Entry information : LeFSD02(Solyc03g095180.2)
Entry ID 15951
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFSD02(Solyc03g095180.2)
Name LeFSD02(Solyc03g095180.2)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Fruits
Green Fruits
Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFSD02
start..stop
S start..stop
LeFSD03 400 1e-142 1..264 1..249
AtFSD02 396 6e-140 25..297 27..297
ThasFSD02 368 8e-129 24..303 29..310
HaFSD01 362 2e-126 1..272 1..273
Literature and cross-references LeFSD02(Solyc03g095180.2)
Protein sequence: LeFSD02(Solyc03g095180.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   303
PWM (Da):   %s   34554.1  
PI (pH):   %s   5.43
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAATASATL FSPFLPSPGF HESCRSLNWR THKKQIASKA GTVKVTAKFE LNPPPYPMNA LEPHMSRTTF EYHWGKHHRA YVDNLNKQIV GTELDELTLE DIILVTYNQG NLLPPFNNAA  QAWNHQFFWE SMKPGGGGQP SGELLKLINR DFGSFEAFVK EFKAAAATQF GSGWAWLAYK ANRLDVGNAS NPHPSDEDKK LVIVKTPNAI NPLVWDYSPL LTIDVWEHAY YLDFRNRRPD 
YISIFMEKLV SWEAVSSRLE AAQAQAAERE KEEERKKREE EEEYQDGNEV REMYVETTDS EAD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence frm genomic and ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTGTGTTCT TCCTCAAGTT CAGTGTTGGA AATGGTATCA AGTCAATTTT GCAAAAGCAG AATAAAACGG AGTTAGGATG TTAGAAGTGT AACGAATGTA ATAGCAAGAT GAAGTTGGGT  TTTGATGTTA GAAGTGGATG TACTATCTGA GAAGTACATG TATAGTGAAA TTCATCTGAC TTTGATTCTT TATAATTGCT CAGTACATCA TACTAATTTC GAATGATACA GAAAGATTTA  GATGTTGCAG GTGCTAGAAA GAGGTTCTTT TATTAGATAG CATTAAGGTT CAGCTACTAC TGAAAAAATA GTCTTTGGAG CAATATAATT CTCATCACTG AAGTTTGGCG GTAACAGATG  AAATGGCATG TATACATTGG GAGAGTTTGT TCCCTGCATT TATTCATGTG ATGCAGGACT AGAAACAGGC AACACCATGC ATGCACAGGG ATAAATCTGT TGAAAATCAG GAAGAATTTG  TGGTTTCCAA CAGATACAGA AGAAAAAGAA GAGTGAACAG GTACAAAGAC AATATTTAAC CAGTCAGAGC AGCATTAAGG GCGCTGTGTA CATCAACTCC AATCTGGGCC TCGGCTTTCT  CTTCGTCAGT TGATGCAGTG TTTAGCTTCT GTGTGAACTC TGTGAGGCCT TTTTGAACCA AATTGGGATC GATTTGGTCA AGTGGCACAG CTTCAACAGC AACTATATCT GCGAAAGAAT  TTGCATGAAC AAATGCAAAC CCACCGCTCA CAAAGTACTT GGTTACATCG TTGCCTTCGT GAACTGATAA GACGCCAGGC TTCAGCTCTG CAATTGTCGC AACATGCCCA GGCAAGACAC  CCATTTGTCC TGTAGTAGCG GGGATGATAA CCATATCAAC CTGCAATATG TTTGACGAGA AGGAATAAAC ATCTTGGGGT TCGATTTTCA GATGATGTAA TCCATGCACA TTCTTCATAT  