Entry information : LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Entry ID 15945
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Name LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Class Alternative Oxidase    [Orthogroup: AOX003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Leaves
Inducer Suberization
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAOX04
start..stop
S start..stop
AtAOX01 450 8e-161 4..318 15..318
HaAOX01 447 2e-159 37..318 49..335
HaAOX02 445 4e-159 51..318 46..312
ThasAOX01 445 5e-159 65..318 71..324
Literature and cross-references LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Protein sequence: LeAOX04(Solyc08g075550.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318
PWM (Da):   %s   36490.26  
PI (pH):   %s   7.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNRNAAMKIS GLLMRQLRGE FLPRGGMVQI RHWSNMNTSS KTKEEQKTHN QPSHTDATNA AGDKAKKIVS YWGVDPPKIS KEDGTPWKWN SFRPWETYSA DISIDVEKHH MPTNFMDKFA  YWTVQSLKYP TYLFFQRRHM CHAMLLETVA AVPGMVGGML LHCKSLRRFE HSGGWIKALL EEAENERMHL MTFIELSNPK WYERALVFAV QGVFVNAYFI AYLASPKLAH RIVGYLEEEA 
VNSYTEFLID IEKGLFENSP APAIAIDYWR LPADATLKDV VTVIRADEAH HRDLNHFASD IQCQGHELKG YPAPIGYH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAAACACTA TATATAAACC AACAATTTTT CACCATAAAA AAACATCATC AACATTTCTT ATTTTGTTAA ATTTCAATCA TTTGAATATG AATCGTAATG CAGCAATGAA AATATCTGGA  TTACTTATGA GACAATTACG GGGCGAATTT TTGCCCCGTG GAGGCATGGT ACAAATTCGT CATTGGAGTA ATATGAATAC TTCTAGTAAA ACAAAAGAAG AACAAAAAAC ACATAATCAA  CCATCACACA CTGATGCAAC CAACGCCGCC GGCGACAAGG CTAAGAAAAT TGTTAGCTAT TGGGGGGTGG ATCCTCCCAA AATCTCCAAG GAAGATGGTA CACCATGGAA GTGGAACAGC  TTCAGGGTAC GTACGCGAAT AATATATTCC CTTTATTCCG TTTTATATGA TTGACTTTCT TTTTTAGTCA GAAAGAATGA CATATTTTTG TACTCTCTCT GAAACGAGAC AGAGGAAGTA  TGTTTCTAAA TTATGACTTA CTTATAAGGC TATAACTAAA TCTCTTTTAG ATAACTTGAT CGTGTAAAAA TATTTTATAT TGATACTATA TATAACTTAA ACTCATAATT TTAATTATAT  ATATATATAT ATATATATAT ATTTTTTTTT TTTTTTTGGT TTTGACAGCC ATGGGAGACG TACTCAGCTG ATATTTCAAT TGATGTGGAG AAGCACCATA TGCCTACCAA TTTTATGGAC  AAGTTTGCTT ATTGGACAGT CCAATCTTTA AAGTACCCCA CCTACTTGTT TTTCCAGGTC AACATCTTGA CTCTCTTATT ATTAAAAAAA ATAATTTTAG TTAAATGATT TTTTACTACT  ACTATAAATT ATTGCAACAA GATTTTTTCA ATATTAAATT AAACTAAATA