Entry information : CcampAPx05(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1/456.1)
Entry ID 16099
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampAPx05(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1/456.1)
Name CcampAPx05(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1/456.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampAPx05
start..stop
S start..stop
CcampAPx06 821 0 1..436 1..436
GmAPx07 721 0 1..436 1..432
VuAPx03-2 695 0 65..436 42..412
MtAPx07-B 692 0 1..436 1..436
Literature and cross-references CcampAPx05(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1/456.1)
Protein sequence: CcampAPx05(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1/456.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   436
PWM (Da):   %s   47737.61  
PI (pH):   %s   9.36
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERVLLTPS LLHFPSQPSP TKMAAIAAAS RIIPSAASLS SSSSSLSFFA SRSPLKCLPL RSSHRVSRLF VTQRRPEVRV LSSGYGTVSA SKSFASDPDQ LKSAREDIKE LLKAKFCHPI  LIRLGWHDAG TYNKNIEEWP RRGGANGSLR FEVELKHAAN AGLVNALKLL QPIKDKYSHV TYADLFQLAS ATAVEEAGGP KIPMKYGRVD VSAPEQCPEE GRLPDAGPPS PADHLRQVFY  RMGLNDKEIV ALSGAHTLGR SRPDRSGWGK PETKYTKDGP GAPGGQSWTA QWLKFDNSYF KDIKEKRDED LLVLPTDAAL FEDPSFKVYA EKYAEDQEAF FSDYAQAHAK LSNLGAKFDP 
PEGIVIDGSP KPQGEKFEAA KYSSGKKELS EAMKQKIRAE YEAVSGSPDK PSKSNYFLNI MILIAVLALL TYLFGN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independent predictions: Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh458.1 (5') and 456.1 (3')).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAAC GTGTGTTGCT CACTCCTTCA CTACTCCATT TCCCTTCTCA GCCCTCTCCT ACCAAAATGG CCGCCATCGC CGCCGCTTCT CGCATCATTC CCTCCGCCGC CTCACTCTCT  TCTTCTTCCT CTTCTCTTTC CTTCTTTGCT TCTCGCTCCC CGCTCAAATG CCTCCCCCTT CGCTCCTCTC ATCGCGTTTC TCGCCTCTTC GTCACTCAGG TAGCAGTCGC CGATTAGTCT  GATAACTGCT CAATTCGCTT CATATTTTTG TTTTCAGCTA TTGAAATTGA GCTATTGATC GGTTCTCTGA CCGTGTTCTT GTGCTATTAC TTCAGCGACG ACCTGAAGTT CGTGTTTTGA  GTTCGGGATA CGGAACGGTG TCTGCTTCCA AGTCCTTCGC CTCTGATCCT GATCAGTTGA AGAGTGCTAG AGAAGATATC AAGGAGCTTC TCAAGGCCAA GTTCTGCCAT CCGATTCTGG  TAACGCTCAG TTCGTTAACA CTCTTATTTT TACGGATCTC TGTTTAGGAG AATATGTTGT GGCTATGGTT AGGTCCGAAG TGGATCCTGG AAATATAGCA TTTCCTCTTC TTCTTTTAAA  AAAAGTTTTA GAAAGCGTTG GAATTAGCAT TTTTCTGCAA AATTTTGGAA TCCTAGCATT GCACTGCATT CTTCAAGATT TAATGCTCTC TGAGTATGTA TCAAGTTATT GAATTCTTCA  GCAAGTTGAT GCTGAATTTC TGATGGAATT TGCTTTTATA CTCTATGTAT TATTTCGTAC ACACACAGTA TGGTATTTTA GATTTTTTAT TTCAATTTAT ATCTCTTCTT GGGATTTTTT  AATTTTCAAT ATATTTCTCT TTTCTTTGTC GCCTTTTACT CGTTGTGTTG TATTTCTTTC TAGAATTGAA TTATCCAATG AAATTCATTG CATTTTTCAT GATGATGCAG CACTTGAACA  TGAATAATGA GGAAATAGAT CTCATAGATT TATATTTCAA GATGTGTAGT TCCATTTTCC AAAAATTTCA GGAATTACAT ACTATAGCAA TTGATAAGCA TTCCGGATCA TAGGTGTTAT  TGCTTGATTG AAACTGAATT