Entry information : LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Entry ID 15948
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Name LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Class Cu/Zn SOD    [Orthogroup: CSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCSD01
start..stop
S start..stop
ThasCSD01-1 272 5e-96 1..152 1..152
ThasCSD01 268 2e-94 1..152 1..152
HaCSD01 269 3e-94 1..152 45..197
AtrCSD02 268 7e-94 1..152 25..176
Literature and cross-references LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Protein sequence: LeCSD01(Solyc01g067740.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   152
PWM (Da):   %s   15275.58  
PI (pH):   %s   5.77
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVKAVAVLNS SEGVSGTILF TQDGDAPTTV NGNISGLKPG LHGFHVHALG DTTNGCMSTG PHYNPAGKEH GAPEDEVRHA GDLGNITVGE DGTASFTITD KQIPLTGPQS IIGRAVVVHA 
DPDDLGKGGH ELSKSTGNAG GRIACGIIGL QG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs . Highly expressed.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTGCTCCGGT GAGGTGAAGA TTCAGCAACT AGCGGTGGTG TCTGTCTTAG AATAAAGTTA TATTGGAGCT GCTGAGCCTT GTTTTCTATG TATTTATCAT TTGACGCCTT TTGAATTGGG  GTTGAACCAT TCATAATACA TGACTGTAGT GCTGCTTTTC AGTGGATGTT GTACTAGTTT TTGCCGATCA TTAACCATAA AAAAACATGG GCTGTGTTAG CTTTGCTGGT TTCTTAAATT  TGAGTGGATG GTTTGAAAAC TAGACAAAAT TTAGATGAAT TTGCAGATTA CAGTGCCTGC AGTTTTTGTT CATAAAATTG TATTTCAACT GACTTCTCAG ATGGCAGAGT ATTTGCAAAA  TGATCCAAGG CTTACATAAA CATTGTGTGT GGAATGATGT TTTGTGAGGT TTACGTCTGA AGATATTGGT GCAGCTACAA TCTCTTCAAG CAACAAACAT TAGTTATAAT GCTAGCAACA  ATTCTAAAAC TATAACTAGA TTTGAAAACT CAAAGCATTA AACCAAATAA ATTTTTTCAA ATGGTTGCTT CTATTACACC TACTTCGTCT GTCTTATTCT ATAGAAAAAT ATAACCAACA  TGTATATATA CCTGCTCCAC ATGCACCAAT ATAGGAAAAA AAAATATTTT TTATATTTTT GTGGATTGTG CAATAATATG GAATAACAAA CAATAACATC CATCAATCTT GTTGTTTTAC  ATCCCTCATC ACTTCAATCT ACAACATATC AAAGAGTTTC TACATTTTTT CTAATTATAA CCTCTTTCAT TCTTTGGAAT ATTTGAAAAA AACAGAAACA GAAAAATCCA AAAATTAAAA  GTACAAATAG AAGTCCGCCG AAGGAAATCA AAGAATTCAA ATATGAATAG AAACCAGCCT TATGATTTTT ATGCATCTAC TTCTTTTGTA ATTAATGCAC TGATAGAGAC GTTAGTGAAA  CTGTGATCAG TTCCTTTTTG TATGTATAAT CCTTTAAAAG ACGAATAAAA TCCCTTCTTT TTAAGCCAAA GAAAATCATT TACTTCAAAA CGTCATTAAA GAAGCTCGAA GCTAAAGTTT  TAAAAATCGA CTTATAGCAA ACTTACTTCA TTTCAAGTGA ATAATATCTC AAAAGAACTA GAAAGTTCGA GTATGAAATT AGGATAAAAT TTGAGCTAGT TATGGATTAA ATTGTATGCT  TAGTTGTATA