ATGATCCCAA TAATTAAATT AAAAAAAAAA AAAAGACAAC GTGATCTTAC CGCACTAGTT GGAGAAAATG  ACAAAATGGT ATCGGCGCGA TATGTTTAAA ATACTCCTTT ACATATATTG TTTAATAATA AATTAAAAAA GAGCATCTTT GGTTTTCATT TAAAAAATTT AACAAACTAT CTCAGATATA  TTTACACTAT ATCTGGATCA TTGTTATCTA CTGTATTGTA CAGTAACATT ATTATACTTA CAATATTTGT TTGGATTATT ACTTAAAATG TATTGTATTG TATTATAAAA TTTGGTTGTT  AAGTAATAAT GAAAACCACT ATTTTATAGA ACATTCAATT TGGTGTGTTC CCATTGTTAC TTAATATCCT TTTTCAATTA TATATTTACA TAATATTTTA AAATACTATT TTACCCTTTA  TCTTAATTAT TTGAATCTAC TAAAACCTCC TACCATAGAA TAATTAGGAT ATTTTAGTAA ATTTATAAAT TACAATACAG TACGTACTAT CAAACCAAAC AATTAAAATG TTATTAAACA  ACAACATACA ATACAGTCTA GCCAAACATT GTATCTACCA TACAATACAG TACAATAGAG TACAATACAA TACAATACAT TATGAAACAA TCGGTAACAA TGATCCAAAC AAAGTGTTAA  AAGGGAATTT TGTTTCAAAA AAATCGATTT AAAGTCATAT CACAAAAATA TTTATAGATT AATACGAATG AAAAATTAAA ATTTAAACGC TCAAAAATAT CGTAATTCAT AATGAGGTTA  TATGTACGAT TTCCTAGCTC GTCGTAGAGA ATCTCTTAAA GTTATTTAAA AAAATCGACC AGGGGATAAA ATATAACTAG AAATTTGTTA AGAAAGTCCC ATAAAATTGT AACAATTGCT  ATATAAAAGA AATTCCATTA CACATCAAAA ATAAATAAAC AAGATTAGAA ATTCGGAGTC TAAAAAAAAA TAGTATAATT GTAGAAATTA GACCTCTAAA TATAAATTCC TTCAGAAACT  CTTTTTCCCT CTCATAAGTT TCTATCAAAT CTAATTAATA TATATTCATT TAAATGATTG AACAAAAATT GTTCATACTC AATTTTAGTG AACTTATTTA AAAGACCAAA ATTAATGAAA  AGTATATTGA AACTCCAAAA AAACACAAGG GACCATTACC TACTATAACC CTATACATTA TTATAACGTT TAATTTATAT ACACTAACAG TATATTTAAT TTCGCAGAGA CGTCACATGT  GTCATGCTAT GTTACTAGAA ACGGTTGCAG CCGTGCCAGG CATGGTAGGT GGTATGCTCC TCCACTGTAA ATCCCTCCGT CGATTCGAGC ACAGTGGTGG TTGGATCAAA GCCCTCCTCG  AAGAAGCAGA GAACGAACGG ATGCATCTCA TGACCTTTAT CGAATTATCA AATCCGAAAT GGTACGAACG TGCATTAGTC TTTGCAGTTC AAGGCGTATT TGTCAATGCC TATTTCATTG  CCTATTTAGC GTCCCCAAAA TTGGCTCATC GAATTGTTGG TTACTTAGAA GAAGAAGCAG TAAATTCGTA TACAGAGTTT TTGATCGATA TAGAAAAGGG ACTTTTCGAG AACTCGCCTG  CACCGGCTAT TGCTATTGAT TATTGGCGTT TGCCGGCCGA TGCAACGCTA AAAGATGTTG TTACTGTTAT TAGGGCCGAT GAGGCACATC ATCGGGACCT AAATCACTTT GCTTCGGTGA  GATTTTTCTA CTTTTAATTT TGTACGTTCG AATTTTTATA GTATTAAAAA GAACTATTTG TGTTTTTTAA AAATTTAAAT TTTTTTTTTG TTACACAGGA TATACAGTGT CAAGGGCATG 
