGGT CTTTTTATCA TTTATTTTTT GTTTATGATG TTTTGTGTTT GGGGCAGGGG AAAAAGTTTG TCCTTTTCAT TGGGATTTTA AAGGCAAAAA GTCCTAATAA GACATCAACA  ACAACAATAA CAACTACAAT GCGCCAATAC CAACCAAGTT GGGGTGTCCA CTATATATAT GAATCCTCAC GGACCATGTA GCTTCATTTA AGTCTAATAA GAAATCAAAG TGGAATTAGT  CGAGGTGCGC GAAAGCTGGT TCAGACACCT AGTCATAAAA ATAGAGAAGA AATCAAAGTG GTAACTTTTT CTCTTCTTCG TTTTACTTTT AGTACAAATA ATAAATTGGT CTTTTGTACT  TTCAATAGAA AATACTAAAT CAAGGTGGTA TCTGATGACT TAACTGCAGT GAGCAGCTTT ATTTGTCTAA TATTTTATCT TCCTGGGAGT ACAAATGAAT ATTGTTATTA CGAATCCAAA  TTTTCAGAAT ACTTTAATCT TGTTACATGC TACTGAATTA ACATTGCCAC TTGGTTGGTT GCACATATTT GCTTCTGGAG GAAAGATACA ACGGGACACA TTTAAATATT TAATACCATT  CTTTCTATTT TTTTCTTTTA TTTTATACAT AGAAGGAGGG GAAGCAGAAG GGGAAATGAG GAATTGAACC TTCAGTAGCA ATGTGAAAGT TCAGGTAGCC GTAGCCAACT AAATGGACTA  CCATGATTCA TCAATTGAAT TATAATAGAA AAGGGTGTTC CCTAGTTTTT TATAGAAGGT TGAATAAACT GACGCTTTTA AATGAATAAA ATGACGCTTA GAAATGATGA AAGAAAGAAA  GGCTTCATTT TTTCTTTGAT GGTTGTGGTA GGAAATTTGC CTCATAGGAG GCTGCGTTAT TGCATAGCCA TTTTATATCC AACCATTTGT TTAATATCTG GTTCTCTTTG TTTTCTTAGG  TTTATATCTT CTAAAGATGT TACTTGTACA ATTTTCAGGG TGCTTACACT GGAGTGTGTT CAATGCAACA TGTACCTAGC TACAAGAATA ACATTGATAA GTTCAAGGCC AAAGGAATCG  ACTCAGTGAT CTGTGTTGCT GTGAATGATC CATACACTAT GAACGGTTGG GCAGAAAAAT TACAAGCCAA AGATGCTGTA AGTCGCTCTG CCCTGCCTCG TCATCCTGTA TTTCTTTAAG  CAAGTGCGAC CTTCACTAAT TACTAATTTG AACTTTCTAC CATCCTTGAA GACTTCAAGT ACTTAATCTA TCCTTTTTGA CCAGACTTGG ACTGGCAAAA TGTTTGTTTG TGTGCTCTTT  TTAGTGTTAA GAATGCATAG AGTGGCGTGT GGGCTAAAAG CTCATATTTT GAGTTTGATT TCTGATGTAG ATTAAAAGCT AGGTGTTTTC AAGTAGTGAG GGGTAGAGGG TAGTCCAAAT  ATTCAATCAC TTCCAAACTA TGTGCTAAAA CCAGTCCTCT GGGATTTCTC GGTTATGAGG GGTGGGTTTG GCCTTGTAGG GTCAAAGATG GAGGAGCAGA TCTACTTTTA AAAAAGAAGA  AGTTATCTGA TTGATTAGAA CACTTAAGCC ACAGCTAAAG GAACGAACTA TTACACTTAC ATTCCTCTAC GTGTTCAAAG ATATTGACAC TGACCATTCA CCATATGCTA ATACATTCCA  AATCAAGCTC AAAGTTTGTC TCTGACCATA TTCTGATATT TTTCTGTTAA AATTCAACTT TCTTCCTCTA TGAGCTGGAA ATCTATACAG GTGGGCTGAA GTTGATCTCT AACTGGAATT  TATTTTGTAG CATATTGAGG ATGACATAAT TCATGAACTG TATGAAGCAT CAAAACACAA ACTTTGTAGA TTGTCATATG CTTTATGGCT AACGCTGGTA CAGGTAGGAT AGTTGATACA  GATAACCAAG AGAGAGATCT ATGATTAAGA TTCTCGTGAT CCTGTTATTA GCCATTCGGC GTTGTTCATC TCACCTTGTT TTATGACCTT TACATCTCAA ATGCCATACA TATACATATA  TTGAATTGTT TCTCATGGGT ATAAGTTTGA TAGCATCAGA AAATTTCATT TTATAAGCTG TTTTGTGATA ATTGCTCTTT ATACTTTCTC TAATAACGAG GATGAGTCTC TATTTTGCGA  TGCAGATTGA GTTTTATGGT