Entry information : LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Entry ID 15943
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Name LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX02
start..stop
S start..stop
LeAOX03 518 0 1..366 1..358
AtAOX03 492 4e-176 1..366 2..354
HaAOX01 482 2e-172 1..366 1..335
HaAOX02 475 4e-170 62..366 25..312
Literature and cross-references LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Protein sequence: LeAOX02(Solyc08g005550.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   42090.11  
PI (pH):   %s   7.96
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIIRGALRLA RSMMSHIGPR YYSTIRPVAG NEAKNGVITR ASFNFLHENS IKGFEKIMMT RVRYFSTTNS CNTSIINLSD KEKNEQTSQE KIDQNGDAEF KVTVLTSGGN NNNINNVSYW  GIQPPKVTKE DGTPWKWNCF MPWETYKADL SIDMKKHHEP ITLLDKLAYW TVKALRVPTD LFFQKRYGCR AMMLETVAAV PGMVGGMLLH CKSLRRFEHS GGWIKALLEE AENERMHLMT  FMEVSKPKWY ERGLVLMVQG IFFNVYFMTY ILSPKLAHRI VGYLEEEAIH SYTQFLKELD EGNIENVAAP AIAIDYWRLT QDATLKDVVM VVRADEAHHR DVNHFASDIY YHGQELKDCP 
APLGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTATAC GTGGCGCATT GAGGTTGGCG CGTTCTATGA TGTCTCACAT TGGTCCACGT TACTATTCAA CTATACGTCC GGTGGCCGGA AATGAAGCCA AAAACGGGGT TATTACTCGT  GCATCGTTCA ATTTCTTGCA TGAAAATTCT ATCAAGGGTT TCGAAAAGAT TATGATGACA CGCGTTAGGT ATTTTTCAAC TACGAATTCG TGTAACACAA GTATAATAAA CTTGAGCGAC  AAGGAAAAAA ATGAACAAAC TAGTCAAGAA AAAATTGATC AGAACGGCGA CGCAGAATTC AAAGTCACCG TTCTTACTAG TGGTGGAAAT AATAATAATA TTAATAATGT TAGCTATTGG  GGTATTCAAC CCCCTAAGGT TACAAAAGAA GATGGTACTC CATGGAAGTG GAATTGTTTT ATGGTACGTA AGTATTATTT TTATTGTATA TATGTAATAT GTGAACAATT GACCTATGTA  TATTTGATTT TTAATGTTAT TTAATTATGT TAAAATTTGA TACTCTTAAT ATATTGATTA TTTTATTTAT TTACTTTTAT AAATTTTGAA TATAGCCATG GGAGACATAC AAGGCAGATT  TATCAATTGA TATGAAAAAA CACCATGAGC CTATAACGTT GTTGGATAAA TTGGCTTATT GGACTGTCAA GGCCCTTAGG GTACCCACAG ACTTATTCTT TCAGGTATTT TATTTTATTT  TATCATATAA TAAGAAAGAA CGATCCTAAG CAGTAATTGA CGTATTTTCT GAGAATCTTT CATTTATGAC ATGAAAATTC AATATTATTA GTTATAACAA TAATAATAAT AATATATCTG  GTGTAAGAGG TTGTCTTTGA CAAATTTTAA ACGATCATAA CAATATACTA ATTCGTCTAA TTTATGTTAT TTTTATTTTT