Entry information : CcampAPx07(Cuscam_OOIL01000073.1_FGenesh70.1)
Entry ID 16082
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampAPx07(Cuscam_OOIL01000073.1_FGenesh70.1)
Name CcampAPx07(Cuscam_OOIL01000073.1_FGenesh70.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampAPx07
start..stop
S start..stop
CcampAPx04 509 0 1..250 1..250
QshAPx01 467 1e-169 1..249 1..248
PtAPx02 462 5e-168 1..250 1..249
PbAPx01 462 5e-168 1..250 1..249
Literature and cross-references CcampAPx07(Cuscam_OOIL01000073.1_FGenesh70.1)
Protein sequence: CcampAPx07(Cuscam_OOIL01000073.1_FGenesh70.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27289.97  
PI (pH):   %s   6.6
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKSYPTVSG EYQKAVEKCK KKLRGLIAEK QCAPLMLRLA WHSAGTYDVK SKTGGPFGTM KHPEELKHGA NNGLDIAVRL LEPLKEHFPI LSYADFYQLA GVVAVEITGG PEVPFHAGRP  DKATPPPEGR LPDATKGSDH LRTVFGVQMG LSDKDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGPWT SNPLIFDNSY FKELLSGEKE GLLQLPTDKV LLEDPVFRPL VEKYAADEDA FFADYAEAHL 
KLSELGFAEC 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (5' is missing)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAAT CGTATCCAAC TGTGAGTGGA GAGTATCAGA AAGCCGTGGA GAAATGCAAG AAGAAGCTCA GAGGATTGAT TGCCGAGAAA CAGTGTGCTC CTCTCATGCT TCGCCTAGCG  TAAACTCTCG CACTCTCAGT CTCTCACTGA TATGTTGATA TTTGTTCCAC CATGTCGATC GATGTAATCT GTTCGTATCT GTAACTTTTC TATGCTAGTA CGTTTTGTGC CGTTTGTGTT  CTATCTGTTT TGTGAATTGT TTTGCAATTT AGCTTTGTTG ATGATTTGAT TATGGTGTTT ATCTTGTTTG CTGGTATGTT ACTATGCACG TCTTTTTGAG ATCTAGTTTT TGTGTGCTTC  TGATTGTCCT ATCGTATCGT TTCATGTTAT AGTTGACTTT GCCTTCCAAA GCGAAAGGAG GTTTATTCTT CACTTTTGGA GAAGCTGAAG TTAAATACCG TAAACTCCAA GATGTAGGAA  TATGGATATG GATTATAAGG AGTACTCCTT CAAAAATTCT TGATTCTTAT TTTCAATAGA ATTTATTTGA AAGTTGGTGT AATTAAATAA AATATGATAT ATATCTAAAA TTACAAAAAA  AATCTATAAA ATACTAGTAT GCGACTATGA TTATTTTATT TTGTTAAATA ATCAATCAAA ATCTAATGAT AGAATTATAG TTTGACCTTA TACATTTATT ATTTTGTTTT GTCAAATCTT  CAATTGAATT ATATACGAAT ATCTGTTCCT GGATATGATT TGACTTTTTA CATAGTAGTA TAAAACTTTT GCTAGGGGTA GGATCGTTTA GTTGAATGGA GGTTTTGTTG CAATGTTTGA  TTAATGAATA ACAAGATGTC TTATCCCTAT AGTGGAAGGG ATCAATGTGC TGTCTTATGT ATCTTTTGAT CTTGTCTTGT AGCCTATTAT TCCTATTCCT GTTTTGTTGG TGGTTAACTT  TTGTATTGAT TGTCTGTATT GACCATGAAG GTGTGAGTGA TATCCTCCGT ATTAACATTC TACTGGTTTT GACTTGTAGC ATAGTCTTGT CTCTATTATA GCATATCTTA AGTTATGGTG  ATTCAACTGT ATTTTGTATT GTGTTAACAA TTCACTGATT GCTGTTGTCA TTGACTCATT