Entry information : LeFer01(Solyc05g052470.2)
Entry ID 15939
Creation 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFer01(Solyc05g052470.2)
Name LeFer01(Solyc05g052470.2)
Class Ferritin    [Orthogroup: Fer001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFer01
start..stop
S start..stop
LeFer02 432 9e-156 1..256 1..250
ThasFer01-2 395 4e-141 1..258 1..264
ThasFer01-1 382 5e-136 1..258 1..264
SpolFer01 369 5e-131 1..257 1..257
Literature and cross-references LeFer01(Solyc05g052470.2)
Protein sequence: LeFer01(Solyc05g052470.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   258
PWM (Da):   %s   29040.76  
PI (pH):   %s   5.61
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLLKVAPAFA LLNTHEENLS SVISFSSHGS ALKNFSAKNG NGLVVCASKG SNSKPLTGVV FEPFEEVKKE LMLVPTVPQA SLARQKFTDQ SEAALNEQIN VEYNVSYVYH AMYAYFDRDN  VALKGLAKFF KESSEEEREH AEKFMEYQNK RGGKVKLQSI LMPLSEFDHA EKGDALYAME LALSLEKLTN EKLLNLHAVA TRNNDVQLAD FVENEYLQEQ VEAIKKISEY VAQLRRVDKG 
HGVWHFDQML LHEAEALA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCTGA AAGTGGCACC TGCGTTTGCG TTATTGAACA CCCATGAGGA AAATTTGAGT TCCGTGATAT CATTTTCTTC ACATGGATCT GCTTTGAAGA ATTTTTCGGC AAAAAACGGA  AATGGATTGG TTGTATGTGC TTCAAAGGGT TCGAACAGTA AACCGTTGAC GGGTGTTGTT TTCGAACCTT TTGAAGAGGT GAAGAAAGAG CTTATGCTTG TACCTACTGT TCCTCAAGCT  TCTCTTGCTA GACAGAAGTT TACTGATCAA TCTGAAGCTG CTCTTAATGA ACAGATCAAG TGAGATTTTA AATATTTTAA AAATTTATCC ATTTTTTATG CTCTCGTTTG CTTTTATTGT  ATTATTTTGT CGTAGTTATT GATCGTTTGG TAGCACGGGT TACTAGAAAT ATCATACATG TATGTATTAG ATCATGCATA AGTAATATCA TGTTTAATAA TTGGTTAGAA CTATATTTAC  AATTAATAGC GTGTTTGATT TGCAATTTAG AAACCTGCAT AACCAATATA TCTATGTTAG GAGGATAGAT GATGAGATAA TTAATACATA AATAACTAAA AGTCTGCCTA ACTAATTTCT  GCATAGAATA ATACGCATAA ATTTACTCAT AACTAATCTA TGTATTATTA ATACCTGCAT GATTCTAGTC AGGTACCAAA CGATTTCTAC TGCTCAAAAA AATTGCTTTC GACGGTTCCT  TTTTGAGTCG TCTAGCAGAA ACAACCTCTC TACTTCTGCC TTAGAAGTAA GGTTGCGTTA CACTCTAACC TCCCCTAACA CCACTTTGTT GGACTATAAT GGGAATAGTG TTGTTGTTAA  AATGGGAAGT TCATGCAAGT GACCACAACT AGTTTGGAAT TGAGGGAAGT AGTAGTTGAT ATGTTATTGT TGTTGTGTTT TAGAAATGGT GTTCAAAACA TTTCACTCTT AGCAATGCGA  AATTTTCCAA TCTCATAGAT ATATATAGAA CTCTGAGGAA ATAGAACTGC CTTAGCGGGG ACTAAAAATA GTGACTATAG AACTGCCTTA