AAACTTATGT TTGAAGTTCT ATTTGTTGTT GGAGTTGTAT AAATTAGTAT GAATATCGTA TAGAAGTAGT ATATAATAAT ATTAAATTTG TAGAAACCTA ACCTACATTT  TATATAATAT TTATACACTT GACACATATA GCAATACCGT CTATATATTG ATTTTATATA CAAAATTATG AACAAAAATT TCAAGCATTG AGCATATACA CACATTTCAT ACCATTTTCA  TAGAGAAAAA ATTGAAGTGA GAATTTCACA TATATTTTGC AAAAGAATTC CTGATATGTT TTGTCTTATT ATTAGGTATA TATAGACACA TCATTCTCCC AAATTTGAAG GAAAAATTAC  ACATTTTGAT AAATAATTAT TAATTTTAGC GATATTTTTT TTATATTTAT TAATATTTGT AGCAATAAAT AACAATATTA TGATAAATCT GTAATATGTA TTAAAAGTGA ATCATGTATG  CAATATATAT GAATTATAAC TGTTTTAAAA TATATTATGC TTGTATAGTA AGAAATTGAC ACGTTGTATT ATAAGGGTAT TAAAATATGT GATACATGTG TTATTTATCA ATAGAACTTG  TATTATATGT GTTTTATAAA TTGTTCTCTG TAATATGTGT TAAAACTATA TTATAAATAT ATTAAAAATA TTTAAGTGAA AAGAAAATAT CATTGTCATA AAGAATAAAT ATTTTCTTCA 
AATTTGAATG GGTATGAAGT TGACCCATAA ATCCTCTAGT TGCCAATAAT AATGGTCATT CGTCATTTTT TGTCTTAAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTTTACAA TTATCGAACT CATCATTATC AGCACTCATA TTGGACTTCT CTCTCTCTCT CTCTAAGGGT GACCTGAGGT AATTCAATTT TTTTCTTCAT CTGTTTTCGA TAGTGATTTT  TGATTATTCA TTTGATTCGC TTTCTCTTGA TGCAACTGAT CTCTCTTTTA TGATGAATGA ATGTTGGATT CAACTTGTGA TTTTGCAGAT CTAGACTTCT TTTTAGGACT TTCGCTTTTG  AATCTGTCGC TGTCTGCCTT TTGAGTTTAT TTCTATGCTG ATTGTGGTGG AGGCCTATTG TTGAGTAGAT ATTAATTTTA TTAGGGAGAT AGAGAAAGAG AAGCTTAGGA TATCATTTTT  ACCTTGCTAA GAGGCGGATC TAAGATTTAG TTGCAATTTT TTTTTATGGA TTTTTAACTG TACATGTTTA TGTCGTTACT CTCATTCCGC CTTTATGGAT GTGTGGTTCG ATCTAATTAG  AGTTTGAGTT TAGAATTATT TGCGTTATCG ATTTGGACTA ATGCATAGGC ATAAATTGTA TCACCTGCAA AATGCGTGTG TAAGCAAATC CTGCTGCAAG TATGTGTTTA CTGTCTTTCT  TATGGGGCTT GGGTGAGAAC ATGAGGATTT TGCGATGGTT CGGGTTGAAG ATAACATTGT TTAGTGTTTT AGGACGAAAT TGGTGTTTTC TTTGTTTTGT TTTATTTTGA AAAAAACAAC  ACATTTGGGC TTGTTTGGAA AACTAGAGGA TTGTTTTTTC GTAATTTCAC AACAAACATG ACCAAGTGTT TTTGTATGTT ACCTCTTTTA GATATTCTTA TATGGTTGAG ATGAAGAAAT  GGAATGCCTA AGGTTTTGGA TGTCAATTTT TGTGATCGAC TTGTTTTCGA GATGAACTAT ATATTGCCTG GGTTGTGACT GAAAGACTTT CTTGCTTAAT GTTTCTAACT GATTGGCCAA  ATGCGATTTT CTATAAATCC AAACTTGTAT ATGGAAATGT TGTCTATCAT CTTATGAGAT GAGCTGCATG TTAACTTATT AATGTGCTTC GTATATGCTC TTACATGTGT AGCCTTGATA  ACAGACTCTT GTATCATAAT TTTCTAGATC ACATACAAAA ATGGTGAAGG CCGTCGCCGT CCTTAACAGC AGTGAAGGTG TTAGTGGCAC CATCCTCTTC ACTCAAGATG GAGATGGTAA  TTTACTTTAA TAATTGTAAA ATGGTTTCTT CATGCATCTA TCATGGGTGA CCGGTCTCTA ACTGATGTGA TGCATACAGC TCCAACCACA GTTAATGGAA ATATTTCTGG CCTAAAACCT  