Entry information : CfasRboh09(Chafa1665S16797)
Entry ID 16218
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CfasRboh09(Chafa1665S16797)
Name CfasRboh09(Chafa1665S16797)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Chamaecrista fasciculate    [TaxId: 53854 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CfasRboh09
start..stop
S start..stop
CausRboh09 1306 0 58..827 41..812
CcaRboh08 1285 0 69..827 43..799
MpudRboh06 1274 0 68..827 67..840
LjRboh09 1261 0 57..827 41..810
Literature and cross-references CfasRboh09(Chafa1665S16797)
Protein sequence: CfasRboh09(Chafa1665S16797)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   827
PWM (Da):   %s   93672.55  
PI (pH):   %s   9.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEEHFEFLTT TTATARERSL IALLRSSSSK SSSSSSSSSS SSSSSSSSSS SYVSWITAEN VLLPLSISPV RTGSESSPRE PDRLTVAENN EAIRGVGCVN FVGHGGIEWN DVERRFDRVA  SSTGDGTEPV VRWSDFGFCI GMQQSREFAN ELLRALRGGR DWKIDITKCD LRSFWFRMKD DSFNSRMRIF FDMCDRNMDG RISETDIKQT ILLSASTNKL SVTHEEAEDY AASIMHLLDN  KNRGYIEVSQ MGSLFKANNI STPSPSPAKQ LPVTQNGEFC EEQEPMSRGE VLFRTYWRRA WVVLVWVIAC CVLFTWKFIQ YRHRSAFEVM GYCLSTAKGS AETLKLNMAL VLLPVCRNTI  TWLRNNPRIN SVVPFNDNIN FHKLIAGGIV VGVILHGGTH LACDFPRISG SNKSIFQQTI AVRFGYHQPT YLQILMTTEV TSGIAMVVLM AIAFSLATKW PRRRSPVLPL SLRQVTGYNT  FWYSHHLFIL VYALLIIHSM FLFLTNNLME KTTWMYIAFP VLLYFGERIF RAIRSGFYEV DILKASLYPG KVLCLKMQKP EGFKFHSGMY IFLQCPQISA FEWHPFSLTS GPQDDYLSVH  IRTLGDWSYQ IHALFQEAVI SRVQGCPKLY IDGPYGAAAQ DYVKYDVVVL IGLGIGATPF ISILKDIVNC VQTAQCDHNN LQECRLQKGP LKAYLYWITR EQSSFDWFRD VMKEISNSTQ 
KQSVVEMHNF LTSVYQEGDV RSALISVIQA LHHAKNGIDV VSNTPIRTHF ARPNWFKIFS RLARRHKGAK IGVFYCGPSN LARDLKSLCT KFSIKTTTRF VFHKENY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGAGC ACTTTGAGTT TCTGACGACG ACGACAGCGA CGGCTCGAGA GCGATCGCTC ATTGCTCTTC TGAGATCGTC GTCTTCCAAA TCTTCATCGT CGTCCTCGTC TTCTTCCTCT  TCGTCGTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCATACGTTT CTTGGATTAC AGCTGAAAAC GTGCTTCTTC CTCTATCAAT TTCTCCGGTT CGAACCGGAT CTGAATCGTC GCCGAGGGAG  CCGGACCGGC TTACGGTCGC TGAGAATAAT GAAGCTATTC GAGGCGTTGG ATGCGTCAAC TTCGTCGGCC ACGGCGGAAT CGAGTGGAAC GACGTCGAGA GGCGGTTCGA CCGGGTCGCC  TCCTCGACCG GAGACGGCAC TGAACCGGTT GTGAGATGGT CCGACTTTGG GTTTTGTATA GGTGAGAATC GGAAACTCGA GAAAATCATA ATCATAATTA ATTAATTCAT TAGTCCATTA  GTCATAATTG TACTTTGTCG CTTTTGTGCC GCCAGAAACG GCACCGTTTC ACCCGTTTAG CGGTGTCGGT TCATGTTACT GTTAACATGA GCGCGCTATA GTGCGATGAC TCTAATCATC  AGTGATGACG ATTATAGAGA TATTCGCGGA GCGCATGTTA GCAGAGTCAA ACAAGCAACG CTAACGTACC CTACTAGGCA CTACTAGACC GGGAGTGGGA CTTTAAGGCC ATGTTCTTGG  CATATGCATG GTGCCATTAT AGGACAGCTT GTTGAATCAT TTATATAATT AATCTCTAAT CTCTATACTT TACGATATTC