Entry information : LeFRO01(Solyc00g026160.2)
Entry ID 15957
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFRO01(Solyc00g026160.2)
Name LeFRO01(Solyc00g026160.2)
Class Ferric reduction oxidase    [Orthogroup: FRO001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFRO01
start..stop
S start..stop
LeFRO03 520 2e-180 1..444 270..719
LeFRO02 493 3e-170 1..444 266..713
LeFRO06 276 5e-89 32..302 110..382
LeFRO06 52 0.0000001 397..444 376..420
LeFRO04 223 1e-65 1..443 278..739
Literature and cross-references LeFRO01(Solyc00g026160.2)
Protein sequence: LeFRO01(Solyc00g026160.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   444
PWM (Da):   %s   50602.36  
PI (pH):   %s   8.9
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MWVTSLYKIR RKMFDLFFYT HQLYTLYIIF YLLHVGVAYT CMILPGIFLF LIDRYLRFLQ SKRSVRLISS RLLSCNTFEL TFSKNPALTY NPTSILFVNV PSVSKLQWHP FTIVSSSNLE  TDKLSVVIKC MGSWSQKLEK QLSSSPDHLQ ISTEGPYGPS SSHFLSRECL VMISGGSGIT PMISIFRELI YRSTLQPNTK LPKVILITSF KNTSDLTMLD LLLPITTAPF DISNLECKIE  AYITRENEPQ QHESKQQLLV FKQNPKDSPI SAALGKSSWL WLGAIITSSF FMFLLLLGLV TRYSIYPIER DGKLYHYSAK IIWDMFLACA SIFIVTSVIF MWQKRENEIE GKQIQNVEIP 
TNSPVGNLCG IERELESLPH QSIVQATKVH YGTRPDLKRI LFGCKESDVG VVVCGPKSMR HEVANICASG LAQNLHFESI SFNW* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Highly expressed mainly from callus.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCATGCCATT ATTGACTTTG GGCAGCACAA ACTGTCGAAC AACGTCAGGC GTGGCATGAC ATCTCCGCCC TAGGACTGCA CACACGGTCG GTTGACGTCG GGCGTGGTAT GACATTACCG  CCCTTGGACA GCACATACGG TCGAACAACG TCAGGCCAGG CATGACATCA CCACATTTGG ATGGTACGCA CGGTCGAACG ACGACGAGCA TGGCATGACA TCACCACCCT TGGACGCCAC  ACACGGTCGA ACGTCCTTGG GTGTAGAATG TCATCATCGC CTTTACGCAG CACACACGAT CGAATGACGT CGGGCGTGGC ATGACATCAC TGCATTTGGC AGCACAAACG GTCAAACAAC  GTCGGGCGTG ACATGTCATC ACCGCCTTTG GACAGCACAC ACGGTCAAAT GACGTCAAGC GTGCCATGCC ATCATCACCT TTGGGCAGCA CACACGGTCG AACTACGTCG GGTGTGGCAT  GCCATCATCG CCTTTGGGAA GCACCAATGG TCGAACGACG TCGGGCGTCG CATGCCAACA TCACCTTTGG GTAGCACACA GGGTCGAACG ACGTCGGGCG TGGCATGCCA GCATCGCCTT  TGGGAAGCAC ACATGGTCGA AAGACGTCGA GCGTGGCATG ACATCACCTT CTTTGGACAG GGCACACGGT CAAACAATGT CGGGCGCGAC ATGCCATTAC CGCCTTTGGA AAGCATACAC  GGTCGAACGA CGTCGGGTGT GGCATGCCAT CATCACCTTT GGGCAGCACA AACAGTCGGA CGGCGTCGGG CGTTGATTGC CATCATAGCC