Entry information : LeGR04(Solyc09g065900.2)
Entry ID 15967
Creation 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeGR04(Solyc09g065900.2)
Name LeGR04(Solyc09g065900.2)
Class Glutathione Reductase    [Orthogroup: GR001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Flower buds
Fruits
Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeGR04
start..stop
S start..stop
ThasGR02 902 0 6..557 3..564
HaGR02 900 0 1..557 1..567
AtGR02 883 0 43..557 55..565
MpGR01 726 0 77..540 84..546
Literature and cross-references LeGR04(Solyc09g065900.2)
Protein sequence: LeGR04(Solyc09g065900.2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   557
PWM (Da):   %s   60050.76  
PI (pH):   %s   7.84
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATSLSSPKL STTLSSPTFH SLYKTKFSNF SLLSLSNPIK PLRFNFLSHT RTSSLSYGRR FTTPRAESSN GAETPRHYDF DLFTIGAGSG GVRASRFASN FGASVAVCEL PFSTISSDST  GGVGGTCVLR GCVPKKLLVY ASKYSHEFEE SCGFGWNYEA EPKHDWSTLI ANKNAELQRL TGIYKNILKN ADVTLIEGRG KVVDPHTVDV DGKLYSAKNI LISVGGRPFI PDIPGSEYAI  DSDAALDLPT KPDKIAIVGG GYIALEFAGI FNGLKSEVHV FIRQKKVLRG FDEEIRDFVG EQMSLRGIEF HTEESPQAIV KSADGSLSIK TNRGTVEGFS HIMFATGRSP NTKNLGLDTV  GVKMTKNGAI EVDEYSRTSV PSIWAVGDVT DRINLTPVAL MEGGALAKTI FAGEPTKPDY RNVPCAVFSQ PPIGLVGLTE EEAIKEYGDV DVYTANFRPL KATLSGLPDR VFMKLVVCAK 
SSKVLGLHMC GDDAPEIVQG FAVAVKAGLT KADFDTTVGI HPTAAEEFVT MRTPTRKIRS SPSEGKAEHD SKAAARV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence fr'om genomic and ESTs. Highly expressed.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTCCAATT CATTCAAAAT AGTATTTTAA TAAAGAAGAG AGGAGCTCGA CGCTAGGATG ATAAAACACT TAACACCTCT CATTTTTATT ATTTTTCCAG TTATAATTAT GAACTCACTA  AAATAAAGAT AAACTCAGTA ATGGATGTTA GAGTTGTTCA AGTTGATTTA CCAATCCTAC TGAGTTCTCG AATTATTTCT TCATAATTGA TTTATCAGTT ATATATTACT AATTAATTTG  ATAGATTTAC TCGTAGTATT CTCTTAAATA TTACTTGTCT ATCAAAATAT ATTGTCACTT GTATTTTTAT GAAATTAGTT TATTATGAAT GCATTGAGTT TACCATATTT AATTGAATAA  GACAACTAAG TGTATCTTTA TCTTAGCCAT AAATTTAACG AAATTAGGCA AGTCTTCTTT AGTTCTTCTC TAGTCTAAGA ATAACCTCTC TTGAGCATGT CTCAAGTAAA TGATAGAACC  TAAATGACCT CTCTCGAGCA TGTCTCAAGT AAATGATAGA ACTATAGCTG TTAATATGGG CTAACTCACC TCATCCGGAG TAATCCATAC AGGCTTTGAC ATTTTACGGG TCAGGCTGGG  