Entry information : LeAOX01(Solyc01g105220.2)
Entry ID 15942
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX01(Solyc01g105220.2)
Name LeAOX01(Solyc01g105220.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Ovaries
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX01
start..stop
S start..stop
HaAOX06 486 2e-174 1..348 1..344
ThasAOX05 452 1e-160 1..348 1..340
AtAOX05 448 6e-159 53..348 67..353
AtAOX03 437 7e-155 76..348 83..354
Literature and cross-references LeAOX01(Solyc01g105220.2)
Protein sequence: LeAOX01(Solyc01g105220.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   348
PWM (Da):   %s   39879.32  
PI (pH):   %s   8.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNQLLVRLVM RRLVSGGTRN GCISSSSAAV MFREVHKPSS ESVVMMSSQR LRFSGRWWRM MCSTTSKNST KSSDVRKEDE KLSGDSVEKM EGEDEVALSS YWGVSRPKIT KEDGSVWPWN  SFMPWETYQA DLSIDLSKHH VPKTFLDKVA YWTVKLLRIP TDLFFKKKYG CRAMMLETVA GVPGMVGGML LHLRSLRKFE HSGGWIKALL EEAENERMHL MTMVELVQPK WYERLLVIAV 
QGVFFNFYSV LYLLSPKLAH RVVGYLEEEA IHSYTLYLND IDRGEIENVP APAIAIDYWR LPKDATLKDV ITVIRADEAH HRDVNHFASD IHYQGKKLQE AAAPIGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCAGT TGCTGGTGAG GTTGGTGATG AGGCGGTTAG TTTCTGGTGG TACCCGTAAC GGTTGCATAT CGTCTTCGTC AGCGGCGGTA ATGTTCAGAG AAGTTCATAA GCCGAGTAGT  GAGTCAGTTG TGATGATGAG TAGCCAGAGG CTGAGATTCT CTGGTCGGTG GTGGAGGATG ATGTGCTCCA CTACATCGAA GAATTCAACG AAGTCCTCTG ACGTGAGGAA GGAGGACGAG  AAATTGAGTG GTGATTCTGT GGAGAAAATG GAAGGGGAAG ACGAAGTAGC TCTTTCCAGT TATTGGGGAG TCTCGAGGCC AAAAATTACG AAAGAAGATG GCTCCGTGTG GCCTTGGAAC  AGCTTCATGG TATGTGAATT ATTTTATCAG TATGGGTAAG TGTAGACCTT GTGTTTCAAA CATATAGAAG ACAATAATTC GGAGGTTCTT CTAGATAGAG CTTTAATTTC CTGGTAGTAA  AGCTGGATGA CTATTGCTTT CTTTCTGCCT GCTTTTCATG TCTGTTTACT CTGTTTCAAT TACCGGTTTA TGTCTTGGTG GAATGCATCA CTGGTTGGTG AACTGACACA CTGACCCTAC  ATAGTCGATG TGGACATCAA ACACCCGCGC ACACCCAAGA CTAGACATTT GGAGTGTGGA CAATAGAACT TGGGGCCTAA TATCGGTAAA CTAAGAGTTG TGACTTGTGT GATTCTTGAT  ACCAGGATAA AAATGGACCT TCAGTCTACC TCAATCCCAA AACCTAGCAG CTAAATTTGT GGGACTTCTG ATATTATTTA CTCTTTGAGG GTTGGAGTAA GATAATCTTA TTTCAATGTT  TGGTGACGTT TCAGTAGTAG TAACTAGTAA ATCACTGTTG TAGCTGGAGC