CTTGAACGGC AAACAAGGTC GAACGACGTC  GGGTGTGGCA TGCATCATCG CCTTTGGGTA GCTCACACGG TCGAACAACG TCAGGTGTGG CATTCCATCA TGGCCCTTGG ATAGCACACT AGATCGAACA ACGTCGGGCG TGGCATGCCA  TCATAGCCCT TGAACGGCAA ACAAGGTTGA ACGGCGTCGA GCGTGGCATA CATTATCGCT TTTGGACTAG CTGAAATAGT TTGACGGCAT AAGGCGTGGC ATGCCATCAT CACCCTTGGA  CGGGAAACAC GGTCGAACGA CGTAGAGCGT GGCATGTCAT CACCGCCTTG GGACAGCACA CACGGTCAGA CGATTTTGGG CGTGGCATGC TATCATCGCC TTTGGGAAGC ACAAACGGTC  ATACGACGTT GGGCGTGGCA TGCCTTCACC GCCCTTGGAT AGCACACAAG GTCGGATGAC GTCTGGCGTG GCATGCCATC ACCGCCCTTG GACTGCACAC ACGATAGGAC GACGTGGGGC  ATGGCATCAG ATCACCGCTC TCAGACTGCA CCCATGGTCG GACGTGGCAT GACATCATCG CCCTTGGACA GCACACACGG TCGAACGACG nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn TATTTTATTT TTAAAAACTA ACAGCATTAG GTTGATATAC GTTACTGTAA  GTAACATTTT ACTCCTAAAA CGTTATTTTC AGTAACGTAT ATCAATCTGA TGCCATCAAC TTTTAAAAAA TAAAATATAT CTTAAAACGT TACTGTGGAA TACGTTTATA CTAGTTTTGT  AAAATTTTAG AAAAACATAT TATTTTGGTG AATGGCTTTA TATAATGGCT TAATTTTGGT TAAAACCTCT CTGAATTCAT TATTTTCAAG ACCCCGAAAT TTTTTCATGG ATCAACCAAG  TGAGGGTTTT TAACGCTACA CAACTTTCCA ATAACGCATC ACAACAAAAA AATAACCCTA GTTTTTTTGT TTTTTTACAA ATTTTTAATC AAAAAAGATC GCGATATCAT TTGTGTGTAT 
ATATTCTGCA GATGATAGAA TGGAGTAGTT CGTACGTATC GAATGTAGCT GGAGAAATAG CGACGTTGGT TGCAATAGCA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGGTTA CAAGTTTGTA CAAGATAAGG AGAAAGATGT TCGATTTATT CTTCTACACA CATCAACTAT ATACTCTATA CATCATCTTC TACCTTTTGC ATGTTGGAGT TGCCTACACA  TGCATGATCT TACCTGGGAT TTTTCTCTTC CTTATCGATC GATACTTGAG ATTTTTACAG TCTAAAAGAA GTGTTAGATT AATTTCTTCA CGACTTTTAT CTTGTAACAC TTTCGAACTC  ACCTTTTCCA AGAATCCAGG TACATTATAT ATACTCCAAT ATTTCACCTC TATTGATTAG TCACACATGA CCTCAAAAAA TTATATTCAA AGAACATAGT TTTGATATAG AAAAAATGCA  CAAGTAGCCC TTCAACCTAT GCCTGAAATC CCAGAGACAC ACTTATACTA TACTAAGGTA CTTCTACCCC TGAACTTATT TTATAAGTAA TTTTCTACCC AGTCAACCAG TGTTGGGCCT  ACAAGATAGT GCCACGTAAA TCGAAAAGTG GTAGAATATT ATTAATAAAA TAAGTTCAGG GGGTAATAGG ACATTTGTAT AGTATAAGTG TGTCTCTGAG ATTTTGGACA TAGGTTGAGG  GTGTACTTGT GCATTATCCC TTTGATATAT TATAAACATT TTTAGTCTAA GATCATAAAT TTTAATTTTC TTAAAAAGAT AAGTTAAACC CCATGCTTAA TTACAAAAAG CATGCTAACT  TTTCAAGAAC ATTAGTTAAG AAGATACAAA CACACACTCT CTCCGTCTCT TTCAATACAT ACATGTGAAT CTATCTCCTT TATAACTCGA TGATAAAGCA ATGATTCTTT TCTAAATTCG  AAATAATTTA ATTTAAACTT