Entry information : LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Entry ID 15955
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Name LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Class Copper chaperone for SOD    [Orthogroup: CCS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types All tissues
Callus
Flower buds
Fruits
Leaves
Ovaries
Roots
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCCS01
start..stop
S start..stop
ThasCCS01 397 3e-140 90..309 86..313
HaCCS01 390 2e-137 35..309 38..307
AtCCS01 376 9e-132 66..309 64..312
MpCCS01 311 2e-105 77..309 116..359
Literature and cross-references LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Protein sequence: LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   311
PWM (Da):   %s   32967.01  
PI (pH):   %s   6.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFLRSIVTA KTTAIAAAIP AAAFAVSSIS SSSQFERPLK NLKFGSISSS NSILQLSFAK NLQKKSPPSA LHMETHSSNH QTSSDNGVVL PELLTEFMVD MSCQGCVSAV KSKLQTVEGV  KNVDVDLDNQ VVRILGSSPV KTMTEALEQT GRKARLIGQG VPDDFLISAA VAEFKGPDIF GVVRLAQVNM ELTRIEANFS GLSPGKHAWS INEFGDLTRG AASTGKLYSL PLGDLGTLDV 
DEKGEAFYSG PKEKLRVADL IGRAIAVYAT EDKSDPGLTA AVIARSAGVG ENYKKLCTCD GTTIWEATSK I* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAGTTTATT ATCTTTAGAA TCATTTGATC ATTGTATACT ACTACGTCTG TATCATTCAC ATTCATGATG CTTTTAAGTT GGATGGACAA GCTAATGTAT CAAAAATAAA TGTAATCATT  TGTTGCTCTC ACTTTCTTTG GTTCCTGTGT GACGAACTGC TCCTCTTCAT TTGAATGAGA AAAGATAGGG AATTCAACTT CAAACAAAGC TCAAATTCCA GTTGGTGGTA GTCGTGTTGA  ATACTGATAG ATAACAAGGA AGAATCTTCT CTTTCCCCTT TTAAATTTCT TTTTCGAAAC AGTAAAATTC TGTTCTATGC AGAACAGTTG CGTCTAATAT ACAAAAATTC AATACCAAGC  AACAGTAGAT GCAATTACCC GGAGCGTTCA CCTAGGAATG CTCATACTGT AGAAGCAGAC TTGCCTAAAA TAGAGAGTCG TCATCTTTTC AGCAAAGCAT ACAATCGTAA GTTGTTATAT  AATGGAGGAG AAATTATTAA CTCGTCGATC AAGACAACAG TCCATCTCTT TTAGCCATCT CATAGAGAGC AATGGCGGTC AGAGCCTTTG CATCAGCTGT GGCACGCCAT AGTTTATCAT  ATGGAACCAC ATGCACTTTG ATCAGCTCAC CATGGTCTCG TAGTCCGGTT TCTTTCCCTT GCAGTTGTTG GATTTTCTCT TTGCTGACAT TTCCTCTGTA GAGAAACAAA CTCATCTCCT  CATCACATCC ACCCTAACAT TGAAAGAACA CCAAAACCAC ATAAATATAG TGTTAAGAGA TATATAAAGG CAGAAACAAT CACAGAAGGC CTCATCTTTG AATTGAAAAA TACACCCAAT  