GCGGGGCTAA AAATAGTTAC TATGTCTTCA  TGCTTCCAAA AAAAAAGAAA ATACCCATCT ATACCGGGCG TTATTTGTCT ACTTATTGCA TTAGTCGTGT CTATTTTGAA GTCCTTTTAA CTTGTTTGAT GTGAAGCCCT TCCACACGTG  TATGAAACTT CGATCAGTCC TCGTTGACTG GTGAAATGAG GATTACGATT TATCACCTTT CGGAACAATT TCTTATAGTT CAGCTACTAT CTATTTATGA GATTGTTTTG TATTTTTTTG  TGATTGCAGT GTCGAATACA ATGTTTCGTA TGTTTACCAT GCTATGTATG CCTATTTCGA CAGAGACAAT GTTGCTCTCA AGGGACTTGC CAAGTAAATA TTCAAAGACT CTTCCAAATC  GATGAGTTAG CCGTGTGGGT TTTGTTTAAT GGTTTGTGAT TATATGTTAT TGTTTTGGTG ATATAGGTTT TTCAAGGAAT CAAGTGAAGA GGAAAGGGAA CATGCTGAGA AGTTCATGGA  GTATCAGGTG TTTGAAAATT TGACATTATG AAATTTTGTG TTACTGCTTT TTATCTTTAT GATTTGTGCT TTGTGTTTGG GGGAGTGGTT AATTCTAGCA TCTGGTTGTT TATGCTAATC  GAGTTTGCTT CAACTTCTTG TATTACTTGG ATTTAGAACA AGCGTGGTGG GAAAGTGAAG CTGCAGTCTA TTTTAATGCC ATTATCCGAA TTTGATCATG CTGAGAAGGG GGATGCATTG  TATGGTAAGT TTGTTTCTGT TCTCGTATGT TTTGCTTATT AACCATGGTG TCTAGGCCAA CTTGCATGTA CCTCGACTAA TTCTTTGGTT ACCTGCTCTA GGAAGAATTC ATTTAGTGTT  TTTGCCTGGA GATGTGATCC TGAGACTTCC TGGAAGCCCC CTCCCCCCCA CCCCCGCCCG TTGCATTTAT CATTAGGCCA CATCCTTGAG TGCACTCTCT GTTGTATGTG TAATCCTATT  TTGTTTTGAT GATACTAGTA GAAATGGTTG TCTAGATAAT AAGTTGCTAG AAATGTTTAC TCTGTTAATC AGATGTCTAT GTTGACAACT TGACATCAAA AGAGATAAAA TTAGTGTTGC  AGACGCCAGC ATGCCTTCGT AGTTCGTACT CCCAAATGCC TTATAATTAC TATTTCCTCT CCTTGTGGAG AAATACGAAA GTACTTGTGT TGTTAAACAC TGAAAAAAAA GGACATTGAT  CTTTCAGTTA CTTACCACAT GCTTTGTTGA ATTTATCTTG TAGCAATGGA GCTTGCACTT TCTTTGGAGA AGTTGACAAA TGAGAAGCTC TTAAACTTGC ATGCTGTGAG TTTTTCTACT  TTTCTTTCTG GTTGTATCTA TCCACAATCA TTTGGATCAA TTTGAAATAG ACAACCATTG TGTTGGTTGT CGATGACATT TAAGAAAAAG GTTCTGCATC TTGGTTTTCC ATGTTTTGTC  ATTATACATT TTGACTGCTC TTAACTTTTA AAAACAGGTA GCCACACGAA ACAATGATGT GCAGTTGGCT GATTTTGTAG AAAACGAGTA CTTGCAAGAA CAGGTCTAAT GGAGTTGTTA  AGTCTCAATA CTAATGCATG ATACTATTTT AAGACATGTT CTTCCCTTTG TTTCTTTTAA CTTTTGAGAC GTGTTCTTCT CACTAGGTGG AAGCAATCAA GAAGATCTCG GAATATGTAG  CTCAGCTGAG AAGAGTGGAC AAAGGTCATG GTAGGATCGC GCTTCCTTGT GAATTACTTC TCATTAATTA TACTGATCCC TTGTACACTA TTCATATAAA CCTTAACTTT TCAACGTCCT 