GATTTTGATG GAAGCTTCCA CAAGAGTTTA GACTTAACAA TTGATCTCTC GGCTGCTTTG CTTGGACTTC GATCTCATAG GTAAGGGATC AGAGTCCGTG  TTTTATGTCA TTCATTACTT TGTCCTGCAA TAACTAAAGA TTCTACTTCC AACAATTGCC AATTCCAAAA TTGATAATCC CAGAGAAATG TGCAGATGTT TAACTCGTTT TAATCAAGTC  TTGTTGAACT TTCTTGCATT CCTTTTCCGA ATAACTTGGC CTTTTGAGCT CAGGCTATAT CGGAAACAAC CTGTCTATCT TCTATTAATC CGTTATTTAT CATTGTTGTT GCATAGGTGG  TCGGCATATG TAGTTGATGG AAATGTTAAG GTTCTGAATG TTGAAGAAGC ACCTTCTGAC TTCAAGGTTT CTGGCGGAGA TGTTATCCTG GGACAAATCT AGATTTGCCC TATTTCTTCA  TTCTCCAATA AGTTTTGCAT ACTTTAATGT ATGGGTGTGT CGCAATGTTG TTAAAAAATC AATCGAGTCG AACCATTGTC GTCCCTAGTA ATTTCAGTTA ATAAATATAA ATTATATATT 
CGGCTAACAA ATTAACCTGA GCTATATATA CACTATCCAC GTTTGGTAAA TTGTTAATCC ATGAAAATAT CTACCATGTT GTTTCAAGCT CCAACT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT  CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGGCAAAA ATGTTGTAAT CTTTGGACTT CCTGGTGCTT ACACTGGAGT GTGTTCAATG  CAACATGTAC CTAGCTACAA GAATAACATT GATAAGTTCA AGGCCAAAGG AATCGACTCA GTGATCTGTG TTGCTGTGAA TGATCCATAC ACTATGAACG GTTGGGCAGA AAAATTACAA  GCCAAAGATG CTATTGAGTT TTATGGTGAT TTTGATGGAA GCTTCCACAA GAGTTTAGAC TTAACAATTG ATCTCTCGGC TGCTTTGCTT GGACTTCGAT CTCATAGGTG GTCGGCATAT 
GTAGTTGATG GAAATGTTAA GGTTCTGAAT GTTGAAGAAG CACCTTCTGA CTTCAAGGTT TCTGGCGGAG ATGTTATCCT GGGACAAATC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGACACCAA ATTTAGGCCC AAGTTTAACT TTCTCGAATA AGGCCCATTC TTTCCCTGTC CATATATTCA CCAAGCAAAC ACTAAAAATG AAGGTAGCAA AAATCACTAT TCCACCACCA  AAAGCTTAGG AGATTTAGCC ATGGCCTCAG CAATTTTAAA AAGAACAAGA ATGATGGCTC AAAGCCTGAG ATCCTATGCT TCAATTTCAG TAGGAAGTGA TGTTACTGTT GCTGCACCGA  ATGTTTCTCT ACAAAAGGCT CGATCTTGGG ATGAAGGTGT CTCCTCAAAA TTCTCTACTA CCCCTATTAA AGATATCTTC AAGGGCAAAA ATGTTGTAAT CTTTGGACTT CCTGGTGCTT  ACACTGGAGT GTGTTCAATG CAACATGTAC CTAGCTACAA GAATAACATT GATAAGTTCA AGGCCAAAGG AATCGACTCA GTGATCTGTG TTGCTGTGAA TGATCCATAC ACTATGAACG  GTTGGGCAGA AAAATTACAA GCCAAAGATG CTATTGAGTT TTATGGTGAT TTTGATGGAA GCTTCCACAA GAGTTTAGAC TTAACAATTG ATCTCTCGGC TGCTTTGCTT GGACTTCGAT  CTCATAGGTG GTCGGCATAT GTAGTTGATG GAAATGTTAA GGTTCTGAAT GTTGAAGAAG CACCTTCTGA CTTCAAGGTT TCTGGCGGAG ATGTTATCCT GGGACAAATC TAGATTTGCC  CTATTTCTTC ATTCTCCAAT AAGTTTTGCA TACTTTAATG TATGGGTGTG TCGCAATGTT GTTAAAAAAT CAATCGAGTC GAACCATTGT CGTCCCTAGT AATTTCAGTT AATAAATATA 
AATTATATAT TCGGCTAACA AATTAACCTG AGCTATATAT ACACTATCCA CGTTTGGTAA ATTGTTAATC CATGAAAATA TCTACCATGT TGTTTCAAGC TCCAACT 

Retrieve as FASTA