Entry information : LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Entry ID 15955
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Name LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Class Copper chaperone for SOD    [Orthogroup: CCS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types All tissues
Callus
Flower buds
Fruits
Leaves
Ovaries
Roots
Inducer Constitutively induced
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeCCS01
start..stop
S start..stop
ThasCCS01 397 3e-140 90..309 86..313
HaCCS01 390 2e-137 35..309 38..307
AtCCS01 376 1e-131 66..309 64..312
MpCCS01 311 2e-105 77..309 116..359
Literature and cross-references LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Protein sequence: LeCCS01(Solyc08g079830.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   311
PWM (Da):   %s   32967.01  
PI (pH):   %s   6.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFLRSIVTA KTTAIAAAIP AAAFAVSSIS SSSQFERPLK NLKFGSISSS NSILQLSFAK NLQKKSPPSA LHMETHSSNH QTSSDNGVVL PELLTEFMVD MSCQGCVSAV KSKLQTVEGV  KNVDVDLDNQ VVRILGSSPV KTMTEALEQT GRKARLIGQG VPDDFLISAA VAEFKGPDIF GVVRLAQVNM ELTRIEANFS GLSPGKHAWS INEFGDLTRG AASTGKLYSL PLGDLGTLDV 
DEKGEAFYSG PKEKLRVADL IGRAIAVYAT EDKSDPGLTA AVIARSAGVG ENYKKLCTCD GTTIWEATSK I* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAGTTTATT ATCTTTAGAA TCATTTGATC ATTGTATACT ACTACGTCTG TATCATTCAC ATTCATGATG CTTTTAAGTT GGATGGACAA GCTAATGTAT CAAAAATAAA TGTAATCATT  TGTTGCTCTC ACTTTCTTTG GTTCCTGTGT GACGAACTGC TCCTCTTCAT TTGAATGAGA AAAGATAGGG AATTCAACTT CAAACAAAGC TCAAATTCCA GTTGGTGGTA GTCGTGTTGA  ATACTGATAG ATAACAAGGA AGAATCTTCT CTTTCCCCTT TTAAATTTCT TTTTCGAAAC AGTAAAATTC TGTTCTATGC AGAACAGTTG CGTCTAATAT ACAAAAATTC AATACCAAGC  AACAGTAGAT GCAATTACCC GGAGCGTTCA CCTAGGAATG CTCATACTGT AGAAGCAGAC TTGCCTAAAA TAGAGAGTCG TCATCTTTTC AGCAAAGCAT ACAATCGTAA GTTGTTATAT  AATGGAGGAG AAATTATTAA CTCGTCGATC AAGACAACAG TCCATCTCTT TTAGCCATCT CATAGAGAGC AATGGCGGTC AGAGCCTTTG CATCAGCTGT GGCACGCCAT AGTTTATCAT  ATGGAACCAC ATGCACTTTG ATCAGCTCAC CATGGTCTCG TAGTCCGGTT TCTTTCCCTT GCAGTTGTTG GATTTTCTCT TTGCTGACAT TTCCTCTGTA GAGAAACAAA CTCATCTCCT  CATCACATCC ACCCTAACAT TGAAAGAACA CCAAAACCAC