ATATATTTAA TTCCTTTATT GTTATTATTT TCCTTTGAGA  ATAAAATGTC TACAGGCTCT GACTGATTTT AAACATTTCG GATTAATTTT AATTCACTAA TTGCTACTTT CTATAGGGAT GCAGCAATCT CGGGAGTTCG CCAATGAATT GCTAAGAGCA  CTGAGAGGAG GAAGAGATTG GAAAATTGAT ATCACCAAAT GTGATTTGCG AAGCTTTTGG TTTCGGATGA AGGATGATTC TTTTAATTCA AGAATGAGAA TATTCTTTGA CATGTAATAA  TCTAACTTTA ATTAATTCTG AAATGTTTCT TTAGAACTTA AAAAAAAAAA AACAATTTAA GTTCTAATCT GTAATTTTCC TTTTATTACT TTAGGTGTGA CAGAAATATG GATGGAAGAA  TTAGTGAGAC AGATATAAAG CAGGTAAATA GCTAACAAAC ATCTCAATAA TCACTACCTA CTAAGTTCTA ACTTACAATT TACTCTTCAA TGGGCCATAC ATCTTATCTT ATTAATTAAA  TGATAATGCT AATTGTCTTT TTCCGCATGT TCATATAATT TTGGCCTTTC TGCCGAGAAT TTTATCATGT TCTTATATGA ACTGTTACAG ATTAAAATCT TATCCCGGTG GGGTGAATTA  GCTTAAATTT TCATTTGCAA AAATCGGGTT ATTCTGCAAG GTTCAATGTT CTTCATTTTA AATGCTAATT TTGTCCCTTG TGCAGACAAT TTTATTAAGC GCTTCTACAA ATAAGCTATC  CGTGACCCAT GAAGAAGCAG AGGATTATGC TGCTTCGATC ATGCACTTGC TTGACAACAA AAATAGAGGC TACATTGAGG TACCAAATTT AGCCTCAACC TTTTATATAT ATATATATAT  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GGTTAAGACT TGAGAGTTTA ATCATTATCA TTTCTATTAT TTTGATTGAC ATAAAATTTT GACTTCCAAG AGTTGGGATG TCAGTAAAAC ACTCTTGATC TATCTGTCTT TAAGATTTTG  GGAGAAGTCA CGACATTTGC GTCTTTATGC AAATTGCAAA AACGTCAATC AAGTAAACTA GCTGAGACTT TCTGATATTG AGATATTCAC ATAGTGTTAA AAATACATAT CACACAGAAT  CTTTTGAAGC AATGAAAATA TATCAACTGT TTGACTTTAC AAGTAAAAGT ATATCAGAAA GTTGATTAAT TTACTGACCT TCTTTGATAC AAATCCGGAT CATAAATTTT CTTTTGTTTG  GATACATAGT TGATTGCAGG AGGAATAGTT GTGGGTGTGA TCCTACATGG AGGGACTCAC CTAGCTTGTG ATTTTCCGAG AATAAGCGGA TCCAATAAAT CGATATTCCA GCAAACCATA  GCTGTGCGAT TTGGGTATCA TCAACCAACT TACTTGCAAA TTTTGATGAC CACAGAAGTG ACCAGTGGGA TTGCCATGGT GGTATTAATG GCCATTGCAT TCTCACTAGC AACAAAGTGG  CCACGACGTC GTTCGCCTGT GCTGCCTTTG TCCCTAAGAC AGGTCACAGG ATACAACACC TTTTGGTACT CACACCACCT GTTCATCCTT GTATATGCCC TCCTAATTAT ACACTCTATG  TTCTTGTTCT TAACCAACAA TCTAATGGAG AAAACGGTGA GTCCATGTTA TATTTTTTAA CGTTTCATGT TCTTATGATT TTTGAATGAA CTAATAACTG AGTTGGTCCC TCAGTCATCA  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ATTTTGTCAG ATACGAACAC ATTTTGCTAG ACCAAATTGG TTCAAAATAT TCTCTAGATT GGCTCGCAGG CATAAAGGAG CTAAAATTGG TGAGACAAAA AAGATCCCAC ATTTTAGCAT  ATTAGATTAT CTTTATGCTT TTGAATTGTT ATAGAATTAC AGATACATCA AACATCTGAT TTACAGCTTG AACTTCAGCT AACTAAAAAT TTACGTTTTA ACCATTATTC CTGACTTAGA  ATGTGGGTTT GCTCGTCATA CAGGGGTTTT CTACTGTGGC CCATCCAATT TGGCACGAGA TTTGAAGAGT TTGTGCACCA AATTTTCCAT TAAAACCACA ACTAGATTTG TTTTCCACAA 