TGTTTCATTC TTGTCTATTC TGATCTTTAA ATGGAGATTA TTTAGGGAAT CTTGCACATG TTAATTGAAA  CTTACTTGTG ATCTCTCTTC TTTTTTTTTT GTCCCTGGGT ACAAGATGTC TGTTTTTTTA CTTGCTCAAA AAGAAAAAAG AAGTCTCGTT CTTTTTTTTA ATTTATATAT ATTTTGTTAC  CGCTTGTAGC CATGGGAGAC ATATCAGGCT GACCTGTCGA TCGATCTAAG CAAGCACCAT GTGCCCAAGA CATTCCTTGA TAAGGTTGCT TATTGGACAG TGAAACTTCT CAGGATTCCA  ACTGATTTAT TTTTTAAGGT TTGCTTTCCA CTCACCTTTG CAAGGAATAT GTTGTCTTAA TCAAATTAAA TGGCTAATTT GTACTATTAC TTCTTTAGAC ACCATGCTCT CCTATGTCTT  CTTGGTCTCG ATGTGGCCAT GATGTTCATA CTACTCGACA GCTTGTACCA GCAATTTTTT TGGCGAATAG AAATGCTAAG AAATGGATTC CTTTTCTGCT AGTTCTTCGG TTTCTTCATA  AATGTAACCA AAGTGGTCAA TGTATGTGAT GAAATACTGA GCAGGGATGT AAGGGAGGTG TGCCCTTTAC ATCATCCTTC CCTAGTGGTA CATCTTTTAG CGAGAGGAAA CACATGCCAA  AATCACAACA GTTATTGCTT CATGGACTAC CGTACCTAAG AGTAATGGAA ATATGTGTAA ACAGGAAAAC TTCTCTGCCG TGGACACTAC AATGTGAATC CTTGAGTTGT TTTTATATCA  AATACCTTCT TGTCACCATT GATTCTAATC TCTGATTTCT ATCGCAGAAA AAATATGGTT GTCGTGCAAT GATGTTGGAA ACAGTGGCAG GTGTACCTGG AATGGTTGGA GGTATGCTGT  TACATCTGAG GTCATTGCGC AAGTTCGAGC ACAGTGGTGG TTGGATAAAA GCATTACTTG AAGAAGCTGA GAATGAGAGA ATGCATCTGA TGACTATGGT GGAGCTAGTA CAACCTAAAT  GGTACGAGAG GTTGTTAGTT ATTGCTGTGC AGGGAGTCTT TTTCAATTTT TACTCTGTGC TTTACTTGCT GTCCCCCAAG CTTGCACACA GAGTTGTTGG TTATCTGGAA GAGGAGGCTA  TACACTCTTA TACATTGTAT CTTAATGATA TTGATCGTGG TGAAATTGAA AATGTTCCTG CTCCTGCAAT AGCAATTGAC TACTGGAGAC TGCCTAAGGA TGCAACTCTA AAGGATGTTA  TTACTGTCAT CCGTGCTGAT GAAGCTCATC ATAGAGATGT TAACCATTTC GCATCTGTAA GTGTTCATCT TCTGTTTTCT CAGATCAATC TTAAACATCA TTGCGAATTT CCACATTTTG  AGCTGGCAAT TTTTTCTAAA GGTTTGCTTG TGCAGAAGTT ATTGATGCAA CTGATTTAGT TATTGCTCAT GTTATTCAGG ATATCCATTA TCAAGGAAAG AAATTGCAGG AGGCAGCTGC 
TCCTATTGGT TACCATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCAGT TGCTGGTGAG GTTGGTGATG AGGCGGTTAG TTTCTGGTGG TACCCGTAAC GGTTGCATAT CGTCTTCGTC AGCGGCGGTA ATGTTCAGAG AAGTTCATAA GCCGAGTAGT  GAGTCAGTTG TGATGATGAG TAGCCAGAGG CTGAGATTCT CTGGTCGGTG GTGGAGGATG ATGTGCTCCA CTACATCGAA GAATTCAACG AAGTCCTCTG ACGTGAGGAA GGAGGACGAG  AAATTGAGTG GTGATTCTGT GGAGAAAATG GAAGGGGAAG ACGAAGTAGC TCTTTCCAGT TATTGGGGAG TCTCGAGGCC AAAAATTACG AAAGAAGATG