Entry information : CcampAPx06(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1/465.1)
Entry ID 16104
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampAPx06(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1/465.1)
Name CcampAPx06(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1/465.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampAPx06
start..stop
S start..stop
CcampAPx05 813 0 1..436 1..436
GmAPx07 724 0 1..436 1..432
VuAPx03-2 698 0 65..436 42..412
MtAPx07-B 691 0 1..436 1..436
Literature and cross-references CcampAPx06(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1/465.1)
Protein sequence: CcampAPx06(Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1/465.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   436
PWM (Da):   %s   47921.57  
PI (pH):   %s   9.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERVLLTPS LLHFPSQPPP TKMAAIAAAS RIIPSAASLS SYSSSLSCFA SRSPLKCLHL RSSHRVSRLF VNQRRPEVRV SSSGYGTVSA SKSFASDPDQ LKSAREDIKE LLKAKFCHPI  LIRLGWHDAG TYNKNIEEWP WRGGANGSLR FEVELKHAAN AGLVNALKLL QPIKDKYSHV TYADLFQLAG ATAVEEAGGP KIPMRYGRVD VSAPEQCPEE GRLPDAGPPS PADHLRQVFY  RMGLNDKEIV ALSGAHTLGR SRPDRSGWGK PETKYTKDGP GAPGGQSWTA QWLKFDNSYF KDIKEKRDED LLVLPTDAAL FEDPSFKVYA EKYAEDQEAF FNDYAQAHAK LSNLGAKFDP 
PEGIVIDGSP KPQGEKFEAA KYSSGKKELS EAMKQKIRAE YEAVSGSPDK PLKSNYFLNI MILIAVLAFL TYLFGN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independent predictions: Cuscam_OOIL01000009.1_FGenesh466.1 (5') and 465.1 (3').
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAAC GCGTGTTGCT CACTCCTTCA CTACTCCATT TCCCTTCGCA ACCCCCTCCT ACCAAAATGG CCGCCATCGC CGCCGCTTCT CGCATCATCC CCTCCGCCGC CTCACTCTCT  TCTTATTCCT CTTCTCTTTC CTGCTTTGCT TCTCGCTCCC CGCTCAAATG CCTCCACCTT CGATCCTCTC ATCGCGTTTC TCGCCTCTTC GTCAATCAGG TAGCAGTCGC CGAGTAGTTT  TGATTACTGC TCATTTCGCT TCATGTTTTG TTCTCATCTC TTGAAATTGA GCTATTGATA GGTTCTATGA CCGTGTTCTT GCTCTATTTT TTTCAGCGAC GACCTGAAGT TCGGGTTTCG  AGTTCGGGAT ACGGAACGGT GTCTGCTTCC AAGTCCTTCG CCTCCGATCC TGATCAGTTG AAGAGTGCTA GAGAAGATAT CAAGGAGCTT CTCAAGGCCA AGTTCTGCCA TCCGATTCTG  GTAACGCTCA GTTCGTTAAC ATTCTTATTT TTGCGTATCT CTGTTTAAGA CAATATGTTG TGGCGATGGT TATGTCCGAA GTGGATTCTG GAAATTTAGC ATTTCCCCTT TTATTAAAAA  AAAAGTTTTA GAAAGCGTTG GAACTTGCAT TTTTCTGCAA AATTTTGGAA TCCTAGCAGT GCACTGCATT