Entry information : LeFSD04(Solyc06g048420.1)
Entry ID 15953
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFSD04(Solyc06g048420.1)
Name LeFSD04(Solyc06g048420.1)
Class FeSOD     [Orthogroup: FSD001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFSD04
start..stop
S start..stop
LeFSD03 265 2e-91 3..160 73..249
LeFSD02 217 8e-72 3..155 73..259
HaFSD03 186 1e-60 3..158 74..248
AtFSD01 184 2e-60 3..160 35..209
Literature and cross-references LeFSD04(Solyc06g048420.1)
Protein sequence: LeFSD04(Solyc06g048420.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   160
PWM (Da):   %s   17929.99  
PI (pH):   %s   6.96
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANFGKHHRS YDDNLNKKIH GTELHGKTLQ DLILVTYNNG SLLPAFNNDA QMKPNGGRES SGELLQLINR DFGSYDTFVK EFKAAAATQF GSGWSWLAYK PEDKKLALVK TPNAENPLVL 
GYTDAYYLDF QNCPPDYISL FMEKLISWEA VSSRLKAATA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. No EST found. Tandem duplicated.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTGCTTAGC AGGAAAACCG AAAGGATGAA GAGGCAAATT TAGGGGGCAC CGAAGGGAGA ATGATGTATG ATGGGAGTTA CATATTTGAG GCAAAATTAT TTTTGTCAAC TTTATGTTCA  ATCCTGCTAT CCTTCCTTTT CAGTGAGAGT TCTAGATGTC TTAGCTGAGA ATTTGAGATG TTTATTTTGT GCACTTTGCA AGAGCGACAA GTGATTTTCT GAATTCAAAT GACAATATCG  TTTATGTTCT CAAGTAGTTG ATGGCTGGGA AAATAATACA GACTATCAAG TTTGAGTTGT GGAACAACAA TGTACAAGGA CATGAATAAA GATATTTATT GCACTTTGAT GCTCTAATAT  CAGAATGATT CTATGATTAG AGAAAACAAA AGAAAACGTG TAGGTAAAAT AAGGCTCTTA CTTCAGAATT GCTATATTTG ACCAAGGGCA TCCAACCAAT TGAAGACTTG ACCCGATATT  CCCTCTTCTC AAGTTGAAAA TATTTCATAC TGCATCAATG TCATGCCAGC GTATTTTTCC TTTTCCTAGT TGCATCACAT TTAGAGGTCA AGAGTAGTCC ATGAAAACAT TATTTGCCCA  ACCGCTAAAG TTTGGGCGAT TATTGACTAG CTAAATGCTT TTAAAAGGAC TCACTAATAA AGGAGGTTAC TAAATGAGGC ACGCGACAAG GAGGTTAGCT TAAAACAACT ATTTTTGAAG  AGTTAGTACT TGAATGAATA GTTCACTGAT TAAGTGATTT GGGCTGAATA TGAACAGGAG TTAAAGGACT ATCTATCCAA GTTATCAAAG ATGTTGAGAG TTAAGTTACA TTTGCATGAA  TATCTTAATT CTTTATCCGT TCTTTCTAGT AAGATACTTT GAAAAATAAT AATTAGAAAT AGTAAATATA TTAATTAGAA ATAGAAAATA TGTTATCAAA AAGGTATAAC TGTTCGAATC  ATTCTCCCAA TTGCTATTTG ATACATTTAA TTCATTATCA TTAGTAAATT ATGTAAAAAA TCCAGTGCGT GATTCAAGTT TAGTCATAGA TGAAATAAAG GAACCCTGTA CTTCCGTCTT  CACCTTTCCC TACTGTTTAT TTTAGCCCAT ATCTATCGAC TGGTTTATTG GTCAGTGTAG GAATACTACA TGCCTATAAC TCATTTATGA GAGAAATTGC TGCCACAAGG ATATGTGAGA  TGTGAGTCGA TGAAGATCTT ATCTAATTCA AGCCTATAAA ACATATAAGT TGGAGTTAGA GTCTTTTGTA GTTGGTGATT ATGGAAGTGA ATGTAGGTCC AAAGACTTGA ATAGATACAG  AAAGAGAACA TTTATTGGGC TTTAGATTTA TTAAGTCATA AAAGATACTA TGTTTCAGAA AGATCTTTCA AGATATTAAG GTCTTTAATC CATGAGGAAG TAGCCCATTT TTCGTCTACA  CAAAGATGAA TTAACACAAG TATGATGTCA AGAGAACTGG AAACCAAATC AAAAAAATAT CTCAAGCTGA AACGTGAAAT GAACAATTCC TTTTGAATAA ATCTATTTCT CAAAAATGCA  GTTTAAAAGT ACAGCAAACA TGGCAACTAA CCAACCACGT ATATGGAAGG AAATCTTATC TAAGGAATGT TTATTGAAGC GATGCAGGGG TTAAAACAGG TAGCGACATA CCTCTTCCTG  GTAAAATTAT TGAAAGCAGC TTTATATAAA AGGGTGGCGA CTACAATCAA GCGAACACAA AGAAGGAGAA AGTATGCTGA ATAAGGACTA ACATAAAGCT CCACATGTTT AACCAGTAAG  TGAAGCATTA AGCGCACTAT GTACATCAAC GCCAATCTGA GCTTCAGCTT TCTCTACATC AGTTGATGCA GTGTTCAACT TCTGTGCAAA GTCAGTCAGG CCCTTTTGAA CCAAATTGGG 
