Entry information : CcampAPx02(Cuscam_OOIL01000175.1_FGenesh46.1)
Entry ID 16096
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampAPx02(Cuscam_OOIL01000175.1_FGenesh46.1)
Name CcampAPx02(Cuscam_OOIL01000175.1_FGenesh46.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampAPx02
start..stop
S start..stop
LeAPx05 483 6e-175 1..285 1..287
NtAPx05-1A 483 1e-174 1..285 1..287
StAPx05 481 4e-174 1..285 1..287
CanAPx03 481 5e-174 1..285 1..287
Literature and cross-references CcampAPx02(Cuscam_OOIL01000175.1_FGenesh46.1)
Protein sequence: CcampAPx02(Cuscam_OOIL01000175.1_FGenesh46.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   288
PWM (Da):   %s   31831.47  
PI (pH):   %s   7.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARPIVDAEY LKEIERARRD LRALISSKNC APIMLRLAWH DAGTYDAKIK AGGPNGSIRN EEEYCHAANN GLKIAIDLCE TVKSKHPKIS YADLYQLAGY VAVEVTGGPS IEFVPGRKDS  KVSPKEGRLP DAKKGAPHLR EVFYRMGLSD RDIVALSGGH TLGRAHPERS GFDGPWTKEP LKFDNSYFVE LLQGETEGLL KLPTDKALLD DPEFRHYVEL YAKDEEAFFE DYAASHKKLS 
ELGFNPSGSK TVKDGPILVQ GAFGVTVVAL VVALGYWYEN RRLLKSIR 

Retrieve as FASTA  
Remarks omplete sequence rfom genomic .Incorrect prediction from FGenSH (splicing error).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGGC CAATCGTCGA CGCCGAGTAC CTCAAGGAGA TCGAGAGAGC TCGCCGGGAC CTCCGCGCTT TGATCTCCAG CAAGAATTGC GCTCCTATTA TGCTTCGCTT GGCGTACGCT  CTTTCTCTCT GTCTCTTATT TCCTCTTTTT TTTTTGAAAT TGTTATTGAA ACAGAGGAAA AAAAGATGGC TAGGATGCTT AGTCGCTTTG GCGATTTCAT TGCAGATGGC ACGATGCTGG  AACTTACGAT GCTAAGATAA AGGCAGGAGG ACCAAACGGT TCAATCAGAA ACGAGGAGGA GTATTGCCAT GCCGCCAATA ATGGCTTGAA AATTGCTATA GATCTTTGCG GTAATTTTCT  GAATTAAATC TTATGCTAGG GAGAGTGATT AGAGTTGGGT TTGTATGTAT TTCACCCTCC TTTTTTTAGA AATTTACCAA GTAATCTCAC ATTTGCACTT TCTTTTACAC TATGTTTGGT  TCAAGGAATT TGAAATGGAA AAGAAACGAA AATGAGATGG AAAACAGTTT TTCTTATTTG GATAAAGAGG AAAAAGAAAA GAATAGTGGA AGGAAAAGAA AATGAAAAGA CAAAATATAC  TAAGAGGGAA AATCAAATTC CTCCCATTTT GGAGAGGAAA ATGAGACAAA ACCATTTTCT TTTCCTTCCA AGTTCCTTGA GCCAAACATA GTGTTAATAT AAAGCGAAAT CAATTCAAAA  TTGAGCAAGC AAATGTTCCT TGTTTTTATA ATCAATTTTG TTAACACTTT TTGTTGAATG CTATCTCTAG CCGCTAGGTA GAGGATTTAA GTGAAACTGT