ATAAATATAG TGTTAAGAGA TATATAAAGG CAGAAACAAT CACAGAAGGC CTCATCTTTG AATTGAAAAA TACACCCAAT  ATAAGGCTGG CTGCATACAA AAGATCCAAT GTAGTTGCGC CTACTCCGAA CCTTTCCCTC TCTAACAAAA AAAGTCAGGT CTAGTCCTAC CCCGTGCAAT GGGCAAGGTT CACAAATATA  CCACTAATTG CAAGTGCACA TGGAGCAATA TCCAATGTCA TTACAATTTA CAGGTTCCAA ACAGTAAAGC AAGCAGTGCA ATGAATCAAA ATTATTGACT AACAGAAATA AAAAAAATAT  ATATTACAAC ACATACATTT CCATAAGAGT TTTAGCAGAA ACTAGTTGTT AATGCAAATA TTTCTACTTT TTTCTGTTCC TATAATACAA AATCCAAGAA AGCATGCGCT GAGAGTTATC  TGAGTCTTAT AGAAGATGGT GGAATGCTTA CAGGAGAAGG AAAAACTCTG CCCCCAGTTG ACGCGTCAAG AAAAGCCGTG AGATCGACCA TATCATGGAC ATTCAGGTGT ATTCCAGTTT  CTTCCTCAAC CTGAATCATA TTAGATCAAA TACTTCAATT ATAAGTTAAG CCAAGCAATG TCAAACTCTC TGATTTTTCC ATCCACGCGC TAAAACCGAT ATATATTCAA ATGCAAAAGT  ATTCAATATT TAATTATACA GTGGAGTGCA ACTAAGTTGT CAAATATGTA AAACAAATAG TTGCTTTTGA TAAGGAAGTT GTGATGTTCT TATAAGGATT TCAGTTTAGT CACGCATATA  GTTTCATTAG CAGATTTCTG GATTCAATTG AACTTGCTCA GAAACGAAGG AACTTCCAGT GATTTGTTGA AAAATGACAC GATAAGAGGA ATACAGTTCA TTATGCCATA ATAAACTAAT  ATACTAGGGA ACTGAACACC AAAAAAACAA GGGGACAGCT TGTCTCACTT GAGAAAATTT TGAGAAGGGG ATAGTGCTTT GATAGAAAGG GAGAGAGAGA CTTCTCGAAC TGCTGTTCCA  GCAAAGTCGC CTTGGTCATC ATCCAACATT CCTGCTGGCA ATTCCAAAAT TAGCCTCCCA ACTGGGACCC TAACCTTCCA AACAGGTTGA ATGTATTTTA GAGTTTAAAC AGTAAAAGGG 
ACAGAAAACT TTCATAAATT TCCTCATATT ATCTGTACTG TGAGATATTT TTCGACGTTA TAAAAATGGA GGAGTTGACA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA  AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC  CAAACTTCCT CCGATGTAAT AATTTTATCC TTCAGCTCTT TTATCTTTTT GTTGATTTTT TGAATTATTT GGAGAATCTT ACAGGGGTCA ATTGGTTGGC TAATTGAATT TTCACCTATT  GGCGAGGATT TAGGGTTTAG GGAGGTCTTA CTTGTATTGC AATTCTTCAC TACTAAATTT TAGATCCATC TCTTTTTTTT AATCCAGAAT GAAAAACTAA TATGTTTAAT TTTTTTTTGT  TTGTAAATTT GGCAATAAAT GGATGCTATT GTTCTAATTG GGTTATGTGA TTTTTCGTTT GCAGAATGGA GTCGTTTTGC CTGAGTTGCT GGTAAGTTTT TTCTCAGGAA AAAAAAAATC  TCTGTTATTT TTGTTTGGAG GAGAAATGAG GAAATTTCTG GTGTTTTTTT ATTGCACATT GGAAGCTGTA CAATAAATAG GATTCTTGTA CTTATAAAGA GTCTAGTAAC TTTGTACTTT  GGATAGTACT ATGAGTAGTA CAACATTTGA TGAAAGGAGG AGATGTACAC TTAAGAGTAG TATTATATCA ATCTTTTTCG CCTCTGCTTT AGGTAGATCA ACTAACATCT TCTGTTAGAA  