ATTCAAGATT TAATGCTCTA AGGAGTATGT ATCAAGTTAT TGAATTCTTC  AGCAAGTTGA TGCTGAATTT CTGATAGAAT TTGCTTGTAT TCTCTATGTA TTATTTTGTA CACACACAGT GACACAGTGT TAAAAAAAAG CCTCTCTACT CTTTCTCAAT AGGGGTAAGG  CTTGCGTACT GCCATCATAC CCACATACCC ACTCTGTAGG ATTTTACTGG TTGTGCTGTA TTTCTTTCTG GAATTGAATT ATCCAACAAA ATTCATTGCA ATTTTCATGA TGATGCAGCA  CTTGAACATG AATAACGAGG AAATAGATGT CATAGATTTT TTATTTCAAG ATGTGTAGAC TGTAGTTCCA TTTTTCAAAA ATTTCATGAA TTACATACTA TAGCAATTGA TAAGCATTCC  GGATCACAGG TGTTATTGCT TGATTGAAAC TTAATTATGA TAAGTTTTCC ACAAAATACA TATCAACTAC CAACTAGTGG TGCTAACTCA AACCTCTCCT ACAAAGAATG CTGGAGAAAG  CCCAATGGGC ACTTGATGCT GAATTCTAAC TACACTATGT CCTTGGTTTT AAATGGATTA CTGTGTGCAA TTTGTAGTTT TTATCACATT TGACTGACCT AATTAAATAA AGGGTTTCTT  TGATGCCATT AACCCAACCT TATAAAAAAT ATGTCATTGA ACAGACTTCT ATGCCTTGTT ATTTTTATCA TATGAACATC GAGTTATGCT ACTTAAAACT CAGTTTTGCA CCCTAAATTT  TTAATATGGA AATAGAAATG GAAAACATCC TCAAATATTT CCTTCTAATG ATCTAGAGAC CGCCTACTTC TTCCGATTGT GAATAATTTA AGTTTGGAAA TTGAGAAGCA ATGGATATCA  ACTGAGTCAC TGGTCAAGCT CAATGCAAAG GGGCCCAGTG AAATGTGTTC CTTCCTCGCG CGAGATCTTG ACCACTTTCC AATTTTCAAA CTTGAATCAT TCTCAATCGT AAGGAATAGA  CAGTCTGGGG ATCATAAAAA TTGAATTCTA GATATTTGAA CTCGGTGTTG GCATAATAGA AATGGAAATA ATAAGGCATT AAGGTCAGCT CAGTACCATA CTTTTTGAAA GGCGGTATGG  TTAAAACTAC CCAGTACCCT AAACGATTGA ATTAATGATG TCCTAAAATA CATTAATAAA TTCACAAGCC TCATTCAATA AAAATAGTAC TTGTAACGAG GATATCTAAT TATTGGTTGC  TTCTCACTTA GCAGAAGTTT CCAATGATGA TAAATAGAAT TTTACTGGGC CGCATTTACC AAGTAATTCG AGACGTCACA TTATAATTCC TTGTGTGACA TTTTTGTTGA ATGTTGGTTG  TGTTCTAGCT CTTTTTCCCA TGACCATTTG TAGAGAGTTA GCTTCTATGG TATTGGGATG AGTAGAGTGG CACGTTTTTG GCACGTGCAC AACTCTCTTA AGTCTAAAGA GGCTTCCCTG  ACACTTCAGC TGATTTTCAA TTAGATTTAT GGGTTACAAT ATATTTAGTG CAAAGCTTGT AACCTTTCCT TGGTGTCTTC AATCTTACAT TTCTTTCTCA GTATCTCTTG AGTCTTCATT  ATTATTAATA AATTTCTAGA GAATAATATT TAAGCTGTAG CATAGATGGA GATTCTTCAT TCATCTCAAT TGTTTACATA GATTTTTATG TGATAGATTC GCTTGGGATG GCATGATGCT  GGTACTTACA ATAAGAATAT TGAGGAATGG CCATGGAGAG GTGGTGCTAA TGGTAGTTTA AGATTTGAAG TTGAGCTGAA ACATGCAGCC AATGCTGGTA AAGATATACT ATATTAAACA  TTATTTGCTT CTAATTTTAC TTTTTCTTAT TTACTCTAAT GGGCTGCATT ATAGGACTTG TGAATGCATT GAAGCTTCTC CAGCCCATCA AAGACAAATA CTCTCATGTG ACATATGCAG  ACTTATTTCA GTTGGCTGGT GCTACTGCTG TTGAGGTTAC TCTTATATCT GCTTCTGGAC TGACTGCTTG CTATTTATAT