Entry information : LeFSD03(Solyc06g048410.2)
Entry ID 15952
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFSD03(Solyc06g048410.2)
Name LeFSD03(Solyc06g048410.2)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFSD03
start..stop
S start..stop
LeFSD02 394 4e-140 1..244 1..259
HaFSD03 323 8e-113 2..247 5..248
AtFSD02 323 2e-112 22..249 24..268
HaFSD01 313 3e-108 2..247 3..263
Literature and cross-references LeFSD03(Solyc06g048410.2)
Protein sequence: LeFSD03(Solyc06g048410.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   249
PWM (Da):   %s   27893.03  
PI (pH):   %s   7.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAATASANSL TSAFLPPQGF NGSSKSLQWR TQKKQFGRKA GSATITAKFD LIPPPYPMDA LEPHMSSRTF EFHWGKHHRA YVDNLNKQID GTELDGKTLE DIILVTYNNG APLPAFNNAA  QAWNHQFFWE SMKPNGGGEP SGELLELINR DFGSYDTFVK EFKAAAATQF GSGWAWLAYK PEDKKLALVK TPNAENPLVL GYTPLLTIDV WEHAYYLDFQ NRRPDYISIF MEKLVSWEAV 
SIRLKAASA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTAAAATAG AAAGGGTTAA GAGGCAAATA TAATGTACAC TGAGTACATA CTTGAGGCAG AATGTTTTTT TGTCAATGAG ACATTATGTT GATGTTGTTT ATGTAGTTGA TGGACAGGAA  AAATAAATGA TGCAAGAAGT TTGAGTAAAG GAATTTATTG CACTTTGATT CTCTAATAAT ATCATAACAT TAGTCATGAA TTATGTGATC AAAAAAATTA TTCTAAAACA CTATAATAAT  GTAAGACGAA GGGAGTAATA TCGAACATGA ATATTATTTT CAATTATTTT TCTACCGTGT GCAGGCCACA AGCTTAAAAA AAATTCTATT GCCCGTCTCT TCTGTTCGTG AACAAAAATG  TCATTTGTGT ATACTTAAAA CTAGTATGAT ATTTATGTCC AGAAGAGCCC TTGCACTATT GTTACTAAAT GGATCAAAAT TGCCTTTCTT CTAATAATTC TTTTTTTCCT TTTAAACATA  TCTTGTTTCT ACTAAAAATA TTACTTTTAA GAAATTTTAT TCTTGTTTTC TTTTTTTAAA AATTATTTTA AATAATAAAA ATGGAAATAT TTTTTCTTCT TCTTAATATC ATTTTATCAA  TCAAAACAGA ATAAATTTAA TGTACACTTT TAACGAATAA TATATATTAT ATATATAAGA TCATAGTAAA CTCATCGTCG ATTTTCATTT AGATAATGAA AAGTTAATTA TAATAAAACA  AAAAAGATAT TAATACTTTC AGTTTTTTCC AAATTAAAGT AGGATAAATA TTCGATGATA AAAAATATTT CTAGGAAAAG AGTGGTATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT  ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATAAATCCAT TAAGTAATAA GAAGAGTATC TTTGGATTAA AATATTGAAG GAAATGATAT TTTTAAATCA  AAATACAAAT AGAAAATATG TTTATTCATT TCACATAATT TATTTTTGAC TCTAAAGAAA CTAATAATAT TTCACTTATA ATTATAGAAG ATAAACCACA GCCATTCATT CACTTTATGG  TTTGAAAATT CACAGGTCTT GACGATTAAA AAAAAAGGAA TTTTTTACAG AAAATTTTAT TCTATGTAAA TTGACCTTGT GGCAATTGTA TAATCACATG ACTATATTCG CGATCGTTTG  TGTATATTGA TATTGATAAT GAGTTCTTCA AAACAATTAT ATGACCAAGA AACCACTCTT TCTATTTAAA ATATATATTT CTTTTTCTTA TACTCCCTCC GTTCGGAATT GTTTGTCATG  GTTTCTATTT TTAGAGTCAA ATTACAAAAA CTTTGATCAA CATTTTAAGA TGGAATTTTT TATCATATTA ATATATAAAA TATTGCAATT CATAGTATTT TTCATATAGT TTTAGAATAT  TTAATTTTTT TTTTAAAAAA ATATTGAATT AATGTAATCT AATTTAACTT TGAAAATTAA TCAAATTGAC TTTGAAGAGC AACATAACAA