Entry information : LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Entry ID 15943
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Name LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX02
start..stop
S start..stop
LeAOX03 518 0 1..366 1..358
AtAOX03 492 4e-176 1..366 2..354
HaAOX01 482 2e-172 1..366 1..335
HaAOX02 475 4e-170 62..366 25..312
Literature and cross-references LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Protein sequence: LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   42090.11  
PI (pH):   %s   7.96
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIIRGALRLA RSMMSHIGPR YYSTIRPVAG NEAKNGVITR ASFNFLHENS IKGFEKIMMT RVRYFSTTNS CNTSIINLSD KEKNEQTSQE KIDQNGDAEF KVTVLTSGGN NNNINNVSYW  GIQPPKVTKE DGTPWKWNCF MPWETYKADL SIDMKKHHEP ITLLDKLAYW TVKALRVPTD LFFQKRYGCR AMMLETVAAV PGMVGGMLLH CKSLRRFEHS GGWIKALLEE AENERMHLMT  FMEVSKPKWY ERGLVLMVQG IFFNVYFMTY ILSPKLAHRI VGYLEEEAIH SYTQFLKELD EGNIENVAAP AIAIDYWRLT QDATLKDVVM VVRADEAHHR DVNHFASDIY YHGQELKDCP 
APLGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAAACAAGT GTCTCAAACT TTGCCTTTTC CTCTAAGTTA CTATCCAAAC TTCTTGCAAT TCTTCAATTA ATTTCACTTT AATTCAAATT AGTTCAAATA ACAAAGATGA TTATACGTGG  CGCATTGAGG TTGGCGCGTT CTATGATGTC TCACATTGGT CCACGTTACT ATTCAACTAT ACGTCCGGTG GCCGGAAATG AAGCCAAAAA CGGGGTTATT ACTCGTGCAT CGTTCAATTT  CTTGCATGAA AATTCTATCA AGGGTTTCGA AAAGATTATG ATGACACGCG TTAGGTATTT TTCAACTACG AATTCGTGTA ACACAAGTAT AATAAACTTG AGCGACAAGG AAAAAAATGA  ACAAACTAGT CAAGAAAAAA TTGATCAGAA CGGCGACGCA GAATTCAAAG TCACCGTTCT TACTAGTGGT GGAAATAATA ATAATATTAA TAATGTTAGC TATTGGGGTA TTCAACCCCC  TAAGGTTACA AAAGAAGATG GTACTCCATG GAAGTGGAAT TGTTTTATGG TACGTAAGTA TTATTTTTAT TGTATATATG TAATATGTGA ACAATTGACC TATGTATATT TGATTTTTAA  TGTTATTTAA TTATGTTAAA ATTTGATACT CTTAATATAT TGATTATTTT ATTTATTTAC TTTTATAAAT TTTGAATATA GCCATGGGAG ACATACAAGG CAGATTTATC AATTGATATG  AAAAAACACC ATGAGCCTAT AACGTTGTTG GATAAATTGG CTTATTGGAC TGTCAAGGCC CTTAGGGTAC CCACAGACTT ATTCTTTCAG GTATTTTATT TTATTTTATC ATATAATAAG  AAAGAACGAT CCTAAGCAGT AATTGACGTA TTTTCTGAGA ATCTTTCATT TATGACATGA AAATTCAATA TTATTAGTTA TAACAATAAT AATAATAATA TATCTGGTGT AAGAGGTTGT  CTTTGACAAA TTTTAAACGA TCATAACAAT