Entry information : CfasRboh02(Chafa481S10130)
Entry ID 16211
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CfasRboh02(Chafa481S10130)
Name CfasRboh02(Chafa481S10130)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Chamaecrista fasciculate    [TaxId: 53854 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CfasRboh02
start..stop
S start..stop
MpudRboh01 1662 0 1..886 1..887
CcaRboh04 1613 0 1..886 1..887
CausRboh03 1598 0 1..886 1..895
CcajRboh03 1588 0 1..886 1..884
Literature and cross-references CfasRboh02(Chafa481S10130)
Protein sequence: CfasRboh02(Chafa481S10130)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   886
PWM (Da):   %s   100685.87  
PI (pH):   %s   9.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIEENQIET WSENGSAGSR STRVGFSGPL MSKRNSSKKS SRFNFKDDEE YVEITLDVRD DSVSVQNIRG GDSETALLAS RLEKRPSSSL GSQLSFRLRQ VSQELKRMTS VKKFDRVDRT  KSGAARALKG LKFMTKNNVG TAGWSQIESR FDELAVDGKL PKTRFAQCIG MKDSSEFAGE LFEALARRRG IVSASISKDE LREFWEQISD QSFDSRLQTF FDMVDKNADG RINEEEVKEI  IALSASANKL SKIQQRAEEY AALIMEELDP DNLGYIELYN LETLLLQAPA QSTHLTTDSR VLSQMLSQKL VPTKEHNPVK RWARGLGYFV EDNWKRIWVI ALWVAICAAL FTWKFIEYRH  RAVFHVMGYC VTTAKGAAET LKFNMALILL PVCRNTITWL RSRTKLGVIV PFDDNINFHK VIALGIAIGV GMHALAHLTC DFPRLLHATD LEYEPMKQFF GVKRPNNYWW FVKGTEGWTG  IVMVVLMAIA FTLAQPWFRR NRLNLPKPLK KLTGFNAFWY SHHLFVIVYA LLIVHGYYLY LTKEWYKKTT WMYIAIPVIL YACERLIRAL RSGNKSVKIS KVAVYPGNVL ALYMSKPQGF  KYKSGQYLYV NCSDVSPFQW HPFSITSAPG DDYVSVHIRT LGDWTSQLKA VFAKACQPAS EGQSGLLRAD MSQGNNIPRM PKVLIDGPYG APAQDYKNYE VLLLVGLGIG ATPLISILKN  VLNNMKQQHD VEEGEVESGV KNNKRKPFAT KRAYFYWVTR EQGSFEWFKG VMNEVAENDK DGLIELHNYC TSVYEEGDAR SALIAMLQSL HHAKNGVDIV SETRIKTHFA RPNWRSVFKR 
VALKHTDQRV GVFYCGASAL TGELRKHSQD FSRKTSTKFD FHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (scaffold481_cov202). Incorrect prediction from SymDB.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATAG AAGAGAACCA AATAGAGACG TGGTCGGAGA ATGGAAGCGC GGGAAGCCGG AGCACTCGAG TAGGATTCAG TGGGCCGTTG ATGTCCAAAA GGAATAGCAG CAAGAAGAGC  TCGAGGTTCA ACTTCAAAGA CGACGAGGAG TATGTGGAAA TTACTTTGGA CGTTCGCGAT GATTCTGTTT CGGTACAGAA CATTCGAGGG GGTGATTCCG AAACGGCATT GCTGGCGAGT  CGTTTGGAGA AGAGGCCGTC GTCGTCGCTA GGGTCGCAGC TGTCGTTTCG GCTGAGACAA GTGTCGCAAG AGCTGAAACG CATGACGTCG GTGAAGAAGT TTGACCGAGT GGATCGAACA  AAGTCTGGTG CCGCTAGAGC CCTCAAAGGT CTTAAGTTTA TGACAAAAAA TAATGTTGGA ACTGCTGGTT GGTCTCAGAT TGAGAGTCGT TTTGATGAGC TTGCTGTTGA CGGAAAACTC  CCCAAGACTC GCTTTGCCCA GTGCATAGGT ACCTTTTTAC TTACTTATGT AATCTCTAAA AACTAAATAG ATTCATTCTT TAATTTGATT GAAAAAACTA ATATGGCATG ATTTGAGGAT  GATTAGGAAT GAAGGACTCG AGTGAGTTTG CTGGTGAGTT ATTTGAAGCA TTGGCTCGTC GGAGAGGCAT AGTGTCAGCT TCTATATCCA AGGATGAGTT ACGTGAATTT TGGGAACAAA  TTTCCGATCA