GTGATTTTGC GTATTTTTCA AGATCTATGT GGATTGCCTA  ACCAAATTAT GATAAAAAGC TATCTTTTAT CACTTACAAT TTACACCCTC CCAAAAAAAT AGTATGACTT TAATCCTTCG ATTTATAAAT TTAATGAAAA TTAACTAAAA TTCCAATATT  AAATAGTTTC ACGTAACTTA TGTCGATGTT AATTTTAGTA ATTTAGTAAG AACAAGAAAA AAAAAAAAAA ACAACAAATA AACTTGTTAA TCTCTTAATG GGTTTTGGGC CGGGTCAGAC  ACTAGTTTTT CGTCCCTAGC CCAGCCCACT AAACTTTTAT CTAGTCCAGC CCCTAACCTA TTAGTAGAGC CGCACTTCAA TGGGTTGAGT CGGCCTGACC CTATTGGCAC CAAAAGTCAA  TAGCACGAAT TTGAACAAAT AAAAAATTAT ATCATATCAA TAAATTTCGA TCGACTTACA ATTATAATGT GATGCAGAAG AGGTACGGTT GTCGAGCAAT GATGTTGGAA ACCGTGGCGG  CAGTCCCCGG TATGGTAGGA GGAATGTTAT TACACTGTAA ATCTTTAAGG CGATTCGAGC ACAGTGGTGG ATGGATCAAA GCACTATTAG AAGAAGCAGA AAATGAAAGA ATGCACTTAA  TGACATTTAT GGAAGTATCA AAACCAAAAT GGTACGAACG TGGACTTGTC TTAATGGTAC AAGGCATATT CTTCAATGTC TATTTTATGA CTTATATTTT GTCACCAAAA TTGGCACATC  GAATTGTTGG TTACTTAGAA GAAGAAGCTA TTCATTCCTA CACACAATTT CTTAAAGAAT TAGATGAGGG AAATATTGAA AACGTAGCTG CTCCGGCTAT CGCTATTGAT TATTGGCGTT  TGACGCAAGA CGCGACTCTT AAAGATGTTG TCATGGTGGT TAGGGCGGAC GAGGCTCATC ATCGCGATGT TAACCACTTT GCATCGGTAA GAATTAGCAT GTGTATAATT TTATCTGATT  CTTGAAAAGA TAGACGTATT CTGAGAATGA CTTGGATCAA ATTTAATAAA TAGGTAAAAG AGCCTAACGT AGTGGACCTA GTAACCTAAA GATATACAAT AGTTGTATCA TAGAAAAATT  CTTAACAATA TTTGTTTATT ATAGTATAAT TCTTGCAGAA ATTAAATTGT TTTTTTTTAG GGATGAATTA AGTGAATTTT TGTGAAAATT GATGGCAGGA TATTTATTAC CATGGGCAAG 
AACTGAAGGA CTGTCCAGCT CCACTTGGGT ATCACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTATAC GTGGCGCATT GAGGTTGGCG CGTTCTATGA TGTCTCACAT TGGTCCACGT TACTATTCAA CTATACGTCC GGTGGCCGGA AATGAAGCCA AAAACGGGGT TATTACTCGT  GCATCGTTCA ATTTCTTGCA TGAAAATTCT ATCAAGGGTT TCGAAAAGAT TATGATGACA CGCGTTAGGT ATTTTTCAAC TACGAATTCG TGTAACACAA GTATAATAAA CTTGAGCGAC  AAGGAAAAAA ATGAACAAAC TAGTCAAGAA AAAATTGATC AGAACGGCGA CGCAGAATTC AAAGTCACCG TTCTTACTAG TGGTGGAAAT AATAATAATA TTAATAATGT TAGCTATTGG  GGTATTCAAC CCCCTAAGGT TACAAAAGAA GATGGTACTC CATGGAAGTG GAATTGTTTT ATGCCATGGG AGACATACAA GGCAGATTTA TCAATTGATA TGAAAAAACA CCATGAGCCT  ATAACGTTGT TGGATAAATT GGCTTATTGG ACTGTCAAGG CCCTTAGGGT ACCCACAGAC TTATTCTTTC AGAAGAGGTA CGGTTGTCGA