Entry information : LePTOX01(Solyc11g011990.1)
Entry ID 15946
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePTOX01(Solyc11g011990.1)
Name LePTOX01(Solyc11g011990.1)
Class Plastid Terminal Oxidase    [Orthogroup: PTOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePTOX01
start..stop
S start..stop
AtPTOX01 482 3e-172 63..359 54..350
ThasPTOX01 481 2e-171 2..361 4..358
HaPTOX03 474 2e-169 62..360 44..333
PpaPTOX02 396 1e-137 85..353 80..374
Literature and cross-references LePTOX01(Solyc11g011990.1)
Protein sequence: LePTOX01(Solyc11g011990.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   41950.26  
PI (pH):   %s   5.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAISISAMSF GTSVSSYSCF RARSFEKSSV LCNSQNPCRF NSVFPIRKSD GASRCSVSRK SCRVRATLLQ ENEEEVVVEK SFAPKSFPDN VGGGSNGKPP DDSSSNGLEK WVIKLEQSVN  ILLTDSVIKI LDTLYHNRNY ARFFVLETIA RVPYFAFISV LHMYESFGWW RRADYMKVHF AESWNEMHHL LIMEELGGNA WWFDRFLAQH IAIFYYFMTV LMYALSPRMA YHFSECVESH  AYETYDKFIK DQGEELKNLP APKIAVDYYT GGDLYLFDEF QTSREPNTRR PKIDNLYDVF MNIRDDEAEH CKTMKACQTH GSLRSPHTDP CDDSEDDTGC SVPQADCIGI VDCIKKSVTD 
TQVTKR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from gneomic and ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATTT CGATTTCTGC TATGAGTTTT GGAACCTCAG TTTCTTCATA TTCTTGTTTT AGAGCTAGGA GTTTTGAGAA GTCATCAGTT TTATGCAATT CCCAGAACCC ATGTCGGTTT  AATTCTGTTT TTCCGATTCG GAAATCTGAT GGGGCTTCAC GGTGTTCTGT TTCTAGGTAA ATTATTGCAT AAAGTTCTTG TTTTTATGGT AAATCAGCTC AAAAATATGA TTTTTCCCCC  AAATATTTGC TGTTTTTTGG GGTTGTCGTT TAGTATATTT TTGTTGGAAT TTGAAATTGA CAGTTGTGGC TAAGAGAATT GATTTATTTC TTTGGTTATT TAGTTTGTGT CAATTGCAAA  TGATTAGCAT TCAATGATTA AAATAAAGGC AACCCGATGC ACTAAGCTTC CACTAGTTTT ACGCCATTTT ACAGTAGCAC AACTCAAACT CGTGACCTCT AGGTAACCTA GCAGCAATTT  TACAAGTTAC GTCAAGGCTC CATTCTTAAT GGATATTTCT TAAAAGAATT TTGCTACGCA TTTACGAGTT AAAAAGGACA TTTAGTTAGT ATTTGAATCT TGCAAATGAT TAGCATTGAA  AAGAAGTTCT TGTGCTTTTG TTGCTTAAGA AGATAGTTTA TATAGTATTA GAATGTAATG AGCTCAAATA GAGCCGAATG AATATAGAGG ATCTTGTAGT CGACTTGAAC TAGTTTGGAA  TCGAGGCAAG