Entry information : SaAPx06
Entry ID 16036
Creation 2019-12-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-12-10 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: SaAPx06
Name SaAPx06
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Striga
Organism Striga asiatica (witchweed)    [TaxId: 4170 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value SaAPx06
start..stop
S start..stop
SaAPx01 526 0 1..287 1..290
MguAPx01 511 0 1..287 1..287
HaAPx03 502 0 1..286 1..283
LsaAPx02 500 0 1..286 1..283
Literature and cross-references SaAPx06
Protein ref. GenBank:   GER50254.1 [Incorrect prediction]
Protein sequence: SaAPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   288
PWM (Da):   %s   31554.28  
PI (pH):   %s   7.11
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKVIVDSEY LKEIERARRE LRALIANKNC APIMLRLAWH DAGTYDVNTK TGGPNGSIRN EEECAHGANS GLKIAIDFCE QVKSKCPRIT YADLYQLAGV VAVEVTGGPT IDFVPGRKDS  KISPKEGRLP DATKGVPHLR EVFYRMGVSD KDIVALSGGH TLGRAHPERS GFDGPWTAEP LKFDNSYFKE LLKGESEGLL KLPTDVALLD DPEFRRYVEL YAKDEDAFFK DYAESHKKLS 
ELGFTPAQSG AKAFVKDGTI LAQSAVGIAV AAAVVVLSYF YEVRKKMN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect prediction from NCBI
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGG TTATCGTCGA CTCGGAGTAC CTGAAGGAGA TCGAGCGAGC TCGCCGCGAG CTTCGCGCTC TCATCGCCAA CAAAAACTGT GCTCCAATTA TGCTGCGTTT GGCGTAAATT  TTCATTTTCC TTCTTTCTAC TCCGTCTTTT TTTCTCGTTT TAAACGTAGT GATAGCTCGG CGAGTAGAGT TTGATTGTTG TATTGGAATA CTTTTTGAGT TTTGGGTTTG TGAATTGGGT  TATGGCTGAG TAGATGGCAT GACGCGGGGA CTTATGATGT GAACACGAAG ACTGGAGGTC CGAATGGTTC GATTCGAAAT GAAGAGGAGT GCGCTCACGG AGCTAACAGT GGCTTGAAAA  TCGCGATCGA TTTCTGTGGT TAGTATTGTT TTGTGATTTT TTATTGAGAT GGAGTTCGCG TTTGGTTGTC TTCTATGTTA TACCAGCTGA ATGCATTGAG TAGAACTATT GAGTGTTGTA  TGTTGAATAT GACTTTTATT GTTACGTTTA GAATGTCAGC TTTCGGTTGT TTCATATTTG GTATTGGGAT GTTATATTGG TTGTCAGGAT TTAGATTAAC CTGTTGTTAA ACATATATTT  GATGCACTGC ATTGTATCCT CTAGTACGTG TTCCGTAGCT TAGCTTGAGT CATGGTCACC AACAGATGAA AAGATTCTTT GTTGCGAGAT GTGATACGTC CCTGAGGATA GGATTGCACT  CTTATTGATA TGTGTTGATT TGACTGTTCA GTTTTGTACT GTTGAACTTA TTTTTTTGGA CGAGTATTTA TCTCGTAAGT GTACAATTGC ACCTTTTCTT ATGTTGGTGT GTTATCTGGT  TGCAGAACAA GTGAAGTCTA AATGCCCAAG AATTACGTAT GCAGATCTGT ATCAGGTAAT CTGTTCTAAT GCTTTGGAGG CTTCATTGTC TGGCTGCTGT GTATTCTGCA ACTTAATCAA  CCCCGCATAG TACAGTGAAT AGGACAAAGA ATGCTAAAAG TCCTGCCTAA GAGAATAACC GTTGGATGGA TTAGCATATT AAAACCTCAT