Entry information : LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Entry ID 15945
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Name LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Leaves
Inducer Suberization
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX04
start..stop
S start..stop
AtAOX01 450 8e-161 4..318 15..318
HaAOX01 447 2e-159 37..318 49..335
HaAOX02 445 5e-159 51..318 46..312
ThasAOX01 445 5e-159 65..318 71..324
Literature and cross-references LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Protein sequence: LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318
PWM (Da):   %s   36490.26  
PI (pH):   %s   7.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNRNAAMKIS GLLMRQLRGE FLPRGGMVQI RHWSNMNTSS KTKEEQKTHN QPSHTDATNA AGDKAKKIVS YWGVDPPKIS KEDGTPWKWN SFRPWETYSA DISIDVEKHH MPTNFMDKFA  YWTVQSLKYP TYLFFQRRHM CHAMLLETVA AVPGMVGGML LHCKSLRRFE HSGGWIKALL EEAENERMHL MTFIELSNPK WYERALVFAV QGVFVNAYFI AYLASPKLAH RIVGYLEEEA 
VNSYTEFLID IEKGLFENSP APAIAIDYWR LPADATLKDV VTVIRADEAH HRDLNHFASD IQCQGHELKG YPAPIGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCGTA ATGCAGCAAT GAAAATATCT GGATTACTTA TGAGACAATT ACGGGGCGAA TTTTTGCCCC GTGGAGGCAT GGTACAAATT CGTCATTGGA GTAATATGAA TACTTCTAGT  AAAACAAAAG AAGAACAAAA AACACATAAT CAACCATCAC ACACTGATGC AACCAACGCC GCCGGCGACA AGGCTAAGAA AATTGTTAGC TATTGGGGGG TGGATCCTCC CAAAATCTCC  AAGGAAGATG GTACACCATG GAAGTGGAAC AGCTTCAGGG TACGTACGCG AATAATATAT TCCCTTTATT CCGTTTTATA TGATTGACTT TCTTTTTTAG TCAGAAAGAA TGACATATTT  TTGTACTCTC TCTGAAACGA GACAGAGGAA GTATGTTTCT AAATTATGAC TTACTTATAA GGCTATAACT AAATCTCTTT TAGATAACTT GATCGTGTAA AAATATTTTA TATTGATACT  ATATATAACT TAAACTCATA ATTTTAATTA TATATATATA TATATATATA TATATTTTTT TTTTTTTTTT GGTTTTGACA GCCATGGGAG ACGTACTCAG CTGATATTTC AATTGATGTG  GAGAAGCACC ATATGCCTAC CAATTTTATG GACAAGTTTG CTTATTGGAC AGTCCAATCT TTAAAGTACC CCACCTACTT GTTTTTCCAG GTCAACATCT TGACTCTCTT ATTATTAAAA  AAAATAATTT TAGTTAAATG ATTTTTTACT ACTACTATAA ATTATTGCAA CAAGATTTTT TCAATATTAA ATTAAACTAA ATAATGATCC CAATAATTAA ATTAAAAAAA AAAAAAAGAC  AACGTGATCT TACCGCACTA GTTGGAGAAA ATGACAAAAT GGTATCGGCG CGATATGTTT AAAATACTCC TTTACATATA TTGTTTAATA ATAAATTAAA AAAGAGCATC