Entry information : LeAOX03(Solyc08g075540.2)
Entry ID 15944
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX03(Solyc08g075540.2)
Name LeAOX03(Solyc08g075540.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX03
start..stop
S start..stop
LeAOX02 515 0 1..358 1..366
HaAOX01 509 0 1..358 1..335
HaAOX02 504 0 49..358 13..312
AtAOX03 506 0 1..358 2..354
Literature and cross-references LeAOX03(Solyc08g075540.2)
Protein sequence: LeAOX03(Solyc08g075540.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358
PWM (Da):   %s   40034.12  
PI (pH):   %s   8.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMTRGATRMT RVVMGHMGPR YFSTTVLRNN PGTGVVGGVA AGLLHGFPAN PSEKVAVTWV RHFSAMGSRS ASTAALNDKQ QEKESSDKKV ENTATATAAV NGGVGKSVVS YWGVPPSKAT  KPDGTEWKWN CFRPWETYEA DMSIDLTKHH APVTFLDKFA YWTVKILRFP TDVFFQRRYG CRAMMLETVA AVPGMVGGML LHCKSLRRFE QSGGWIKALL EEAENERMHL MTFMEVAKPN 
VYERALVFAV QGVFFNAYFA AYLISPKLAH RIVGYLEEEA VHSYTEFLKE LDNGNIENVP APAIAIDYWR LPKDATLRDV VLVVRADEAH HRDVNHYASD IHYQGQQLKD SPAPLGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs . Highly expressed.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACCC GTGGAGCAAC AAGGATGACA CGAGTTGTCA TGGGTCATAT GGGTCCACGT TACTTTTCAA CTACAGTTCT GCGAAATAAT CCCGGGACCG GAGTTGTTGG TGGAGTCGCT  GCCGGACTTT TGCATGGTTT TCCGGCGAAT CCATCGGAGA AAGTGGCAGT AACGTGGGTT AGGCATTTTT CGGCTATGGG TTCACGGAGC GCTAGTACTG CGGCTTTGAA TGATAAGCAA  CAAGAGAAGG AAAGTAGTGA CAAAAAAGTG GAGAACACCG CCACCGCCAC CGCCGCTGTA AACGGTGGTG TTGGTAAATC TGTGGTGAGT TATTGGGGGG TTCCTCCTTC AAAGGCTACT  AAACCAGATG GTACTGAATG GAAATGGAAT TGTTTTAGGG TAAGTTTTAG TAAGGTTTTT CACATATTTT TTTCTGATAT ATATATTATG TAGGATTAAT GGTGGATTTT TTTTTTTTTG  ATTTAGCCAT GGGAGACTTA TGAAGCTGAT ATGTCGATAG ATTTGACGAA ACACCATGCG CCTGTAACGT TTTTGGATAA ATTTGCTTAT TGGACTGTTA AGATCCTTCG TTTCCCCACT  GATGTATTTT TTCAGGTACG TAATATAATA AAATTCCCAG TATATAGGAA ACTGGAAAAA AAATTCAATG CAATTTCCCA TAATTTCGGA ATTTTATAAT AGTGAAATTG AATTGAAAAT  TTCGAATGAA ATCATAGAGA GATGATTTAA TTTTGATGTG GTGCAGAGGA GATATGGTTG CAGAGCAATG ATGTTAGAGA CAGTGGCGGC GGTGCCTGGA ATGGTGGGAG GTATGTTGTT  GCATTGTAAG TCATTGAGGC GATTCGAACA GAGTGGTGGA TGGATCAAAG CTCTGTTAGA AGAAGCTGAA AACGAGAGGA TGCATTTGAT GACTTTCATG GAAGTTGCAA AGCCAAATGT  ATACGAACGT GCTCTGGTTT TCGCAGTGCA AGGCGTCTTC TTCAACGCTT ACTTTGCTGC ATACCTTATT TCCCCAAAAT TGGCTCATCG TATCGTCGGA TATTTGGAAG AAGAGGCTGT  ACATTCGTAC ACCGAGTTCC TCAAGGAATT GGACAATGGT AACATTGAGA ACGTTCCTGC TCCCGCTATT GCTATTGATT ACTGGCGACT GCCTAAGGAT GCCACTCTCC GCGATGTTGT  CTTGGTTGTT CGGGCTGATG AGGCTCATCA TCGCGATGTC AACCACTATG CATCTGTAAG AAACTAAAAA AGCTGATGAT CTCAATTTAT TTTAGATTGA TGCGTTAATG CATCTAACTA 