GCAATGATGT TGGAAACCGT GGCGGCAGTC  CCCGGTATGG TAGGAGGAAT GTTATTACAC TGTAAATCTT TAAGGCGATT CGAGCACAGT GGTGGATGGA TCAAAGCACT ATTAGAAGAA GCAGAAAATG AAAGAATGCA CTTAATGACA  TTTATGGAAG TATCAAAACC AAAATGGTAC GAACGTGGAC TTGTCTTAAT GGTACAAGGC ATATTCTTCA ATGTCTATTT TATGACTTAT ATTTTGTCAC CAAAATTGGC ACATCGAATT  GTTGGTTACT TAGAAGAAGA AGCTATTCAT TCCTACACAC AATTTCTTAA AGAATTAGAT GAGGGAAATA TTGAAAACGT AGCTGCTCCG GCTATCGCTA TTGATTATTG GCGTTTGACG  CAAGACGCGA CTCTTAAAGA TGTTGTCATG GTGGTTAGGG CGGACGAGGC TCATCATCGC GATGTTAACC ACTTTGCATC GGATATTTAT TACCATGGGC AAGAACTGAA GGACTGTCCA 
GCTCCACTTG GGTATCACTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAAACAAGT GTCTCAAACT TTGCCTTTTC CTCTAAGTTA CTATCCAAAC TTCTTGCAAT TCTTCAATTA ATTTCACTTT AATTCAAATT AGTTCAAATA ACAAAGATGA TTATACGTGG  CGCATTGAGG TTGGCGCGTT CTATGATGTC TCACATTGGT CCACGTTACT ATTCAACTAT ACGTCCGGTG GCCGGAAATG AAGCCAAAAA CGGGGTTATT ACTCGTGCAT CGTTCAATTT  CTTGCATGAA AATTCTATCA AGGGTTTCGA AAAGATTATG ATGACACGCG TTAGGTATTT TTCAACTACG AATTCGTGTA ACACAAGTAT AATAAACTTG AGCGACAAGG AAAAAAATGA  ACAAACTAGT CAAGAAAAAA TTGATCAGAA CGGCGACGCA GAATTCAAAG TCACCGTTCT TACTAGTGGT GGAAATAATA ATAATATTAA TAATGTTAGC TATTGGGGTA TTCAACCCCC  TAAGGTTACA AAAGAAGATG GTACTCCATG GAAGTGGAAT TGTTTTATGC CATGGGAGAC ATACAAGGCA GATTTATCAA TTGATATGAA AAAACACCAT GAGCCTATAA CGTTGTTGGA  TAAATTGGCT TATTGGACTG TCAAGGCCCT TAGGGTACCC ACAGACTTAT TCTTTCAGAA GAGGTACGGT TGTCGAGCAA TGATGTTGGA AACCGTGGCG GCAGTCCCCG GTATGGTAGG  AGGAATGTTA TTACACTGTA AATCTTTAAG GCGATTCGAG CACAGTGGTG GATGGATCAA AGCACTATTA GAAGAAGCAG AAAATGAAAG AATGCACTTA ATGACATTTA TGGAAGTATC  AAAACCAAAA TGGTACGAAC GTGGACTTGT CTTAATGGTA CAAGGCATAT TCTTCAATGT CTATTTTATG ACTTATATTT TGTCACCAAA ATTGGCACAT CGAATTGTTG GTTACTTAGA  AGAAGAAGCT ATTCATTCCT ACACACAATT TCTTAAAGAA TTAGATGAGG GAAATATTGA AAACGTAGCT GCTCCGGCTA TCGCTATTGA TTATTGGCGT TTGACGCAAG ACGCGACTCT  TAAAGATGTT GTCATGGTGG TTAGGGCGGA CGAGGCTCAT CATCGCGATG TTAACCACTT TGCATCGGAT ATTTATTACC ATGGGCAAGA ACTGAAGGAC TGTCCAGCTC CACTTGGGTA 
TCACTGATAA CAACAATTTT GATCTAATAA ATGTTTTGAA ACAATTAAAG AACACAAAAT AGTGAAAAAG ATCACAATTT ACTAATATTT TTGAGTAT 

Retrieve as FASTA