Entry information : CausRboh04(Casaus_Castanospermum01295-PA)
Entry ID 16204
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CausRboh04(Casaus_Castanospermum01295-PA)
Name CausRboh04(Casaus_Castanospermum01295-PA)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Castanospermum australe    [TaxId: 24962 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CausRboh04
start..stop
S start..stop
CausRboh03 1675 0 1..879 1..895
CcajRboh03 1657 0 1..879 1..884
AdurRboh03 1655 0 1..879 1..882
GmRboh02 1652 0 1..879 1..885
Literature and cross-references CausRboh04(Casaus_Castanospermum01295-PA)
Protein sequence: CausRboh04(Casaus_Castanospermum01295-PA)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   879
PWM (Da):   %s   100252.69  
PI (pH):   %s   9.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIQESQQQD SWSETESTGS RSTRVGFSGP LSGPLVSNKR NSSKKSARFR DDDDMFVEIT LDVRDDTVSV QNIRGGDPET ALLASRIEKR PSSLSVRLRQ VSQELKRMTS SKRFDRVDRS  KSGAARALRG LKFMTKSVGT EGWSQVEKRF DELAVDGKLP KTRFSQCIGM NESREFAGEL FDALARRRGI SSASITKDEL REFWEQITDQ SFDSRLQTFF DMVDKDADGR ITEEEVKEII  ALSASANKLS KIQERAEEYA ALIMEELDPD NLGFIELHNL EILLLQAPAQ STHITTDSRV LSQMLSQRLV PTKEHNPIKR GFRALAYFVQ DNWKRLWVIA LWLAICAALF TWKFIQYKDR  AVFHVMGYCV TTAKGAAETL KFNMALILLP VCRNTITWLR SRTKLGVAVP FDDNINFHKV IAFGIAIGIG LHAISHLTCD FPRLLHATDA EYEPMKRYFG EKRPDNYWWF VKGTEGWTGL  VMVVLMAIAF ILAQPWFRRN RLNLPKTLKK LTGFNAFWYS HHLFVIVYAL FIVHGYFLYL SKKWYKKTTW MYLAVPMILY ACERLIRAFR SGYKSVKILK EMYWPLHMSK PQGFKYASGQ  YIFVNCSDVS PFQWHPFSIT SAPGDDYVSV HIRTLGDWTS QLKAVFAKAC QPASDGQSGL LRADMLQGNN IPRMPKLQID GPYGAPAQDY KNYEVILLVG LGIGATPLIS ILKDVLNNIK  QQQDIEEGMV ESGVKNKRKP FATKRAYFYW VTREQGSFEW FKGVMNEVAE NDKDGVIELH NYCTSVYEEG DARSALITML QSLHHAKNGV DIVSGTRVKT HFARPNWRNV FKQVALKYPG 
KRVGVFYCGA PGLVGELRRL SLDFSRKTTT KFDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks "VAVYPGNVLA" is missing at position 584 but found in another frame (frame shift? sequencing error? mutation
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATTC AAGAAAGCCA ACAACAGGAT TCGTGGTCGG AGACAGAGAG CACGGGAAGC CGCAGCACGC GAGTGGGCTT CAGCGGGCCT CTGAGCGGCC CATTAGTTTC CAACAAGAGG  AACAGCAGCA AGAAGAGCGC CAGGTTCAGG GACGACGACG ACATGTTCGT GGAGATAACG TTGGACGTCC GCGACGACAC CGTGTCCGTC CAGAACATCC GCGGCGGCGA CCCCGAGACG  GCGTTGCTGG CCAGCCGCAT CGAGAAGCGG CCGTCGTCGC