TTAATTGTTT GATTGCTTTT TTGTAGTAAT TTGCAGGTTG ATTGACATTT TCTTGAACTT GACATAGATG AATGACGTCC TTCTCTCCGT TGTACAATTG TCTGCAGGAA  ATCATGTAGA GTTCGAGCAA CGTTGTTACA AGAGAATGAA GAAGAAGTGG TTGTGGAGAA ATCTTTTGCA CCTAAGAGTT TTCCTGATAA CGTGGGAGGG GGAAGTAATG GGAAGCCACC  AGATGATTCA TCCTCTAACG GTCTAGAGAA ATGGGTTATA AAGCTTGAGC AGTCTGTAAA TATCTTACTC ACGGTAAGTA TTACATTTTC TGAATCTAAT TAGTGTCTTG TATATTTCTT  TTCAACTCGA CAACAGGCAT CTTCGTCGGA ATTGCGTGTC AATTAATATC AGTCCACTAT GGCTCGACCT TAAAATAAGT TAATCTTGGC TATATGGATT CATGCAGCAT GGTGCCAATA  AGTTATTTCT TCACTATTAA CTACACAATG GCCTATCCTT TCTCCCTTTC CGTAAAAGAA GAAAACACAA CTAGATATGA TCATGGTTTA TGTTAAAGTT TTTGTTTGAA TCACTTTAGT  TGCAACTTGA GCAATGCATC GGAATTCGGT AATAGAGTGT GCAATTTCAT CTTCTTCTGA TATGTTTTGT ATTGTAAGTT TATGGAATTG CTTTGTGCAG AGTGAATAAG TTATTTTCTG  AAATTAATTT TATAGTATTA TGTGATACGT TGATGAAAAG GTGTTTGACA GTATTTTCTA TTAGGAACAT CTTTATTGCA ACAGGTTGAC TGCTGAGTAG CTTTTCAATA TTTTCATTTG  GTTTGAAATT TGTCTGATTT CAAAATTATG CCTGATAATT TCAGGATTCA GTGATAAAGA TTCTTGACAC TTTGTATCAC AACCGAAACT ATGCGAGGTT TTTTGTTCTG GAAACAATTG  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AACTTCTTGA TTTCCTTTCA ATGCATCCAA GTTTTATTTT CCTCTCTGCC TTTTAATTAA ACTGATGAGC ATCTGTCTTT CCGGTTTAGT GAGTGACTTG TATATGTTCT GTCTTAACTA  GCCATAGTTT ATTCAGAATG AGTTAAAATG TGAAGAGCTT GATGTTTCGT TTTCTCCATG TGCAAGTTTG AACTTTTTGC TGGAAGAGTA TATTACAGCT CATTTACTTA TTTACTGAAA  GAATAAACTT TTTCTCTGGG ATGGGCTTGT ACAAATTTGC GCATCAATGT AATGAACGTA TATGTCAGGC ATCACAAGCC CTTAATTTCT AGAAATTTTA TTGCGATATA ATACCAATAT  TTCTTTGTCT TGGTATTAAT GGTAATTGTG GTTCAACTGC AGGAATTAGG GGGAAATGCT TGGTGGTTTG ATCGATTTCT TGCACAACAT ATAGCTATAT TCTATTATTT CATGACAGTC  TTGATGTATG CTTTGAGCCC GAGAATGGCA TGTAAGTTGA AATATTAAGA TCTGATTTAA TCATTTTTCT GCAACGTACC CGTGTTCTTT CAATGCGTCT CTGTGGGTTT AGCTTTCACG  GTTTATCCAT TCACAGTTTC CCCTGGCTTT TGTACGAGTT TCATCTTTTC ATTGTTGTTG TTTTTAGGGG AAGCATTAGC ATATTTTAAG TCTTACTTTA TTTAAATATT TGGGGGAGGA  AGGCACTTTT GATATTTTTG CCGTTCTTTG CCTGGCTTTA AGTTCTTTGA TTTGTTTACC TTAATAAAAT TGGTGATTGG TCACGATTTT ATGTTTGATA