Entry information : AgluRboh04(Alngl4634S04539)
Entry ID 16263
Creation 2020-01-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AgluRboh04(Alngl4634S04539)
Name AgluRboh04(Alngl4634S04539)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Alnus glutinosa    [TaxId: 3517 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AgluRboh04
start..stop
S start..stop
JregRboh02 1459 0 1..918 6..892
CglaRboh02 1450 0 54..918 2..872
CausRboh02 1337 0 13..918 12..937
DdruRboh01 1326 0 12..918 13..954
Literature and cross-references AgluRboh04(Alngl4634S04539)
Protein sequence: AgluRboh04(Alngl4634S04539)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   918
PWM (Da):   %s   103149.47  
PI (pH):   %s   8.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METEGVRISY PGDQYHHHSD SEITESESNV YSGPLSGPLN KRAGMKSNSS ASCNICDDSV AAQSVKTSAV ASDLEKDPQL TSPARGLEKR TSFGSSVVRS ASARITQVSQ ELKRLTSFLK  RAPPARFDRT KSAATQALKG LKFISKTDDD AGWPAVEKQF NKLTASTNGS LPRSLFGKCI GMNEESTDFA GNLFDALARE RGMKGDSINK AQLKEFWDQI SEQSFDSRLR TFFDMVDKDA  DGRITEVEIR EIICLSASAN KLLNIQKQAQ EYAALIMEEF DPDHLGYIMI DDLEMLLLPT PNQSLRGGDS QNLSKNLSKK LKYTKEKNRL RRWSQSTKYF LQDNWQRVCI IALWIGVMCG  LFAYKFVQYR NKAAYEVMDH CVCMAKGAAE TLKLNMALIL LPVCRNTITY LRNKTTLGVV IPFDDNLNFH QMIAGGIAIG TGIHAIYHLA CDFPRLIYAR SDKYKLMEPF FGDQPSSYWR  FVKSTEGVTG IVMVVLMAIA FTLASPWFRR SELKRLPKPL KSLTGFNAFW YSHHLFIIVY ILLILHGIYL YLIKEWYKKT TWMYLAVPLA LYVCERLIRA LRSSIEPVTI LKVAVYRENV  LSLHMSKPEG FSYKSGQYMF VNCAALSPFE WHPFSLTSAP GEDYLSVHIR SRGDWTQQLI TRFSKVCKPP PSGESGLLRA DFLQGDSNSN FPKVLIDGPY GAPAQEYKNY EVVLLVGLGI  GATPMISIMK DIVNNIKAVK EEEEDALENG MNGRSGQTLK ATTAEAVPKR KAAGSTINNF QTRKTYFYWV TREQGSFDWF RGEMNEVAEL DSRGVIDLNT YCTSVYEEGD ARSALIAMLQ 
SLNHAKNGID IVSGTRVKSH FAKPNWHCVY ERIASNHTHA RVGVFYCGSA ALAKELRQLG KDFSHKTSTK FDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB (3' end is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAACAG AGGGGGTGCG GATATCTTAT CCAGGTGATC AATATCATCA TCACTCAGAT TCAGAGATCA CTGAGAGTGA AAGCAATGTT TACAGTGGTC CACTGAGTGG ACCTCTGAAC  AAAAGAGCAG GAATGAAAAG