TAGTTTAAAA CATACACTGA CCACTTTCTT GGAATTTTTA  GGAAGCTGGA GGCCCAAAAA TTCCAATGAG ATATGGAAGG GTGGACGTCT CTGCACCTGA ACAATGCCCT GAAGAAGGGA GACTTCCTGG TAACTAGACT ATTTATCCGG AGGATGCCAC  ATTGTTATTT AAAAAGTTCA AATTTTCCTT TCTATTGATT GTAGAACTTA AATTGACAAG TTTACCACTA ATTTGGGAAT GAGAAACAAT GATAAAAAAA CATATAACTA TTTTTTTATA  ATAATACATC TGTTAATAAA CCTTGATACA TCATACATAG GTTACATATA TAACTTCCAT TAATACATTA TACTTGGATT GACTAGCCTA CCACTAATTT TGGAGTAGTA ATGTAGTATT  TATGCTTTTA CTATAAAAAA AGGTAATAAA TTAGTTAGTG ATTATGTAAC TAATTATTAT GATTTGGCTC AATTCAATTG TATATTGGCC CAAACAAGAT GTAGCCAAAA ACAGAGATTT  TTTCAAATTT GAAATCATCC CAACAACAAC AAACCCAGTA TAATCACAAC TCCCTTGGGG TCTTGGGTGT CAACTGTCAA GATGTAAGCA ACCTTACCCG TGTAGAAGAG AGACTCTTTC  ATTTAGGCCC TTAATGGATT GCTGTATTTA CAGCACAACA CTTCATACAA ACAAGTAGCT AGGAAGGTTT TATGTGTCGT TTGTATTTAG TCCATTATTT ATCCGAAGCT AAAATAATAT  AATAAAATGT CTCTTTGAGC TCCATTAGAA CCATCCCAGT CGAAATAAAA GTAACAACAA AGCAGCGGAA GCTTGGTTTT CAGTTTGATA TGGCTTTTGA AAAGCCCTGG TGTAGGATTG  CATTGAAGTT TGAGTGGAAA TTTAACTATG ATATCAAGAG GCTTATACCA GCTATTGGTA GTTAGTATAG AACAAGCATT TTAGACATTT TCATTGCTGG AGGAGATGTA GCCAATATGT  AAATCTAGTT GTGTTTATTA TGCTTGAGAA CATCAAAAAT CTTATCTCTC ATGTTTGTTC ATATTCTCAC GAGTATATAT TGCTGCTGTT CATAGTTCGT CCTGTTTGAA GAGCCCTTGT  CAACCTTGTC AAGTAACAGA ATTTTTTTGT ATAGATGCTG GCCCTCCTTC ACCAGCTGAC CATTTGCGTC AGGTTTTCTA CCGAATGGGA TTAAATGACA AGGTATTTTC CTTTGTTTCT  CAAAAGGGAT AAGGTAGTAG GTTGGATACT TGCAATATGT CTCTGATTTT GATTATCAAG TTGATCTGCA GGAAATTGTT GCATTATCTG GTGCGCACAC ACTGGGAAGG TCTAGACCGG  ATCGTAGTGG CTGGGGCAAG CCTGAGACTA AGTATACAGT ATATTATCTA TCCTTTCGCC CACAAAGTTA TAAGAATCTT TTGTTGTGGC AAATTTCTTT AAACTATTTA AAGTCATATT  TCATCTCTTA GGCTTAGTCT ACATGGTGAT GATCAAATAA TTTCAAGTCA TAATATAACT TGAATTTAAT AAGCAATTGG AAATTCATGT GTAACATTCT ATATGCAGAA AGATGGGCCT  GGAGCACCTG GAGGACAATC CTGGACAGCC CAATGGCTGA AATTTGATAA CTCATACTTC AAGGTCCTTT TACCACACGC CCTTCAAAAT GGGGGGGGGG ATGGGTAGAT TAGGGGAACT  ATGCAGTTTT TCTAATTCCT TTACGATGCC TGTACACAGG ACATCAAAGA AAAAAGGGAT GAAGATCTAT TGGTACTTCC AACTGATGCT GCTCTTTTTG AGGATCCATC CTTCAAGGTA  AAAAGTAGCT GCAGTTATTA TTTTCACAAC AGCTATTTCA ATTCAACATG AATCAAACTC GGTAAAACAT CCATGCAGGT TTATGCGGAG AAATATGCTG AAGACCAGGA AGCATTCTTC  AATGATTATG CTCAAGCCCA TGCCAAACTA AGCAATCTTG GAGCCAAATT TGACCCTCCG GAGGTCTCTG TTCAATTCAA GTTACCCTCA