TTTATAGTAT GAATGTATGA TTGAGATGGT TTTATACACC AAATGTTATA GCGTTATCAG TAGGTGATTG GCCTTAGAAT TATGAAACTC AAATTTGACA  TCAACATTTG TTTATGAATT GCAACAAAAA TTCAATTTCA AACTTTAAAT TTTTTTAAGT CGGATTTGAA ATACCAAGTT GTATTTCCAA TTTTTTTTTA AATGAGAAAC TTGAACAATA  AGTTTATATT TTGTCAAAAA AGAAAAGACA GTTTTAAACT TAACAAAAAA AATCTCATGT TCGACATGAA TGGTTGTTCA TATCATATGA GGAAGGTTTT TTTTAAAAGA AAAATCGCTA  AATACTATAT ATTGTTGATT TATTAAACCA ATGTAATTTT TATAATAGCA TTTGTAATCA CTCCATTATT ATTGAACTTT ATTCCCAATT AATTAAATAT GTTCACACAC ATTGAAATTA  GCAGTAGTAG TACACTAGTA CTATTACTAG TACTACACAT GTTAGTTAAT ACGTACTTAT AATTTTTTCA CATTATTACA GCATTAACAT ACAACCCTAC AAGCATCTTG TTTGTGAACG  TGCCAAGTGT ATCCAAGTTA CAATGGCATC CATTTACTAT TGTTTCAAGC AGTAATTTGG AGACAGATAA ATTAAGTGTT GTAATTAAAT GCATGGGAAG TTGGAGCCAA AAATTAGAAA  AACAACTTTC TTCTTCTCCA GATCACCTAC AAATATCAAC AGAGGGACCT TATGGACCTT CATCGTCTCA TTTCTTAAGG TAATTAATTA CTCCCTCCGT CTATTTTTAC TGGTTCACTG  CACTATAAAA AATAGTTGTT CAATATAATA CTTGTTCAGT TTGAAAAATT TAAGAGATAG ATTAACCTTT TGTGTCTATT TTACGCTGAT ATTAAATGGA GTATTCAATA TCTAATACAT  ATCTCAAAGG CCAAATAATA AACAGATCCC TAAACTTGTA GGATTTTTCC CTCATGTACC TCAACTATGC TAGTTTCCTA TTGAATCATT GAACCACCTA TAATTTGTTT CTTTTAAATA  ACGGTGGCTG ATGTGGAACA AGATTTTGTG AAAGGTATTG ATAGAAAAGA CATACTCATT AGTCCAATTG ATAGTTCGAG AATAATTGTG TTTTACTTCA AGTCATTTGA ACACATTAGA  TAATAAATGA AACTAACACA CAATTTGTCT TCATTCCTTC AATCAAAATC ATTGCAATAC GAACACAATT AAAGACATTT ACAATCGAAA AAGACGATCA AAATCAGTCA AACAAAGTTT  AAAAGGAACA AATTATGGGT GGTTGAATGA TTGAATAGGA AAATGACGTA ATTGAAGTAC TTGACCTGAC GGAAAACCTA ACAAGTTTAG AAATTCATTT ATTACACTTA ATTACAATGA  TTAGTAACTC AAATAAAACA AATGCTCGTT GATCACATAA TCATTTAAAT TTAAGCTACT AGAACGTTAC ATAAAACATT GTAAAATATT TTTGAAGCTA TTACTTAGCA TATGTGTGTA  AATTTCATTG ATTTAACAAA GCCAATGTGA CATACACATT TCAGTCGAGA ATGCTTGGTG ATGATTAGTG GAGGAAGTGG AATTACTCCC ATGATTTCAA TATTTCGAGA GCTCATTTAC  AGAAGCACAC TTCAACCAAA CACCAAATTA CCAAAAGTCA TCTTAATTAC ATCCTTCAAA AACACATCAG ATCTCACAAT GCTTGATCTC TTGCTCCCTA TCACCACAGC TCCTTTCGAT  ATCTCCAACT TAGAATGCAA AATCGAAGCT TATATCACTA GAGAAAACGA ACCACAACAA CACGAGTCGA AACAACAACT CCTAGTGTTC AAACAAAATC CGAAAGACTC TCCTATTTCT  GCAGCACTCG GGAAAAGCAG CTGGCTCTGG CTTGGAGCGA TAATTACTTC TTCATTCTTC ATGTTTCTCC TTTTGTTAGG CCTCGTTACG CGTTACTCCA TATATCCAAT TGAACGCGAT  GGGAAATTGT ATCATTACAG CGCGAAAATT ATTTGGGATA