CAACTCCAGT GCTTCTTGCA ATATTTGTGA CGATTCTGTT GCTGCTCAAA GTGTTAAGAC GTCTGCTGTT GCCTCTGATC TTGAAAAAGA TCCCCAGTTG  ACTTCACCTG CCAGAGGCCT CGAGAAGAGA ACCTCGTTTG GTTCCTCAGT CGTAAGAAGC GCTTCTGCAC GCATCACGCA GGTCTCTCAG GAACTGAAGC GTCTCACCTC TTTCTTGAAA  CGGGCCCCTC CAGCTCGCTT TGATCGGACT AAGTCCGCAG CAACTCAGGC TTTGAAGGGC CTCAAGTTTA TCAGCAAGAC AGATGACGAC GCTGGGTGGC CTGCTGTTGA GAAGCAATTC  AACAAGCTCA CAGCTTCCAC CAATGGCTCT CTCCCTCGTT CGCTCTTTGG CAAATGCATA GGTGTGGCAC AGCCTCACGT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT TTTTTTTCTT TTTCTTTTTC  TTTTTTCGTG TGTATCAGTT AATAAAAGAA AGTAGCTCTA CCTCTCTTTT TCTACAATCA GTTTCAGCTC CTCACGCTGT ACCTCAATAA TCATTTGCCC TTGGAGCTTA TATTTTCATT  AATTCTTCAA AGATCTCTGA TATGTAATGG CAGGAATGAA TGAAGAATCG ACGGATTTTG CGGGCAACCT TTTTGATGCA CTGGCTCGGG AGCGGGGTAT GAAGGGTGAC TCCATCAACA  AGGCCCAGCT GAAAGAGTTC TGGGACCAGA TTTCTGAACA GAGCTTCGAC TCCAGGCTTC GAACCTTCTT CGACATGTTG TTCTTTTTCT TTTCTTTTCT TTGTTTCTTC TTTTTCTTTT  CTTCAATAAA AGCTTGCTTG AATGTCTCCA AAGAATTATT CCTTTATTTT TCATCTACTG CCTACTAATA ATCAATGAGC TTACAATTAA ATGCAGGGTC GATAAAGATG CTGATGGTAG  AATCACTGAA GTGGAAATCA GAGAGGTATG GCATATTGGA TGCAGGACTA GATAAATCCA AAGTGGATAT CCCGAACGTT AATTAACTCC CTGCCTTATT TTACAACTCC AGCAATAATA  GTTAAAGTAA CTATTAAAAA AATATAACTC TCTATTTTTG CTACTACTTT TTCTATATCT ATTCTACTCT CTATTTGCAT TTAAATATTA TTTTGTGTGA GAAAAAATGT AAAAGAAATA  AGAAAAGAGA GAAAGAGAAA AAAGGAAAGG GAGAGAGAAA ATAATAAAAA ATTCTTTGTA GTATGAATAG TGAATAGGCA AAAAAAGCCT ATTTACTATT TACACTAGAA AAAAATATAT  ATATATATTT TACCTATTTT GCTGGAAACA AAAAATGGCT CATAATAGTC AAATTTAAGT ATTATGAACC ATTTACCTAT TTTATTGGAG ATACTCTTAT ATTTTGGCAA TTAATCAAAT  TCATTATTTA TATTGAAAAG AAATGTACTT CAGCAAGAAA ACCAACTCCA GAATGTGCTT CCTCAGGATA AGATTGTTCT AAACCAAAGT GATAAATTAC ATTTACAGAT TATCTGCCTA  AGTGCTTCTG CCAACAAACT CTTAAATATC CAGAAACAAG CGCAGGAATA TGCAGCCCTG ATCATGGAAG AGTTCGATCC AGATCATCTT GGATACATCA TGGTAAACAA CCTGAAAAAT  GATCTTAAGA TTAAATTAGG AGACAATTCA TTCTTTTGGT TAATTATAGA ATTCCCATTA TAGAGAAATA TTTTATGGTC ATCTGACTTC ACAGTTACTG GAACTGACAG ATAGACGACC  TGGAAATGCT TCTGCTGCCA ACACCAAACC AGTCTTTAAG