TGTCGGTTCG GCTGAGACAA GTGTCGCAGG AGCTGAAGCG CATGACGTCC TCGAAGAGGT TCGACAGGGT CGACAGGAGC  AAATCCGGCG CTGCTCGTGC CCTGCGAGGC CTCAAGTTCA TGACCAAAAG CGTCGGAACC GAAGGCTGGT CCCAGGTTGA GAAGCGCTTC GATGAATTGG CCGTTGATGG AAAATTGCCC  AAAACTCGCT TCAGCCAGTG CATAGGTATG TTATTCGTTC GGCTCCACGC TTTGCATTGT AAGCATAACT AGCCGGATTT GGGAACTGGT CGTGGGCATA GTGTGTTTGG CGAGCATTGC  ATAGTAAAAT TACCTAGTAA TTAACGAGGT GTGTGTGTGT GTGCATATAT GTAATTTTTT CTTGCTTTTT ATGACCTAGC TAGAACAAAA AATTATTACA GGAATGGTTT ACATTCTAGT  TCTGCTCCAG ACAGTGATCT TTAAGAAAAC ATTTGCTGAA ACTAATGTTG TTGTTGGTGA ATTTTGGGTG GAATTGACAA TTAGGAATGA ACGAGTCGAG GGAGTTTGCC GGTGAGTTAT  TTGATGCATT GGCTCGCCGT CGAGGGATAT CATCAGCTTC CATAACCAAG GATGAGTTGC GTGAATTTTG GGAACAAATT ACGGATCAGA GCTTTGATTC ACGGCTGCAG ACCTTTTTTG  ACATGTAAGA AATCAGTACT TTTCATTTTC ATTTTCATTA AGGTTTGTAA CAAAAAAAAT TTCATATATA ATTAGGATAT GGCAGAAGAA ATAGAATTTA ACTCGGCAGC TTCAAAGAGA  CGAGTTTCAT TGGCTTCAAC CAGTTCAACA CATAAATATT TCCTTATTTG GAACCATTCC TTAATGTATT TTAGTGTCAA ATTATGGTGC TCAATTTTCT AAAGTCTTGG GAATTATTTA  TGACTATAAG ACGTATAAAA AGCATCACCG CATTTAGTGG AATTTGCATG TGAAACCATG CGTCCTAACA TTATTATTGA CTTTTTAAAA ATATTATATC ACTTACGACT AAAGGTACAG  AATATAAAAG TGAGAGATTC TTCTAGTGAC TTGTGTGGAT TGTTATAAGA GAATGATATC CCGTGGTATT TCATAAAAAA ATATTTATAA ATTACTAAAT TTAATTGAAT ATAAATATAG  ATAAAAAAAT TCAATATACA TAAAAATTAT TTATCTAAAT ATCATTAAAC TATTGTTTTA TCAAACTTAG AAATAAATTA TTAGCAGTGA AAACATTTTA TTAGTTTATT TCATATAGAA  AAATATTATT TTTATATTTG AATTTAGACA CTTTTTTTTA CATTTATTTT TTATGAAAAA AAATGAGACA TGGGAATGTG AGTTTTTTCA TTCAGAGTAC TATTATTTTA TTCACTATTC  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AATG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATTC AAGAAAGCCA ACAACAGGAT TCGTGGTCGG AGACAGAGAG CACGGGAAGC CGCAGCACGC GAGTGGGCTT CAGCGGGCCT CTGAGCGGCC CATTAGTTTC CAACAAGAGG  AACAGCAGCA AGAAGAGCGC CAGGTTCAGG GACGACGACG ACATGTTCGT GGAGATAACG TTGGACGTCC GCGACGACAC CGTGTCCGTC CAGAACATCC GCGGCGGCGA CCCCGAGACG  GCGTTGCTGG CCAGCCGCAT CGAGAAGCGG CCGTCGTCGC TGTCGGTTCG GCTGAGACAA GTGTCGCAGG AGCTGAAGCG CATGACGTCC TCGAAGAGGT TCGACAGGGT CGACAGGAGC  AAATCCGGCG CTGCTCGTGC CCTGCGAGGC CTCAAGTTCA TGACCAAAAG CGTCGGAACC GAAGGCTGGT CCCAGGTTGA GAAGCGCTTC GATGAATTGG CCGTTGATGG AAAATTGCCC  AAAACTCGCT TCAGCCAGTG CATAGGAATG AACGAGTCGA GGGAGTTTGC CGGTGAGTTA TTTGATGCAT TGGCTCGCCG TCGAGGGATA TCATCAGCTT