Entry information : ClanRboh03
Entry ID 16353
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: ClanRboh03
Name ClanRboh03
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh03
start..stop
S start..stop
CsaRboh03 1813 0 1..934 1..935
CcaRboh05 1676 0 1..934 1..945
CcaRboh01 1676 0 1..934 1..945
DgloRboh04 1667 0 1..934 1..948
Literature and cross-references ClanRboh03
Protein sequence: ClanRboh03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   934
PWM (Da):   %s   106287.8  
PI (pH):   %s   9.57
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGPPKHERR WASDTVPGNA KMMSAGSSPG TESSAAEEFV EVTLDLQDDD RIILRSVEPA TVINIDNAVS VGSETPKSAS VSRSPTFKRS SSNLLRQFSQ ELKAEAVAKA RQFSQELKAE  LKRFSWSHGH SAGAGNGFDS ALAARALRKR QAQLDRTRSG AHKALRGLRF ISSKSNGVDA WNEIQSNFDK LAKDGYLYRS DFAQCIGMKD SKEFALELFD ALSRRRRLKV EKISKEELFE  FWSQITDQSF DSRLQIFFDM VDKNEDGRIT EEEVKEIIML SASANKLSRL KEQAEEYAAL IMEELDPERL GYIELWQLET LLLQKDTYLN YSQALSYTSQ ALSQNIQGLR NKGPITRIRT  KLLYYLQENW RRIWVLTLWA MILVGLFTWK FFQYKHKQAY NVMGYCLLTA KGAAETLKFN MAIILLPVCR NTITWIRSTR LGYFVPFDDN INFHKTIAAA IVVGVILHVG NHLACDFPRL  VQASDENYNY VKGYFGPDKP TYLDLVKGWE GATGILMVIL MAVAFTLATR WFRRSLIKLP KPFDRLTGFN AFWYSHHLFV IVYVLLVIHG IFLYLEHRWY RKTTWMYLAV PVLLYAGERT  LRFFRSGFYS VRLLKVAIYP GNVLALQMSK PPQFRYKSGQ YMFVQCPAVS PFEWHPFSIT SAPGDDYLSV HIRQLGDWTR ELKRVFAEAC EPPVAGKSGL LRADETTKKC LPKLLIDGPY  GAPAQDYRNY DVLLLVGLGI GATPFISILK DLLNNIVKME EQADSIADGG KESDLSFGST DSSSSARVSP KRKKILKTTN AYFYWVTREQ GSFDWFKGVM NEVAEMDQRG VIEMHNYLTS 
VYEEGDARSA LITMVQALNH AKNGMDIVSG TRVRTHFARP NWKKVFSRIC SKHCNAKIGV FYCGAPILAK ELSNLCYEFN QKGPTKFDFH KEHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Citlan_Cla011409
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGGC CTCCGAAGCA CGAGCGGCGT TGGGCGTCGG ATACGGTTCC TGGAAATGCG AAGATGATGA GCGCAGGATC GTCTCCTGGA ACGGAGTCGA GTGCGGCGGA GGAGTTTGTT  GAGGTCACTC TTGATCTACA GGACGATGAT AGAATCATCC TGCGAAGCGT TGAGCCGGCT ACGGTTATCA ACATCGATAA CGCCGTCTCT GTTGGATCTG AAACTCCGAA GTCTGCTTCT  GTGTCGAGAT CGCCGACGTT TAAACGTAGC TCGTCGAATC TGTTGCGTCA ATTTTCGCAG GAATTGAAAG CGGAAGCGGT TGCTAAGGCA AGGCAATTCT CGCAGGAGTT GAAGGCCGAG  TTGAAGCGGT