CGGCTCCAAT TTAGGTGTCT GGCACTTTGA TCAAATGCTC CTGCACGAGG CGGAAGCTCT TGCATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCTGA AAGTGGCACC TGCGTTTGCG TTATTGAACA CCCATGAGGA AAATTTGAGT TCCGTGATAT CATTTTCTTC ACATGGATCT GCTTTGAAGA ATTTTTCGGC AAAAAACGGA  AATGGATTGG TTGTATGTGC TTCAAAGGGT TCGAACAGTA AACCGTTGAC GGGTGTTGTT TTCGAACCTT TTGAAGAGGT GAAGAAAGAG CTTATGCTTG TACCTACTGT TCCTCAAGCT  TCTCTTGCTA GACAGAAGTT TACTGATCAA TCTGAAGCTG CTCTTAATGA ACAGATCAAT GTCGAATACA ATGTTTCGTA TGTTTACCAT GCTATGTATG CCTATTTCGA CAGAGACAAT  GTTGCTCTCA AGGGACTTGC CAAGTTTTTC AAGGAATCAA GTGAAGAGGA AAGGGAACAT GCTGAGAAGT TCATGGAGTA TCAGAACAAG CGTGGTGGGA AAGTGAAGCT GCAGTCTATT  TTAATGCCAT TATCCGAATT TGATCATGCT GAGAAGGGGG ATGCATTGTA TGCAATGGAG CTTGCACTTT CTTTGGAGAA GTTGACAAAT GAGAAGCTCT TAAACTTGCA TGCTGTAGCC  ACACGAAACA ATGATGTGCA GTTGGCTGAT TTTGTAGAAA ACGAGTACTT GCAAGAACAG GTGGAAGCAA TCAAGAAGAT CTCGGAATAT GTAGCTCAGC TGAGAAGAGT GGACAAAGGT 
CATGGTGTCT GGCACTTTGA TCAAATGCTC CTGCACGAGG CGGAAGCTCT TGCATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATCTTCCCT TTGATTCTTT CTACTGATAA TTTTTTTTTC AATTTCTGCA TAATTTTGAG TATTCATCAT CATGCTTCTG AAAGTGGCAC CTGCGTTTGC GTTATTGAAC ACCCATGAGG  AAAATTTGAG TTCCGTGATA TCATTTTCTT CACATGGATC TGCTTTGAAG AATTTTTCGG CAAAAAACGG AAATGGATTG GTTGTATGTG CTTCAAAGGG TTCGAACAGT AAACCGTTGA  CGGGTGTTGT TTTCGAACCT TTTGAAGAGG TGAAGAAAGA GCTTATGCTT GTACCTACTG TTCCTCAAGC TTCTCTTGCT AGACAGAAGT TTACTGATCA ATCTGAAGCT GCTCTTAATG  AACAGATCAA TGTCGAATAC AATGTTTCGT ATGTTTACCA TGCTATGTAT GCCTATTTCG ACAGAGACAA TGTTGCTCTC AAGGGACTTG CCAAGTTTTT CAAGGAATCA AGTGAAGAGG  AAAGGGAACA TGCTGAGAAG TTCATGGAGT ATCAGAACAA GCGTGGTGGG AAAGTGAAGC TGCAGTCTAT TTTAATGCCA TTATCCGAAT TTGATCATGC TGAGAAGGGG GATGCATTGT  ATGCAATGGA GCTTGCACTT TCTTTGGAGA AGTTGACAAA TGAGAAGCTC TTAAACTTGC ATGCTGTAGC CACACGAAAC AATGATGTGC AGTTGGCTGA TTTTGTAGAA AACGAGTACT  TGCAAGAACA GGTGGAAGCA ATCAAGAAGA TCTCGGAATA TGTAGCTCAG CTGAGAAGAG TGGACAAAGG TCATGGTGTC TGGCACTTTG ATCAAATGCT CCTGCACGAG GCGGAAGCTC  TTGCATGATG GAGGAGATAG ACTTTGAACT TTCTACGAGT AGTCTTCTTT TGGAGGATGT TGTCTGGGTA TATTTTGGCA TTAGCCTTTT CTATGAGATA GATATGTAAG GCGTTTTGGT  GATGGAAAGT CCCAGTGCTG TATATATAGA CCAAATAGAT GTAGTAATTT GTGCTACTTA TTAGTACCCT CCTGGTGTTC AAATCAGCTT TAATTTACCT CATGGTTTGC TAGTTGTAGC 
TTGGAATTGA AGGTACCCCA GTGAAGTCAA ATGTAAAGTG AAGTTGATAG TTTTGTTTTT AGTTGGATGT TGACTCATCT GGAGAAATAA TAAATAATCG GAATTTAGCT CA 

Retrieve as FASTA