GAGAGGACAA GAGCCCTTAT ATAATGCTAC TACAAACAAT ATTCATTTGT CAATAAAAAA TCTGTAGCTC TGCTTTTGAA TTATATTGCC GATAACACGT GACGGTTTTT TCTCCTTGAT  CAATTGCTGA GGTAAATTGA TTGTGCTGGT TGTAATGTGA TTAGTGAGTG TATCAGAGAT GATGACTTTT AACGGGAGGG GGGTATCTTT TAATCTTGAT GGCTTAATGT AGCCCATTTT  GTTGGTTATT GAAGGTTTAG TTTGGGGGGC TTATGTTTGT TTCTATTGGT TTCTTTGTGA GTTGATATAT TATGTTGCAC ATTGTTGTTT TTTTCCACGT TAAACTGATC ATATTGACAA  ATTGGTGACA GACAGAGTTT ATGGTGGATA TGTCGTGTCA AGGCTGTGTT AGTGCTGTCA AGAGCAAATT GCAAACCGTA GAAGGTATAT GCTAAGAAAA AAGAAGAAGA GAGAAACCAT  GCCCTGTAAT GGGGCTTTAT TTTTAACTTC CTCATTTGTT TTGGTGTTGA AAGAGATCTT TTATGTGGCT TTTAGGAGTC AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA  TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA GTACCGGATG GTATGTTCCG ATCTTATCTA ATTGCATCTG  TCATGTTTCC TAAGTTAGTA TTATAGAAAA TTTGTGAAGC ATTATGTCTT CACATCTCTG GCTATGTTAA AGAGGATGAG CAGAAGTAAA GCATACTTAT GATTATAGTG TGTAATGGCC  TTCTTAAGTG CTGAAGGGAA CGAAGAGTGC AAAAAAAGAG ATATTATGCA CTTCTCTCAT GAGCTTCAGT CGTCTTAGCT TTATCTGCTT TATATTTTAT GCGATGCATC TTACTTTTAT  ATTCATTTGA ACCATGCCCT GTAGATTTCC TTATATCTGC TGCCGTTGCC GAATTCAAAG GACCAGATAT TTTTGGTGTT GTTCGCTTGG CTCAAGTCAA TATGGAATTA ACTAGGATTG  AAGCAAACTT CAGTGGCCTG TCACCTGGGA AGCATGCTTG GTCTATTAAT GAATTTGGTG ATTTGACGAG GGGGGCAGCT AGTACTGGAA AATTGTACAG CCTAGTAAGT AACACGCAAA  AGAACATTTT ATTTATGTTG AATATGTTGT ACTATCTTCT TTCTACGAAC CTTTGTTTCT TGGGGGCATG GATTCTGCAA TATACTTGCA TTGAGAAAGA GAGAATCAGG ATCCATAATA  TTAATTATGC AATCATGTTT CATTTAATCT CACTCAAGGA TGCTTGAAGT GTTTGGAGTA TGATATAAAT GCTTTTAAGT GGTCCTTTGC CATATGAAAT GCATCTAATA CCATGCTGTT  AGTTATGGAA TCGTAACTGT CTGGATACTA GATAACATTT GTCAAGGACT GTGAAACTTT TCCTCTCTCT TTGTCCTCTG AAAGTGAAAT AAGCATCTAT CAATTGTAAT TTTCCTTTTG  TTGGACAGTC AAAAGGAGAC AAATATATGG ATAAAGTTCT AATGAATGAT TGGTTTACTT ATGTCTAATA TATGTTGCAC CAGACAGACT ATTAACTGCA TTTCTGATGT GTTTTTCCAT  CTTTCAGCCA CTCGGTGACC TGGGAACACT GGATGTTGAC GAGAAAGGAG AGGCATTTTA TTCCGGTCCT AAAGAGAAGC TGAGAGTTGC TGACCTGATT GGGAGAGCTA TTGCTGTATA  TGCTACTGAA GATAAATCAG ACCCAGGACT TACAGCAGCA GTGATAGCTA GAAGTGCCGG GGTTGGTGAG AACTACAAGA AGCTTTGCAC TTGTGATGGT ACAACTATCT GGGAAGCAAC 