CATAAGAGAG GTCATCTTGC TATGCCAAGT  CAGCTGTCTG GCTGTACAGG ATAAAATCCT GTTTCACATA AACATGGAAT AATAGAATTT AAATTTAAAA TAGTCACGAA CAAAAGGAAC TGTAATACTT GGATGATGAA TTGCCTGTCT  AAAATAGAAT ATTTAAAAGC TTAAGTGAGG AAAACTCTAC TCATACACCC AGGTAGTTTC TTGGTCTCTC GGTCTCTCTG AAACATTGTT AGTGAACCTA GTGTTAAAGT TAGTGACATT  CAGTTGCATC TATTATGGAT GGAATTGTCC AATAACATCT TTAGTATTCT TCAAGATAAT TTACCTTCTA TTCTGCATTC TGCCTTTCCA ACATCTCATG GTAACATGTC AATAGGTGGA  TAAATCAAGA GCAATTGCTT CTAAGTTGTA ACCAAATTAA TCTGCCCACA GCTTGCAGGC GTTGTCGCCG TTGAAGTCAC TGGAGGCCCG ACAATTGATT TTGTTCCTGG TAGAAAGGTA  CAATTAGTCT ATTTCATAGA AATATAATGA ATCTTGTCAT TTGATTAAGG CTGAGTTGTG TCTTCCCATG GGACTTTTGA AACTGATTTC AGTTACATTC CGTCCATCCA TTGGCTTGTA  TTTTAGTTTC ATCGACAGAA ATCTTAGTGG TAGCCACCTC ATGTTTCTTT CAGGATTCAA AGATTTCTCC AAAGGAAGGG CGGCTTCCAG ATGCTACTAA AGGTTGAATT AAATATTGTG  GAAGTTTTAG TTGTTCATAA CATCACTTGG TTTAAATTTG TACTTTGTGG AATCAATATA TCTTTTTGCC CATGGTTTTT AATTGAAATT CTTCTGTAAC ATCGTGAGAT ATAAATGATA  CCCACTTTCT TGTTTAAGTT CTTCAGTATT AATTTTCCCA ACGGTATATA GGGCCCGGCT TGTATTTTCA GTCTGGTTTA CTTGTGAGTA CAAGAGTCTC CAGAATGGAG AAACTCGAAG  ATTGTTGTTT AAAGGAAACT GGTTGATGAT TTTCTAATGT TCTTTTGAAA TTTTATTGTT AGGCGTGCCA CACCTTCGGG AGGTGTTCTA TCGTATGGGC GTGTCTGATA AAGACATAGT  GGCACTGTCT GGTGGCCACA CCCTGGTAAT TATCATTTCA ATTTTTTTTT ATTTAATATA CTACCCACTG AACTTTGTTT TCCCCACTCA AGTTGCAACA GATAAAATAA CACAATTTAA  GGAAAGAAGA GATTGAGACA AAAGTGAGGG GGAATTATTA TTTATTAAGG GGGAAAAAAA ATCTGTTCTA ACACAATTAA GTATAATAAT GTTTTCAGGG AAGGGCACAT CCTGAGAGAT  CTGGCTTTGA TGGCCCTTGG ACTGCAGAGC CACTGAAGTT TGATAATTCA TACTTCAAGT AATTCGTTCG AGCTCCATGT ACTCATGTTC TATATTTTCT GTCTGTCTAT ATGTGTCTTT  GATTTACGCC ATCTGAACCA GGGAATTGCT TAAGGGGGAA TCTGAGGGTT TGCTAAAACT CCCAACTGAT GTTGCATTGC TGGATGATCC TGAGTTTAGA CGTTATGTTG AGCTTTATGC  TAAGGTAAAG TATCGTAAGT AGTTATTTCT ACAATCAGCA CACAATAATT GTATCTTGTG TGTGTGTGTG TGTTGTTATG CAATTACCAC AATAAAGCAG CTCAAATATT AATTAACTTT  GCAAAACCAG TTCTTCTTCT TTAAACAGTA GGTGATCACT TGTGAAATTG ATTTAGATTC AAATTTGATG ACCCAAATAA AATTTGGCTC TGAAAATACA AGTGCTAATA GTGGTGATTG  TATCAAATGT CTGTCCTTCG GCCTGAAATC TGCAGACTAT ACTCCCCAAT TAATATATAT TTACTTTATT TTTGCACAAT CAGGATGAAG ATGCTTTCTT CAAAGACTAT GCTGAATCAC  ACAAAAAACT TTCCGAATTA GGGTTTACCC CAGCCCAATC TGGTGCAAAG GCATTCGTGA AAGATGGCAC CATATTGGCC CAGAGTGCCG TTGGAATTGC AGTTGCCGCT GCAGTTGTGG 
TCTTGAGTTA CTTTTATGAA GTTCGGAAGA AGATGAATTA A 

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