TAAGTACGGA TTATGTATTA  TTACAATAAT CATATTTTTT GAATCTACAA TTATCATTTC CATTGCTCTT AAATCTAAAA AAACCATCTC ATTCGACTGA AGGAAATATT TATCATGCTA ATGATTATCT AAACGTTAAT  TTAGTTTGCT CCTAATTCCA ACTTATGCCG AACTATTTGA ATATTTAGAG TAGATATTTA TCAGCATTTG ATTCGCTGTT TTTTTATGGC AGAGACTGTA AAGTCCAAAC ATCCAAAGAT  TTCATATGCA GATTTGTACC AGGTGTGTTT ATTTTTAATT TCTTACAGCA GCTCCTTTTT TAAACCCAGT AATTCAATGC ATTAGGTTGC GCCATCTTCC TACTCAGTGT TTCTTATTTT  TAGTATTGTT TCTAGCTTCT TTCTTTAGCA TAGTTTTTCT ACATTTCTAG CCAGATTTAA AATTATATTG CATCCACACA TCACTTTCCT TAAATTTCAT TGGCCTGCAT TTGTTTGACC  ATCCACTCAA TTATTTTAAA TTGAACTATG TCATTCTAAA TTGCATTGCG GATCATAGCT TGCTGGTTAT GTTGCTGTTG AGGTCACTGG TGGTCCATCC ATAGAATTTG TTCCTGGCAG  GAAGGTATGT AAGTTTGTTT AATCCCAAAT ATAGATTGAA GTAATGCTAT GTTATGGCTG TATGCCCATA TCATTTCCTT AGATCTAATT CGTTAATGCC CATGAATTAT AGGACTCCAA  GGTCTCTCCG AAGGAAGGAC GTCTTCCAGA TGCCAAGAAA GGTTTTCCCA AAGAAATTCT TACTAATTTA CCATTTCTCA AAATAATCAC ACAGTATTTC TTTGGAATTT GGAGnGGTAT  GGAATCACTG AATCCTGGTT ATATCTGTCT CTTCCAAGCT GTAATGCCCA TGGAGAAATA TGATCCTATC ATGGTTTCTC TTACAAGTAT TGACTGTTTA TTAGTTAATT CAACATGTGC  ATTTATTATC CATTTCTTTG TCAATTGAAA AAACAAATGG TCAGGAGAGA TGCAAAAGAA AAGTGGATTC TTCTTTGATT TATAATTTTG TTACTTCTTT TCAGTGGTGG CCTAATATCA  CTATGTTGAA GATGACAGTT CACCAATTGG ATTTTTTATT TCAATTCTCA GGAAAATGCG AAACAGAAAA TGTATATGTG GTTTGTTGCT TGACATTTGA ATTGTTTCAT TTTTTCATTC  TTTTGAATTT GTGAAGTGTT ATCCAAAAAT GGAAATTTGC AAAGCACAGT GGCTGGCATG TCACTGCTGA CTGCCAACAG ACAGTTGTGG CCATCACCTG GCTGCCCACC ATAACTGTTT  CCCACCACAA TCTACATATT GATTGCTAAA CATATCTGCG TTTACCCCCT GCTACCATAG CCAATGTGGA GGTTGCCGGC GGCGAGGAAA GAGTAACTTT GTGTTATTGT TCATGTTTTT  TGTTGGTTAG GAAAACAAAC TTATGAAAGT AATGATTGGT AAATGTATTT GGAGAGATGA AAAACTAAAG AATAAAAATG AAATTGAAAA ACATGGTTAT ATTTTCTTGT TTTTTGTATA  GTTTTTTTGG TACAGCGGAA GAACTTTAGT TGAAGAGTAC GATGTATCAA CATTCTTCTT GAACAATCAC TTTTTTCTTT ATATTGCAAT AGGTGCACCA CATCTGAGGG AGGTCTTTTA  TCGCATGGGT TTATCTGATA GAGATATTGT AGCTTTATCG GGAGGTCACA CTCTGGTATT TGCGTTCCCC TTTCTCGGTT TATACTTGGC ACATTAAATG TCCTTTCCTC TTTGATTTCC  AAAAAACTTC ATTGTGCATA AATAAGATGT TTGTTTCCAA ATGAAAAACA TGCAGGGAAG GGCCCATCCA GAGAGATCAG GATTTGACGG