Entry information : LeFer03
Entry ID 15947
Creation 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFer03
Name LeFer03
Class Ferritin    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFer03
start..stop
S start..stop
ThasFer01-1 204 1e-66 48..168 61..181
ThasFer04 201 2e-65 44..168 56..180
HaFer05 201 2e-65 50..168 45..163
HaFer04 201 2e-65 50..168 45..163
Literature and cross-references LeFer03
Protein ref. GenBank:   XP_025888835.1
Protein sequence: LeFer03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   209
PWM (Da):   %s   24647.15  
PI (pH):   %s   5.76
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Not predicted from Phytozome. No EST found.
DNA
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ATCATAACCT TGGTTCGCCC TTCCAGGCTT GGTTCCAGTC TCTACGGGCT CAGCAGCAGC TTCTTGAGCT GGGCCACCAG CATGAAGCTG TTCCTGATGC TGGACTTCAG CAATGGTAG 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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GTTCCTGATG CTGGACTTCA GCAATGGTAG 

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