GGAAAATTAT TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGAGC ACTTTGAGTT TCTGACGACG ACGACAGCGA CGGCTCGAGA GCGATCGCTC ATTGCTCTTC TGAGATCGTC GTCTTCCAAA TCTTCATCGT CGTCCTCGTC TTCTTCCTCT  TCGTCGTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCATACGTTT CTTGGATTAC AGCTGAAAAC GTGCTTCTTC CTCTATCAAT TTCTCCGGTT CGAACCGGAT CTGAATCGTC GCCGAGGGAG  CCGGACCGGC TTACGGTCGC TGAGAATAAT GAAGCTATTC GAGGCGTTGG ATGCGTCAAC TTCGTCGGCC ACGGCGGAAT CGAGTGGAAC GACGTCGAGA GGCGGTTCGA CCGGGTCGCC  TCCTCGACCG GAGACGGCAC TGAACCGGTT GTGAGATGGT CCGACTTTGG GTTTTGTATA GGGATGCAGC AATCTCGGGA GTTCGCCAAT GAATTGCTAA GAGCACTGAG AGGAGGAAGA  GATTGGAAAA TTGATATCAC CAAATGTGAT TTGCGAAGCT TTTGGTTTCG GATGAAGGAT GATTCTTTTA ATTCAAGAAT GAGAATATTC TTTGACATGT GTGACAGAAA TATGGATGGA  AGAATTAGTG AGACAGATAT AAAGCAGACA ATTTTATTAA GCGCTTCTAC AAATAAGCTA TCCGTGACCC ATGAAGAAGC AGAGGATTAT GCTGCTTCGA TCATGCACTT GCTTGACAAC  AAAAATAGAG GCTACATTGA GGTATCTCAA ATGGGGTCCC TCTTCAAAGC AAACAACATA TCAACTCCTT CTCCTTCACC AGCTAAACAG TTACCAGTTA CACAAAACGG TGAGTTCTGT  GAAGAACAAG AGCCAATGTC AAGAGGCGAA GTGTTGTTTA GAACATATTG GAGACGTGCT TGGGTTGTTC TAGTTTGGGT GATTGCTTGC TGTGTGTTAT TTACATGGAA ATTCATTCAA  TACCGCCATA GATCAGCGTT TGAAGTAATG GGTTATTGCC TTTCAACGGC CAAGGGATCA GCTGAGACCT TGAAACTCAA TATGGCACTC GTTCTCCTTC CTGTTTGTAG AAACACTATC  ACGTGGCTGC GCAATAACCC TCGTATCAAC TCTGTTGTTC CTTTTAACGA CAATATTAAC TTCCACAAGT TGATTGCAGG AGGAATAGTT GTGGGTGTGA TCCTACATGG AGGGACTCAC  CTAGCTTGTG ATTTTCCGAG AATAAGCGGA TCCAATAAAT CGATATTCCA GCAAACCATA GCTGTGCGAT TTGGGTATCA TCAACCAACT TACTTGCAAA TTTTGATGAC CACAGAAGTG  ACCAGTGGGA TTGCCATGGT GGTATTAATG GCCATTGCAT TCTCACTAGC AACAAAGTGG CCACGACGTC GTTCGCCTGT GCTGCCTTTG TCCCTAAGAC AGGTCACAGG ATACAACACC  TTTTGGTACT CACACCACCT GTTCATCCTT GTATATGCCC TCCTAATTAT ACACTCTATG TTCTTGTTCT TAACCAACAA TCTAATGGAG AAAACGACAT GGATGTACAT TGCTTTTCCA  GTCTTACTAT ACTTCGGAGA GAGGATCTTT CGAGCTATAA GATCAGGATT TTATGAGGTT GATATTTTGA AGGCAAGTCT CTATCCAGGA AAGGTTTTGT GTCTCAAAAT GCAAAAACCA  GAAGGTTTTA AGTTCCATAG TGGCATGTAC ATATTCCTTC AGTGCCCTCA AATTTCAGCT TTTGAATGGC ACCCATTTTC CTTGACTTCA GGACCACAAG ATGACTACCT TAGTGTGCAT  ATTAGAACTC TTGGAGACTG GAGCTACCAA ATTCATGCTC TTTTCCAGGA GGCAGTAATA TCAAGAGTAC AGGGTTGTCC AAAACTATAC ATAGATGGTC CATATGGTGC TGCAGCTCAG  GATTATGTGA AATATGATGT TGTGGTGCTA ATTGGGCTTG GCATAGGAGC CACACCTTTC ATTAGCATCC TCAAAGATAT AGTTAATTGT GTCCAAACAG CACAATGTGA TCATAATAAT  CTCCAAGAAT GCCGCTTGCA GAAGGGGCCA TTAAAAGCAT ACCTCTATTG GATCACAAGA GAGCAAAGCT CCTTTGATTG GTTTAGAGAC GTCATGAAGG AAATCTCCAA TTCAACACAA  AAGCAGTCGG TTGTGGAGAT GCACAATTTC CTGACGAGTG TATATCAGGA AGGAGATGTA CGTTCGGCTT TGATAAGTGT CATTCAGGCC TTACATCACG CCAAGAATGG CATTGACGTT  GTTTCAAACA CTCCAATACG AACACATTTT GCTAGACCAA ATTGGTTCAA AATATTCTCT AGATTGGCTC GCAGGCATAA AGGAGCTAAA ATTGGGGTTT TCTACTGTGG CCCATCCAAT 
TTGGCACGAG ATTTGAAGAG TTTGTGCACC AAATTTTCCA TTAAAACCAC AACTAGATTT GTTTTCCACA AGGAAAATTA TTAG 

Retrieve as FASTA