GCTCCGTGTG GCCTTGGAAC  AGCTTCATGC CATGGGAGAC ATATCAGGCT GACCTGTCGA TCGATCTAAG CAAGCACCAT GTGCCCAAGA CATTCCTTGA TAAGGTTGCT TATTGGACAG TGAAACTTCT CAGGATTCCA  ACTGATTTAT TTTTTAAGAA AAAATATGGT TGTCGTGCAA TGATGTTGGA AACAGTGGCA GGTGTACCTG GAATGGTTGG AGGTATGCTG TTACATCTGA GGTCATTGCG CAAGTTCGAG  CACAGTGGTG GTTGGATAAA AGCATTACTT GAAGAAGCTG AGAATGAGAG AATGCATCTG ATGACTATGG TGGAGCTAGT ACAACCTAAA TGGTACGAGA GGTTGTTAGT TATTGCTGTG  CAGGGAGTCT TTTTCAATTT TTACTCTGTG CTTTACTTGC TGTCCCCCAA GCTTGCACAC AGAGTTGTTG GTTATCTGGA AGAGGAGGCT ATACACTCTT ATACATTGTA TCTTAATGAT  ATTGATCGTG GTGAAATTGA AAATGTTCCT GCTCCTGCAA TAGCAATTGA CTACTGGAGA CTGCCTAAGG ATGCAACTCT AAAGGATGTT ATTACTGTCA TCCGTGCTGA TGAAGCTCAT 
CATAGAGATG TTAACCATTT CGCATCTGAT ATCCATTATC AAGGAAAGAA ATTGCAGGAG GCAGCTGCTC CTATTGGTTA CCATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TATCGGAAAG ATGAATCAGT TGCTGGTGAG GTTGGTGATG AGGCGGTTAG TTTCTGGTGG TACCCGTAAC GGTTGCATAT CGTCTTCGTC AGCGGCGGTA ATGTTCAGAG AAGTTCATAA  GCCGAGTAGT GAGTCAGTTG TGATGATGAG TAGCCAGAGG CTGAGATTCT CTGGTCGGTG GTGGAGGATG ATGTGCTCCA CTACATCGAA GAATTCAACG AAGTCCTCTG ACGTGAGGAA  GGAGGACGAG AAATTGAGTG GTGATTCTGT GGAGAAAATG GAAGGGGAAG ACGAAGTAGC TCTTTCCAGT TATTGGGGAG TCTCGAGGCC AAAAATTACG AAAGAAGATG GCTCCGTGTG  GCCTTGGAAC AGCTTCATGC CATGGGAGAC ATATCAGGCT GACCTGTCGA TCGATCTAAG CAAGCACCAT GTGCCCAAGA CATTCCTTGA TAAGGTTGCT TATTGGACAG TGAAACTTCT  CAGGATTCCA ACTGATTTAT TTTTTAAGAA AAAATATGGT TGTCGTGCAA TGATGTTGGA AACAGTGGCA GGTGTACCTG GAATGGTTGG AGGTATGCTG TTACATCTGA GGTCATTGCG  CAAGTTCGAG CACAGTGGTG GTTGGATAAA AGCATTACTT GAAGAAGCTG AGAATGAGAG AATGCATCTG ATGACTATGG TGGAGCTAGT ACAACCTAAA TGGTACGAGA GGTTGTTAGT  TATTGCTGTG CAGGGAGTCT TTTTCAATTT TTACTCTGTG CTTTACTTGC TGTCCCCCAA GCTTGCACAC AGAGTTGTTG GTTATCTGGA AGAGGAGGCT ATACACTCTT ATACATTGTA  TCTTAATGAT ATTGATCGTG GTGAAATTGA AAATGTTCCT GCTCCTGCAA TAGCAATTGA CTACTGGAGA CTGCCTAAGG ATGCAACTCT AAAGGATGTT ATTACTGTCA TCCGTGCTGA  TGAAGCTCAT CATAGAGATG TTAACCATTT CGCATCTGAT ATCCATTATC AAGGAAAGAA ATTGCAGGAG GCAGCTGCTC CTATTGGTTA CCATTAAATC TTCATATTAT TCTGCTTTGC 
ATAGCTTCTT TTTTTTTTTG TGTGTGTATA TATATGTGTG TGTGTGTGTG TGT 

Retrieve as FASTA