CGACAAGTTC TCTCGTATCA CACGATACCA AATATGACAT CCAGCCACAG CATTAAAATT GAATAACAAA ATTATAGATT GATTCAGGCA ACATTTATAG TTGCTAATCC AAAACATAAT  AAACGTGACA GTCAGATACT GGAATGTGTA TTTAAGATTT CTGAAAATAA CTAACCATTC ACAATTAAAA GTAAACTTAG AAACTTCCAG ACAGCAATTA ACACCCAAGC TGATAAACTG  TTGAGAAGTC TTATACAGCT AAAAAAGGCT GTAAGAACAG CTACTGTCAA AAAGCTTTAG ATTTATCTTT TCCCTTCACT TGTAAACAGC TGGAATTTTT TGTTTTTTTT TGTGTGTGTG  GGGTGGTGGG GAAGCAATAC AAGGTACAGT TTCGACCGCA CCCAGTAGCT TTGGCGCAGC CTAGTATATA AGTTAAGAAG TGTATGTGTG AAAGAAATCT ACTAAATTTC AAATCCAGTG  ACTCAAATGG TCGTTGAGTT CAGCTGCATC TGGATTCATC AAGTTCGAAT CCTGAACGCG TTTTTGACTT TTAAGTACCG AACAAACATC CCACAAAAAA AAAAAAAACT GTTCACTATT  TCTTTGCAGC ATAAGCAAGT AAAAAGATAT GTATCATTCA TTCCTTTTGG AGGCCAATGT TGCAAGTACA GCTTCTTGAC TAGAATGCCG AAGACTTCTC TTTAATAAGG TACCTAAGCC  AGCTGCTCAT GGAATCAACA GACTACCAAA TTGTCTTGAC CAAAAAAAAT AATAGAAAAA GACTACCAAA TTGTATTAAA ATGAAAGTGC ATATCATCAG TAATTTTTTT CTTGTCAATA  CACAATCACC AAATCTATTC ATCCCTAGAA AGTGACAAAG GAGCAGAGCT GCTATTTTGA AAATTTCAGA TATGAGAAAG CTACTATTAT TTTTATCAGT ATCATAAGAA ATTTCCTTGA 
TCCAATTGAT CTCTCAAAAA TATCAATTTA TGTGACAGCT GCTACCTCCT CTTTGGTCAT GACTCATGAT TTGCTTGACC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCG CCACAGCTTC TGCTACACTA TTCTCTCCAT TTCTTCCTTC CCCAGGTTCG GCTTTTCCTA CATTTCACTC CAAATCTTCC CTTTTTCTGT ATTTTTATGC TTAATTTGTA  TTGGTAATGT AGGATTTCAT GAGTCATGTC GAAGCCTAAA TTGGAGAACC CACAAGGTAT TTCTGCTTTC TTGACGTTTT TTTGGGTGAT AGATTTTGAT AAGATAGACA AAAAGGAGTT  GATTATCTAC TTGAGTTTAT GTAGTACACA TGGTGTTCGA CGAAATGCTT CACTGAGAAC GAAGGCTCTG TCTTTATTTT GTTTTTTTTT TTATTGCTGA AAAGACTTTT TGGTTGCAGA  AACAGATAGC GAGTAAAGCT GGTACTGTTA AAGTTACAGC TAAATTTGAG CTGAATCCTC CACCTTATCC TATGGTATTT ATTGTTCCAA CTTTCAAACA ACATCGAATT TTTTTGTCAT  CGTCTGTTTC TTGAATTTAA ATTGATCACA CTATTTTGTG TTCTTGTTCC TTTCTTGTAG GATTTGCATT GCTTCGCTTT CAGTTGTTCT GTTTTTTTTT CTTTTTGTAT TGGGATTTGC  TACACTTGAG CTGGGGTCTT TCGGGATTTG GTGTAAAATT TGGTGTTGGG TTTGAGATGG TCTCAAGTGG GATTCCTTTG GGTATGTTGT TGTTGTTAAC TACATCCTGA CAGTGTTTTT  ATTATCGGAG TGTTTTGACG GTGAGCTTTG GTTAGTAATC TGATTCAGTT CCAAAATTGC TGAAGTTTAT GGATTGGGAA AATCAAGTCT TGGAATGATA GACTCCAATC GTGAGACCAC  AAAATAGTGC CCCTTACTCC GGCTCTTCTC ACCCTTCTCA TTTCCCCATC TGAAGAATGA TAATGCTTCC GCATGTGTTT TTCAAATGAA TGATAGACAT TTGTCCAAAG