AGGTGGAGAT AGCCAGAACT TGAGCAAAAA CTTGAGCAAG AAGCTCAAGT ATACGAAGGA GAAGAACCGA TTAAGGAGAT  GGAGTCAAAG CACAAAGTAT TTCTTACAGG ACAACTGGCA GAGAGTTTGC ATAATCGCAC TGTGGATTGG GGTTATGTGT GGCCTCTTTG CATACAAGTT TGTGCAGTAT CGAAACAAAG  CTGCATACGA GGTAATGGAC CATTGTGTAT GCATGGCCAA AGGTGCAGCC GAGACACTAA AGTTGAACAT GGCCCTTATT TTACTTCCAG TTTGCAGAAA CACCATCACC TATCTCAGGA  ATAAGACAAC ACTAGGTGTT GTCATCCCTT TTGATGACAA CCTCAATTTC CACCAGGTAA TTTTTCAAAT TTTCTCATTT TTATGCGAGA TGAGTGTGAA AGATCTCTGA CTAGGCAGTA  GGCACCAAAA GCTAAAGCCA AAACTGACAC TGACAGCATC TTTCTCAGAT GATAGCAGGG GGAATCGCAA TTGGAACTGG AATACATGCA ATTTATCATT TAGCTTGTGA TTTCCCTCGC  CTTATTTATG CAAGGAGTGA CAAGTACAAG TTGATGGAAC CTTTCTTCGG GGATCAACCA TCAAGCTACT GGCGTTTTGT AAAGTCAACA GAAGGAGTGA CTGGGATCGT AATGGTAGTG  TTGATGGCAA TAGCCTTCAC GCTAGCTTCC CCTTGGTTCA GGAGAAGTGA GCTCAAACGT CTACCCAAAC CCCTCAAGAG TCTCACTGGC TTCAATGCTT TTTGGTATTC CCACCACCTC  TTCATCATTG TCTACATTTT GCTGATTCTA CATGGTATTT ACCTCTACCT GATTAAGGAA TGGTACAAGA AAACGGTTAG CACATCTCAC CTCACATTAC AACTCTTTTT GCACATTCTT  TTGATTGTTT GATTATTACG AATCTGTGCG TATATTACAC TTGGCAGACC TGGATGTATT TGGCTGTTCC ACTAGCCCTT TATGTCTGTG AAAGATTGAT TAGGGCACTC AGATCCAGCA  TCGAGCCTGT TACAATACTA AAGGTAATCA TTATTTTTTT GTCACATATG CATATATGTA TACATTTGGT TTATATCGCT AATATAGAAG AGCATCTCAT TCTTTCTTAC ACTGAAGGTC  GCTGTTTATC GTGAAAATGT CTTGTCACTT CACATGTCCA AGCCCGAGGG CTTCAGTTAC AAAAGCGGGC AATACATGTT TGTCAATTGT GCTGCTCTGT CGCCATTCGA ATGGTATACA  TCTCTAAAAC GTTGTTACTA AATATGCTAT ACAGTGTTAT TTAAGACACA CAAAATTTAA CTTGCATGTC TGTATGATAT CTGTTTCCTG TATGTAGACC TCACCTCTTT ATTACCATAT  CCAGAATTAG AAATAAGGTT GCACTCATCA CCACTTTATC TTGGTGTTTC TTTCCCCCAT GTCAACAGGC ACCCATTTTC CCTCACCTCT GCCCCTGGGG AAGACTACCT AAGTGTTCAT  ATTCGAAGTC GTGGTGATTG GACGCAACAA CTCATCACAA GGTTCTCAAA GGTGCGTTAT CCTTTTGAGG AATCGGTGCC TCTTTTGCAG ATAATTGAAT CTGCATCAGC TACTCCATTT  TTTAGGAAAA ATTACCATCT TTATTTCTTG AATTTCCTTA ATGCCTCTAC ACACCATTCA ATAACAATAT TGGTAAAAAT TGCTGGTCAT GTGATGTGGC GGTAGTATAC TCTTTTCATT  ACTAAACTTT CTCTATTGCT TGCTTGTTTG TCTAATATTG CACGTTCCTT TCGGCACGAT GGTAACAAGA AAGATGGTCT