CTAGTCCATT TTTTATGTGG GTCGAAAAGT GATCGGCCCA ACCTACAAAT ACGTAGGCTA CAGGCTTGCC GGGCCAGCCC ACCTTTTTTA AAAATTATAC ATATATATAT ATATTAATTA  CTAATTATTA ATTAAAAATA TAAATTATAA TTTAAAAATA TTATCATAAA TATCGACAAA ACAATATTAC ATGATGTTAA TGTTACTACT TGTTAATCAA ATTCACAAAT AAAATTATTT  TTATAAAATA TTTATTAAGT TAAGTTACCA TTTTCAAGAA ACAAAAAAAA ATTATTAAAT TTTTTCAAGT AAAAGTATAA ATATCTAAAT AGAAATATTA ACTTAATTGT TTTGAGTTTG  GACTCCCTCT AATTTTAAAT TTAATATCAT ATTATATTTT TTAATTAAAT TTTATTAGCC CACGGGCCGG CCTTATCGAT ATTTCTCAAG TCAATTCAAC AGGCAGGCTA AAAAGTCTTT  TTCTTAAATG GGCTTCAAAA ATCTTTGCCC AACTCTACTA AATTTGGGTT TAGGCCAGTT CCGCCCACGG GCCTAGCCCA TATTGACGGC TCTAGGTATA ACCTAAATGT TTGTAAAACA  ATCAAGCAAT TGATAATTCG TATTAAGATT GAAAATAATC GTCAAACATA AATATATGTA ATTTATCATT TTCAGAATGT AAAATTTAGC TTCACATAAA CATATTGAGA ATATATATAT  ATATATATAT ATAAAAGGTA ACCGATTAAA CTTCAATTTC CACAATGCTC CTACCTTTCT CTATTTATGA AGAGTATGTA TCTAAAAGAT CATTTGATAA GGTGTACAAG AATAACACTA  AATAGAATGC ATTAGTTAAT GATATAGAAT CATAAGTGAA ATCAGGGTGA AATTGTCTAT CCAAACGTTG ATTTCATCTC ATATATTATA TCACATGACC GAATGCTTAC TTAGTGATGA  GGATATTTTA AAATTATTTA ACAAATAACA ATAATAATTT TATAAAAAAT TGAAGTTGAT AAAAATAAGG CATTTGGCAA TGTTTAATTT TCAATTTATA TTAAGCCAGA AATTTTTGAA  AATTGATTTG AAATTAAATT ATACTCTAGA ATTTTCAGAG GATAATATAA TAATAATAAA CAAAAGTATT TTCAGTTAAA AATAAAAAAA ATAACTTCAA TTTTTAAAAT TAACCTTTTA  GATACTTCCA AAATAGTCAA ATTTCCAAAA GAAATAAATA AACAAAAAGC TGCGTAGAAG TGAAGTTTGA ATAGCTATCT TTGAGAGATT TTCCGAATCA CAAAAAATAA AAATTAAAAA 
TAAAGAGAGA CAAATTCGGA ATTGCCTTCA CTTATTTCTT CACCACAAAA AAGAAAAAAA ACAGAGAAAT TTATTCCGCC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT CTTTGAGCTC ACCAAAGCTC AGTACAACTC TTTCTTCTCC AACTTTCCAT TCTCTTTACA AGACCAAATT CTCTAATTTC TCTCTTCTTT CTCTCTCTAA CCCTATCAAG  CCTCTCCGCT TCAATTTTCT CTCTCATACC CGTACCTCAT CATTATCTTA TGGCCGCCGT TTCACTACTC CTCGTGCTGA GTCATCTAAT GGAGCTGAAA CTCCTCGGCA TTACGATTTC  GATTTATTCA CTATAGGTGC TGGTAGTGGT GGCGTTAGGG CTTCTCGTTT TGCTTCTAAT TTTGGGGCTT CGGTTGCTGT TTGTGAGCTT CCTTTCTCTA CTATATCTTC TGATTCAACT  GGAGGCGTCG GTGGCACGTG AGTCTTTCAT TATAGTGAAC CTTTTTTATT TGGTTGTGAA AAAATGTCAT CTTTAGTTTT TTCCTACTTT TATCTGGGGA ATTAGGTGAA GGAGAATCAA  CAAATTGTTG AATTAGAGAA AAGTGTAGAA GATGGGCGAT TTTTAACTGT TCTATTTGTC