ATACTAATTC GTCTAATTTA TGTTATTTTT ATTTTTGTGA TTTTGCGTAT TTTTCAAGAT CTATGTGGAT TGCCTAACCA AATTATGATA  AAAAGCTATC TTTTATCACT TACAATTTAC ACCCTCCCAA AAAAATAGTA TGACTTTAAT CCTTCGATTT ATAAATTTAA TGAAAATTAA CTAAAATTCC AATATTAAAT AGTTTCACGT  AACTTATGTC GATGTTAATT TTAGTAATTT AGTAAGAACA AGAAAAAAAA AAAAAAACAA CAAATAAACT TGTTAATCTC TTAATGGGTT TTGGGCCGGG TCAGACACTA GTTTTTCGTC  CCTAGCCCAG CCCACTAAAC TTTTATCTAG TCCAGCCCCT AACCTATTAG TAGAGCCGCA CTTCAATGGG TTGAGTCGGC CTGACCCTAT TGGCACCAAA AGTCAATAGC ACGAATTTGA  ACAAATAAAA AATTATATCA TATCAATAAA TTTCGATCGA CTTACAATTA TAATGTGATG CAGAAGAGGT ACGGTTGTCG AGCAATGATG TTGGAAACCG TGGCGGCAGT CCCCGGTATG  GTAGGAGGAA TGTTATTACA CTGTAAATCT TTAAGGCGAT TCGAGCACAG TGGTGGATGG ATCAAAGCAC TATTAGAAGA AGCAGAAAAT GAAAGAATGC ACTTAATGAC ATTTATGGAA  GTATCAAAAC CAAAATGGTA CGAACGTGGA CTTGTCTTAA TGGTACAAGG CATATTCTTC AATGTCTATT TTATGACTTA TATTTTGTCA CCAAAATTGG CACATCGAAT TGTTGGTTAC  TTAGAAGAAG AAGCTATTCA TTCCTACACA CAATTTCTTA AAGAATTAGA TGAGGGAAAT ATTGAAAACG TAGCTGCTCC GGCTATCGCT ATTGATTATT GGCGTTTGAC GCAAGACGCG  ACTCTTAAAG ATGTTGTCAT GGTGGTTAGG GCGGACGAGG CTCATCATCG CGATGTTAAC CACTTTGCAT CGGTAAGAAT TAGCATGTGT ATAATTTTAT CTGATTCTTG AAAAGATAGA  CGTATTCTGA GAATGACTTG GATCAAATTT AATAAATAGG TAAAAGAGCC TAACGTAGTG GACCTAGTAA CCTAAAGATA TACAATAGTT GTATCATAGA AAAATTCTTA ACAATATTTG  TTTATTATAG TATAATTCTT GCAGAAATTA AATTGTTTTT TTTTAGGGAT GAATTAAGTG AATTTTTGTG AAAATTGATG GCAGGATATT TATTACCATG GGCAAGAACT GAAGGACTGT 
CCAGCTCCAC TTGGGTATCA CTGATAACAA CAATTTTGAT CTAATAAATG TTTTGAAACA ATTAAAGAAC ACAAAATAGT GAAAAAGATC ACAATTTACT AATATTTTTG AGTAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTATAC GTGGCGCATT GAGGTTGGCG CGTTCTATGA TGTCTCACAT TGGTCCACGT TACTATTCAA CTATACGTCC GGTGGCCGGA AATGAAGCCA AAAACGGGGT TATTACTCGT  GCATCGTTCA ATTTCTTGCA TGAAAATTCT ATCAAGGGTT TCGAAAAGAT TATGATGACA CGCGTTAGGT ATTTTTCAAC TACGAATTCG TGTAACACAA GTATAATAAA CTTGAGCGAC  AAGGAAAAAA ATGAACAAAC TAGTCAAGAA AAAATTGATC AGAACGGCGA CGCAGAATTC AAAGTCACCG TTCTTACTAG TGGTGGAAAT AATAATAATA TTAATAATGT TAGCTATTGG  GGTATTCAAC CCCCTAAGGT TACAAAAGAA GATGGTACTC CATGGAAGTG GAATTGTTTT ATGCCATGGG AGACATACAA GGCAGATTTA TCAATTGATA TGAAAAAACA CCATGAGCCT  ATAACGTTGT TGGATAAATT GGCTTATTGG