GAGACTTGAG TTTTACTTGC ATTCATGACC ATTGGTGTTG TATTGGATAA TGTCTGAGTG  ATTGTAAGCT GTCTTCCAGA TGGCATTCAG CTGGAACATA TGATGTGAAA AGTAAAACCG GAGGTCCTTT TGGCACAATG AAGCACCCCG AAGAGCTTAA ACATGGAGCC AACAATGGCC  TTGACATTGC TGTCAGGCTG TTGGAACCAC TTAAGGAGCA TTTCCCCATC CTCTCGTATG CTGACTTCTA TCAGGTGGAC TTCTGGTTCT TCTTCAATTC TTTGTTTGTG GTCTTATAAT  CTTACTCACA ATTTTTTTTC TTCAATTTTA TATGAATTGA AGTTGGCTGG AGTTGTAGCT GTTGAGATTA CTGGTGGCCC TGAAGTTCCT TTCCATGCTG GGAGGCCGGT ATAGAACACG  ATTTCCCTTC AGATTTTATA GGATTCACGT TGCAATTTGT GTTCATATTG TTTGTTATTC TTTGCTCCTT ATACACTAAC ATTGTTGTTG GCTTTTCAGG ATAAGGCAAC CCCTCCTCCT  GAAGGTCGTT TGCCTGATGC TACCAAAGGT TTGCGTTTAT TCACTCGTTC TTTATTTATG GTAGTTTAAT CTTTGAAGCG TAGGTCAAGT ACATTTAAAG TATGCTACTA TTTCAGGCTC  CGATCACCTT AGGACTGTCT TTGGAGTGCA AATGGGGCTG AGTGACAAGG ACATTGTTGC TCTATCTGGT GGCCACACAC TGGTAAATAT CATAGAAAAT CGACATCTGT GTTCACGGCT  TCCTATGTTT TTATTTTAAT GACCGGGTTT GTTCAATTTT AGGGAAGGTG CCACAAGGAA CGCTCTGGAT TTGAGGGTCC ATGGACTTCC AACCCTCTCA TATTTGACAA CTCATACTTC  AAGTAAGTTA AAAGTCTGCT TTGCTGATCC TTCTTATCTT AAGTAAGAGC AAGGGGAGTA GATTTTAACT TCTGATTTTG CTATCCTGAA ATGCAGGGAA CTTCTTTCTG GGGAGAAGGA  AGGTCTCCTC CAGCTTCCCA CAGATAAGGT TCTTCTGGAA GACCCCGTTT TCCGCCCCCT TGTGGAGAAA TATGCTGCGG TACATAATCA ATTGAATTTC GAGTTTCCAA AGCTCCAAAT  TTTAACTGTC CGTTGTGATT TGTGATCGGG CATTGAATTG ACTGTTTTTT GTGTAGGATG AGGATGCTTT CTTTGCCGAC TATGCTGAAG CCCATTTGAA GCTCTCTGAG CTTGGGTAAG 
CATTGGTTTT CCATAGATAC TTTATCTTTG TCAGCTACTT TCATGAACTG ACTCTAGTGT GTATTATTTC CAACTGGCAG GTTTGCGGAG TGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAAT CGTATCCAAC TGTGAGTGGA GAGTATCAGA AAGCCGTGGA GAAATGCAAG AAGAAGCTCA GAGGATTGAT TGCCGAGAAA CAGTGTGCTC CTCTCATGCT TCGCCTAGCA  TGGCATTCAG CTGGAACATA TGATGTGAAA AGTAAAACCG GAGGTCCTTT TGGCACAATG AAGCACCCCG AAGAGCTTAA ACATGGAGCC AACAATGGCC TTGACATTGC TGTCAGGCTG  TTGGAACCAC TTAAGGAGCA TTTCCCCATC CTCTCGTATG CTGACTTCTA TCAGTTGGCT GGAGTTGTAG CTGTTGAGAT TACTGGTGGC CCTGAAGTTC CTTTCCATGC TGGGAGGCCG  GATAAGGCAA CCCCTCCTCC TGAAGGTCGT TTGCCTGATG CTACCAAAGG CTCCGATCAC CTTAGGACTG TCTTTGGAGT GCAAATGGGG CTGAGTGACA AGGACATTGT TGCTCTATCT  GGTGGCCACA CACTGGGAAG GTGCCACAAG GAACGCTCTG GATTTGAGGG TCCATGGACT TCCAACCCTC TCATATTTGA CAACTCATAC TTCAAGGAAC TTCTTTCTGG GGAGAAGGAA  GGTCTCCTCC AGCTTCCCAC AGATAAGGTT CTTCTGGAAG ACCCCGTTTT CCGCCCCCTT GTGGAGAAAT ATGCTGCGGA TGAGGATGCT TTCTTTGCCG ACTATGCTGA AGCCCATTTG 
AAGCTCTCTG AGCTTGGGTT TGCGGAGTGT TAA 

Retrieve as FASTA