ATAAGGCTGG CTGCATACAA AAGATCCAAT GTAGTTGCGC CTACTCCGAA CCTTTCCCTC TCTAACAAAA AAAGTCAGGT CTAGTCCTAC CCCGTGCAAT GGGCAAGGTT CACAAATATA  CCACTAATTG CAAGTGCACA TGGAGCAATA TCCAATGTCA TTACAATTTA CAGGTTCCAA ACAGTAAAGC AAGCAGTGCA ATGAATCAAA ATTATTGACT AACAGAAATA AAAAAAATAT  ATATTACAAC ACATACATTT CCATAAGAGT TTTAGCAGAA ACTAGTTGTT AATGCAAATA TTTCTACTTT TTTCTGTTCC TATAATACAA AATCCAAGAA AGCATGCGCT GAGAGTTATC  TGAGTCTTAT AGAAGATGGT GGAATGCTTA CAGGAGAAGG AAAAACTCTG CCCCCAGTTG ACGCGTCAAG AAAAGCCGTG AGATCGACCA TATCATGGAC ATTCAGGTGT ATTCCAGTTT  CTTCCTCAAC CTGAATCATA TTAGATCAAA TACTTCAATT ATAAGTTAAG CCAAGCAATG TCAAACTCTC TGATTTTTCC ATCCACGCGC TAAAACCGAT ATATATTCAA ATGCAAAAGT  ATTCAATATT TAATTATACA GTGGAGTGCA ACTAAGTTGT CAAATATGTA AAACAAATAG TTGCTTTTGA TAAGGAAGTT GTGATGTTCT TATAAGGATT TCAGTTTAGT CACGCATATA  GTTTCATTAG CAGATTTCTG GATTCAATTG AACTTGCTCA GAAACGAAGG AACTTCCAGT GATTTGTTGA AAAATGACAC GATAAGAGGA ATACAGTTCA TTATGCCATA ATAAACTAAT  ATACTAGGGA ACTGAACACC AAAAAAACAA GGGGACAGCT TGTCTCACTT GAGAAAATTT TGAGAAGGGG ATAGTGCTTT GATAGAAAGG GAGAGAGAGA CTTCTCGAAC TGCTGTTCCA  GCAAAGTCGC CTTGGTCATC ATCCAACATT CCTGCTGGCA ATTCCAAAAT TAGCCTCCCA ACTGGGACCC TAACCTTCCA AACAGGTTGA ATGTATTTTA GAGTTTAAAC AGTAAAAGGG 
ACAGAAAACT TTCATAAATT TCCTCATATT ATCTGTACTG TGAGATATTT TTCGACGTTA TAAAAATGGA GGAGTTGACA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTATGACCA AAACTCTGAA TATAAAAAGA GTAAAAAAAA ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC  TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC  TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC CAAACTTCCT CCGATGTAAT AATTTTATCC TTCAGCTCTT TTATCTTTTT GTTGATTTTT TGAATTATTT GGAGAATCTT  ACAGGGGTCA ATTGGTTGGC TAATTGAATT TTCACCTATT GGCGAGGATT TAGGGTTTAG GGAGGTCTTA CTTGTATTGC AATTCTTCAC TACTAAATTT TAGATCCATC TCTTTTTTTT  AATCCAGAAT GAAAAACTAA TATGTTTAAT TTTTTTTTGT TTGTAAATTT GGCAATAAAT GGATGCTATT GTTCTAATTG GGTTATGTGA TTTTTCGTTT GCAGAATGGA GTCGTTTTGC  CTGAGTTGCT GGTAAGTTTT TTCTCAGGAA AAAAAAAATC TCTGTTATTT TTGTTTGGAG GAGAAATGAG GAAATTTCTG GTGTTTTTTT ATTGCACATT GGAAGCTGTA CAATAAATAG  GATTCTTGTA CTTATAAAGA GTCTAGTAAC TTTGTACTTT GGATAGTACT ATGAGTAGTA CAACATTTGA TGAAAGGAGG AGATGTACAC TTAAGAGTAG TATTATATCA ATCTTTTTCG  CCTCTGCTTT AGGTAGATCA