ATGTATTCAA TTTTGATTGC AGGACATTCA TTACCAAGGA CAACAGCTGA AGGACTCACC AGCACCACTT GGGTATCACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACCC GTGGAGCAAC AAGGATGACA CGAGTTGTCA TGGGTCATAT GGGTCCACGT TACTTTTCAA CTACAGTTCT GCGAAATAAT CCCGGGACCG GAGTTGTTGG TGGAGTCGCT  GCCGGACTTT TGCATGGTTT TCCGGCGAAT CCATCGGAGA AAGTGGCAGT AACGTGGGTT AGGCATTTTT CGGCTATGGG TTCACGGAGC GCTAGTACTG CGGCTTTGAA TGATAAGCAA  CAAGAGAAGG AAAGTAGTGA CAAAAAAGTG GAGAACACCG CCACCGCCAC CGCCGCTGTA AACGGTGGTG TTGGTAAATC TGTGGTGAGT TATTGGGGGG TTCCTCCTTC AAAGGCTACT  AAACCAGATG GTACTGAATG GAAATGGAAT TGTTTTAGGC CATGGGAGAC TTATGAAGCT GATATGTCGA TAGATTTGAC GAAACACCAT GCGCCTGTAA CGTTTTTGGA TAAATTTGCT  TATTGGACTG TTAAGATCCT TCGTTTCCCC ACTGATGTAT TTTTTCAGAG GAGATATGGT TGCAGAGCAA TGATGTTAGA GACAGTGGCG GCGGTGCCTG GAATGGTGGG AGGTATGTTG  TTGCATTGTA AGTCATTGAG GCGATTCGAA CAGAGTGGTG GATGGATCAA AGCTCTGTTA GAAGAAGCTG AAAACGAGAG GATGCATTTG ATGACTTTCA TGGAAGTTGC AAAGCCAAAT  GTATACGAAC GTGCTCTGGT TTTCGCAGTG CAAGGCGTCT TCTTCAACGC TTACTTTGCT GCATACCTTA TTTCCCCAAA ATTGGCTCAT CGTATCGTCG GATATTTGGA AGAAGAGGCT  GTACATTCGT ACACCGAGTT CCTCAAGGAA TTGGACAATG GTAACATTGA GAACGTTCCT GCTCCCGCTA TTGCTATTGA TTACTGGCGA CTGCCTAAGG ATGCCACTCT CCGCGATGTT 
GTCTTGGTTG TTCGGGCTGA TGAGGCTCAT CATCGCGATG TCAACCACTA TGCATCTGAC ATTCATTACC AAGGACAACA GCTGAAGGAC TCACCAGCAC CACTTGGGTA TCACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TATATAAAAT GAGTGTATTT CATTAAAGAA ATTATTACCA TCACATATAA TAAAATATAT ATATATAATA TTATTATTTG CCTTCTTCCT CAAGTTTCTT TCCAAACTTC CGGCGAACAT  TTTTTTTGAT TCCAGATTTT GATCGGAAGT TATCAAACAT GATGACCCGT GGAGCAACAA GGATGACACG AGTTGTCATG GGTCATATGG GTCCACGTTA CTTTTCAACT ACAGTTCTGC  GAAATAATCC CGGGACCGGA GTTGTTGGTG GAGTCGCTGC CGGACTTTTG CATGGTTTTC CGGCGAATCC ATCGGAGAAA GTGGCAGTAA CGTGGGTTAG GCATTTTTCG GCTATGGGTT  CACGGAGCGC TAGTACTGCG GCTTTGAATG ATAAGCAACA AGAGAAGGAA AGTAGTGACA AAAAAGTGGA GAACACCGCC ACCGCCACCG CCGCTGTAAA CGGTGGTGTT GGTAAATCTG  TGGTGAGTTA TTGGGGGGTT CCTCCTTCAA AGGCTACTAA ACCAGATGGT ACTGAATGGA AATGGAATTG TTTTAGGCCA TGGGAGACTT ATGAAGCTGA TATGTCGATA GATTTGACGA  AACACCATGC GCCTGTAACG TTTTTGGATA AATTTGCTTA TTGGACTGTT AAGATCCTTC GTTTCCCCAC TGATGTATTT TTTCAGAGGA GATATGGTTG CAGAGCAATG ATGTTAGAGA  CAGTGGCGGC GGTGCCTGGA ATGGTGGGAG GTATGTTGTT GCATTGTAAG TCATTGAGGC GATTCGAACA GAGTGGTGGA TGGATCAAAG CTCTGTTAGA AGAAGCTGAA AACGAGAGGA  TGCATTTGAT GACTTTCATG GAAGTTGCAA AGCCAAATGT ATACGAACGT GCTCTGGTTT TCGCAGTGCA AGGCGTCTTC TTCAACGCTT ACTTTGCTGC ATACCTTATT TCCCCAAAAT  TGGCTCATCG TATCGTCGGA TATTTGGAAG AAGAGGCTGT ACATTCGTAC ACCGAGTTCC TCAAGGAATT GGACAATGGT AACATTGAGA ACGTTCCTGC TCCCGCTATT GCTATTGATT  ACTGGCGACT GCCTAAGGAT GCCACTCTCC GCGATGTTGT CTTGGTTGTT CGGGCTGATG AGGCTCATCA TCGCGATGTC AACCACTATG CATCTGACAT TCATTACCAA GGACAACAGC  TGAAGGACTC ACCAGCACCA CTTGGGTATC ACTAAGCGAC TAATAATAAA TACAAAGATA TGACTTATCA AGCTAAAAGT CCGTCACTAT TTTGTTCCTT TTTTTGAACT GGTAATAGAG  AATATGTAGT AGGTATTACT AATCTCGAAT GTTGATGTAC ATATTTTTGT GTGGATTTGG TTCGTTCTTT GCTGCCTCTT CATCGATAAG AGGTAGAGTA GGATGACCTC TGTATCCTAT 
ATATTCTTGA TGAAATTATA TCATCTTTTT GTCTACTTGA AT 

Retrieve as FASTA