AAGAAGAAAA  CATGACCCTT TGCCTGTTAG CTTAGTTCTC TTTTAATATG CTTTAGACAT TTTACATGTT TATATCATGA TGTAGAATGC TCTGGAGCCT CATATGAGCC GGACTACATT TGAATATCAC  TGGGGGAAGC ATCACAGAGC CTATGTTGAC AACTTAAACA AGCAAATAGT CGGAACAGAA CTGGATGAAC TGACGCTAGA GGACATAATA CTTGTTACAT ATAACCAAGG CAATCTCCTT  CCACCATTCA ACAATGCTGC ACAGGTGAGA AACAGACAAG TAGATCCCCC ATCCTCACCG TTTGTTACCT TCTTGATGGG AGTGCAATGT CTATTTTGGA GAACATAACT GGAATACCTC  TAGTCTTTTT TTATCATTCA GCTTATCAAT TTATTCTTCA TCAAGACTAC ACATTTTTAA TTTACAATTG ATCCAAGTGC ATTCCAATTA AACCTTATGG TTGTGAATTA TAATGTTATT  TATAATACAT ATTTTGGTTA AGATCACAGT TAGGTGTTGA GAATTGCATA AAAGTTCTAC CAATAAGTGA AAAGATATCA TAGAGAAGTT CAATGGATCG ATAGTTTCAT GTGTTTTGGA  TGATATTCTC CATCTAACTC CACGCCTTTT ACATCCCCCT TGCCCTCTCT CTATACAGGC TTGGAACCAT CAATTCTTCT GGGAGTCTAT GAAACCTGGT GGAGGAGGAC AGCCATCTGG  TGAACTATTA AAATTAATCA ACAGAGACTT CGGCTCCTTT GAAGCATTTG TTAAAGAATT TAAGGCAGCT GCTGCAACAC AATTTGGTTC TGGGTGGGCT TGGCTTGCAT GTGAGAAATT  ATTTACCTTT TATCTACATA CTTGTCCTGT AATCCTGACT GTAATCTTAA TACTTCTTCT ACTCACTTTG CAGACAAAGC AAATAGACTT GATGTAGGAA ACGCGTCAAA TCCCCATCCT  TCCGATGAGG ACAAAAAGCT TGTGATTGTG AAAACACCTA ATGCTATAAA CCCCCTCGTT TGGGATTACT CGGTGAGTAG AACTGCATTC TTTTCTGTTG CCTTGGTGGA GGTTTCAAAT  TCTAGTATGG TAGTTAAAAC CATTAGGTGA ATCTCACAAC TATGTCTTAT TGGATGCAGC CACTCCTAAC TATAGATGTT TGGGAGGTAA GCAGAACGTG CTCTTTTGTC AATATATTTG  ATTCATTTTG GTCCACATCT TTTTGCATTT TTGGTGATTG TAATGGTTAT TGATACCAAA TCTAATTTTC TTAATCTTTT ATTTGAAATT GCAGCATGCT TACTATCTGG ACTTCCGGGT  AAGCCTAGCT GATAAAATTA CTTAAATATG TCCTGGATTT TCCTATAGAA AAGATTGTGC TGGTCTAATG GTTGCACTTT CATCTCTTTT CCTCTAGAAT CGGCGCCCCG ACTACATATC  AATCTTTATG GAGAAGCTTG TATCATGGGA GGCAGTGAGT TCTAGGCTTG AAGCAGCTCA AGCTCAAGCT GCTGAGCGGG AAAAAGAAGA AGAGAGGAAG AAGAGAGAGG AGGAAGAGGA  GTATCAAGAT GGTAATGAAG TTAGAGAGAT GTATGTGGAA ACTACAGATT CTGAGGCAGA CTAAGTTGTG TTCTTCCTCA AGTTCAGTGT TGGAAATGGT ATCAAGTCAA TTTTGCAAAA  GCAGAATAAA ACGGAGTTAG GATGTTAGAA GTGTAACGAA TGTAATAGCA AGATGAAGTT GGGTTTTGAT GTTAGAAGTG GATGTACTAT CTGAGAAGTA CATGTATAGT GAAATTCATC 