GGACTTCATG GCTTCCATGT CCATGCCCTT GGTGATACCA CAAATGGCTG TATGTCAACA GGTAATTTTA TTTTATCTAT TTGAGACTCT GACAAATAAT GATTTTTAGA TGTTTTGAGT  TTTGAATTTT TTCTTGGTTA ACTTGCAGGA CCACATTACA ATCCTGCTGG TAAGGAGCAT GGTGCTCCTG AAGATGAGGT GCGTCATGCT GGTGATCTTG GTAACATCAC AGTTGGAGAA  GATGGTAAGT GTTCCTTGTT TAATAATTTA ACTTAATCTG GTTGTAGTTA TCCTTATTCA TTTCAAATCA AATGTCTGCA ATTGAAGATT TTTATCATCA TCTATGCCTA GTGTTTTTGG  TTTGACATGA TGTATAGTTC ATTTGGAAAA ATTAATTCTC TTGTAGTAAA GGTTTACCCA TGATTTTATT GTCCCGAAAA CAACAATTAT TTTGCATAGT GAAGCCAAAA TTTATTTCAG  AGAGGTCAAT GCTGCTCTCT CCCTCTCTCT CCTTGCGTAA TTCCAAATTA GTTAGCATCA CTAACGATGT AATCATTGCA AAAAATTTCA GGTACTGCAT CTTTTACTAT TACCGACAAG  CAGGTAAATT CTTTGTTGAA CTCTAAGCTT TAGACTTGCT CTAATATTTG TTCCTGAACT AATTGGCAAG CTGATTTGTT GCAGATTCCT CTCACTGGTC CACAGTCCAT CATTGGAAGA  GCTGTTGTTG TTCATGCTGA TCCTGATGAT CTTGGAAAGG GTTAGTTTCT CTACTTCAGT GACTAAACTT TAATGAGCTG AGTACGACAT GCTTTTATTA TTACAACAGA ATGTGAAAGA  TGAAAGAGGA TAAGAAAGTA AGAAATAAAA TACATATAAC CTTGACACTC AACCTTTTAT TTTAGTTTGA GACCATCAAC ACTCGTCCAT AGTGCTTGAC ATATAAAAAC CCCATTTCCA  TTTAATGTGT TTTCTTCAAG AAGTATATCT GGGAGATTGG TGTATTATAA TGGAAAGTAT TATGGATTGG AGAAGGAAGA AGTCTAGGTG TGATTGTGTC ATATCTTATA ATTTAATTTT  GAAGAAAACG ATGAAAGCTC ATTTAAATAA GACTAGGTAA AGTGAAAGAG AAAGGGGCTC TGAACCATGA CCACACTAGC AAGGATCCAC TAGGTTCATT TAAATAAGAC TAGGCAAAGT  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TTTTTAATGT TTCTGTAAGG GGAGGGACAG AGAGAAATGG ACTAACATTT GCAGATGTTG GATATAAATT GATTTTAGCC TGAAGCTGAG ACTTGTGATT GATTGATTGT AAGAAAGGTG  GACTGAAATC TAATAAGAAA ATGCATTACA ATGATAAGCT ATTGAGTTCT ATTTTTGCTT AGAGTTAAGT CATTGTGAGC CCTTTGCTTT ATCCATCTAA AATTACTTCA AGATCCTTCA  GGATTAAGGC TGGATAAGAG CCTGTTTGGA TTGACTTATT TCAAGTGTCT TTAAGCCAAA ATAACTTTTA AGCAATTTTG GAGTGTTAGG GTATATAGCT CTTAGTTTTA AACAGGCTCT  AAGACCCATA GGTTTTACAT ATCCTTTAGT GTGTGTGATT GGAATGGTTG AACTGCAAGG AATATGTTCC TCATTGTGCA AATTGTGAGA TCTCGAATGC AAATGTTCGA GGATGACCAA  GTATCAACTT GTTTCAGAAA ATTGAAATTA GGGAAGTGGA CTATAGTTGC AAATAATCAA GTGGGCGTAC AGTGATATAT GAGATTAGGA TTATGCACAA AAGAGTTATG CTCTATTTAG  CTACGAGGTT TAGTATTCTA TTTGCATCCA AACAAATTTG GTGTCTGGTG TAGGAGCATT GAAAATCCTT TCATCATGGA ATAAAAATAA GACGGTTAAA ATATAATTTA CTTTAACCAT  ATTTGTAACC CACTTTCACT TAATCTGACT TGAAATTTAT TTTCCTGCTG TTTTAGGAGG ACATGAGCTC AGTAAAAGCA CCGGAAATGC TGGCGGAAGG ATTGCTTGTG GTAAGTACTA  ATTGTCTTGC ATCTGGGACT AGATCCATTG ATTTATGTGT CTCATTTAGT CATTTAACTA