ACTAACATCT TCTGTTAGAA GAGAGGACAA GAGCCCTTAT ATAATGCTAC TACAAACAAT ATTCATTTGT CAATAAAAAA TCTGTAGCTC TGCTTTTGAA  TTATATTGCC GATAACACGT GACGGTTTTT TCTCCTTGAT CAATTGCTGA GGTAAATTGA TTGTGCTGGT TGTAATGTGA TTAGTGAGTG TATCAGAGAT GATGACTTTT AACGGGAGGG  GGGTATCTTT TAATCTTGAT GGCTTAATGT AGCCCATTTT GTTGGTTATT GAAGGTTTAG TTTGGGGGGC TTATGTTTGT TTCTATTGGT TTCTTTGTGA GTTGATATAT TATGTTGCAC  ATTGTTGTTT TTTTCCACGT TAAACTGATC ATATTGACAA ATTGGTGACA GACAGAGTTT ATGGTGGATA TGTCGTGTCA AGGCTGTGTT AGTGCTGTCA AGAGCAAATT GCAAACCGTA  GAAGGTATAT GCTAAGAAAA AAGAAGAAGA GAGAAACCAT GCCCTGTAAT GGGGCTTTAT TTTTAACTTC CTCATTTGTT TTGGTGTTGA AAGAGATCTT TTATGTGGCT TTTAGGAGTC  AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA  GTACCGGATG GTATGTTCCG ATCTTATCTA ATTGCATCTG TCATGTTTCC TAAGTTAGTA TTATAGAAAA TTTGTGAAGC ATTATGTCTT CACATCTCTG GCTATGTTAA AGAGGATGAG  CAGAAGTAAA GCATACTTAT GATTATAGTG TGTAATGGCC TTCTTAAGTG CTGAAGGGAA CGAAGAGTGC AAAAAAAGAG ATATTATGCA CTTCTCTCAT GAGCTTCAGT CGTCTTAGCT  TTATCTGCTT TATATTTTAT GCGATGCATC TTACTTTTAT ATTCATTTGA ACCATGCCCT GTAGATTTCC TTATATCTGC TGCCGTTGCC GAATTCAAAG GACCAGATAT TTTTGGTGTT  GTTCGCTTGG CTCAAGTCAA TATGGAATTA ACTAGGATTG AAGCAAACTT CAGTGGCCTG TCACCTGGGA AGCATGCTTG GTCTATTAAT GAATTTGGTG ATTTGACGAG GGGGGCAGCT  AGTACTGGAA AATTGTACAG CCTAGTAAGT AACACGCAAA AGAACATTTT ATTTATGTTG AATATGTTGT ACTATCTTCT TTCTACGAAC CTTTGTTTCT TGGGGGCATG GATTCTGCAA  TATACTTGCA TTGAGAAAGA GAGAATCAGG ATCCATAATA TTAATTATGC AATCATGTTT CATTTAATCT CACTCAAGGA TGCTTGAAGT GTTTGGAGTA TGATATAAAT GCTTTTAAGT  GGTCCTTTGC CATATGAAAT GCATCTAATA CCATGCTGTT AGTTATGGAA TCGTAACTGT CTGGATACTA GATAACATTT GTCAAGGACT GTGAAACTTT TCCTCTCTCT TTGTCCTCTG  AAAGTGAAAT AAGCATCTAT CAATTGTAAT TTTCCTTTTG TTGGACAGTC AAAAGGAGAC AAATATATGG ATAAAGTTCT AATGAATGAT TGGTTTACTT ATGTCTAATA TATGTTGCAC  CAGACAGACT ATTAACTGCA TTTCTGATGT GTTTTTCCAT CTTTCAGCCA CTCGGTGACC TGGGAACACT GGATGTTGAC GAGAAAGGAG AGGCATTTTA TTCCGGTCCT AAAGAGAAGC  TGAGAGTTGC TGACCTGATT GGGAGAGCTA TTGCTGTATA TGCTACTGAA GATAAATCAG ACCCAGGACT TACAGCAGCA GTGATAGCTA GAAGTGCCGG GGTTGGTGAG AACTACAAGA  AGCTTTGCAC TTGTGATGGT ACAACTATCT GGGAAGCAAC CAGCAAAATC TGAACAGTTT ATTATCTTTA GAATCATTTG ATCATTGTAT ACTACTACGT CTGTATCATT CACATTCATG  ATGCTTTTAA GTTGGATGGA CAAGCTAATG TATCAAAAAT AAATGTAATC ATTTGTTGCT CTCACTTTCT TTGGTTCCTG TGTGACGAAC TGCTCCTCTT CATTTGAATG AGAAAAGATA 
