Entry information : CroPrx70(CRO_T004996)
Entry ID 16278
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx70(CRO_T004996)
Name CroPrx70(CRO_T004996)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx226]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx70
start..stop
S start..stop
CroPrx74 595 0 1..327 1..326
CroPrx75 421 3e-149 1..325 1..326
PpePrx43 384 2e-134 1..325 1..320
PtPrx39 378 2e-132 24..326 21..320
Literature and cross-references CroPrx70(CRO_T004996)
Protein sequence: CroPrx70(CRO_T004996)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   35808.67  
PI (pH):   %s   4.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSNYEFSFFC IILITSSIIH AEYSAELSPD YYDETCPAAL PVVTKIVQQA IKQDPRMAAS LLRLHFHDCF VNGCDGSNLL DDNGTFVGEK TASANLNSAR GYEVIDQIKD AVDTICYGSV  VSCADILALA ARDSIVAMKG PFYPVLLGRR DARTASLDDA NNDIPSPNFN LSQLVENFES HGLNSKDLVV LSGAHTIGLA RCSSFLARIT NDKNINSVLR YMLRRDCPNV PAQSDNIAPL 
DQTSTLFDSR YYQELLQFKG LLHSDQELYK GNNGSSESTD ALVKKYSASP KAFWYDFAVS MVKMGSIDPL TGLDGEIRSN CRALNND 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAATT ATGAATTCTC CTTCTTCTGC ATTATTCTGA TTACTAGTTC AATTATACAT GCTGAATATT CTGCTGAACT CAGCCCAGAT TATTACGACG AAACCTGCCC AGCCGCTTTG  CCTGTTGTAA CTAAAATTGT ACAGCAAGCA ATTAAACAAG ATCCACGAAT GGCAGCTTCT CTCCTTCGCT TGCATTTTCA CGATTGCTTT GTCAATGTAA GTTTTTTTTT TCCATTTTTT  TCAGAAAAAA ATTGATTCAA AGTTACGTCT TTGAAAATAT CCTTGTTCAC TACATTGAAA CTTCACCGTT AATGAATAAT ATTTGGCTCT TGTAGGGCTG TGATGGATCC AATCTTCTAG  ATGATAATGG AACTTTCGTA GGAGAGAAGA CGGCATCTGC CAACCTTAAT TCGGCGAGGG GCTATGAGGT GATTGACCAA ATCAAAGATG CAGTGGACAC AATCTGCTAT GGCAGTGTGG  TATCTTGTGC CGATATCTTA GCACTGGCAG CACGAGACTC TATCGTAGCG GTAAGTTGAG GGCTCAACAA CATTAAAAAT TTTACTAAAA TTTCGTCTAT AAAATAGATG TATTTAAAAT  ACAAAAACAT TCAAACAATT TCAAATTTTT ATAAAGTTTT TGAATTTTAC GGAGGGGCTC GAGCCCCCAC TTGATTCCAC CACTATATAC CACTATTGTA GCGGTAACTT CAAATATAAC  AATATTACCT TATAATATGA AACGGTGATA CTATACATGT ATAACTATTC GTCAAATTGT AAAGCGTTTA GCGTTTATAT TTTCTTGATT TTGTTTTTTC CTTTCAAATG AATGAGAAGG  TATTATATAT GAGTAATTTT TACGTTGCAT GTATAATTAT TCGCCGTGAT TTTGTTTCTT GCTTTCAGAT GAAAGGTCCA TTCTACCCTG TCCTACTTGG TAGAAGAGAT GCAAGAACAG  CTAGTTTAGA TGATGCAAAT AATGATATCC CTTCTCCAAA TTTCAACTTA TCACAACTCG TAGAGAATTT TGAATCCCAT GGACTAAATT CGAAAGACCT CGTAGTCTTG TCCGGAGCCC  ATACAATCGG TCTTGCAAGA TGTTCATCGT TTTTAGCTAG GATAACCAAT GATAAAAACA TAAACAGTGT CTTGAGATAC ATGTTAAGAC GAGATTGTCC TAATGTTCCT GCCCAAAGTG  ACAATATTGC CCCTCTTGAC CAGACTAGTA CACTATTTGA TTCAAGATAC TACCAAGAGT TGCTGCAATT TAAGGGCCTT CTTCATTCGG ATCAAGAACT CTATAAGGGT AATAATGGAA  GTAGTGAAAG TACTGATGCC CTTGTTAAGA AATACAGTGC AAGTCCTAAG GCATTTTGGT ATGATTTTGC TGTGTCGATG GTGAAGATGG GTAGCATTGA CCCTCTCACG GGGTTGGATG 
GAGAGATTAG GTCAAATTGC AGGGCACTTA ATAATGATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAATT ATGAATTCTC CTTCTTCTGC ATTATTCTGA TTACTAGTTC AATTATACAT GCTGAATATT CTGCTGAACT CAGCCCAGAT TATTACGACG AAACCTGCCC AGCCGCTTTG  CCTGTTGTAA CTAAAATTGT ACAGCAAGCA ATTAAACAAG ATCCACGAAT GGCAGCTTCT CTCCTTCGCT TGCATTTTCA CGATTGCTTT GTCAATGGCT GTGATGGATC CAATCTTCTA  GATGATAATG GAACTTTCGT AGGAGAGAAG ACGGCATCTG CCAACCTTAA TTCGGCGAGG GGCTATGAGG TGATTGACCA AATCAAAGAT GCAGTGGACA CAATCTGCTA TGGCAGTGTG  GTATCTTGTG CCGATATCTT AGCACTGGCA GCACGAGACT CTATCGTAGC GATGAAAGGT CCATTCTACC CTGTCCTACT TGGTAGAAGA GATGCAAGAA CAGCTAGTTT AGATGATGCA  AATAATGATA TCCCTTCTCC AAATTTCAAC TTATCACAAC TCGTAGAGAA TTTTGAATCC CATGGACTAA ATTCGAAAGA CCTCGTAGTC TTGTCCGGAG CCCATACAAT CGGTCTTGCA  AGATGTTCAT CGTTTTTAGC TAGGATAACC AATGATAAAA ACATAAACAG TGTCTTGAGA TACATGTTAA GACGAGATTG TCCTAATGTT CCTGCCCAAA GTGACAATAT TGCCCCTCTT  GACCAGACTA GTACACTATT TGATTCAAGA TACTACCAAG AGTTGCTGCA ATTTAAGGGC CTTCTTCATT CGGATCAAGA ACTCTATAAG GGTAATAATG GAAGTAGTGA AAGTACTGAT  GCCCTTGTTA AGAAATACAG TGCAAGTCCT AAGGCATTTT GGTATGATTT TGCTGTGTCG ATGGTGAAGA TGGGTAGCAT TGACCCTCTC ACGGGGTTGG ATGGAGAGAT TAGGTCAAAT 
TGCAGGGCAC TTAATAATGA TTAA 

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