GAGCTTTGAT TCCAGGCTCC AGACCTTTTT TGATATGTAA GTATACATTT ATCAATTAAT TAGTATCATT AAGTATGTTT TTTCTGGTTT AAATACAGTC ACTCGCAAAA  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TAGGACCGAT TTGACTTCGT TTGTTGACGA TCCCAACTTA ATAGAGAAAT TACTCTTTAA GAAAAATATG TAGCTCTAAA CTTGCTACGT TTGAATTTGA AACGAGCTAT ATTTAATAGT  TTGAAACCTA ATGAACCAAA TTGAACATTA GACATACATT TAGGACCAAA ATGAACCTTT ATCATTTAAT TTATATTCCA AGTAGTTTGA ATTGTAATTG TACACTCAAC TTTGGAGTAC  GTACGTAGGG CATGTCTATT AAGTTATAGT ACAATTTTGA CCCTAAGAGG CCTAGCTAAT TAACGTAAAA TGGGTGATAC ATACAGCTGT ACAACTTGGA AACACTGCTT CTACAAGCCC  CGGCTCAGTC AACACACTTA ACCACGGACA GTCGAGTGCT GAGTCAAATG CTGAGCCAGA AGCTGGTGCC TACGAAAGAG CACAACCCAG TAAAACGGTG GGCACGTGGT TTAGGGTACT  TCGTGGAGGA CAATTGGAAA CGTATTTGGG TGATAGCCTT ATGGGTAGCC ATATGTGCAG CCCTTTTCAC TTGGAAGTTC ATTGAGTATA GACACCGAGC CGTGTTTCAT GTCATGGGCT  ATTGTGTCAC TACAGCTAAA GGTGCAGCTG AGACCCTTAA GTTCAACATG GCCCTCATTT TATTACCTGT TTGTCGTAAC ACCATCACTT GGCTCAGAAG TCGTACCAAG TTGGGAGTCA  TAGTACCTTT TGATGACAAC ATCAACTTTC ACAAGGTACA CATTTTTCAG ATTTTTTTTT TTGACCAAAG CGTACTTTTG GTCCCATAAC TTTTACTAAG GTCTCAATTA GGTCCCATAA  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ATAAAAAAAT TTGGGACTGT TTTGCAATTC TATCTTCTGT CCTATATTTT CAAAAATTAT GTTTTGACCC AAGGATCTTT TTATAATTTT CTGAAAATAT TGAAGGTCAA TATGTAATTT  TTGCAAAATT TATTATGGTT AAAATCAAAA AATAATTCCA AAAGGGTACC GAAGTATTAA CGGAGAATAT CACAAGGTAC CAAAGTGTGA CTTTTTAAAC CACAGGGTTT TGAAGTGAAA  TATGACCAAA TCACTGGGGG TATCAAAATG TAATTTACTC TATATTAATT AAGAAAATAA TTAAGTTGAT GAAAAGCAGT TATTTGACCA TCGACTATAT ATATATAATT AATGAATGCA  GGATGCCAAA GGTGTTGATT GATGGGCCAT ATGGAGCACC AGCACAAGAT TACAAGAACT ACGAAGTTCT GCTTCTAGTG GGACTAGGAA TAGGAGCGAC CCCATTGATT AGCATACTGA  AAAATGTGCT AAACAACATG AAGCAACAAC ACGACGTGGA AGAAGGAGAG GTAGAGAGTG GAGTAAAGAA CAATAAGAGG AAGCCTTTTG CCACCAAGCG AGCCTATTTC TATTGGGTCA  CTCGAGAACA AGGTTCTTTT GAATGGTTCA AAGGTGTCAT GAATGAGGTT GCAGAAAACG ACAAGGATGG TCTCATTGAG CTTCATAATT ATTGCACTAG TGTCTATGAA GAAGGAGATG  CGAGATCAGC TTTGATCGCT ATGCTTCAAT CTCTTCATCA TGCTAAGAAT GGTGTGGATA TAGTTTCAGA GACAAGGATC AAGACCCATT TTGCTAGACC CAATTGGCGT AGTGTCTTTA  AACGTGTCGC CCTAAAACAC ACTGACCAAA GAGTTGGTAA GTATTCTTTA ATTTAATTAA CTATTAAATA CTTAAGTGAA TGGTTTCAAA ACACGGCTCT TATATATTTT CATCCTGATT  TACTCTTTCA GGTGTTTTCT ATTGTGGAGC TAGTGCATTG ACAGGAGAAC TAAGGAAGCA TTCTCAGGAC TTTTCCAGAA AGACCAGCAC CAAGTTTGAT TTTCATAAGG AAAACTTTTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATAG AAGAGAACCA AATAGAGACG TGGTCGGAGA ATGGAAGCGC GGGAAGCCGG AGCACTCGAG TAGGATTCAG TGGGCCGTTG ATGTCCAAAA GGAATAGCAG CAAGAAGAGC  TCGAGGTTCA ACTTCAAAGA CGACGAGGAG TATGTGGAAA TTACTTTGGA CGTTCGCGAT GATTCTGTTT CGGTACAGAA CATTCGAGGG GGTGATTCCG AAACGGCATT GCTGGCGAGT  CGTTTGGAGA AGAGGCCGTC