TGTTTTTGGC TTGTGCTTCG ATATTTATTG TCACTAGTGT TATTTTTATG TGGCAAAAGA GGGAGAATGA AATTGAAGGC  AAACAAATTC AGAATGTGGA AATTCCTACA AATTCACCTG TTGGTAATTT ATGTGGTATC GAAAGGGAGC TGGAAAGCCT TCCTCATCAG TCAATTGTTC AAGCTACTAA GGTGCATTAT  GGTACTAGGC CTGATCTAAA AAGTAAGTTT ACTAGCTAAT TTATTTGCTA CTTCAATATT TAAATCGCAT ATTCCCTTTA ACTTGGTTTC GAATTATATA TACGTTCTTC AATTTTGGGT  GTGCAAAAAT AGACACTTAA ACTTGTATAA AGTTGAACAA ATAGACACAC ATGTCCTACA TGTCATTTTT TGTCATACAT GGTGTCCTAC GTGTATTTTG TCATGTAAGA CTCATGTGTT  TATTTATTCA AAAGTTAGAT AGTTAAACTG TCTGTTTGTG CATTTTGAAA GTTGGAGGTC AAAGTTAAAA TTTGAAAAAA CCAAGTTTAA AGTCTAATAT ATGTATTATG CCTATTTAAA  TTGTATGTAC GATATAATTT TTTGATGAAA GACTTGAACT TACATTATTT TGAATTGAAT GACAGGAATA CTTTTTGGTT GCAAAGAATC AGATGTTGGA GTTGTTGTTT GTGGGCCAAA  GAGCATGAGA CATGAGGTTG CCAATATATG TGCTTCTGGC TTGGCACAAA ACCTACATTT TGAGTCTATC AGCTTTAATT GGTGATGCTC TCTACTTGCT TCTATCACAA AAAAAAACAA  GGATGTATGT ATTGTCTTTT ACTATTTTTC TTTCTTTTTT TTTGGATTAT TTGGTTGTGT GCAAGTTTCT GAAATATGGT TTAAAAAGTT GTGTTGTACA ACAGTATATA TAATCTGGTC  AAAAGTTGTG TAAAATGAAC ATGTTTGCTT GAATGGTTTA TCTTGTAATT GAATTAGAAT GTAATTAAGT GTGAAGACAT GTTATTCAAT ATCAATACAT AAAGAAAAAT ATAATCACCT 
AAACC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGGTTA CAAGTTTGTA CAAGATAAGG AGAAAGATGT TCGATTTATT CTTCTACACA CATCAACTAT ATACTCTATA CATCATCTTC TACCTTTTGC ATGTTGGAGT TGCCTACACA  TGCATGATCT TACCTGGGAT TTTTCTCTTC CTTATCGATC GATACTTGAG ATTTTTACAG TCTAAAAGAA GTGTTAGATT AATTTCTTCA CGACTTTTAT CTTGTAACAC TTTCGAACTC  ACCTTTTCCA AGAATCCAGC ATTAACATAC AACCCTACAA GCATCTTGTT TGTGAACGTG CCAAGTGTAT CCAAGTTACA ATGGCATCCA TTTACTATTG TTTCAAGCAG TAATTTGGAG  ACAGATAAAT TAAGTGTTGT AATTAAATGC ATGGGAAGTT GGAGCCAAAA ATTAGAAAAA CAACTTTCTT CTTCTCCAGA TCACCTACAA ATATCAACAG AGGGACCTTA TGGACCTTCA  TCGTCTCATT TCTTAAGTCG AGAATGCTTG GTGATGATTA GTGGAGGAAG TGGAATTACT CCCATGATTT CAATATTTCG AGAGCTCATT TACAGAAGCA CACTTCAACC AAACACCAAA  TTACCAAAAG TCATCTTAAT TACATCCTTC AAAAACACAT CAGATCTCAC AATGCTTGAT CTCTTGCTCC CTATCACCAC AGCTCCTTTC GATATCTCCA ACTTAGAATG CAAAATCGAA  GCTTATATCA CTAGAGAAAA CGAACCACAA CAACACGAGT CGAAACAACA ACTCCTAGTG TTCAAACAAA ATCCGAAAGA CTCTCCTATT TCTGCAGCAC TCGGGAAAAG CAGCTGGCTC  TGGCTTGGAG CGATAATTAC TTCTTCATTC TTCATGTTTC TCCTTTTGTT AGGCCTCGTT ACGCGTTACT CCATATATCC AATTGAACGC GATGGGAAAT TGTATCATTA CAGCGCGAAA  