Entry information : ToriRboh06(PON97758.1)
Entry ID 16254
Creation 2020-03-20 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ToriRboh06(PON97758.1)
Name ToriRboh06(PON97758.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Trema orientalis    [TaxId: 63057 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ToriRboh06
start..stop
S start..stop
CclRboh01 1706 0 1..963 1..946
CsRboh01 1702 0 1..963 1..946
CcaRboh05 1699 0 1..963 1..945
CcaRboh01 1699 0 1..963 1..945
Literature and cross-references ToriRboh06(PON97758.1)
Protein sequence: ToriRboh06(PON97758.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   963
PWM (Da):   %s   108411.13  
PI (pH):   %s   9.66
Sequence
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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EHF 

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Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB.
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGTT TTCCAAAGCA CGAACGGCGA TGGGCCTCCG ACTCGGTTCC GGCTAAATCG GCGGTGAGCG CCGAATCGTC GCCGGGAAAT GACTCCGGTT CGGTGGCGTC GGCGGCGGCG  CCGGAGGAGG AGTTCGTGGA GGTCACGCTC GACCTCCAAG ACGACGACAC GATCGTGCTC CGGAGCGTCG AGCCGGCGAC GGTGATCAAC ATCGACGACG AGAGCTCGGT CGGCGGCACC  GCCGGGAGCG AGACGCCGGC GTCGGCGTCG AGGTCTCCGT CGTCGATCAG GAGGAGCTCG TCGAACCGGC TCCGGCAATT CTCGCAGGAG CTCAAGGCGG AGGCCGTGGC GAAGGCGAGG  CTGTTCTCGC AAGAGCTCAA GGCGGAACTC AGGAGATTCT CGTGGAGCCA CGGGCACGCC GCGCGCGTGC TCTCGGCTTC GGCGTCTTCG TCCGCCACGC CGGTCCAGAA TGGCGCCGCT  GGAGCCGGAT TCGACTCGGC CCTGGCGGCT CGAGCCTTGC GGAAGCAGCG AGCTCAGCTG GATCGGACTC GGTCCGGAGC ACATAAGGCC CTTCGAGGAT TGAAGTTCAT CAGTACTAAT  AGTAAGACCA ATGGCGTCGA TGCATGGAAC GAAGTTGAGA AAAATTTCGA AAAGTTCGCC AAAGATGGCT TTCTCTATCG CTCTGATTTC GCTCAATGCA TAGGTAATTC TGTTCATTTT  CGTTATTTTT TCACCATTTT CATTTTAATA TTTTCTTTTT ATTTACTTGT TTATTTATTT TTTATTCTTT AAAAAAAAAA AAGGAATGGG GAATTCGAAG GAGTTTGCTC TGGAATTACT  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Retrieve as FASTA  
CDS
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GAGCATTTCT AG 

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