ATGATAAGTT TTCCACAAAA TACGTATCGA CTACCAACTA GTGGTGCTAA CTCAAACCTA TCCTACAAAG AATGCTGGAG AAAGTCCAAT GGGCACTTGA  TGCTGAATTC TAACTACACT ATGTCCTTGA TTTTAAATGG AGTACTGTGT GCAATTTTTA GCTTTTATCA CATTTGACTG ACCTAATTAA ATAAAGAGTT TCTTTGATGC CATTAATCCA  ACCTTATAAA AAATATGTCA TTGAACAGAC TTCTATGCCT TGTTATTTTT ATCATATGAA CATCGAGTTA TGTTAGTTAA AACTCAGTTT TGCACCCTAA ATTTTTAATA TGGAAATAGA  AATGGAAAAC ATCCTCAAAT ATTTCCTTCT TATGATCTAC AGACCCCCTA CTTCTTCTGA TTGTGAATAA TTTAAGTTTG TAAATTGAAA AGCAATGGGT ATACTCTGAG TCACTGGTCA  AGCTTGATGC AAAGGGGCCC AGTGAAACGA GTTCCTTCCT CGTGCGAGAT CTTGACCACT TTCCAATTTT CAAACTTGAA TCATTCTCAA TCGTAGGGAA TAGACTGTCT GGTCATCATA  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AATGGTAGTT TAAGATTTGA AGTTGAGCTG AAACATGCAG CCAATGCTGG TAAAGATATA CTCTATTAAA CATTATTTGC TTCTAATTTT ACTTTTTCTT ATTTACTCTA ATGGGCTGCA  TTATAGGACT TGTGAATGCA TTGAAGCTTC TCCAGCCCAT CAAAGACAAA TACTCTCATG TGACATATGC AGACTTATTT CAGTTGGCTA GTGCTACTGC TGTTGAGGTT ACTCTTATAT  CTGCTTCTGG ACCGACTGTT TGCTATTTAT ATTAGTTTAA AACATACACT GAACACTTTC TTGGAATTTT TAGGAAGCTG GAGGCCCAAA AATTCCAATG AAATATGGAA GGGTGGACGT  CTCTGCACCT GAACAATGCC CGGAAGAAGG GAGACTTCCT GGTAACTAGA CTATTTATCC GGTGGATGCC ACAATGTTAT TTAAAAAGTT CAAAGTTTCC TTTCTATTGA TTGCATAGTT  ATCAAGGCGT CGCCTAGGCG TCGCTTAGGC GACGCTTAGG CGTCTGGGCG AGGTCATATG GACGCCTAAC TGCTCGCCTA GCCTTTTTTG TGCAAACACC GGAAAAGATG ACTGGAAGAA  GCTGAGAGAG GAAGAAGGAG GAGAAGAAGA TCTGAAGAAG ACGAAAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAAACT GAGGAAGATC GAGCTTACCT TACTTGCCGA CGCTGATTCA TTGTCGCGAC  TGCCGAGATA ACCAGCGGCT CCTCTAAACC CTCCGACTCT CCGACTCTCC AATTAGTTAT TTTAGGTTAA CTAATTTGGG CTGAGTTTAT TAAAAGAGAA GTGGGCCTTT ACACTTATTA  ATATAGTTGT TTATTAAAAG AGCATTGGGC CCAAAAATTA TTTCACTTTT AAAAAGTTTA GAAAGATCAA AATATTTACT TATTTTTCTG AATATATTTT TAAATTTTAT TTTTTTTGAA  AAACAACATA CATTCATATA ATTTAGAATA TATACTCTTT ATTTTTTGGG GTTCATATGT TCTCTTTAAT TACTTATTTC ATATTATATG CTTTTATATT AATACCTATA AAATATTAAA  GTTGTCATAG CCACTCGCCT AGAGGACGCC TAGGCGGACG CCTAATCGCT TAGGCGATTA GAAGGTACCC AAGCGCCTAG ACTCGCCTAG TCGCCTTAAC AACTATGATT GATTGTAGAA  CTTGGATTGA CTAGCCTACC ACTAATTTGG GAATGAGAAA CAATGATAAA AACAACAAAC ATATCACTAT TTTTTTAAAT AATACATCTG TTAGTAAACC TTGATGCATA GGTTACATAT  ATAACTTCCA CTAATGCATT ATATTTGGAT TGACTAGCCT ACCACTAATT TGGGAGTAGT ATTTATTATG CTTTTACTAT AAAAAAAGGT AATAAATTAG TTAGTAATTA CCTAACTAAT  TATGATGGTT TGGCTCAATT CAATTGTATA TTGACCCAAA CAAGATGTAG CCAAAAACAG AGATTTTTTC AAATTTGAAA TCATCCCAGC TGCAAACCCA GTAAAATCAC AACTCCCTTG  GGGTCTTGGG TGTCAACTGT CAAGATGTAA GCAGCCTTAC CCCTGTAGAA GAGAGACTCT TTCTTTTAGA CCCAATGGAT TTCTGTATTT ACAGCACAAA ACTTCATACA AAACAAGAAG  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GAATTTAATA AGCAATTGGA AATTCATGTG TAACATTCTA TATGCAGAAA GATGGGCCTG GAGCACCTGG AGGACAATCC TGGACAGCCC AATGGCTGAA ATTTGATAAC TCATACTTCA  