ATCGATGCGG TCAAGTGGTA CAACTTCAAC AGCAATTATA TCTGCAAAAG AATTTGCATG AACATATGCA AACCCACCAC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAATT TTGCACTTCA TTCATAATGT AAACTTCCCC TTTCTTCCTT TTATGCCAGT TCCTCTGTTA ATTTCAGTTT TCCTTTTTTG ACCTTAAAAT ATGACATAAG ATGGTTTGGA  GCCTCATATG AGTAGTAAAA CATTGGAATT CCACTAGGGA AAGCATCACA GGTCATATGA CGACAACTTA AACAAGAAAA TACATGGAAC AGAACTACAT GGAAAGACTC TACAAGACCT  AATACTCGTT ACCTATAACA ATGGTTCTCT CCTTCCAGCA TTCAACAATG ATGCTCAGGT AAATTGACAG TTGACACTGT TTTGTTCTGT GTAATGCCGA ATCCTTTCAT ATCTTCTTTC  GTATTACAGG CCTATTCTTC TAGGAATCTA TGAAGCCTAA CGGAGGAAGA GAGTCATCTG GTGAATTATT ACAACTAATC AACAGAGACT TTGGTTCCTA TGATACATTT GTTAAAGAAT  TTAAGGCAGC TGCAGCAACA CAATTTGGCT CTGGTTGGTC CTGGCTTGCA TGTGAGAAGT TCTTTGCCTC TTATCTGCTG TCCATCCATC CGTCTAACCC TTTAGTTATA ATTGAGCCAA  ATAGCTGAAA AAGGATTCAT TTGTTACTTC GTAGACAAAC CTGAAGACAA AAAGCTTGCT CTGGTAAAAA CTCCTAACGC TGAAAATCCT CTGGTTTTGG GTTACACAGT GAGTAAAACA  CATGCTTCTC TATTCTTGTA TTCATGGGAT TTCATCTTAC ATAGCATAGC AGTTTATATC ATACTATAAA TCTCAAAACT GTGGTTTTGG TTTCAGCCAC TGCTCACCAT AGACGTTTAG  GAGGTAAGCA GAAAACACTC ACTTGTCACA AATCTATTTG AATTAACTTT TTTGCCCTCT CTTCTTTCGG AACAAAAATG ATAGGAAGAC AAGTCTTACT CTTTTACTTT TGTGTTTGAT  ACTGCAGGAT GCCTACTATC TGGACTTTCA GGTAAACCTA GCCTGATGAA ACTACTCAAA TACTTTCTTT GATGTATAGT CTTTCCCCGA GACATATTTG AACTCTCTTA ATGGTAGCAC 
CACCATCTTT TTCTTGTAGA ATTGCCCACC GGACTACATA TCTTTGTTTA TGGAGAAGCT CATATCATGG GAAGCAGTCA GTTCTAGGCT CAAAGCAGCA ACAGCTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAATT TTGGAAAGCA TCACAGGTCA TATGACGACA ACTTAAACAA GAAAATACAT GGAACAGAAC TACATGGAAA GACTCTACAA GACCTAATAC TCGTTACCTA TAACAATGGT  TCTCTCCTTC CAGCATTCAA CAATGATGCT CAGATGAAGC CTAACGGAGG AAGAGAGTCA TCTGGTGAAT TATTACAACT AATCAACAGA GACTTTGGTT CCTATGATAC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCAGC AACACAATTT GGCTCTGGTT GGTCCTGGCT TGCATACAAA CCTGAAGACA AAAAGCTTGC TCTGGTAAAA ACTCCTAACG CTGAAAATCC TCTGGTTTTG  GGTTACACAG ATGCCTACTA TCTGGACTTT CAGAATTGCC CACCGGACTA CATATCTTTG TTTATGGAGA AGCTCATATC ATGGGAAGCA GTCAGTTCTA GGCTCAAAGC AGCAACAGCT 
TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAATT TTGGAAAGCA TCACAGGTCA TATGACGACA ACTTAAACAA GAAAATACAT GGAACAGAAC TACATGGAAA GACTCTACAA GACCTAATAC TCGTTACCTA TAACAATGGT  TCTCTCCTTC CAGCATTCAA CAATGATGCT CAGATGAAGC CTAACGGAGG AAGAGAGTCA TCTGGTGAAT TATTACAACT AATCAACAGA GACTTTGGTT CCTATGATAC ATTTGTTAAA  GAATTTAAGG CAGCTGCAGC AACACAATTT GGCTCTGGTT GGTCCTGGCT TGCATACAAA CCTGAAGACA AAAAGCTTGC TCTGGTAAAA ACTCCTAACG CTGAAAATCC TCTGGTTTTG  GGTTACACAG ATGCCTACTA TCTGGACTTT CAGAATTGCC CACCGGACTA CATATCTTTG TTTATGGAGA AGCTCATATC ATGGGAAGCA GTCAGTTCTA GGCTCAAAGC AGCAACAGCT 
TGA 

Retrieve as FASTA