Entry information : AtrPrx21(AmTr_v1.0_scaffold00008.184)
Entry ID 16090
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrPrx21(AmTr_v1.0_scaffold00008.184)
Name AtrPrx21(AmTr_v1.0_scaffold00008.184)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx21
start..stop
S start..stop
VvPrx64 503 0 15..312 22..319
CsPrx27 502 0 2..314 3..316
AfpPrx24 501 0 2..314 3..315
AcoPrx43 501 0 2..314 3..315
Literature and cross-references AtrPrx21(AmTr_v1.0_scaffold00008.184)
Protein sequence: AtrPrx21(AmTr_v1.0_scaffold00008.184)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   315
PWM (Da):   %s   33755.14  
PI (pH):   %s   8.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALIVIVNLL MLSSVASLVN SLSVNYYDRT CPNAESAVTD AVKKAVLNDK TVPAALLRMH FHDCFIRGCD GSVLLESGKG NTAEKDGPPN VSLHGFYVIH NAKKAVEAIC PGVVSCADIL  ALAARDAVTL SGGPSWNVPK GRKDGRVFKA TETRSLPAPT FNLSQLIQSF SQRGLSQQDL VALSGGHTLG FSHCSSFENR IHNFDASHDV DPSLNPSFAS KLKNICPAHN KVKGAGSTMD 
STSTAFDNSY YKLLVQGKSL FSSDQSLLSS PQTKALVAKF ASSKKAFEDA FINSMIKMSS LNGGQEVRLD CRFVR* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCTAA TTGTGATTGT TAACCTCCTA ATGCTCTCCT CTGTTGCCTC ACTAGTTAAT AGCCTGAGTG TAAATTACTA TGATAGGACA TGCCCTAATG CGGAATCAGC TGTGACTGAT  GCCGTCAAGA AGGCTGTGCT CAATGACAAG ACGGTCCCGG CAGCTCTCCT GAGGATGCAT TTCCATGATT GCTTTATCAG GGTTCGTTTG CTTATCCTTC TATCCTCCCC CTTTTATTCT  TTTTATTGAG AGTTGGTCCT GTGTAATCTT TCTACTATTC CAAAATTGGC CTATTGCTTT TCGCCTGCAT CAATTCACTT CCTTACATTA TGTTAGGATA GGGTGGGTCT AGGATAAGAT  TGTTTACCAT CAACATATTA TAAAAAAGTT ACAATCATTC TTAATTATTA ATTATTAGAT TTGAAATCAG ATGGCTAAAG ATATGCTGCA AGTTCATGGA AAAAATAAAA TAACTTTTGA  CTACAGTGAT TCAGCACACT CCCAAGTGTT TCTTTTCAAA TCTAGCTATT AGTTACTAAA TTTTTTATAC AAAGAGATAT TGTCTTTGTT ATTTTCCTAT ATTATTATCA AGGGAAAAAT  TTATATAAGG TGCCCACCTT ATAATGTAAA AGGAAGTTGC GCCTCAAAAA TCCACTCAAA AGGTCTTTCG GATATAGAAA AACTCTACAA TTGATCATCT CAGTGTAGAG AAACATGGAT  ATCGGATAAA AATGACTTTA ACTCTTAAAA GTAATGTATC TTGTAATACA TGTTTAGATT TCCGATTTTC AAAATAGCCT GTCAAGATAT GTATATTCCC CTCTCTTTTC TTTTAACTTG  AGGAGGTATA TGGGTTTTTT ATAGACTAAA AGGGTTAATT GGGATTATGA TTTCAGAGAG AGGGGGTATA AGTCATTGTC CTAACTTTTA AATTGTTTGT AGATTAGCCC TATCTAAACC  ATTATTGACA ATATTCCAAA ATTTATTTTT TCCTGTAATA ATATCGAACC AGCTATTTAG CCCTCTTCCA CGAAAGCAAG CAGCGTGATA TGGGTCTTCG TTTTGCAGGG TTGTGATGGG  TCGGTTTTGT TGGAATCGGG AAAGGGTAAC ACAGCGGAGA AAGACGGTCC ACCAAATGTT TCACTGCATG GATTCTATGT CATTCACAAC GCCAAGAAGG CAGTGGAAGC TATTTGCCCT  GGCGTCGTCT CTTGTGCTGA TATCCTCGCT CTTGCTGCAA GAGATGCTGT CACGCTCGTA ATATTCTCTC TCCACTAGGA TTGGAAACTA AAAAGGTTAT CATTGGAAAC TAAAAAGGTT  ATTTTTGAGA CCGACCAGGT CAAGTTGAGT CCGTCGGGCT AGGCCAATGT AACCTTTCAT TAGTGTATAT ATAAAGAGAC CATTTACCTT TAGTACATAA AGGTCACAAT TAACTTTTAA  CCATAGGATA TTCTTTTTAA TTTATTAGGT CAGGCTCGGA CCAGGGCAGG GCCGTTTGGG TCGGTTTAGG CGGGCAGACT CTGATAGGGT