ATAAATAGGA ATACATGCAT GTTGAGCGAT GTGGCAAGGG  ATATTTAGAG TAGTATACAG ATGAAATTGC ATACTACAGA TTAGGGAAGA GAGCCATCTT CCTGTAGCTA ACGTCCCTTG AAATTGGTTG TTCTAGGTGT GCAAGCCACC TCCTAGTGGG  GAAAGTGGAC TCCTCAGAGC TGACTTCTTG CAAGGTGATA GCAATTCAAA GTAAGTAAAT TTAGTTCTAT CAAAAAATCC AATGAAAACA GATGTTTTTT GGGTAAAAGG CAAAAATCTA  TGTATCACTC GCTGTATAAT ATAACCAGAG CCTCCGAGAA AAGGTCATGA TGAAACATCA TATTTGCCAA AGACAGTTCC ATAAGTAACA ATAAATTTTA TTGAGGGGAT CAATAGGCTT  ATTGTACACG AGAGGCTTTA GGTCTATCTC AGGCTAAAGT GGGTGTTAGA TGTTTGGTAG TTGGTACCAC TCTTTCACGT TGTTGCTTTA CACAAGTGAA CCAAATTATT TCATCACTTT  CTAACTCACC TTTGGAGGCC TCATTACCTG CTTTCACCCC GCTTTTATGT GGTCTATTCA GACTTCAGCG ATGAACGCAT TAATAATGTT CGAGTCACAT ATGTAGCCCT GCAGGCATAG  AAAGGCGGGA TCAGATAAGG CTGAACTTCA TTAATCTTGC CCGTTAACTC AATGGCATGT GATGTGAGAA ACCAGATGGG TTCATCCTTG AATCAGAAGG ACAAGGATCT TCTCTATTTT  TTCGTTTGAA ATAAAAAGTA TCTATTTATA GATAAAATTT AGTTAGTGTA TCTAATGGTG TATTTAAATT TTTTAAAAGA CGTATTAACA TTAACTTTAT ATGCACTTTA GATATACCAA  CTTTAATTTT AAACTATGAA TAGATACTTT CTATTTCAAA TAGATTAATA GAAGATCATA TTCCTTGAAT CAGGGTCTAC CCATGAAAAA GTAGATGCTT TAATACGGCA GACCACTTTG  AGCGAGTTTT CTTATCTCTA ACCTGATTAA TTTGGATAAG GGATTGAGAA AAGCTGTCAA TTGCGGAGTC CACTTGGTCA CTAATAACAA CTTCCTTTTT GGCCTTATTT ATTGTCAAGA  GTATTATAAT AGGTTACCAG ATTATCAGCA TTGTACGATT TACATAGACC ATCTCCTAAC CTATAAACAA TAGGTTTACA GTCTAGGAAA TATAAAGTGT GATTTTAATC TAATTACTGG  GGCGGCATCC ATGTCGGCTT TGGCAAAAGG TGTGCGACTT ACAAATTCCC AGCTGCATCT TGAAAATTGT TATTAGGTTT ATAGTCAAGA CACAAAACTT CCAACAGATT GGTACACTAG  ATAGTCCATA GGTATATCGA AAAAATGCTT TGGTAGGGAT CTTTTTTGGC AATCTTTCCG CAGCATAGAT TGGAACATAC AGCGTCAAAC AAACGTGTGC ATATATTATT GTCCTTGACG  GGGTGTGGAA GGGCCAAAAC TAAGATATAC AAATTGTCAT TTTCTTCTTA AGTTGCAGAC TCCATGGCAT TAGCCATTAG CTTTCCTTTT ACTCGCTTGA GAGAAAAAAG AGTTGTCTTT  ATTTTAATAA TAATGTAATA ATTTGAATGA CGATAAGGGT GATGGGTGAT GAACAGTTTT CCAAAAGTTC TGATCGATGG TCCATATGGA GCACCAGCAC AAGAATACAA AAACTATGAG  GTGGTGTTAT TAGTCGGGCT GGGAATTGGG GCAACCCCAA TGATCAGTAT TATGAAGGAC ATAGTAAACA ACATCAAGGC CGTAAAGGAG GAGGAGGAGG ATGCTTTAGA GAATGGAATG  AATGGGAGAA