AGGTCCTTTT ACCACACGCC CTTCAAAAGG GGGGGGGGAA TGGGTAGATT AGGGGAACTA TGCAGTTTTT CTTATTCCTT ATGCCTGTAC ACAGGACATC AAAGAAAAAA GGGATGAAGA  TCTATTGGTA CTTCCAACTG ATGCTGCTCT TTTTGAGGAT CCATCCTTCA AGGTAAAAGT AGCTGCAGTT ATAATTTTCA CGATAGTTAT TTCAATTCAA CACAAATCAA ACTCGGTAAA  ACACCCTTGC AGGTTTACGC GGAGAAGTAT GCTGAAGACC AGGAAGCGTT CTTCAGTGAT TATGCTCAAG CCCATGCCAA ACTAAGCAAC CTTGGAGCCA AATTTGACCC TCCAGAGGTC  TCTGTTTAAT TCAAGTTACC CTCAACTGTT TTTTTTTTTG AGTTTTTTGC GCCATTACTC TTGAACATTT CAAAAACTGC ACGGATTCCC CCTGAACTTT AAAAATTGCA CCAATGCCTC  CTGGACTTTT AAAAATGTTA CACAAATGTC CCTCTGCGCC AAAAATGCTG CACCAATGGC GCAAAAACTC ATTTTTTTAA CCCGTAAAGC TTTTGTTCTT GCTTTACTAC AGACCTTTAA  TGATTACTTT ATTTTCTTTT AATTATTGTC CATGTACATG TCCGAATCCA AACATATTTT TTTCTCCAGG GCATTGTGAT AGATGGTTCT CCAAAACCAC AAGGGGAGAA GTTTGAAGCA  GCCAAGTACT CCTCTGGAAA GGTTCGTTCT AATCTTGCAC ACTTGATCAA ACCCTACCAT TCATTTAGCT AGCTAACATG AGACACCTTT CGAAAGGGTT GCTCGGGAAA CTATTAATGA  TTCTGCATAT GGTTCATCGT TCTGCTTTTC CTGGTTTGTT GCAGGAGTAA GAACAAGTGT CATGTTTTCA AACATGTAAA TTTTGGAAGT CTTAAATGAA GAAGAATGGA ATAAATATAC  AAAAAAAATT ATGCCTCTAT TTGAATTGCA GAAAGAGCTA TCAGAGGCTA TGAAGCAGAA GATTCGTGCC GAATATGAGG CAGTTAGTGG AAGCCCAGAT AAGCCTTCAA AGTCAAACTA 
TTTTCTTAAT ATCATGATTC TCATTGCTGT TTTGGCACTT TTGACATATC TCTTTGGAAA TTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAAC GTGTGTTGCT CACTCCTTCA CTACTCCATT TCCCTTCTCA GCCCTCTCCT ACCAAAATGG CCGCCATCGC CGCCGCTTCT CGCATCATTC CCTCCGCCGC CTCACTCTCT  TCTTCTTCCT CTTCTCTTTC CTTCTTTGCT TCTCGCTCCC CGCTCAAATG CCTCCCCCTT CGCTCCTCTC ATCGCGTTTC TCGCCTCTTC GTCACTCAGC GACGACCTGA AGTTCGTGTT  TTGAGTTCGG GATACGGAAC GGTGTCTGCT TCCAAGTCCT TCGCCTCTGA TCCTGATCAG TTGAAGAGTG CTAGAGAAGA TATCAAGGAG CTTCTCAAGG CCAAGTTCTG CCATCCGATT  CTGATTCGCT TGGGATGGCA TGATGCTGGT ACTTACAATA AGAATATTGA GGAATGGCCA CGGAGAGGTG GTGCTAATGG TAGTTTAAGA TTTGAAGTTG AGCTGAAACA TGCAGCCAAT  GCTGGACTTG TGAATGCATT GAAGCTTCTC CAGCCCATCA AAGACAAATA CTCTCATGTG ACATATGCAG ACTTATTTCA GTTGGCTAGT GCTACTGCTG TTGAGGAAGC TGGAGGCCCA  AAAATTCCAA TGAAATATGG AAGGGTGGAC GTCTCTGCAC CTGAACAATG CCCGGAAGAA GGGAGACTTC CTGATGCTGG CCCTCCTTCA CCAGCTGATC ATTTGCGTCA GGTTTTCTAC  CGAATGGGAT TAAATGACAA GGAAATTGTT GCGTTATCTG GCGCGCACAC ACTGGGAAGG TCTAGACCGG ATCGTAGTGG CTGGGGCAAG CCTGAGACTA AGTATACAAA AGATGGGCCT  GGAGCACCTG GAGGACAATC CTGGACAGCC CAATGGCTGA AATTTGATAA CTCATACTTC AAGGACATCA AAGAAAAAAG GGATGAAGAT CTATTGGTAC TTCCAACTGA TGCTGCTCTT  TTTGAGGATC CATCCTTCAA GGTTTACGCG GAGAAGTATG CTGAAGACCA GGAAGCGTTC TTCAGTGATT ATGCTCAAGC CCATGCCAAA CTAAGCAACC TTGGAGCCAA ATTTGACCCT  CCAGAGGGCA TTGTGATAGA TGGTTCTCCA AAACCACAAG GGGAGAAGTT TGAAGCAGCC AAGTACTCCT CTGGAAAGAA AGAGCTATCA GAGGCTATGA AGCAGAAGAT TCGTGCCGAA 
TATGAGGCAG TTAGTGGAAG CCCAGATAAG CCTTCAAAGT CAAACTATTT TCTTAATATC ATGATTCTCA TTGCTGTTTT GGCACTTTTG ACATATCTCT TTGGAAATTA G 

Retrieve as FASTA