AGTTGAAGGG CTACCCTGCC CCAATTGGAT ATCATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCGTA ATGCAGCAAT GAAAATATCT GGATTACTTA TGAGACAATT ACGGGGCGAA TTTTTGCCCC GTGGAGGCAT GGTACAAATT CGTCATTGGA GTAATATGAA TACTTCTAGT  AAAACAAAAG AAGAACAAAA AACACATAAT CAACCATCAC ACACTGATGC AACCAACGCC GCCGGCGACA AGGCTAAGAA AATTGTTAGC TATTGGGGGG TGGATCCTCC CAAAATCTCC  AAGGAAGATG GTACACCATG GAAGTGGAAC AGCTTCAGGC CATGGGAGAC GTACTCAGCT GATATTTCAA TTGATGTGGA GAAGCACCAT ATGCCTACCA ATTTTATGGA CAAGTTTGCT  TATTGGACAG TCCAATCTTT AAAGTACCCC ACCTACTTGT TTTTCCAGAG ACGTCACATG TGTCATGCTA TGTTACTAGA AACGGTTGCA GCCGTGCCAG GCATGGTAGG TGGTATGCTC  CTCCACTGTA AATCCCTCCG TCGATTCGAG CACAGTGGTG GTTGGATCAA AGCCCTCCTC GAAGAAGCAG AGAACGAACG GATGCATCTC ATGACCTTTA TCGAATTATC AAATCCGAAA  TGGTACGAAC GTGCATTAGT CTTTGCAGTT CAAGGCGTAT TTGTCAATGC CTATTTCATT GCCTATTTAG CGTCCCCAAA ATTGGCTCAT CGAATTGTTG GTTACTTAGA AGAAGAAGCA  GTAAATTCGT ATACAGAGTT TTTGATCGAT ATAGAAAAGG GACTTTTCGA GAACTCGCCT GCACCGGCTA TTGCTATTGA TTATTGGCGT TTGCCGGCCG ATGCAACGCT AAAAGATGTT 
GTTACTGTTA TTAGGGCCGA TGAGGCACAT CATCGGGACC TAAATCACTT TGCTTCGGAT ATACAGTGTC AAGGGCATGA GTTGAAGGGC TACCCTGCCC CAATTGGATA TCATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAAACACTA TATATAAACC AACAATTTTT CACCATAAAA AAACATCATC AACATTTCTT ATTTTGTTAA ATTTCAATCA TTTGAATATG AATCGTAATG CAGCAATGAA AATATCTGGA  TTACTTATGA GACAATTACG GGGCGAATTT TTGCCCCGTG GAGGCATGGT ACAAATTCGT CATTGGAGTA ATATGAATAC TTCTAGTAAA ACAAAAGAAG AACAAAAAAC ACATAATCAA  CCATCACACA CTGATGCAAC CAACGCCGCC GGCGACAAGG CTAAGAAAAT TGTTAGCTAT TGGGGGGTGG ATCCTCCCAA AATCTCCAAG GAAGATGGTA CACCATGGAA GTGGAACAGC  TTCAGGCCAT GGGAGACGTA CTCAGCTGAT ATTTCAATTG ATGTGGAGAA GCACCATATG CCTACCAATT TTATGGACAA GTTTGCTTAT TGGACAGTCC AATCTTTAAA GTACCCCACC  TACTTGTTTT TCCAGAGACG TCACATGTGT CATGCTATGT TACTAGAAAC GGTTGCAGCC GTGCCAGGCA TGGTAGGTGG TATGCTCCTC CACTGTAAAT CCCTCCGTCG ATTCGAGCAC  AGTGGTGGTT GGATCAAAGC CCTCCTCGAA GAAGCAGAGA ACGAACGGAT GCATCTCATG ACCTTTATCG AATTATCAAA TCCGAAATGG TACGAACGTG CATTAGTCTT TGCAGTTCAA  GGCGTATTTG TCAATGCCTA TTTCATTGCC TATTTAGCGT CCCCAAAATT GGCTCATCGA ATTGTTGGTT ACTTAGAAGA AGAAGCAGTA AATTCGTATA CAGAGTTTTT GATCGATATA  GAAAAGGGAC TTTTCGAGAA CTCGCCTGCA CCGGCTATTG CTATTGATTA TTGGCGTTTG CCGGCCGATG CAACGCTAAA AGATGTTGTT ACTGTTATTA GGGCCGATGA GGCACATCAT 
CGGGACCTAA ATCACTTTGC TTCGGATATA CAGTGTCAAG GGCATGAGTT GAAGGGCTAC CCTGCCCCAA TTGGATATCA TTGA 

Retrieve as FASTA