TTTGGTTTTC  ATTTAAAAAA TTTAACAAAC TATCTCAGAT ATATTTACAC TATATCTGGA TCATTGTTAT CTACTGTATT GTACAGTAAC ATTATTATAC TTACAATATT TGTTTGGATT ATTACTTAAA  ATGTATTGTA TTGTATTATA AAATTTGGTT GTTAAGTAAT AATGAAAACC ACTATTTTAT AGAACATTCA ATTTGGTGTG TTCCCATTGT TACTTAATAT CCTTTTTCAA TTATATATTT  ACATAATATT TTAAAATACT ATTTTACCCT TTATCTTAAT TATTTGAATC TACTAAAACC TCCTACCATA GAATAATTAG GATATTTTAG TAAATTTATA AATTACAATA CAGTACGTAC  TATCAAACCA AACAATTAAA ATGTTATTAA ACAACAACAT ACAATACAGT CTAGCCAAAC ATTGTATCTA CCATACAATA CAGTACAATA GAGTACAATA CAATACAATA CATTATGAAA  CAATCGGTAA CAATGATCCA AACAAAGTGT TAAAAGGGAA TTTTGTTTCA AAAAAATCGA TTTAAAGTCA TATCACAAAA ATATTTATAG ATTAATACGA ATGAAAAATT AAAATTTAAA  CGCTCAAAAA TATCGTAATT CATAATGAGG TTATATGTAC GATTTCCTAG CTCGTCGTAG AGAATCTCTT AAAGTTATTT AAAAAAATCG ACCAGGGGAT AAAATATAAC TAGAAATTTG  TTAAGAAAGT CCCATAAAAT TGTAACAATT GCTATATAAA AGAAATTCCA TTACACATCA AAAATAAATA AACAAGATTA GAAATTCGGA GTCTAAAAAA AAATAGTATA ATTGTAGAAA  TTAGACCTCT AAATATAAAT TCCTTCAGAA ACTCTTTTTC CCTCTCATAA GTTTCTATCA AATCTAATTA ATATATATTC ATTTAAATGA TTGAACAAAA ATTGTTCATA CTCAATTTTA  GTGAACTTAT TTAAAAGACC AAAATTAATG AAAAGTATAT TGAAACTCCA AAAAAACACA AGGGACCATT ACCTACTATA ACCCTATACA TTATTATAAC GTTTAATTTA TATACACTAA  CAGTATATTT AATTTCGCAG AGACGTCACA TGTGTCATGC TATGTTACTA GAAACGGTTG CAGCCGTGCC AGGCATGGTA GGTGGTATGC TCCTCCACTG TAAATCCCTC CGTCGATTCG  AGCACAGTGG TGGTTGGATC AAAGCCCTCC TCGAAGAAGC AGAGAACGAA CGGATGCATC TCATGACCTT TATCGAATTA TCAAATCCGA AATGGTACGA ACGTGCATTA GTCTTTGCAG  TTCAAGGCGT ATTTGTCAAT GCCTATTTCA TTGCCTATTT AGCGTCCCCA AAATTGGCTC ATCGAATTGT TGGTTACTTA GAAGAAGAAG CAGTAAATTC GTATACAGAG TTTTTGATCG  ATATAGAAAA GGGACTTTTC GAGAACTCGC CTGCACCGGC TATTGCTATT GATTATTGGC GTTTGCCGGC CGATGCAACG CTAAAAGATG TTGTTACTGT TATTAGGGCC GATGAGGCAC  ATCATCGGGA CCTAAATCAC TTTGCTTCGG TGAGATTTTT CTACTTTTAA TTTTGTACGT TCGAATTTTT ATAGTATTAA AAAGAACTAT TTGTGTTTTT TAAAAATTTA AATTTTTTTT 