ACTGTCAAGG CCCTTAGGGT ACCCACAGAC TTATTCTTTC AGAAGAGGTA CGGTTGTCGA GCAATGATGT TGGAAACCGT GGCGGCAGTC  CCCGGTATGG TAGGAGGAAT GTTATTACAC TGTAAATCTT TAAGGCGATT CGAGCACAGT GGTGGATGGA TCAAAGCACT ATTAGAAGAA GCAGAAAATG AAAGAATGCA CTTAATGACA  TTTATGGAAG TATCAAAACC AAAATGGTAC GAACGTGGAC TTGTCTTAAT GGTACAAGGC ATATTCTTCA ATGTCTATTT TATGACTTAT ATTTTGTCAC CAAAATTGGC ACATCGAATT  GTTGGTTACT TAGAAGAAGA AGCTATTCAT TCCTACACAC AATTTCTTAA AGAATTAGAT GAGGGAAATA TTGAAAACGT AGCTGCTCCG GCTATCGCTA TTGATTATTG GCGTTTGACG  CAAGACGCGA CTCTTAAAGA TGTTGTCATG GTGGTTAGGG CGGACGAGGC TCATCATCGC GATGTTAACC ACTTTGCATC GGATATTTAT TACCATGGGC AAGAACTGAA GGACTGTCCA 
GCTCCACTTG GGTATCACTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAAACAAGT GTCTCAAACT TTGCCTTTTC CTCTAAGTTA CTATCCAAAC TTCTTGCAAT TCTTCAATTA ATTTCACTTT AATTCAAATT AGTTCAAATA ACAAAGATGA TTATACGTGG  CGCATTGAGG TTGGCGCGTT CTATGATGTC TCACATTGGT CCACGTTACT ATTCAACTAT ACGTCCGGTG GCCGGAAATG AAGCCAAAAA CGGGGTTATT ACTCGTGCAT CGTTCAATTT  CTTGCATGAA AATTCTATCA AGGGTTTCGA AAAGATTATG ATGACACGCG TTAGGTATTT TTCAACTACG AATTCGTGTA ACACAAGTAT AATAAACTTG AGCGACAAGG AAAAAAATGA  ACAAACTAGT CAAGAAAAAA TTGATCAGAA CGGCGACGCA GAATTCAAAG TCACCGTTCT TACTAGTGGT GGAAATAATA ATAATATTAA TAATGTTAGC TATTGGGGTA TTCAACCCCC  TAAGGTTACA AAAGAAGATG GTACTCCATG GAAGTGGAAT TGTTTTATGC CATGGGAGAC ATACAAGGCA GATTTATCAA TTGATATGAA AAAACACCAT GAGCCTATAA CGTTGTTGGA  TAAATTGGCT TATTGGACTG TCAAGGCCCT TAGGGTACCC ACAGACTTAT TCTTTCAGAA GAGGTACGGT TGTCGAGCAA TGATGTTGGA AACCGTGGCG GCAGTCCCCG GTATGGTAGG  AGGAATGTTA TTACACTGTA AATCTTTAAG GCGATTCGAG CACAGTGGTG GATGGATCAA AGCACTATTA GAAGAAGCAG AAAATGAAAG AATGCACTTA ATGACATTTA TGGAAGTATC  AAAACCAAAA TGGTACGAAC GTGGACTTGT CTTAATGGTA CAAGGCATAT TCTTCAATGT CTATTTTATG ACTTATATTT TGTCACCAAA ATTGGCACAT CGAATTGTTG GTTACTTAGA  AGAAGAAGCT ATTCATTCCT ACACACAATT TCTTAAAGAA TTAGATGAGG GAAATATTGA AAACGTAGCT GCTCCGGCTA TCGCTATTGA TTATTGGCGT TTGACGCAAG ACGCGACTCT  TAAAGATGTT GTCATGGTGG TTAGGGCGGA CGAGGCTCAT CATCGCGATG TTAACCACTT TGCATCGGAT ATTTATTACC ATGGGCAAGA ACTGAAGGAC TGTCCAGCTC CACTTGGGTA 
TCACTGATAA CAACAATTTT GATCTAATAA ATGTTTTGAA ACAATTAAAG AACACAAAAT AGTGAAAAAG ATCACAATTT ACTAATATTT TTGAGTAT 

Retrieve as FASTA