CAGCAAAATC TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA  AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC  CAAACTTCCT CCGATAATGG AGTCGTTTTG CCTGAGTTGC TGACAGAGTT TATGGTGGAT ATGTCGTGTC AAGGCTGTGT TAGTGCTGTC AAGAGCAAAT TGCAAACCGT AGAAGGAGTC  AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA  GTACCGGATG ATTTCCTTAT ATCTGCTGCC GTTGCCGAAT TCAAAGGACC AGATATTTTT GGTGTTGTTC GCTTGGCTCA AGTCAATATG GAATTAACTA GGATTGAAGC AAACTTCAGT  GGCCTGTCAC CTGGGAAGCA TGCTTGGTCT ATTAATGAAT TTGGTGATTT GACGAGGGGG GCAGCTAGTA CTGGAAAATT GTACAGCCTA CCACTCGGTG ACCTGGGAAC ACTGGATGTT  GACGAGAAAG GAGAGGCATT TTATTCCGGT CCTAAAGAGA AGCTGAGAGT TGCTGACCTG ATTGGGAGAG CTATTGCTGT ATATGCTACT GAAGATAAAT CAGACCCAGG ACTTACAGCA 
GCAGTGATAG CTAGAAGTGC CGGGGTTGGT GAGAACTACA AGAAGCTTTG CACTTGTGAT GGTACAACTA TCTGGGAAGC AACCAGCAAA ATCTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTATGACCA AAACTCTGAA TATAAAAAGA GTAAAAAAAA ATGGCATTTT TGAGGTCCAT TGTGACTGCA AAAACTACCG CCATTGCTGC TGCTATTCCA GCTGCTGCTT TTGCTGTTTC  TTCTATTTCT TCTTCTTCGC AGTTTGAACG TCCGTTGAAA AATCTAAAAT TTGGCTCAAT TTCTAGTTCG AATTCGATTC TCCAATTAAG CTTCGCGAAG AATCTACAAA AAAAGAGTCC  TCCTTCAGCT CTTCATATGG AAACGCATTC TTCAAATCAC CAAACTTCCT CCGATAATGG AGTCGTTTTG CCTGAGTTGC TGACAGAGTT TATGGTGGAT ATGTCGTGTC AAGGCTGTGT  TAGTGCTGTC AAGAGCAAAT TGCAAACCGT AGAAGGAGTC AAGAATGTAG ATGTGGATCT TGATAATCAA GTAGTGAGAA TTCTTGGATC TTCACCTGTG AAGACAATGA CTGAAGCCTT  GGAGCAAACA GGTCGAAAAG CCCGTCTGAT TGGGCAAGGA GTACCGGATG ATTTCCTTAT ATCTGCTGCC GTTGCCGAAT TCAAAGGACC AGATATTTTT GGTGTTGTTC GCTTGGCTCA  AGTCAATATG GAATTAACTA GGATTGAAGC AAACTTCAGT GGCCTGTCAC CTGGGAAGCA TGCTTGGTCT ATTAATGAAT TTGGTGATTT GACGAGGGGG GCAGCTAGTA CTGGAAAATT  GTACAGCCTA CCACTCGGTG ACCTGGGAAC ACTGGATGTT GACGAGAAAG GAGAGGCATT TTATTCCGGT CCTAAAGAGA AGCTGAGAGT TGCTGACCTG ATTGGGAGAG CTATTGCTGT  ATATGCTACT GAAGATAAAT CAGACCCAGG ACTTACAGCA GCAGTGATAG CTAGAAGTGC CGGGGTTGGT GAGAACTACA AGAAGCTTTG CACTTGTGAT GGTACAACTA TCTGGGAAGC  AACCAGCAAA ATCTGAACAG TTTATTATCT TTAGAATCAT TTGATCATTG TATACTACTA CGTCTGTATC ATTCACATTC ATGATGCTTT TAAGTTGGAT GGACAAGCTA ATGTATCAAA 
AATAAATGTA ATCATTTGTT GCTCTCACTT TCTTTGGTTC CTGTGTGACG AACTGCTCCT CTTCATTTGA ATGAGAAAAG ATAGGGAATT CAACTTCAAA C 

Retrieve as FASTA