GCGGTCAGAC ATTAAAAGCA ACAACAGCAG AAGCAGTACC AAAAAGAAAA GCAGCAGGGT CAACGATCAA CAACTTCCAG ACAAGGAAGA CATACTTTTA CTGGGTGACA  CGGGAGCAGG GGTCCTTCGA CTGGTTTAGA GGGGAGATGA ATGAGGTCGC TGAACTGGAC AGCAGGGGAG TGATTGATCT CAATACTTAC TGCACCAGCG TCTACGAAGA GGGTGATGCC  CGTTCTGCTC TCATTGCCAT GCTTCAGTCC CTCAATCATG CGAAGAATGG CATTGACATC GTCTCCGGTA CACGTGTCAA GTCTCACTTT GCCAAACCCA ACTGGCACTG TGTCTACGAG  CGCATTGCCT CTAATCACAC CCATGCCCGA GTAGGTCAGT CCCCGGCCCC GCTTCACTGA ATTTGATAGT TTTCTGCGTT GCTTTATGCT GTAACATCTA TATTCCACTT CTTTTTGTGA  ACCAACTTTT TATCTTCACA CCGACAGCGC TTTCAGCTTT CCTTTCCCTA CAAAAAGGTG AATGATGGGT AAGTATGATT ATTATACATG GCTCTAATGT TTCACGTCTA GAGTGCTTTC  TGCCGTTTCC ACACGAAAAG ATGAAAGATA CGTAGATATT TTAGTCTATT AGAGCGCTTC CGTTTTGCTT TTGCTGATGA TGATAATTGC CATGTTTCAT AATTCATCAC TTGTAAATGA  TATTTTAGTA AATAGAAATT GACGCGTGTG TGGGTGTATG CACGAACTCA TGCAGGGGTC TTTTACTGTG GATCAGCAGC GCTTGCGAAA GAGTTACGCC AGCTCGGAAA GGACTTCTCT 
CACAAGACTT CCACCAAATT TGATTTCCAT AAAGAAAATT TCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAACAG AGGGGGTGCG GATATCTTAT CCAGGTGATC AATATCATCA TCACTCAGAT TCAGAGATCA CTGAGAGTGA AAGCAATGTT TACAGTGGTC CACTGAGTGG ACCTCTGAAC  AAAAGAGCAG GAATGAAAAG CAACTCCAGT GCTTCTTGCA ATATTTGTGA CGATTCTGTT GCTGCTCAAA GTGTTAAGAC GTCTGCTGTT GCCTCTGATC TTGAAAAAGA TCCCCAGTTG  ACTTCACCTG CCAGAGGCCT CGAGAAGAGA ACCTCGTTTG GTTCCTCAGT CGTAAGAAGC GCTTCTGCAC GCATCACGCA GGTCTCTCAG GAACTGAAGC GTCTCACCTC TTTCTTGAAA  CGGGCCCCTC CAGCTCGCTT TGATCGGACT AAGTCCGCAG CAACTCAGGC TTTGAAGGGC CTCAAGTTTA TCAGCAAGAC AGATGACGAC GCTGGGTGGC CTGCTGTTGA GAAGCAATTC  AACAAGCTCA CAGCTTCCAC CAATGGCTCT CTCCCTCGTT CGCTCTTTGG CAAATGCATA GGAATGAATG AAGAATCGAC GGATTTTGCG GGCAACCTTT TTGATGCACT GGCTCGGGAG  CGGGGTATGA AGGGTGACTC CATCAACAAG GCCCAGCTGA AAGAGTTCTG GGACCAGATT TCTGAACAGA GCTTCGACTC CAGGCTTCGA ACCTTCTTCG ACATGGTCGA TAAAGATGCT  GATGGTAGAA TCACTGAAGT GGAAATCAGA GAGATTATCT GCCTAAGTGC TTCTGCCAAC AAACTCTTAA ATATCCAGAA ACAAGCGCAG GAATATGCAG CCCTGATCAT GGAAGAGTTC  GATCCAGATC ATCTTGGATA CATCATGATA GACGACCTGG AAATGCTTCT GCTGCCAACA CCAAACCAGT CTTTAAGAGG TGGAGATAGC