TGACTTTGAT TCTTTATAAT TGCTCAGTAC ATCATACTAA TTTCGAATGA TACAGAAAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCG CCACAGCTTC TGCTACACTA TTCTCTCCAT TTCTTCCTTC CCCAGGATTT CATGAGTCAT GTCGAAGCCT AAATTGGAGA ACCCACAAGA AACAGATAGC GAGTAAAGCT  GGTACTGTTA AAGTTACAGC TAAATTTGAG CTGAATCCTC CACCTTATCC TATGAATGCT CTGGAGCCTC ATATGAGCCG GACTACATTT GAATATCACT GGGGGAAGCA TCACAGAGCC  TATGTTGACA ACTTAAACAA GCAAATAGTC GGAACAGAAC TGGATGAACT GACGCTAGAG GACATAATAC TTGTTACATA TAACCAAGGC AATCTCCTTC CACCATTCAA CAATGCTGCA  CAGGCTTGGA ACCATCAATT CTTCTGGGAG TCTATGAAAC CTGGTGGAGG AGGACAGCCA TCTGGTGAAC TATTAAAATT AATCAACAGA GACTTCGGCT CCTTTGAAGC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCTGC AACACAATTT GGTTCTGGGT GGGCTTGGCT TGCATACAAA GCAAATAGAC TTGATGTAGG AAACGCGTCA AATCCCCATC CTTCCGATGA GGACAAAAAG  CTTGTGATTG TGAAAACACC TAATGCTATA AACCCCCTCG TTTGGGATTA CTCGCCACTC CTAACTATAG ATGTTTGGGA GCATGCTTAC TATCTGGACT TCCGGAATCG GCGCCCCGAC  TACATATCAA TCTTTATGGA GAAGCTTGTA TCATGGGAGG CAGTGAGTTC TAGGCTTGAA GCAGCTCAAG CTCAAGCTGC TGAGCGGGAA AAAGAAGAAG AGAGGAAGAA GAGAGAGGAG 
GAAGAGGAGT ATCAAGATGG TAATGAAGTT AGAGAGATGT ATGTGGAAAC TACAGATTCT GAGGCAGACT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCG CCACAGCTTC TGCTACACTA TTCTCTCCAT TTCTTCCTTC CCCAGGATTT CATGAGTCAT GTCGAAGCCT AAATTGGAGA ACCCACAAGA AACAGATAGC GAGTAAAGCT  GGTACTGTTA AAGTTACAGC TAAATTTGAG CTGAATCCTC CACCTTATCC TATGAATGCT CTGGAGCCTC ATATGAGCCG GACTACATTT GAATATCACT GGGGGAAGCA TCACAGAGCC  TATGTTGACA ACTTAAACAA GCAAATAGTC GGAACAGAAC TGGATGAACT GACGCTAGAG GACATAATAC TTGTTACATA TAACCAAGGC AATCTCCTTC CACCATTCAA CAATGCTGCA  CAGGCTTGGA ACCATCAATT CTTCTGGGAG TCTATGAAAC CTGGTGGAGG AGGACAGCCA TCTGGTGAAC TATTAAAATT AATCAACAGA GACTTCGGCT CCTTTGAAGC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCTGC AACACAATTT GGTTCTGGGT GGGCTTGGCT TGCATACAAA GCAAATAGAC TTGATGTAGG AAACGCGTCA AATCCCCATC CTTCCGATGA GGACAAAAAG  CTTGTGATTG TGAAAACACC TAATGCTATA AACCCCCTCG TTTGGGATTA CTCGCCACTC CTAACTATAG ATGTTTGGGA GCATGCTTAC TATCTGGACT TCCGGAATCG GCGCCCCGAC  TACATATCAA TCTTTATGGA GAAGCTTGTA TCATGGGAGG CAGTGAGTTC TAGGCTTGAA GCAGCTCAAG CTCAAGCTGC TGAGCGGGAA AAAGAAGAAG AGAGGAAGAA GAGAGAGGAG  GAAGAGGAGT ATCAAGATGG TAATGAAGTT AGAGAGATGT ATGTGGAAAC TACAGATTCT GAGGCAGACT AAGTTGTGTT CTTCCTCAAG TTCAGTGTTG GAAATGGTAT CAAGTCAATT  TTGCAAAAGC AGAATAAAAC GGAGTTAGGA TGTTAGAAGT GTAACGAATG TAATAGCAAG ATGAAGTTGG GTTTTGATGT TAGAAGTGGA TGTACTATCT GAGAAGTACA TGTATAGTGA 
AATTCATCTG ACTTTGATTC TTTATAATTG CTCAGTACAT CATACTAATT TCGAATGATA CAGAAAG 

Retrieve as FASTA