TGTGTCGTAA TTACATTGAT CAATTGCTGA TAGGTTAGTT CAATCTCTTT GATTTCTTTT  TCAAATGATT CTTCTGGGCT ACTTGTTTTG AGTAAAATAG AAACATGCAA GATTCTTTTG CTTTCTAATC TAAGTTGTCC ATTTGTCAAT GTGCTTTCAA ACGACAAGTT GAATCATTTG  CTTTTTGAGA ATTATATAGG CAAGCCTGGT TTTGTTCTTA ATTATGTTTG TAGTAGTAAT AACATGTGGT ATTGTCACTC TTGTCAGGTA TTATTGGCCT CCAGGGTTAA CTGCTCCGGT  GAGGTGAAGA TTCAGCAACT AGCGGTGGTG TCTGTCTTAG AATAAAGTTA TATTGGAGCT GCTGAGCCTT GTTTTCTATG TATTTATCAT TTGACGCCTT TTGAATTGGG GTTGAACCAT  TCATAATACA TGACTGTAGT GCTGCTTTTC AGTGGATGTT GTACTAGTTT TTGCCGATCA TTAACCATAA AAAAACATGG GCTGTGTTAG CTTTGCTGGT TTCTTAAATT TGAGTGGATG  GTTTGAAAAC TAGACAAAAT TTAGATGAAT TTGCAGATTA CAGTGCCTGC AGTTTTTGTT CATAAAATTG TATTTCAACT GACTTCTCAG ATGGCAGAGT ATTTGCAAAA TGATCCAAGG 
CTTACATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGG CCGTCGCCGT CCTTAACAGC AGTGAAGGTG TTAGTGGCAC CATCCTCTTC ACTCAAGATG GAGATGCTCC AACCACAGTT AATGGAAATA TTTCTGGCCT AAAACCTGGA  CTTCATGGCT TCCATGTCCA TGCCCTTGGT GATACCACAA ATGGCTGTAT GTCAACAGGA CCACATTACA ATCCTGCTGG TAAGGAGCAT GGTGCTCCTG AAGATGAGGT GCGTCATGCT  GGTGATCTTG GTAACATCAC AGTTGGAGAA GATGGTACTG CATCTTTTAC TATTACCGAC AAGCAGATTC CTCTCACTGG TCCACAGTCC ATCATTGGAA GAGCTGTTGT TGTTCATGCT 
GATCCTGATG ATCTTGGAAA GGGAGGACAT GAGCTCAGTA AAAGCACCGG AAATGCTGGC GGAAGGATTG CTTGTGGTAT TATTGGCCTC CAGGGTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTTTACAA TTATCGAACT CATCATTATC AGCACTCATA TTGGACTTCT CTCTCTCTCT CTCTAAGGGT GACCTGAGAT CACATACAAA AATGGTGAAG GCCGTCGCCG TCCTTAACAG  CAGTGAAGGT GTTAGTGGCA CCATCCTCTT CACTCAAGAT GGAGATGCTC CAACCACAGT TAATGGAAAT ATTTCTGGCC TAAAACCTGG ACTTCATGGC TTCCATGTCC ATGCCCTTGG  TGATACCACA AATGGCTGTA TGTCAACAGG ACCACATTAC AATCCTGCTG GTAAGGAGCA TGGTGCTCCT GAAGATGAGG TGCGTCATGC TGGTGATCTT GGTAACATCA CAGTTGGAGA  AGATGGTACT GCATCTTTTA CTATTACCGA CAAGCAGATT CCTCTCACTG GTCCACAGTC CATCATTGGA AGAGCTGTTG TTGTTCATGC TGATCCTGAT GATCTTGGAA AGGGAGGACA  TGAGCTCAGT AAAAGCACCG GAAATGCTGG CGGAAGGATT GCTTGTGGTA TTATTGGCCT CCAGGGTTAA CTGCTCCGGT GAGGTGAAGA TTCAGCAACT AGCGGTGGTG TCTGTCTTAG  AATAAAGTTA TATTGGAGCT GCTGAGCCTT GTTTTCTATG TATTTATCAT TTGACGCCTT TTGAATTGGG GTTGAACCAT TCATAATACA TGACTGTAGT GCTGCTTTTC AGTGGATGTT  GTACTAGTTT TTGCCGATCA TTAACCATAA AAAAACATGG GCTGTGTTAG CTTTGCTGGT TTCTTAAATT TGAGTGGATG GTTTGAAAAC TAGACAAAAT TTAGATGAAT TTGCAGATTA 
CAGTGCCTGC AGTTTTTGTT CATAAAATTG TATTTCAACT GACTTCTCAG ATGGCAGAGT ATTTGCAAAA TGATCCAAGG CTTACATAA 

Retrieve as FASTA