Entry information : LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Entry ID 15958
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Name LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Class Ferric reduction oxidase    [Orthogroup: FRO001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFRO02
start..stop
S start..stop
LeFRO03 846 0 19..713 21..719
LeFRO01 480 1e-164 266..713 1..444
LeFRO06 379 7e-126 194..570 26..382
LeFRO06 48 0.000007 680..713 387..420
LeFRO04 334 2e-104 34..711 36..738
Literature and cross-references LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Protein sequence: LeFRO02(Solyc01g094890.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   713
PWM (Da):   %s   80867.46  
PI (pH):   %s   9.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEVMNRRSSS FSDGKIRMIQ GAILALALTI FLGNLMMWII MPTFTYYQKW VPVLVAATNS TFFDIQGPIM MNFTFPILFI AVLGCLYVHL EKKKSDIVTS SYCNKDWLKI LKKPKIIKSL  GIVTWIELFF LAMFIILCVW YFSAFVYFHY STITTYAATK GVEVWQARID RLALVIGLTG NICLTFLFYP VSRGSSILPL LGLTSEGSIK YHIWLGHMAM TLFTIHGLLF ILFWAVSGRL  HEMLTWNPHY ISNVPGELGL LVGLILWATT FPAIRRRMFE VFFYTHYLYI LFMVFYLLHT GMFYACIMLP GFFLFLIDRY LRFLQSKQQV RLISARVLTC ETVELNFSKI SGLEYSPTSI  MFLNVPSISK LQWHPFTVTS NSNLESDTIS VVIKCEGSWT KKLYSVMSLP KPVDRLDVSV EGPYGPASTH FLRHDTLVLI SGGSGITPFI SIVRELIHMS STLKCKTPKI LLVSVFRNTS  QLSMLDLLYP IAGTPSGCSS NLDLQVEAYI TREIEPAQEK SEPLRTILFK PDHSDAPITP ILGQNNWLWL AAIISSSFAL YLLFVGLLYQ YYVYPMDHGT NQVFPYHTRA LFNMLFIAAA 
IVITASAAFL WNKKKSARET KQIQDMADSA KSLNSLIAYA DQELESLPQQ SLDKSIKTHY GHRPDLKRIL LEVKGSSVGV LASGPKTLRH DVAAICSSEL VENLHFESIS FTW* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGATGTTTA GTCATAATTT GCATCGACCT TTTGATAGAA TGGTCCATAG ATGTGAAAAT ATTATCGTAA GTGAAGATGT ACTAAAAGGA AATAGAATAA AGTAATAAAC TTAAAACTCA  CATAAAAGAA AATTGTCTTG AATGACATTT ATTGTTTCAT ATAAATTTAG CAAAATAATT GATTTTTTTT TAAAAGATAA CACTAATTAG TTGATAATCT ATTTCAATGA CATTTATTGT  CTCATATAAA TTTAGCAAAA TAATTGATTT TTTTTAAAGA TAACACTAAT TAGTTGATAA TCTATTTCAG TCATATTTAT TTTAGGTATA TACTATACTT TATAAAAGTT ATTAACCTTA  CTTGAGCAAT GATATACCCA TCGTAATTCT ACATAATATA AAGTCAGAAA TAAATAAATA TTTTTAAGAC AAAGTTACAA TCTATCCTTT AAAAGTTTAT AATTACAGAA ATTCCTTAAA  TAGATACAAC AATATAAGCG TTGATAAACT AAAAAGAGGG CCGAATACAT ACATGGCCGA AAAATCAAGC GCGGATACAT TAAAATGAAG ATCGATACAT GCGATAATAC ATTAAAAAAG  AGTCGAATAC ATTAATGGCC AAAAAATCAA AACATTGATA CATTAGGAAG AGGGTCAGAT ACATGCTCTG ATACATTTAA TGGAGAATCG GATACATTAA TGACATCTAT TACCTATGAG  AATAATGAAC AGTTTTAAAA ATTCATAAAA CTTATTAGGA ATAATGATAA TATATAAACT AAAAGTGAGA TTTATATTAT TATTCCGTAT AAATAAAATA TATACAAAAC CTACCACTAA  TTTACTTTAC ATGCACTTCT TTTTGTATTC TGTTCTTTTT TTCTTAAAGC AGGATAAGGC CACAAGTTCA CTTTTTTAAT TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATAAAATAT  TTTTTATTTT TACATATTTC AATGATACTG TTATACCTAC TCTCCCATAG CCAAGCTACA ACAATATCAC AAAATTAAAA AATAACCAAA AGAGAGAAAA AAATCTAAGG CAACAACCAC  AAGATTCCTG GTACAAATCT AAAGCCAAAA GATCTAAAAG AAAATATATA GCTTACTTTT AAATGTATTT TAATATTTTC ACCAATTTGT CATTAAGAAA CCCAACAAAA CAATAATCTT  TAATTACTAA TTGCCAAAAG AACATATATA TATTTACAGA AGTAGTAGTA ATTAAAATAA ATTGCATTTG GTTAGGGAGT