TCAAATATGT TTTAAGCTAA AGTGTAATGT TGTTTTATGA TATTGTTGCT AAAGTTTCTG  AATTGATCGA ACTGGATGAG CTATGTGATT CATAGGAAAA ACTGCAGCTT TACTATGGAT TCCAGGATCA TTTCGCGGAA GGTCCTGATA TCAAAATCGT GCATATTTCT CTAGAGAGAG  TGGGATTGTT TTTCAGAAAC TAGACTATGA TTATCATTAA TATAAGAAAA TAGTATGTAC AGTAAGGTTG TAAATGCCTG TGATGTTATC ATTTCTTTTT ACCAGCTTCT TAACATGAAG  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CAAGAGTTTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT CTTTGAGCTC ACCAAAGCTC AGTACAACTC TTTCTTCTCC AACTTTCCAT TCTCTTTACA AGACCAAATT CTCTAATTTC TCTCTTCTTT CTCTCTCTAA CCCTATCAAG  CCTCTCCGCT TCAATTTTCT CTCTCATACC CGTACCTCAT CATTATCTTA TGGCCGCCGT TTCACTACTC CTCGTGCTGA GTCATCTAAT GGAGCTGAAA CTCCTCGGCA TTACGATTTC  GATTTATTCA CTATAGGTGC TGGTAGTGGT GGCGTTAGGG CTTCTCGTTT TGCTTCTAAT TTTGGGGCTT CGGTTGCTGT TTGTGAGCTT CCTTTCTCTA CTATATCTTC TGATTCAACT  GGAGGCGTCG GTGGCACGTG TGTGCTTCGG GGATGTGTAC CCAAGAAATT GCTCGTATAT GCATCAAAAT ATTCTCATGA GTTTGAGGAG AGTTGTGGTT TTGGATGGAA CTATGAGGCA  GAACCTAAAC ATGATTGGAG CACCCTCATT GCTAATAAAA ATGCCGAGTT GCAGCGCCTC ACGGGTATCT ACAAGAATAT TCTGAAGAAT GCGGATGTCA CTCTGATAGA AGGGCGGGGA  AAGGTGGTGG ATCCTCATAC AGTGGATGTG GATGGTAAAC TCTACTCGGC TAAGAACATA CTAATTTCAG TTGGGGGCCG CCCATTTATC CCAGACATTC CTGGAAGCGA GTATGCTATA  GATTCTGATG CTGCCCTTGA TTTGCCAACG AAGCCTGACA AAATTGCCAT TGTTGGAGGC GGTTATATTG CACTTGAATT TGCTGGAATC TTCAATGGAT TGAAAAGTGA GGTCCATGTA  TTTATACGAC AAAAGAAGGT TTTGAGAGGC TTTGATGAAG AAATTAGGGA TTTTGTTGGT GAACAGATGT CACTGAGAGG CATTGAGTTC CATACCGAGG AGTCGCCTCA GGCTATTGTC  AAGTCAGCAG ATGGTTCACT GTCTATAAAG ACTAACAGAG GAACAGTTGA AGGTTTCTCT CATATCATGT TTGCAACAGG ACGAAGTCCA AATACTAAGA ATTTAGGATT AGATACAGTG  GGAGTGAAAA TGACAAAGAA CGGAGCCATA GAGGTTGACG AGTATTCTCG TACATCAGTG CCATCAATTT GGGCAGTTGG AGATGTTACT GATAGAATTA ATCTAACTCC AGTTGCTTTG  ATGGAGGGAG GAGCATTGGC AAAAACTATT TTTGCTGGTG AACCCACAAA ACCTGATTAT AGGAACGTAC CATGTGCAGT ATTTTCCCAG CCACCTATTG GACTAGTTGG CCTGACAGAA  GAAGAGGCCA TCAAAGAATA TGGTGATGTT GATGTTTATA CAGCAAATTT TAGACCATTA AAGGCCACTC TTTCTGGTCT TCCAGATCGG GTTTTCATGA AATTGGTAGT ATGTGCGAAG  TCTAGCAAAG TTCTGGGCTT GCACATGTGT GGAGACGATG CACCAGAAAT TGTACAGGGA TTTGCGGTTG CAGTCAAAGC AGGGTTGACC AAGGCGGACT TCGATACCAC TGTGGGTATT 