ACTGTTTTTT TTTTGAGTTT TTTGCGCCAT  TACTCTTGAA CTTTTAAAAA TGTCACACAA ATGTCCCTAT GCGCCAAAAA TGCTGCACCA ATGGCGCAAA AACTCATTTT TTTAACCCGT AAAGCTTTTG TTCTTGCTTA ACTACAAAGC  TTTAATGATT ACTTTATTTT CTTTTAATTA TTGTCCACGT ACATGTCTGA ATCCAAACAT ATTTTTTCCT CCAGGGCATT GTGATAGATG GTTCTCCAAA ACCACAAGGG GAGAAGTTTG  AAGCAGCCAA GTACTCCTCC GGAAAGGTTG GTTCTAATCT TGCACACTTG ATCAAATCCT ACCATTCATT TAGCTAACAT TAGACACCTT TCGAAAGGGT TGCTCGGGAA ATTATTAATG  ATTCCGCATA TGGTTCATCG TTCTGCTTTT CCTGGTTTGT TGCAGGAGTA AGAACAAGTG TCATGTTTTC AAACATGTAA ATTTTGGAAG TCTTAAATGA AGAATGGAAT AAAAAAATTA  TGCCTCTATT TGAATTGCAG AAAGAGCTAT CAGAGGCTAT GAAGCAGAAG ATTCGTGCCG AATATGAGGC AGTTAGTGGA AGCCCAGATA AGCCTTTAAA ATCAAACTAT TTTCTTAATA 
TCATGATTCT CATTGCTGTT TTGGCTTTTT TGACATATCT CTTTGGAAAT TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAAC GCGTGTTGCT CACTCCTTCA CTACTCCATT TCCCTTCGCA ACCCCCTCCT ACCAAAATGG CCGCCATCGC CGCCGCTTCT CGCATCATCC CCTCCGCCGC CTCACTCTCT  TCTTATTCCT CTTCTCTTTC CTGCTTTGCT TCTCGCTCCC CGCTCAAATG CCTCCACCTT CGATCCTCTC ATCGCGTTTC TCGCCTCTTC GTCAATCAGC GACGACCTGA AGTTCGGGTT  TCGAGTTCGG GATACGGAAC GGTGTCTGCT TCCAAGTCCT TCGCCTCCGA TCCTGATCAG TTGAAGAGTG CTAGAGAAGA TATCAAGGAG CTTCTCAAGG CCAAGTTCTG CCATCCGATT  CTGATTCGCT TGGGATGGCA TGATGCTGGT ACTTACAATA AGAATATTGA GGAATGGCCA TGGAGAGGTG GTGCTAATGG TAGTTTAAGA TTTGAAGTTG AGCTGAAACA TGCAGCCAAT  GCTGGACTTG TGAATGCATT GAAGCTTCTC CAGCCCATCA AAGACAAATA CTCTCATGTG ACATATGCAG ACTTATTTCA GTTGGCTGGT GCTACTGCTG TTGAGGAAGC TGGAGGCCCA  AAAATTCCAA TGAGATATGG AAGGGTGGAC GTCTCTGCAC CTGAACAATG CCCTGAAGAA GGGAGACTTC CTGATGCTGG CCCTCCTTCA CCAGCTGACC ATTTGCGTCA GGTTTTCTAC  CGAATGGGAT TAAATGACAA GGAAATTGTT GCATTATCTG GTGCGCACAC ACTGGGAAGG TCTAGACCGG ATCGTAGTGG CTGGGGCAAG CCTGAGACTA AGTATACAAA AGATGGGCCT  GGAGCACCTG GAGGACAATC CTGGACAGCC CAATGGCTGA AATTTGATAA CTCATACTTC AAGGACATCA AAGAAAAAAG GGATGAAGAT CTATTGGTAC TTCCAACTGA TGCTGCTCTT  TTTGAGGATC CATCCTTCAA GGTTTATGCG GAGAAATATG CTGAAGACCA GGAAGCATTC TTCAATGATT ATGCTCAAGC CCATGCCAAA CTAAGCAATC TTGGAGCCAA ATTTGACCCT  CCGGAGGGCA TTGTGATAGA TGGTTCTCCA AAACCACAAG GGGAGAAGTT TGAAGCAGCC AAGTACTCCT CCGGAAAGAA AGAGCTATCA GAGGCTATGA AGCAGAAGAT TCGTGCCGAA 
TATGAGGCAG TTAGTGGAAG CCCAGATAAG CCTTTAAAAT CAAACTATTT TCTTAATATC ATGATTCTCA TTGCTGTTTT GGCTTTTTTG ACATATCTCT TTGGAAATTA G 

Retrieve as FASTA