TGGATACAAA ATCAAACTAA TTAAAATGAT ATATATGCCA  TGTATACATT CACCATAGCT ATTTTACTAG TAAAAACATT TTAAGTGATT TGATAACACT GTCGATTTAT ATTACTTAAA CTCAAGCTAA ATACTCATGC ATCAATTTAA ATGACACATT  TTATATCTTG AGAATCAACC AATTTAAGTT TTATCGAAAA TTTGCGCATG AAATTTTTAA TTTTTTTGAA ATGAAATTTA TAGATTTGTA AACTACGTAA AAAGTACTAC GAGTCACAAT  AATCGATAAT ACAAAATATT TTTAAAAATC TATAAAAATT TTACGATCAC AGATAGATTT ATTTGACTCT TGAAATCTAA AATGTGGCAT ATAAAATAGA ACGGAGGGAG TATACAACTC  AAACAATTAG TGAAGAACTT AGTTTAGAGG AAAAGTTTCA ACAAAAACTT GAAGAAGAGT TTAGAGGTGA AGAAAAATAA TTAAAAGTTA GGTGAAAAAA AAATGAAAAA ATGAAAAATA  TATTTACAAT GGGGCCCTAG GAAGACAAGA TCACTAGACC ATTGAGAGGT GGAATAATCT TGTCAAGTCA GCATCCTATA CAAATTTTGC TTATTTATAG CATACAACTT GTGAACACTT 
ATTTGATGTA TATAACAAGT TCACTACTAC TATATATTTC CAATTTATAT TCAACAAAAG CTAATTTTGT TACAAGAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGATGTATAT AACAAGTTCA CTACTACTAT ATATTTCCAA TTTATATTCA ACAAAAGCTA ATTTTGTTAC AAGAAAAATG GAGGTGATGA ATAGGAGATC ATCATCATTT TCTGATGGAA  AAATTAGAAT GATACAAGGA GCAATATTAG CTTTAGCACT TACAATATTT CTTGGGAATT TAATGATGTG GATTATTATG CCAACTTTTA CATATTATCA AAAATGGGTC CCTGTTCTTG  TTGCTGCCAC CAATTCCACA TTCTTTGATA TTCAAGGTAT TTTAATTTTA ATTATGTATT CCATTTTCCC ATCCTCGAGG CGTGAATTTA GGATTTGAAT ATTATAAAAT TGAGTTTGGA  AGTATACTAG TACTAAAAAC ACGCGAATTT CTGATGGAAA TTTTCGTCCT TGGAGAAAAA TTGTTTGGCA ATTTGCGTGT TTTTAATAGT GTATGTGTAT AAGGTTCGTC AGTGGATCTT  TTAATATATC TGTGTATAAG ATTTAAATCA AAATTACATA CTGAGTTTGA ATGAGCTCGT CAGTACTTAA TAACTACATT CACTCTTGCC TTTTTGGAAA TTTTCTAATA AAATTAGAAC  GACACAGAAA ATAAACCTAG CAAGAAAATT GGACTTCCTT TATTTTCTTT TGCATGTTTC TATTTTTTTT TCATGTCGAG ATGAGGGTAA ATAAAAGAAA TTATAATTTT GATTTTTGGT  GTTATTTTTA CAGGTCCCAT TATGATGAAC TTCACATTCC CAATCTTATT CATAGCTGTT TTGGGTTGTC TTTATGTTCA TCTAGAGAAG AAAAAAAGTG ATATTGTCAC TTCATCATAT  TGGTATATGA TATATATATT TTTTTATTTT GGTTTGTGAT TATGATATAT TTAATTGTTT TTATTGTTGT TTAATTTCAG CAATAAGGAT TGGTTGAAGA TATTGAAAAA GCCAAAAATC  ATCAAATCAT TAGGAATAGT GACATGGATA GAACTATTTT TTCTAGCCAT GTTTATTATT CTATGTGTTT GGTATTTCTC AGCATTTGTC TATTTTCACT ATAGTACCAT TACTACTTAT  GCAGCAACTA AAGGAGTTGA AGTGTAAGTT TCTCCGATTC GGTTTCGATT ATATTATCTG TCTTTTAAGA TTTTTACACG CAATACTAAA TCTTTATTTA TTAGTGACCA ATTTTTTAAA  GTAAAATAAG TCAAAAACCA AAGTAGGATA TCCTGATATA TCAACCACTT ATAAATTTTA GTTTTTTTGA CTTATATAAG TTTAGTACTA TAGTATTTAA TAGTGTCCCA CTTCATCAAT  TAATACTTCA CTAATTAGAG AATTATGGAT GAATTAATTT AGAAAAAAGC GTGTAAATTA AATTATTTTT GCTTGTCTAT AAAGTCAAAT ATTATTTTGG AATAAGTTTT AATTTTTCAA  ACGACTTACA TTTGAGACGG AAGAGAGTGA CAATAAATGA ATGAATATTA TGATGGTTCA CTATTATATT CACGAAGAAT ACTTACGTAG TCAAATATTT TGAAACGAGT TTAATTTGTT  AAACGACTAA TATTTGAAAT TGAAAAACGT GATAATAATT GAAGGAACAT TGTTATTATA TTCATGAATA CTTAAATAGT CAAATATTTT GAAACAAGTT CAATTTATTA AATGACTAAT  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Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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CTTGCCTCTG GACCGAAGAC CTTGAGACAT GACGTAGCAG CCATTTGCTC GTCTGAGTTG GTTGAAAATC TGCACTTTGA GTCCATCAGC TTCACCTGGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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