CACCCTACAG CAGCAGAGGA GTTTGTCACC ATGCGAACCC CAACAAGGAA GATTCGAAGC AGTCCATCTG AGGGTAAGGC AGAGCACGAC TCTAAAGCTG CTGCAAGAGT TTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAGTTTGAA TAGCTATCTT TGAGAGATTT TCCGAATCAC AAAAAATAAA AATTAAAAAT AAAGAGAGAC AAATTCGGAA TTGCCTTCAC TTATTTCTTC ACCACAAAAA AGAAAAAAAA  CAGAGAAATT TATTCCGCCA TGGCTACATC TTTGAGCTCA CCAAAGCTCA GTACAACTCT TTCTTCTCCA ACTTTCCATT CTCTTTACAA GACCAAATTC TCTAATTTCT CTCTTCTTTC  TCTCTCTAAC CCTATCAAGC CTCTCCGCTT CAATTTTCTC TCTCATACCC GTACCTCATC ATTATCTTAT GGCCGCCGTT TCACTACTCC TCGTGCTGAG TCATCTAATG GAGCTGAAAC  TCCTCGGCAT TACGATTTCG ATTTATTCAC TATAGGTGCT GGTAGTGGTG GCGTTAGGGC TTCTCGTTTT GCTTCTAATT TTGGGGCTTC GGTTGCTGTT TGTGAGCTTC CTTTCTCTAC  TATATCTTCT GATTCAACTG GAGGCGTCGG TGGCACGTGT GTGCTTCGGG GATGTGTACC CAAGAAATTG CTCGTATATG CATCAAAATA TTCTCATGAG TTTGAGGAGA GTTGTGGTTT  TGGATGGAAC TATGAGGCAG AACCTAAACA TGATTGGAGC ACCCTCATTG CTAATAAAAA TGCCGAGTTG CAGCGCCTCA CGGGTATCTA CAAGAATATT CTGAAGAATG CGGATGTCAC  TCTGATAGAA GGGCGGGGAA AGGTGGTGGA TCCTCATACA GTGGATGTGG ATGGTAAACT CTACTCGGCT AAGAACATAC TAATTTCAGT TGGGGGCCGC CCATTTATCC CAGACATTCC  TGGAAGCGAG TATGCTATAG ATTCTGATGC TGCCCTTGAT TTGCCAACGA AGCCTGACAA AATTGCCATT GTTGGAGGCG GTTATATTGC ACTTGAATTT GCTGGAATCT TCAATGGATT  GAAAAGTGAG GTCCATGTAT TTATACGACA AAAGAAGGTT TTGAGAGGCT TTGATGAAGA AATTAGGGAT TTTGTTGGTG AACAGATGTC ACTGAGAGGC ATTGAGTTCC ATACCGAGGA  GTCGCCTCAG GCTATTGTCA AGTCAGCAGA TGGTTCACTG TCTATAAAGA CTAACAGAGG AACAGTTGAA GGTTTCTCTC ATATCATGTT TGCAACAGGA CGAAGTCCAA ATACTAAGAA  TTTAGGATTA GATACAGTGG GAGTGAAAAT GACAAAGAAC GGAGCCATAG AGGTTGACGA GTATTCTCGT ACATCAGTGC CATCAATTTG GGCAGTTGGA GATGTTACTG ATAGAATTAA  TCTAACTCCA GTTGCTTTGA TGGAGGGAGG AGCATTGGCA AAAACTATTT TTGCTGGTGA ACCCACAAAA CCTGATTATA GGAACGTACC ATGTGCAGTA TTTTCCCAGC CACCTATTGG  ACTAGTTGGC CTGACAGAAG AAGAGGCCAT CAAAGAATAT GGTGATGTTG ATGTTTATAC AGCAAATTTT AGACCATTAA AGGCCACTCT TTCTGGTCTT CCAGATCGGG TTTTCATGAA  ATTGGTAGTA TGTGCGAAGT CTAGCAAAGT TCTGGGCTTG CACATGTGTG GAGACGATGC ACCAGAAATT GTACAGGGAT TTGCGGTTGC AGTCAAAGCA GGGTTGACCA AGGCGGACTT  CGATACCACT GTGGGTATTC ACCCTACAGC AGCAGAGGAG TTTGTCACCA TGCGAACCCC AACAAGGAAG ATTCGAAGCA GTCCATCTGA GGGTAAGGCA GAGCACGACT CTAAAGCTGC 
TGCAAGAGTT TGA 

Retrieve as FASTA