AGGCCCTTAA GGAGTGACCG  ATGAGTTTTT TTTATGTATG GCCCATTATC AAGCAGTGTT ATCAAAGGCG CGCTTTAAGC CTAAAGCGAC GCTCAAAACG TGTTGAGCGT TTAGCCTCGC TTTATGTGCA CTTTAGTGTT  GTCATCAAGG TTCCAAGGCA AGCATTTCCT TGCCAATGAG CCTCTTATGA AGAATTTGAA GCTAAACAAT TGATATTTCA CTCTATCATA AATTTTTTTC AATTTGGTTA GTCATATATT  TTAAACATTC ATGTTTATAA TTATTAAGTT TTGGACTAAA CATATATATT TTATTCTTTG CTCCCTTTGT GCCTTTTTTC GTTAAAGCCC ACGCTTTATT TGCGCTTTGC GCTTAAAGCC  CCCACAGACC TTAGAGCTTT TTTGCGCTTT TCGCCTTTGA TAACTCTGTT ATCAAGGCTA ATATCGATAC ATTGATTGGT GTTCCTTCAA TTCTCGCAGA TCATTTCTCT GAATGTGTGG  AGAGCCATGC ATACGAGACT TACGATAAAT TCATCAAGGA TCAAGGAGGT AATTTTTTTT TAAAGAAGTT GAATAGTTTG AACAACAATG TTGCACTGAT GGAATTAGAA GTGCTAGTTT  CTTTAAATTT GTTTGGCCGT TTCTCGAGGA TATGCTGTAC TATACTTCAA TTTGTTTGTT TCGAACTCTT TCCTTTTTGG CAACTCTTTA ATACCTACAT TCAGCAATGC ATGTTTAAGA  CCACGAGAAT CAAGGGCATT TTGGTACGAA CAAATTGAAG CGAAGGGAGT ATATATTCTT AACTAATATG TAGTCCGAAT GCTTCTGCAG AGGAATTGAA GAATTTGCCC GCTCCAAAGA  TTGCAGTGGA CTACTACACG GGAGGTGACT TATATTTATT TGGTGAGTGT TACATATCTT CCTTAATACT CTCGTGACTC GATATCTATC TGGTTCAGTA ATCTAAACCG TTTTGTGATT  GCATCAGATG AGTTTCAAAC TTCACGAGAG CCTAATACTC GAAGACCAAA AATAGGTAAA ACACACACCT CATATACCTT TAGTAAAACC GTTTTTAGAC AAGTGAGAGT ATAATACTGA  TTGAAGTCTT GCGTTTCCTG TTTAGATAAT CTCTATGACG TATTCATGAA CATTAGAGAT GACGAAGCAG AGCATTGTAA AACGATGAAA GCCTGTCAAA CTCACGGGAG CCTTCGTTCT  CCACACACAG ATCCATGCGA TGATTCTGAA GATGATACAG GGTGTTCCGT ACCTCAAGCT GATTGTATAG GTATCGTGGA TTGTATAAAG AAGTCAGTCA CCGATACTCA AGTAACCAAA 
AGGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATTT CGATTTCTGC TATGAGTTTT GGAACCTCAG TTTCTTCATA TTCTTGTTTT AGAGCTAGGA GTTTTGAGAA GTCATCAGTT TTATGCAATT CCCAGAACCC ATGTCGGTTT  AATTCTGTTT TTCCGATTCG GAAATCTGAT GGGGCTTCAC GGTGTTCTGT TTCTAGGAAA TCATGTAGAG TTCGAGCAAC GTTGTTACAA GAGAATGAAG AAGAAGTGGT TGTGGAGAAA  TCTTTTGCAC CTAAGAGTTT TCCTGATAAC GTGGGAGGGG GAAGTAATGG GAAGCCACCA GATGATTCAT CCTCTAACGG TCTAGAGAAA TGGGTTATAA AGCTTGAGCA GTCTGTAAAT  ATCTTACTCA CGGATTCAGT GATAAAGATT CTTGACACTT TGTATCACAA CCGAAACTAT GCGAGGTTTT TTGTTCTGGA