CCATAACCAA GGATGAGTTG  CGTGAATTTT GGGAACAAAT TACGGATCAG AGCTTTGATT CACGGCTGCA GACCTTTTTT GACATGGTGG ACAAGGATGC TGATGGACGA ATTACCGAAG AAGAAGTTAA AGAGATTATC  GCCTTAAGCG CTTCAGCCAA TAAGCTGTCA AAAATACAAG AACGTGCGGA GGAATATGCT GCCCTTATCA TGGAGGAGCT GGATCCGGAC AACCTTGGAT TTATTGAGCT GCATAACCTG  GAAATTCTTC TCCTGCAAGC CCCAGCACAA TCGACCCACA TAACCACGGA TAGTAGGGTG CTGAGCCAAA TGCTGAGCCA GAGACTAGTC CCCACCAAAG AGCACAACCC CATCAAGCGC  GGCTTCCGAG CGCTGGCATA CTTCGTCCAG GACAATTGGA AGCGGCTTTG GGTCATAGCC CTGTGGCTCG CCATTTGCGC AGCTCTTTTC ACTTGGAAGT TCATCCAGTA CAAGGACCGC  GCCGTGTTCC ACGTCATGGG CTACTGTGTC ACCACAGCCA AGGGCGCCGC CGAGACTCTC AAGTTCAACA TGGCCTTGAT CTTGTTGCCT GTCTGCAGAA ACACTATAAC TTGGCTCAGG  AGCAGGACCA AGTTAGGAGT AGCGGTTCCC TTCGATGACA ACATCAACTT TCACAAGGTG ATAGCTTTCG GTATTGCGAT TGGGATTGGG TTGCATGCGA TTTCACATCT AACCTGCGAC  TTCCCGAGGC TATTACACGC CACGGACGCA GAATATGAGC CCATGAAACG CTATTTTGGG GAGAAGAGGC CCGATAACTA TTGGTGGTTC GTGAAAGGGA CCGAGGGTTG GACCGGGTTG  GTCATGGTGG TGCTTATGGC CATAGCCTTC ATCTTGGCTC AACCTTGGTT CCGCCGGAAC AGGCTGAACC TCCCCAAAAC CCTCAAGAAG CTCACTGGTT TCAACGCGTT TTGGTATTCC  CACCACCTCT TCGTCATCGT CTACGCGCTT TTCATTGTTC ACGGATACTT TCTGTATCTC TCCAAGAAAT GGTACAAGAA AACGACGTGG ATGTATCTCG CCGTTCCTAT GATACTGTAC  GCATGCGAAC GGCTGATTCG TGCTTTTAGG TCTGGCTACA AATCTGTGAA GATCTTGAAG GAAATGTATT GGCCTTTGCA TATGTCTAAA CCACAAGGAT TTAAGTACGC CAGTGGCCAG  TATATTTTCG TTAACTGTTC AGATGTCTCC CCATTTCAAT GGCATCCCTT CTCTATCACA TCAGCTCCGG GAGATGACTA CGTAAGCGTT CACATTCGGA CTCTGGGTGA CTGGACATCG  CAGCTGAAGG CTGTTTTCGC CAAGGCATGT CAGCCAGCAA GTGATGGCCA AAGTGGTCTC CTACGAGCTG ATATGTTACA AGGCAACAAC ATACCAAGGA TGCCAAAGCT CCAGATTGAT  GGCCCTTATG GAGCTCCAGC GCAAGACTAC AAAAACTACG AAGTCATTCT TCTCGTGGGC CTAGGAATTG GCGCCACCCC TTTGATTAGC ATACTCAAAG ACGTGCTAAA CAACATCAAG  CAACAGCAAG ACATAGAAGA GGGAATGGTA GAAAGTGGAG TGAAGAACAA GAGAAAACCT TTCGCCACCA AGCGAGCCTA TTTCTACTGG GTTACTCGCG AGCAAGGTTC CTTTGAATGG  TTTAAGGGTG TGATGAATGA GGTTGCAGAG AACGACAAGG ATGGAGTAAT CGAGCTTCAC AACTACTGCA CGAGTGTGTA TGAAGAAGGA GATGCTCGTT CGGCTTTGAT CACAATGCTT  CAGTCCCTCC ACCATGCCAA AAATGGCGTG GATATAGTTT CGGGGACAAG GGTCAAGACC CATTTTGCTA GACCCAATTG GCGTAATGTC TTTAAACAAG TGGCCCTCAA ATATCCTGGC  AAAAGAGTTG GTGTTTTTTA CTGTGGGGCT CCGGGATTAG TTGGCGAACT AAGAAGGCTT TCACTCGACT TTTCCAGGAA AACCACCACC AAGTTTGATT TTCATAAAGA AAACTTTTAG 

Retrieve as FASTA