Entry information : LeFer02(Solyc06g050980.2)
Entry ID 15938
Creation 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFer02(Solyc06g050980.2)
Name LeFer02(Solyc06g050980.2)
Class Ferritin    [Orthogroup: Fer001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFer02
start..stop
S start..stop
LeFer01 432 9e-156 1..250 1..256
ThasFer01-2 389 1e-138 1..250 1..262
ThasFer01-1 382 4e-136 1..251 1..263
AtFer02 365 1e-129 1..247 1..251
Literature and cross-references LeFer02(Solyc06g050980.2)
Protein sequence: LeFer02(Solyc06g050980.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   251
PWM (Da):   %s   28201.22  
PI (pH):   %s   6.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLLKVAPAFA LLNTPKSTNG ENLLTHKSFS AKSGNGFMVC ASKGTNHKPL TGVVFEPFEE LKKEFMLVPS LPQASLARQK YCDESEAAIN EQINVEYNVS YVYHAMYAYF DRDNVALKGL  AKFFKESSAE EREHAEKFME YQNKRGGKVK LQSMLMPLTE FDHVEKGDAL YAMELALSLE KLTNEKLLNV HAVASRNNDV QLADFVESEF LGEQVEAIKK ISEYVAQLRR VGQGHGVWHF 
DQMLLQEGAA A* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCTCA AGGTTGCTCC AGCTTTTGCT CTATTGAACA CACCTAAGTC TACAAATGGG GAAAATCTGT TAACCCACAA GAGTTTTTCT GCTAAAAGTG GAAATGGGTT CATGGTTTGT  GCTTCAAAGG GGACAAACCA TAAGCCCTTG ACAGGGGTTG TGTTTGAGCC TTTTGAGGAG TTGAAGAAAG AGTTTATGCT TGTCCCTTCT CTTCCACAAG CCTCTCTTGC CCGACAGAAA  TACTGCGATG AATCTGAAGC TGCTATTAAT GAACAGATCA AGTGGGTTTG TTTTATAATT TTTGTAATTG TTTTTGTGTT TTGAATCTGT TGGTGTTAAT GCGTTTTGTT TTTGGATCTT  CAGTGTGGAA TACAATGTTT CTTACGTTTA TCATGCTATG TACGCCTATT TTGATCGAGA CAACGTTGCT CTCAAGGGTC TAGCCAAGTA ATTTTTCTAG AAACCCTTTT GATATTTTGA  TTTTCTTTGT CTGTGGATTT GTTAGGTGTG TTTTCATTCT GGTTTTCTTG ACTTTAGGTT TTTCAAGGAA TCTAGTGCAG AGGAAAGGGA ACATGCTGAG AAATTTATGG AATACCAGGT  GTTTGACGAT TCGGTATTAT GATGAATCTC CGGCTGGGGT TATGGTTTCT AATATTTTGT GTTTTTTCTT GTTTGTAGAA CAAGCGTGGT GGGAAGGTGA AGCTGCAGTC TATGTTGATG  CCACTTACTG AGTTTGATCA TGTTGAGAAG GGGGATGCAT TGTATGGTAA GTTTAGCTCC ATTTCTCCTA GCTGTATAGA GTTAAATCTA CTACTATGTA CAAATGGTTG TCTCTGTCAA  CTTGGAAATG GATTACTTGT GGGCTATTAA ATGGGGTGTT CGGTGCATAT TTATTGTGAA TTGTTTTGTA CACTCAGATT CCTATTAATT ACTGTATATT TGTGTTGCTT CTCGTGAATT  TAGAATTGTT ACATTCTGTT CAACCACTGA TTTTTAATTA CTCTGTAGCG ATGGAGCTTG CGCTGTCTCT GGAGAAGTTG ACAAATGAAA AACTTCTAAA CGTCCATGCT GTGAGTTCCC  TTGTCATGCT TGTTGGTTGT ATCTACTTAG ATCTTGATAT ATTTTGACAA GAATTGTAGA TTTTTGTGAT GAAAACGACA AGTTTTGAAT TGCAACAGTG CATCTGCCTA TTTTTAGAAT  CTGTCCCTTT TAGGTTTTTT ATTGACGTTG ATAAACTCTT TAAAAAAAAC AGGTAGCCTC ACGAAACAAT GATGTGCAAT TGGCTGATTT TGTTGAAAGC GAGTTCTTGG GTGAACAGGT  GATGCAGTAT TACCGCTTAT TTGAAGATTT TGAGATTCAT TTTGTAGCTA TACAAATTTA AGATGTTGCT TTACTAATTT TAGGTGGAAG CTATCAAGAA GATCTCTGAA TATGTTGCTC  AGCTGAGAAG AGTTGGCCAA GGACATGGTA GGATTGCATA CCCTGTTTAA CGATTGTATT TTTTTCATTC TGAAATACAC CGCCGTCATA TATCTATATT GTGTTCCCCT CATCTTAACA 