TCCATGGACA AAGGAGCCCC TAAAATTCGA  CAATTCTTAC TTTGTGTAAG ACTTGGCAGG AATTAATTAT TGTTTACAGA TTGTAGTTTA TATAATACTC GTGTACAAAT TGTAGTATAT ACGAGTATAA TACATAGCAA GATTTGACAG  AGATCATACT TTTACTCAAT CAATTCATAC CATAACATGT ATCATCATAA AACAAATCAA TCATGCACGT CATATACATA AATATGAAGT ACATAATTAC CTAGCAACAG ATATTATGGG  ACATCATTTC ATGTCTCGCA GTTAAGTGCA CATAATTTGT GCACATTATT CATGCATACA GATTGTTGTT GTGCTTCTTC TGTTTTTTCT CCTGTTGACT ATGGTCATCT AAATGTTTCA  ATATCAGGGA GCTGCTTCAG GGTGAAACTG AGGGCCTGTT AAAACTGCCC ACTGATAAGG CTTTGCTCGA TGATCCTGAG TTTCGGCATT ACGTTGAGCT TTACGCTAAG GTAACCCACC  CACCCCCACC CCCACCCCAA ATGGACCTTT GTTTGCTAGT CTTATACTCA TTTTATTCAA TTTCATTGCT GCCTGGAATG GACAACCACA TGATAAAGTA ATTTTGGAAA AGCCATAAAG  GGAAAGATGG TTCTCATATG TGTTTCTGTA ATGCTCAAAT GTTTAAATTC ATGAAATTTC TGGTATCTGT TTAAAGAAAT GAAAAGTATG AAATGTGATT CTCTTGCACC ATATCAAGCT  GGAAGCATGA TGGAACTTTT GCTGCAGGAT GAAGAAGCTT TCTTTGAAGA TTATGCAGCA TCTCACAAGA AACTCTCCGA GCTTGGATTT AATCCATCTG GTTCCAAGAC GGTGAAGGAC 
GGCCCCATAT TGGTGCAGGG TGCTTTTGGT GTTACCGTGG TTGCTTTAGT TGTGGCATTG GGCTACTGGT ATGAAAACCG AAGGCTTTTA AAGTCAATAA GGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGGC CAATCGTCGA CGCCGAGTAC CTCAAGGAGA TCGAGAGAGC TCGCCGGGAC CTCCGCGCTT TGATCTCCAG CAAGAATTGC GCTCCTATTA TGCTTCGCTT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CTTACGATGC TAAGATAAAG GCAGGAGGAC CAAACGGTTC AATCAGAAAC GAGGAGGAGT ATTGCCATGC CGCCAATAAT GGCTTGAAAA TTGCTATAGA TCTTTGCGAG  ACTGTAAAGT CCAAACATCC AAAGATTTCA TATGCAGATT TGTACCAGCT TGCTGGTTAT GTTGCTGTTG AGGTCACTGG TGGTCCATCC ATAGAATTTG TTCCTGGCAG GAAGGACTCC  AAGGTCTCTC CGAAGGAAGG ACGTCTTCCA GATGCCAAGA AAGGTGCACC ACATCTGAGG GAGGTCTTTT ATCGCATGGG TTTATCTGAT AGAGATATTG TAGCTTTATC GGGAGGTCAC  ACTCTGGGAA GGGCCCATCC AGAGAGATCA GGATTTGACG GTCCATGGAC AAAGGAGCCC CTAAAATTCG ACAATTCTTA CTTTGTGGAG CTGCTTCAGG GTGAAACTGA GGGCCTGTTA  AAACTGCCCA CTGATAAGGC TTTGCTCGAT GATCCTGAGT TTCGGCATTA CGTTGAGCTT TACGCTAAGG ATGAAGAAGC TTTCTTTGAA GATTATGCAG CATCTCACAA GAAACTCTCC  GAGCTTGGAT TTAATCCATC TGGTTCCAAG ACGGTGAAGG ACGGCCCCAT ATTGGTGCAG GGTGCTTTTG GTGTTACCGT GGTTGCTTTA GTTGTGGCAT TGGGCTACTG GTATGAAAAC 
CGAAGGCTTT TAAAGTCAAT AAGGTAG 

Retrieve as FASTA