ACAATTTCGG ACGAAGAAAG TACTACTTAT  TAGATAGTGA AAATGAATAT TTCTATTATC ATTAATATAC TACTCACAAA AATTTTGATT TTTTTTTAAA AAAATAGAGT ATTTTTTAAT TAATAGGGTT GTTTAAAGTG TATGCATAGA  ATAGAGTGTG TACTACAAAC TTGTAGTACC ATAATGAAAT AGCACAAAGG CAATGAACTA TTTGTAGAGA AGCCCATTGT TTTGGTTATT TCTCATACTT TGAGCAAATT AAACACAAGT  GATAATGGAG GCTGAAGGAT TCCATGCTAA GATGAAAATA TTTGTATCAC TTATCGCTTA TTAATATTTC ATACAGTCAT CATTTCAACA AATGTTGTCA CTGAGATATG CATATAATAA 
GTCTTTCTTA GGATTCATAT TTTGGGGGTG AATTGTAATT CCATTAAATT TAGAGTTTTG TTTGGTACGA AGAAAAACAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCA CTGCCTCTGC TAATTCACTC ACATCTGCTT TTCTTCCTCC TCAAGGTTTA TTTTTTTATT TTACTAGTTG TTTTTGTCAT TTTTGGGACA CAATATTACC TTTTTTGAAT  AATATTACAG GATTTAATGG ATCATCTAAG AGCTTACAAT GGAGAACCCA AAAGGTATTT TCTGTCTTCT TTTTTATTAT TTTTATGTTC TCAATTAGGT ATCACTGTCT GTTGTAGCTT  TCTTCTGATT TTTATGTATT AGTTGCAGAA ACAATTTGGA AGAAAAGCTG GCTCTGCTAC AATAACAGCT AAATTTGACC TCATCCCTCC TCCTTATCCA ATGGTATTTT TTTATATGTA  TTTTTTAGTC TGGACGCACC TCTGCTAATT TTATGGATAC CTGTCACGTC TCGCCTAATA ACTCTGCTGT TGTGTTTTTA CTCAATTGTT TGAACAGTTA AATGAAAATT GGATATAAAA  ATTGATAGGG AAAATGTACA AATACCTCAA CTAATCTTTG AAATCTTAGA GACATACTTA TACTATATTA AATTCTTATT ACGTCTGACC TTATTTATAA ATAATTTTCT ATCCTTTTCA  GCCTACGTGG TATTATCTTG TGAGTCCAGT ACGTGTTGAC ATTTTTTTCA AGTTAGTGTA ACGTATGTCG AAATGGGGTA GAAAATTATT TATAAAATAA GTTCAGGAAT AATAGGATTT  AAGGACTTAG TATAGTATAA GTGTATCTCT GAAATTTCGG GCATAGGTTG GAGATACTTA CGCGTTTTCC CGAATTGATA TAATAATCGA CTCTTGAATA GTTATGGATT GTAATTTGAA  GCGTAGCAGT AGTAGTTATT GTAGTTATAA TTAGTCTTTT GCCTTGAAAT AATCATGTCA TTGTTATTAT TAGTATATGA TTTGTAGAAG GATGGAAAAT TCTGCAAATT AATTAGTCTA  ATGAAAACTC CCAAGAGTCC TTTTTCTCCC TCAAACTCTT TTCTTTTTTA TATTTGATTT GAACTCTGAA TATGTTATAG GATGCTTTGG AGCCTCATAT GAGTAGTAGA ACATTTGAAT  TCCACTGGGG GAAGCATCAC AGGGCGTATG TCGACAACTT AAACAAGCAA ATTGATGGAA CAGAATTAGA TGGAAAGACA CTAGAAGATA TAATACTTGT TACATATAAC AATGGTGCTC  CCCTTCCAGC ATTCAACAAT GCTGCTCAGG TGAAGTACTT AACGTTTGAT TGTTTTTGCT GTCATAATGT TACTAATACG TGTTTTTAAG TTATCTCAGT GATTGTCATC TCATGGTTTT  ATGCACTTTT AGCTATTTTG TTCTGTGTAG TGCTGAGTTC TTTTGCATTT CAGGCCTGGA ATCATCAGTT CTTCTGGGAA TCTATGAAGC CCAACGGAGG AGGAGAGCCA TCCGGTGAAT  TATTAGAACT AATAAATAGA GACTTTGGTT CCTATGATAC ATTTGTTAAA GAATTTAAGG CAGCTGCAGC AACACAATTT GGCTCCGGAT GGGCCTGGCT TGCATGTGAG AAAGTTTTTG  CCTTGTTGTG TTCAAACATT TCGTTAAAAT TAAGCAAAAT GATTGAAAAT GGATTCGTTT GTTACTTCGT AGACAAACCT GAAGACAAAA AGCTTGCTCT AGTGAAAACT CCTAATGCTG  AAAATCCTCT TGTTTTGGGA TACACAGTGA GTAAAACACA TGCTTCTCTA TTTCATATAT TCGTGGGATT TCATCTTGCA TAGCATAGAA GTTTATACGG TAATAGAAAT CTCACAACTG  TGGTTTCCAT TGCAGCCACT CCTCACCATC GACGTTTGGG AGGTAAGCAG AACACACTTG TTATGAATCT GACTGAATTC GTTTTTTTTC CCTCTCTTCT TTCGGAACAA