TTACCTCTTT GGTTGTGATA TAGGTGTCTG GCATTTCGAT CAGATGTTGC TGCAAGAGGG AGCTGCTGCT TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCTCA AGGTTGCTCC AGCTTTTGCT CTATTGAACA CACCTAAGTC TACAAATGGG GAAAATCTGT TAACCCACAA GAGTTTTTCT GCTAAAAGTG GAAATGGGTT CATGGTTTGT  GCTTCAAAGG GGACAAACCA TAAGCCCTTG ACAGGGGTTG TGTTTGAGCC TTTTGAGGAG TTGAAGAAAG AGTTTATGCT TGTCCCTTCT CTTCCACAAG CCTCTCTTGC CCGACAGAAA  TACTGCGATG AATCTGAAGC TGCTATTAAT GAACAGATCA ATGTGGAATA CAATGTTTCT TACGTTTATC ATGCTATGTA CGCCTATTTT GATCGAGACA ACGTTGCTCT CAAGGGTCTA  GCCAAGTTTT TCAAGGAATC TAGTGCAGAG GAAAGGGAAC ATGCTGAGAA ATTTATGGAA TACCAGAACA AGCGTGGTGG GAAGGTGAAG CTGCAGTCTA TGTTGATGCC ACTTACTGAG  TTTGATCATG TTGAGAAGGG GGATGCATTG TATGCGATGG AGCTTGCGCT GTCTCTGGAG AAGTTGACAA ATGAAAAACT TCTAAACGTC CATGCTGTAG CCTCACGAAA CAATGATGTG  CAATTGGCTG ATTTTGTTGA AAGCGAGTTC TTGGGTGAAC AGGTGGAAGC TATCAAGAAG ATCTCTGAAT ATGTTGCTCA GCTGAGAAGA GTTGGCCAAG GACATGGTGT CTGGCATTTC 
GATCAGATGT TGCTGCAAGA GGGAGCTGCT GCTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCTATCATCA GTCATCACCA CACACTGAAT TTTCTCCCCT GTTTATTCAT AACCCTAATT TTCCATCATG CTTCTCAAGG TTGCTCCAGC TTTTGCTCTA TTGAACACAC CTAAGTCTAC  AAATGGGGAA AATCTGTTAA CCCACAAGAG TTTTTCTGCT AAAAGTGGAA ATGGGTTCAT GGTTTGTGCT TCAAAGGGGA CAAACCATAA GCCCTTGACA GGGGTTGTGT TTGAGCCTTT  TGAGGAGTTG AAGAAAGAGT TTATGCTTGT CCCTTCTCTT CCACAAGCCT CTCTTGCCCG ACAGAAATAC TGCGATGAAT CTGAAGCTGC TATTAATGAA CAGATCAATG TGGAATACAA  TGTTTCTTAC GTTTATCATG CTATGTACGC CTATTTTGAT CGAGACAACG TTGCTCTCAA GGGTCTAGCC AAGTTTTTCA AGGAATCTAG TGCAGAGGAA AGGGAACATG CTGAGAAATT  TATGGAATAC CAGAACAAGC GTGGTGGGAA GGTGAAGCTG CAGTCTATGT TGATGCCACT TACTGAGTTT GATCATGTTG AGAAGGGGGA TGCATTGTAT GCGATGGAGC TTGCGCTGTC  TCTGGAGAAG TTGACAAATG AAAAACTTCT AAACGTCCAT GCTGTAGCCT CACGAAACAA TGATGTGCAA TTGGCTGATT TTGTTGAAAG CGAGTTCTTG GGTGAACAGG TGGAAGCTAT  CAAGAAGATC TCTGAATATG TTGCTCAGCT GAGAAGAGTT GGCCAAGGAC ATGGTGTCTG GCATTTCGAT CAGATGTTGC TGCAAGAGGG AGCTGCTGCT TGAAGGAGAA GATAGAATTT  CGCTTACCAT TTGTATTTTT CCACTGTTGT CTGGGTAAAT TTGGATATTA GAATGGGCTA ATCTGAGAGT ATGAGCTTCT TCTTATTAAT AGATTATTAG CAAGTGCATA CAAGAGTGAT  CTAGTAGATT GATCTAGTCA GTTGTGCTAG TTTTCCAAGT ACTTTGGAGT TTGATTACTT ACCATCTATG CTATCATCTA TCTTGCTTGA ACCTGAAATG CACCAGTGAG CAGCATTCTA 
TCAAATTCTA TTTGGTAACA GTTC 

Retrieve as FASTA