GTCGTCGCTA GGGTCGCAGC TGTCGTTTCG GCTGAGACAA GTGTCGCAAG AGCTGAAACG CATGACGTCG GTGAAGAAGT TTGACCGAGT GGATCGAACA  AAGTCTGGTG CCGCTAGAGC CCTCAAAGGT CTTAAGTTTA TGACAAAAAA TAATGTTGGA ACTGCTGGTT GGTCTCAGAT TGAGAGTCGT TTTGATGAGC TTGCTGTTGA CGGAAAACTC  CCCAAGACTC GCTTTGCCCA GTGCATAGGA ATGAAGGACT CGAGTGAGTT TGCTGGTGAG TTATTTGAAG CATTGGCTCG TCGGAGAGGC ATAGTGTCAG CTTCTATATC CAAGGATGAG  TTACGTGAAT TTTGGGAACA AATTTCCGAT CAGAGCTTTG ATTCCAGGCT CCAGACCTTT TTTGATATGG TGGACAAGAA TGCCGACGGA CGAATCAACG AAGAAGAAGT AAAAGAGATT  ATTGCCTTAA GCGCATCCGC TAATAAGCTG TCCAAAATTC AACAACGTGC TGAGGAATAT GCAGCCCTTA TTATGGAGGA ACTGGACCCC GACAATCTGG GATACATTGA GCTGTACAAC  TTGGAAACAC TGCTTCTACA AGCCCCGGCT CAGTCAACAC ACTTAACCAC GGACAGTCGA GTGCTGAGTC AAATGCTGAG CCAGAAGCTG GTGCCTACGA AAGAGCACAA CCCAGTAAAA  CGGTGGGCAC GTGGTTTAGG GTACTTCGTG GAGGACAATT GGAAACGTAT TTGGGTGATA GCCTTATGGG TAGCCATATG TGCAGCCCTT TTCACTTGGA AGTTCATTGA GTATAGACAC  CGAGCCGTGT TTCATGTCAT GGGCTATTGT GTCACTACAG CTAAAGGTGC AGCTGAGACC CTTAAGTTCA ACATGGCCCT CATTTTATTA CCTGTTTGTC GTAACACCAT CACTTGGCTC  AGAAGTCGTA CCAAGTTGGG AGTCATAGTA CCTTTTGATG ACAACATCAA CTTTCACAAG GTGATAGCTC TTGGCATAGC GATTGGGGTT GGGATGCACG CGCTGGCGCA TTTGACGTGC  GACTTCCCAA GGTTATTGCA CGCAACGGAC TTAGAATATG AACCCATGAA GCAATTTTTT GGAGTAAAGA GACCCAATAA CTATTGGTGG TTCGTGAAAG GAACAGAGGG TTGGACTGGG  ATTGTGATGG TAGTTCTTAT GGCTATAGCC TTTACGTTGG CTCAACCATG GTTCCGTCGA AACAGATTAA ACCTTCCCAA ACCACTCAAG AAGCTTACTG GTTTCAACGC ATTTTGGTAC  TCTCACCATC TCTTCGTCAT TGTCTACGCC CTCTTAATCG TTCACGGATA TTACCTTTAC CTCACCAAAG AATGGTATAA GAAAACGACG TGGATGTATA TCGCGATTCC AGTGATCTTA  TACGCATGTG AACGTCTCAT TCGTGCTTTG AGGTCCGGAA ACAAGAGTGT CAAAATCTCC AAGGTTGCGG TATACCCAGG AAATGTATTG GCTTTGTACA TGTCTAAACC ACAAGGATTC  AAGTACAAGA GTGGGCAGTA TCTTTACGTG AACTGTTCAG ATGTCTCCCC ATTCCAATGG CATCCTTTCT CTATTACATC AGCTCCTGGA GATGATTATG TGAGCGTTCA TATTCGCACT  TTGGGAGACT GGACATCACA ACTCAAAGCT GTTTTCGCCA AGGCATGCCA GCCAGCAAGT GAGGGCCAAA GTGGTCTTCT ACGAGCTGAT ATGTCACAAG GCAACAACAT ACCAAGGATG  CCAAAGGTGT TGATTGATGG GCCATATGGA GCACCAGCAC AAGATTACAA GAACTACGAA GTTCTGCTTC TAGTGGGACT AGGAATAGGA GCGACCCCAT TGATTAGCAT ACTGAAAAAT  GTGCTAAACA ACATGAAGCA ACAACACGAC GTGGAAGAAG GAGAGGTAGA GAGTGGAGTA AAGAACAATA AGAGGAAGCC TTTTGCCACC AAGCGAGCCT ATTTCTATTG GGTCACTCGA  GAACAAGGTT CTTTTGAATG GTTCAAAGGT GTCATGAATG AGGTTGCAGA AAACGACAAG GATGGTCTCA TTGAGCTTCA TAATTATTGC ACTAGTGTCT ATGAAGAAGG AGATGCGAGA  TCAGCTTTGA TCGCTATGCT TCAATCTCTT CATCATGCTA AGAATGGTGT GGATATAGTT TCAGAGACAA GGATCAAGAC CCATTTTGCT AGACCCAATT GGCGTAGTGT CTTTAAACGT  GTCGCCCTAA AACACACTGA CCAAAGAGTT GGTGTTTTCT ATTGTGGAGC TAGTGCATTG ACAGGAGAAC TAAGGAAGCA TTCTCAGGAC TTTTCCAGAA AGACCAGCAC CAAGTTTGAT 
TTTCATAAGG AAAACTTTTA G 

Retrieve as FASTA