AATTGATTGA  ATAAGCCAAG TCTTATTCTT TTACTTTTTG TGTTTGATAC TGCAGCATGC TTACTATCTG GACTTTCAGG TAAGCCTAGC CTGATGAAAC TACTTAAAAT ACATTCTTTG ATGTATATAA  TGTTTCGTCG AAGTCTCTTA ATGGTAGAAG TACTATCTTT TTGCTTGTAG AATCGGCGAC CTGACTACAT ATCTATCTTT ATGGAGAAGT TGGTGTCATG GGAAGCAGTC AGTATTAGGC  TTAAAGCAGC ATCAGCTTGA GGTAAAATAG AAAGGGTTAA GAGGCAAATA TAATGTACAC TGAGTACATA CTTGAGGCAG AATGTTTTTT TGTCAATGAG ACATTATGTT GATGTTGTTT  ATGTAGTTGA TGGACAGGAA AAATAAATGA TGCAAGAAGT TTGAGTAAAG GAATTTATTG CACTTTGATT CTCTAATAAT ATCATAACAT TAGTCATGAA TTATGTGATC AAAAAAATTA 
TTCTAAAACA CTATAATAAT GTAAGACGAA GGGAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCA CTGCCTCTGC TAATTCACTC ACATCTGCTT TTCTTCCTCC TCAAGGATTT AATGGATCAT CTAAGAGCTT ACAATGGAGA ACCCAAAAGA AACAATTTGG AAGAAAAGCT  GGCTCTGCTA CAATAACAGC TAAATTTGAC CTCATCCCTC CTCCTTATCC AATGGATGCT TTGGAGCCTC ATATGAGTAG TAGAACATTT GAATTCCACT GGGGGAAGCA TCACAGGGCG  TATGTCGACA ACTTAAACAA GCAAATTGAT GGAACAGAAT TAGATGGAAA GACACTAGAA GATATAATAC TTGTTACATA TAACAATGGT GCTCCCCTTC CAGCATTCAA CAATGCTGCT  CAGGCCTGGA ATCATCAGTT CTTCTGGGAA TCTATGAAGC CCAACGGAGG AGGAGAGCCA TCCGGTGAAT TATTAGAACT AATAAATAGA GACTTTGGTT CCTATGATAC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCAGC AACACAATTT GGCTCCGGAT GGGCCTGGCT TGCATACAAA CCTGAAGACA AAAAGCTTGC TCTAGTGAAA ACTCCTAATG CTGAAAATCC TCTTGTTTTG  GGATACACAC CACTCCTCAC CATCGACGTT TGGGAGCATG CTTACTATCT GGACTTTCAG AATCGGCGAC CTGACTACAT ATCTATCTTT ATGGAGAAGT TGGTGTCATG GGAAGCAGTC 
AGTATTAGGC TTAAAGCAGC ATCAGCTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCCA CTGCCTCTGC TAATTCACTC ACATCTGCTT TTCTTCCTCC TCAAGGATTT AATGGATCAT CTAAGAGCTT ACAATGGAGA ACCCAAAAGA AACAATTTGG AAGAAAAGCT  GGCTCTGCTA CAATAACAGC TAAATTTGAC CTCATCCCTC CTCCTTATCC AATGGATGCT TTGGAGCCTC ATATGAGTAG TAGAACATTT GAATTCCACT GGGGGAAGCA TCACAGGGCG  TATGTCGACA ACTTAAACAA GCAAATTGAT GGAACAGAAT TAGATGGAAA GACACTAGAA GATATAATAC TTGTTACATA TAACAATGGT GCTCCCCTTC CAGCATTCAA CAATGCTGCT  CAGGCCTGGA ATCATCAGTT CTTCTGGGAA TCTATGAAGC CCAACGGAGG AGGAGAGCCA TCCGGTGAAT TATTAGAACT AATAAATAGA GACTTTGGTT CCTATGATAC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCAGC AACACAATTT GGCTCCGGAT GGGCCTGGCT TGCATACAAA CCTGAAGACA AAAAGCTTGC TCTAGTGAAA ACTCCTAATG CTGAAAATCC TCTTGTTTTG  GGATACACAC CACTCCTCAC CATCGACGTT TGGGAGCATG CTTACTATCT GGACTTTCAG AATCGGCGAC CTGACTACAT ATCTATCTTT ATGGAGAAGT TGGTGTCATG GGAAGCAGTC  AGTATTAGGC TTAAAGCAGC ATCAGCTTGA GGTAAAATAG AAAGGGTTAA GAGGCAAATA TAATGTACAC TGAGTACATA CTTGAGGCAG AATGTTTTTT TGTCAATGAG ACATTATGTT  GATGTTGTTT ATGTAGTTGA TGGACAGGAA AAATAAATGA TGCAAGAAGT TTGAGTAAAG GAATTTATTG CACTTTGATT CTCTAATAAT ATCATAACAT TAGTCATGAA TTATGTGATC 
AAAAAAATTA TTCTAAAACA CTATAATAAT GTAAGACGAA GGGAG 

Retrieve as FASTA