GGGAATTCAA CTTCAAAC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA  AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC  CAAACTTCCT CCGATAATGG AGTCGTTTTG CCTGAGTTGC TGACAGAGTT TATGGTGGAT ATGTCGTGTC AAGGCTGTGT TAGTGCTGTC AAGAGCAAAT TGCAAACCGT AGAAGGAGTC  AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA  GTACCGGATG ATTTCCTTAT ATCTGCTGCC GTTGCCGAAT TCAAAGGACC AGATATTTTT GGTGTTGTTC GCTTGGCTCA AGTCAATATG GAATTAACTA GGATTGAAGC AAACTTCAGT  GGCCTGTCAC CTGGGAAGCA TGCTTGGTCT ATTAATGAAT TTGGTGATTT GACGAGGGGG GCAGCTAGTA CTGGAAAATT GTACAGCCTA CCACTCGGTG ACCTGGGAAC ACTGGATGTT  GACGAGAAAG GAGAGGCATT TTATTCCGGT CCTAAAGAGA AGCTGAGAGT TGCTGACCTG ATTGGGAGAG CTATTGCTGT ATATGCTACT GAAGATAAAT CAGACCCAGG ACTTACAGCA 
GCAGTGATAG CTAGAAGTGC CGGGGTTGGT GAGAACTACA AGAAGCTTTG CACTTGTGAT GGTACAACTA TCTGGGAAGC AACCAGCAAA ATCTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTATGACCA AAACTCTGAA TATAAAAAGA GTAAAAAAAA ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC  TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC  TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC CAAACTTCCT CCGATAATGG AGTCGTTTTG CCTGAGTTGC TGACAGAGTT TATGGTGGAT ATGTCGTGTC AAGGCTGTGT  TAGTGCTGTC AAGAGCAAAT TGCAAACCGT AGAAGGAGTC AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT  GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA GTACCGGATG ATTTCCTTAT ATCTGCTGCC GTTGCCGAAT TCAAAGGACC AGATATTTTT GGTGTTGTTC GCTTGGCTCA  AGTCAATATG GAATTAACTA GGATTGAAGC AAACTTCAGT GGCCTGTCAC CTGGGAAGCA TGCTTGGTCT ATTAATGAAT TTGGTGATTT GACGAGGGGG GCAGCTAGTA CTGGAAAATT  GTACAGCCTA CCACTCGGTG ACCTGGGAAC ACTGGATGTT GACGAGAAAG GAGAGGCATT TTATTCCGGT CCTAAAGAGA AGCTGAGAGT TGCTGACCTG ATTGGGAGAG CTATTGCTGT  ATATGCTACT GAAGATAAAT CAGACCCAGG ACTTACAGCA GCAGTGATAG CTAGAAGTGC CGGGGTTGGT GAGAACTACA AGAAGCTTTG CACTTGTGAT GGTACAACTA TCTGGGAAGC  AACCAGCAAA ATCTGAACAG TTTATTATCT TTAGAATCAT TTGATCATTG TATACTACTA CGTCTGTATC ATTCACATTC ATGATGCTTT TAAGTTGGAT GGACAAGCTA ATGTATCAAA 
AATAAATGTA ATCATTTGTT GCTCTCACTT TCTTTGGTTC CTGTGTGACG AACTGCTCCT CTTCATTTGA ATGAGAAAAG ATAGGGAATT CAACTTCAAA C 

Retrieve as FASTA