AACAATTGCA AGGGTTCCTT ATTTTGCATT TATATCGGTT  CTTCACATGT ATGAGAGCTT TGGCTGGTGG AGAAGGGCAG ATTATATGAA AGTGCATTTT GCTGAAAGCT GGAATGAGAT GCACCATTTG CTCATTATGG AAGAATTAGG GGGAAATGCT  TGGTGGTTTG ATCGATTTCT TGCACAACAT ATAGCTATAT TCTATTATTT CATGACAGTC TTGATGTATG CTTTGAGCCC GAGAATGGCA TATCATTTCT CTGAATGTGT GGAGAGCCAT  GCATACGAGA CTTACGATAA ATTCATCAAG GATCAAGGAG AGGAATTGAA GAATTTGCCC GCTCCAAAGA TTGCAGTGGA CTACTACACG GGAGGTGACT TATATTTATT TGATGAGTTT  CAAACTTCAC GAGAGCCTAA TACTCGAAGA CCAAAAATAG ATAATCTCTA TGACGTATTC ATGAACATTA GAGATGACGA AGCAGAGCAT TGTAAAACGA TGAAAGCCTG TCAAACTCAC  GGGAGCCTTC GTTCTCCACA CACAGATCCA TGCGATGATT CTGAAGATGA TACAGGGTGT TCCGTACCTC AAGCTGATTG TATAGGTATC GTGGATTGTA TAAAGAAGTC AGTCACCGAT 
ACTCAAGTAA CCAAAAGGTA G 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATTT CGATTTCTGC TATGAGTTTT GGAACCTCAG TTTCTTCATA TTCTTGTTTT AGAGCTAGGA GTTTTGAGAA GTCATCAGTT TTATGCAATT CCCAGAACCC ATGTCGGTTT  AATTCTGTTT TTCCGATTCG GAAATCTGAT GGGGCTTCAC GGTGTTCTGT TTCTAGGAAA TCATGTAGAG TTCGAGCAAC GTTGTTACAA GAGAATGAAG AAGAAGTGGT TGTGGAGAAA  TCTTTTGCAC CTAAGAGTTT TCCTGATAAC GTGGGAGGGG GAAGTAATGG GAAGCCACCA GATGATTCAT CCTCTAACGG TCTAGAGAAA TGGGTTATAA AGCTTGAGCA GTCTGTAAAT  ATCTTACTCA CGGATTCAGT GATAAAGATT CTTGACACTT TGTATCACAA CCGAAACTAT GCGAGGTTTT TTGTTCTGGA AACAATTGCA AGGGTTCCTT ATTTTGCATT TATATCGGTT  CTTCACATGT ATGAGAGCTT TGGCTGGTGG AGAAGGGCAG ATTATATGAA AGTGCATTTT GCTGAAAGCT GGAATGAGAT GCACCATTTG CTCATTATGG AAGAATTAGG GGGAAATGCT  TGGTGGTTTG ATCGATTTCT TGCACAACAT ATAGCTATAT TCTATTATTT CATGACAGTC TTGATGTATG CTTTGAGCCC GAGAATGGCA TATCATTTCT CTGAATGTGT GGAGAGCCAT  GCATACGAGA CTTACGATAA ATTCATCAAG GATCAAGGAG AGGAATTGAA GAATTTGCCC GCTCCAAAGA TTGCAGTGGA CTACTACACG GGAGGTGACT TATATTTATT TGATGAGTTT  CAAACTTCAC GAGAGCCTAA TACTCGAAGA CCAAAAATAG ATAATCTCTA TGACGTATTC ATGAACATTA GAGATGACGA AGCAGAGCAT TGTAAAACGA TGAAAGCCTG TCAAACTCAC  GGGAGCCTTC GTTCTCCACA CACAGATCCA TGCGATGATT CTGAAGATGA TACAGGGTGT TCCGTACCTC AAGCTGATTG TATAGGTATC GTGGATTGTA TAAAGAAGTC AGTCACCGAT 
ACTCAAGTAA CCAAAAGGTA G 

Retrieve as FASTA