CAGAACTTGA GCAAAAACTT GAGCAAGAAG  CTCAAGTATA CGAAGGAGAA GAACCGATTA AGGAGATGGA GTCAAAGCAC AAAGTATTTC TTACAGGACA ACTGGCAGAG AGTTTGCATA ATCGCACTGT GGATTGGGGT TATGTGTGGC  CTCTTTGCAT ACAAGTTTGT GCAGTATCGA AACAAAGCTG CATACGAGGT AATGGACCAT TGTGTATGCA TGGCCAAAGG TGCAGCCGAG ACACTAAAGT TGAACATGGC CCTTATTTTA  CTTCCAGTTT GCAGAAACAC CATCACCTAT CTCAGGAATA AGACAACACT AGGTGTTGTC ATCCCTTTTG ATGACAACCT CAATTTCCAC CAGATGATAG CAGGGGGAAT CGCAATTGGA  ACTGGAATAC ATGCAATTTA TCATTTAGCT TGTGATTTCC CTCGCCTTAT TTATGCAAGG AGTGACAAGT ACAAGTTGAT GGAACCTTTC TTCGGGGATC AACCATCAAG CTACTGGCGT  TTTGTAAAGT CAACAGAAGG AGTGACTGGG ATCGTAATGG TAGTGTTGAT GGCAATAGCC TTCACGCTAG CTTCCCCTTG GTTCAGGAGA AGTGAGCTCA AACGTCTACC CAAACCCCTC  AAGAGTCTCA CTGGCTTCAA TGCTTTTTGG TATTCCCACC ACCTCTTCAT CATTGTCTAC ATTTTGCTGA TTCTACATGG TATTTACCTC TACCTGATTA AGGAATGGTA CAAGAAAACG  ACCTGGATGT ATTTGGCTGT TCCACTAGCC CTTTATGTCT GTGAAAGATT GATTAGGGCA CTCAGATCCA GCATCGAGCC TGTTACAATA CTAAAGGTCG CTGTTTATCG TGAAAATGTC  TTGTCACTTC ACATGTCCAA GCCCGAGGGC TTCAGTTACA AAAGCGGGCA ATACATGTTT GTCAATTGTG CTGCTCTGTC GCCATTCGAA TGGCACCCAT TTTCCCTCAC CTCTGCCCCT  GGGGAAGACT ACCTAAGTGT TCATATTCGA AGTCGTGGTG ATTGGACGCA ACAACTCATC ACAAGGTTCT CAAAGGTGTG CAAGCCACCT CCTAGTGGGG AAAGTGGACT CCTCAGAGCT  GACTTCTTGC AAGGTGATAG CAATTCAAAT TTTCCAAAAG TTCTGATCGA TGGTCCATAT GGAGCACCAG CACAAGAATA CAAAAACTAT GAGGTGGTGT TATTAGTCGG GCTGGGAATT  GGGGCAACCC CAATGATCAG TATTATGAAG GACATAGTAA ACAACATCAA GGCCGTAAAG GAGGAGGAGG AGGATGCTTT AGAGAATGGA ATGAATGGGA GAAGCGGTCA GACATTAAAA  GCAACAACAG CAGAAGCAGT ACCAAAAAGA AAAGCAGCAG GGTCAACGAT CAACAACTTC CAGACAAGGA AGACATACTT TTACTGGGTG ACACGGGAGC AGGGGTCCTT CGACTGGTTT  AGAGGGGAGA TGAATGAGGT CGCTGAACTG GACAGCAGGG GAGTGATTGA TCTCAATACT TACTGCACCA GCGTCTACGA AGAGGGTGAT GCCCGTTCTG CTCTCATTGC CATGCTTCAG  TCCCTCAATC ATGCGAAGAA TGGCATTGAC ATCGTCTCCG GTACACGTGT CAAGTCTCAC TTTGCCAAAC CCAACTGGCA CTGTGTCTAC GAGCGCATTG CCTCTAATCA CACCCATGCC 
CGAGTAGGGG TCTTTTACTG TGGATCAGCA GCGCTTGCGA AAGAGTTACG CCAGCTCGGA AAGGACTTCT CTCACAAGAC TTCCACCAAA TTTGATTTCC ATAAAGAAAA TTTCTGA 

Retrieve as FASTA