AGCATTTGGC CCCTTGCCGG CCTTTCTAGA  GAATAAAAAG TCCTCTATGC TCCAAACAAA ATAAACCCTC TTATGGATGC GTGTTTCGGG CATTTGGGGC AGCATTCTAG GAATTGCTTG ATGCACATGT TTGATACTGT TTTATTAACC  CATTTATGTA CCTCGAAACA CCAGCCTCTT TATAAGTAAA AATAAAATAA AAAATAAATA AATGATAAAT ATACCCTCGC AACATTATTA AGGGGTTATT GAGGGGTCCA ACGATCCCCA  ATCAATATTA GACGGTTCAC ATTTTATTTT TTCACTCATG TGCCTCCTTA AAATATATAT TAAAATACCC AAATTACCCC TATTCAGGAT TGGGAACTCT TAACAAATAT GAGTAATTTC  AATAATTTGG CCAATCTAGG AGGCACCTAC AAAATGAATA CTTTCAAAGT TATTGAAGCT CTTTCTTGTT ATTTAATGCC CTTCATAATT TTGTAAGGTA TTTTGAACCA TTAAATGATA  CTTTCTTAAA AAAGGAACAA AATTCTTGTT TTTATAATTA ATGAAGAGTT GCATATTGAT ATCTCTGGAG TAAATCAGTA AATCATCAAC TTAGCTCTTG TTAGTCTTTG GTTTTTCTTC  TATGGAGCTG TTCAATGAAA AAATAGTATT AATAAATAAA TATAAAAATA AAACATTCTA AACAGGTCTC AGAGTCAAAA CTTTCACAAA CACATTTATG TTAAATCATT TTAGCATATC  TCTTAATATG GGCGTCAGTT TGGGAATAAA ATATAAGAGG AACCCTCATA TCTTTGCAGT CAGGAGGACC TAGCTGGAAC GTACCAAAGG GCAGGAAAGA TGGAAGGGTT TTCAAGGCCA  CAGAGACCAG ATCACTGCCA GCCCCCACAT TTAACCTCTC TCAGCTCATA CAAAGCTTCT CACAAAGAGG ACTCTCACAG CAAGACCTCG TAGCTCTCTC TGGTCTGTAA GAAAAAGAAT  AAATGAAAAA AGAGACAACA ATTGCTGCTT ATTATGCATA ATTTGGAGAT GCATTTTCCC TAATGCAAAT ATTTGTGAAT TTGGATAGGT GGGCACACAT TGGGGTTCTC TCATTGCTCC  TCTTTCGAGA ACAGAATTCA CAATTTCGAT GCCAGCCACG ATGTGGACCC ATCACTGAAC CCGAGCTTTG CGTCGAAGTT GAAGAACATC TGTCCAGCTC ACAACAAGGT TAAGGGTGCA  GGTTCAACCA TGGACTCAAC TTCTACGGCT TTCGACAACT CGTATTATAA GCTTTTAGTT CAAGGGAAGA GCCTCTTCTC TTCTGATCAA TCCTTGCTTT CGAGCCCTCA AACCAAGGCT  CTGGTGGCCA AGTTCGCAAG CTCAAAGAAG GCCTTTGAGG ATGCCTTCAT TAATTCCATG ATCAAGATGA GTAGCCTAAA TGGAGGTCAG GAAGTAAGGC TAGATTGCAG GTTCGTTAGA 
TAA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCTAA TTGTGATTGT TAACCTCCTA ATGCTCTCCT CTGTTGCCTC ACTAGTTAAT AGCCTGAGTG TAAATTACTA TGATAGGACA TGCCCTAATG CGGAATCAGC TGTGACTGAT  GCCGTCAAGA AGGCTGTGCT CAATGACAAG ACGGTCCCGG CAGCTCTCCT GAGGATGCAT TTCCATGATT GCTTTATCAG GGGTTGTGAT GGGTCGGTTT TGTTGGAATC GGGAAAGGGT  AACACAGCGG AGAAAGACGG TCCACCAAAT GTTTCACTGC ATGGATTCTA TGTCATTCAC AACGCCAAGA AGGCAGTGGA AGCTATTTGC CCTGGCGTCG TCTCTTGTGC TGATATCCTC  GCTCTTGCTG CAAGAGATGC TGTCACGCTC TCAGGAGGAC CTAGCTGGAA CGTACCAAAG GGCAGGAAAG ATGGAAGGGT TTTCAAGGCC ACAGAGACCA GATCACTGCC AGCCCCCACA  TTTAACCTCT CTCAGCTCAT ACAAAGCTTC TCACAAAGAG GACTCTCACA GCAAGACCTC GTAGCTCTCT CTGGTGGGCA CACATTGGGG TTCTCTCATT GCTCCTCTTT CGAGAACAGA  ATTCACAATT TCGATGCCAG CCACGATGTG GACCCATCAC TGAACCCGAG CTTTGCGTCG AAGTTGAAGA ACATCTGTCC AGCTCACAAC AAGGTTAAGG GTGCAGGTTC AACCATGGAC  TCAACTTCTA CGGCTTTCGA CAACTCGTAT TATAAGCTTT TAGTTCAAGG GAAGAGCCTC TTCTCTTCTG ATCAATCCTT GCTTTCGAGC CCTCAAACCA AGGCTCTGGT GGCCAAGTTC 
GCAAGCTCAA AGAAGGCCTT TGAGGATGCC TTCATTAATT CCATGATCAA GATGAGTAGC CTAAATGGAG GTCAGGAAGT AAGGCTAGAT TGCAGGTTCG TTAGATAA 

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