TTGTTACACA GGATATACAG TGTCAAGGGC ATGAGTTGAA GGGCTACCCT GCCCCAATTG GATATCATTG A 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCGTA ATGCAGCAAT GAAAATATCT GGATTACTTA TGAGACAATT ACGGGGCGAA TTTTTGCCCC GTGGAGGCAT GGTACAAATT CGTCATTGGA GTAATATGAA TACTTCTAGT  AAAACAAAAG AAGAACAAAA AACACATAAT CAACCATCAC ACACTGATGC AACCAACGCC GCCGGCGACA AGGCTAAGAA AATTGTTAGC TATTGGGGGG TGGATCCTCC CAAAATCTCC  AAGGAAGATG GTACACCATG GAAGTGGAAC AGCTTCAGGC CATGGGAGAC GTACTCAGCT GATATTTCAA TTGATGTGGA GAAGCACCAT ATGCCTACCA ATTTTATGGA CAAGTTTGCT  TATTGGACAG TCCAATCTTT AAAGTACCCC ACCTACTTGT TTTTCCAGAG ACGTCACATG TGTCATGCTA TGTTACTAGA AACGGTTGCA GCCGTGCCAG GCATGGTAGG TGGTATGCTC  CTCCACTGTA AATCCCTCCG TCGATTCGAG CACAGTGGTG GTTGGATCAA AGCCCTCCTC GAAGAAGCAG AGAACGAACG GATGCATCTC ATGACCTTTA TCGAATTATC AAATCCGAAA  TGGTACGAAC GTGCATTAGT CTTTGCAGTT CAAGGCGTAT TTGTCAATGC CTATTTCATT GCCTATTTAG CGTCCCCAAA ATTGGCTCAT CGAATTGTTG GTTACTTAGA AGAAGAAGCA  GTAAATTCGT ATACAGAGTT TTTGATCGAT ATAGAAAAGG GACTTTTCGA GAACTCGCCT GCACCGGCTA TTGCTATTGA TTATTGGCGT TTGCCGGCCG ATGCAACGCT AAAAGATGTT 
GTTACTGTTA TTAGGGCCGA TGAGGCACAT CATCGGGACC TAAATCACTT TGCTTCGGAT ATACAGTGTC AAGGGCATGA GTTGAAGGGC TACCCTGCCC CAATTGGATA TCATTGA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAAACACTA TATATAAACC AACAATTTTT CACCATAAAA AAACATCATC AACATTTCTT ATTTTGTTAA ATTTCAATCA TTTGAATATG AATCGTAATG CAGCAATGAA AATATCTGGA  TTACTTATGA GACAATTACG GGGCGAATTT TTGCCCCGTG GAGGCATGGT ACAAATTCGT CATTGGAGTA ATATGAATAC TTCTAGTAAA ACAAAAGAAG AACAAAAAAC ACATAATCAA  CCATCACACA CTGATGCAAC CAACGCCGCC GGCGACAAGG CTAAGAAAAT TGTTAGCTAT TGGGGGGTGG ATCCTCCCAA AATCTCCAAG GAAGATGGTA CACCATGGAA GTGGAACAGC  TTCAGGCCAT GGGAGACGTA CTCAGCTGAT ATTTCAATTG ATGTGGAGAA GCACCATATG CCTACCAATT TTATGGACAA GTTTGCTTAT TGGACAGTCC AATCTTTAAA GTACCCCACC  TACTTGTTTT TCCAGAGACG TCACATGTGT CATGCTATGT TACTAGAAAC GGTTGCAGCC GTGCCAGGCA TGGTAGGTGG TATGCTCCTC CACTGTAAAT CCCTCCGTCG ATTCGAGCAC  AGTGGTGGTT GGATCAAAGC CCTCCTCGAA GAAGCAGAGA ACGAACGGAT GCATCTCATG ACCTTTATCG AATTATCAAA TCCGAAATGG TACGAACGTG CATTAGTCTT TGCAGTTCAA  GGCGTATTTG TCAATGCCTA TTTCATTGCC TATTTAGCGT CCCCAAAATT GGCTCATCGA ATTGTTGGTT ACTTAGAAGA AGAAGCAGTA AATTCGTATA CAGAGTTTTT GATCGATATA  GAAAAGGGAC TTTTCGAGAA CTCGCCTGCA CCGGCTATTG CTATTGATTA TTGGCGTTTG CCGGCCGATG CAACGCTAAA AGATGTTGTT ACTGTTATTA GGGCCGATGA GGCACATCAT 
CGGGACCTAA ATCACTTTGC TTCGGATATA CAGTGTCAAG GGCATGAGTT GAAGGGCTAC CCTGCCCCAA TTGGATATCA TTGA 

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