ATTATTTGGG ATATGTTTTT GGCTTGTGCT TCGATATTTA TTGTCACTAG TGTTATTTTT ATGTGGCAAA AGAGGGAGAA TGAAATTGAA GGCAAACAAA TTCAGAATGT GGAAATTCCT  ACAAATTCAC CTGTTGGTAA TTTATGTGGT ATCGAAAGGG AGCTGGAAAG CCTTCCTCAT CAGTCAATTG TTCAAGCTAC TAAGGTGCAT TATGGTACTA GGCCTGATCT AAAAAGAATA  CTTTTTGGTT GCAAAGAATC AGATGTTGGA GTTGTTGTTT GTGGGCCAAA GAGCATGAGA CATGAGGTTG CCAATATATG TGCTTCTGGC TTGGCACAAA ACCTACATTT TGAGTCTATC 
AGCTTTAATT GGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGGTTA CAAGTTTGTA CAAGATAAGG AGAAAGATGT TCGATTTATT CTTCTACACA CATCAACTAT ATACTCTATA CATCATCTTC TACCTTTTGC ATGTTGGAGT TGCCTACACA  TGCATGATCT TACCTGGGAT TTTTCTCTTC CTTATCGATC GATACTTGAG ATTTTTACAG TCTAAAAGAA GTGTTAGATT AATTTCTTCA CGACTTTTAT CTTGTAACAC TTTCGAACTC  ACCTTTTCCA AGAATCCAGC ATTAACATAC AACCCTACAA GCATCTTGTT TGTGAACGTG CCAAGTGTAT CCAAGTTACA ATGGCATCCA TTTACTATTG TTTCAAGCAG TAATTTGGAG  ACAGATAAAT TAAGTGTTGT AATTAAATGC ATGGGAAGTT GGAGCCAAAA ATTAGAAAAA CAACTTTCTT CTTCTCCAGA TCACCTACAA ATATCAACAG AGGGACCTTA TGGACCTTCA  TCGTCTCATT TCTTAAGTCG AGAATGCTTG GTGATGATTA GTGGAGGAAG TGGAATTACT CCCATGATTT CAATATTTCG AGAGCTCATT TACAGAAGCA CACTTCAACC AAACACCAAA  TTACCAAAAG TCATCTTAAT TACATCCTTC AAAAACACAT CAGATCTCAC AATGCTTGAT CTCTTGCTCC CTATCACCAC AGCTCCTTTC GATATCTCCA ACTTAGAATG CAAAATCGAA  GCTTATATCA CTAGAGAAAA CGAACCACAA CAACACGAGT CGAAACAACA ACTCCTAGTG TTCAAACAAA ATCCGAAAGA CTCTCCTATT TCTGCAGCAC TCGGGAAAAG CAGCTGGCTC  TGGCTTGGAG CGATAATTAC TTCTTCATTC TTCATGTTTC TCCTTTTGTT AGGCCTCGTT ACGCGTTACT CCATATATCC AATTGAACGC GATGGGAAAT TGTATCATTA CAGCGCGAAA  ATTATTTGGG ATATGTTTTT GGCTTGTGCT TCGATATTTA TTGTCACTAG TGTTATTTTT ATGTGGCAAA AGAGGGAGAA TGAAATTGAA GGCAAACAAA TTCAGAATGT GGAAATTCCT  ACAAATTCAC CTGTTGGTAA TTTATGTGGT ATCGAAAGGG AGCTGGAAAG CCTTCCTCAT CAGTCAATTG TTCAAGCTAC TAAGGTGCAT TATGGTACTA GGCCTGATCT AAAAAGAATA  CTTTTTGGTT GCAAAGAATC AGATGTTGGA GTTGTTGTTT GTGGGCCAAA GAGCATGAGA CATGAGGTTG CCAATATATG TGCTTCTGGC TTGGCACAAA ACCTACATTT TGAGTCTATC  AGCTTTAATT GGTGATGCTC TCTACTTGCT TCTATCACAA AAAAAAACAA GGATGTATGT ATTGTCTTTT ACTATTTTTC TTTCTTTTTT TTTGGATTAT TTGGTTGTGT GCAAGTTTCT  GAAATATGGT TTAAAAAGTT GTGTTGTACA ACAGTATATA TAATCTGGTC AAAAGTTGTG TAAAATGAAC ATGTTTGCTT GAATGGTTTA TCTTGTAATT GAATTAGAAT GTAATTAAGT 
GTGAAGACAT GTTATTCAAT ATCAATACAT AAAGAAAAAT ATAATCACCT AAACC 

Retrieve as FASTA