TTTCCTGGAG CCATGGACAT TCTGCTGGTG CTGGAAATGG ATTCGACTCG GCGTTGGCTG CTCGAGCTCT GAGGAAGCGA CAAGCTCAGC TTGATCGCAC TCGTTCCGGT  GCTCATAAAG CGCTTCGCGG TTTGAGATTC ATTAGCAGTA AGAGCAATGG CGTCGATGCC TGGAACGAAA TCCAGAGCAA CTTCGATAAG CTTGCCAAGG ATGGGTATCT CTACCGCTCC  GATTTCGCAC AATGCATAGG AATGAAAGAT TCAAAGGAGT TTGCTCTGGA ACTGTTCGAT GCTTTGAGTC GAAGACGAAG ATTGAAGGTC GAAAAGATCA GTAAAGAAGA ATTGTTCGAG  TTCTGGTCAC AAATCACCGA TCAAAGTTTC GATTCGCGGC TGCAGATCTT CTTCGACATG GTCGACAAAA ACGAAGACGG CCGAATTACC GAAGAAGAAG TGAAAGAGAT TATTATGCTG  AGTGCCTCTG CAAACAAGCT ATCGAGGCTA AAGGAGCAGG CAGAGGAATA TGCGGCCCTC ATCATGGAGG AGCTGGACCC TGAAAGGCTT GGCTATATTG AGCTGTGGCA ATTGGAAACC  CTTTTGCTAC AAAAGGACAC GTATCTCAAC TACAGTCAAG CCCTCAGCTA TACCAGCCAA GCATTGAGCC AGAACATACA GGGACTAAGG AACAAGGGCC CGATAACAAG GATAAGAACA  AAACTGCTCT ACTATTTGCA GGAGAATTGG AGAAGAATAT GGGTGCTGAC ATTATGGGCC ATGATATTGG TTGGGCTTTT CACGTGGAAG TTCTTCCAGT ACAAGCATAA GCAAGCCTAC  AATGTCATGG GCTACTGTCT CCTTACGGCT AAGGGTGCGG CTGAGACCCT GAAGTTCAAC ATGGCTATCA TTTTGCTGCC CGTATGTAGA AATACCATCA CTTGGATAAG GTCGACCAGG  CTGGGATATT TTGTACCATT CGACGACAAT ATCAATTTTC ACAAGACGAT TGCCGCAGCT ATTGTAGTTG GTGTCATTCT CCATGTAGGG AACCACCTTG CCTGTGATTT TCCAAGACTG  GTACAGGCAT CAGATGAAAA CTATAATTAT GTGAAGGGTT ACTTCGGACC AGACAAGCCA ACCTACTTAG ACTTGGTCAA GGGATGGGAA GGTGCGACTG GTATACTAAT GGTCATCTTG  ATGGCAGTAG CATTCACTCT AGCTACTCGA TGGTTCAGGA GGAGCCTTAT TAAGCTGCCC AAGCCGTTTG ATAGGCTGAC GGGTTTCAAT GCCTTCTGGT ATTCACACCA CCTGTTTGTC  ATTGTTTACG TCTTGCTCGT CATTCATGGC ATATTCCTCT ACCTTGAACA CAGATGGTAC CGTAAGACGA CTTGGATGTA TCTTGCTGTC CCAGTTTTAT TATATGCTGG GGAAAGGACC  CTTAGATTCT TCCGCTCAGG CTTCTACAGT GTTCGGCTCC TCAAGGTTGC TATTTACCCG GGGAATGTTC TTGCATTACA AATGTCTAAA CCTCCTCAGT TCCGTTATAA GAGTGGACAG  TACATGTTTG TCCAATGCCC CGCTGTCTCT CCATTTGAAT GGCATCCATT TTCGATTACT TCTGCTCCAG GGGATGACTA TCTGAGTGTT CACATACGGC AGCTGGGTGA TTGGACACGA  GAGTTAAAGA GGGTATTTGC TGAAGCTTGT GAGCCACCAG TTGCTGGGAA GAGTGGGTTG CTTAGGGCTG ATGAAACGAC CAAGAAATGT TTGCCGAAGC TCTTAATAGA TGGACCTTAT  GGTGCACCTG CACAAGACTA CAGAAATTAT GATGTTCTAT TACTTGTTGG TCTTGGTATT GGAGCAACAC CTTTCATTAG CATTTTGAAG GATTTGCTTA ACAACATTGT CAAAATGGAG  GAGCAGGCAG ATTCAATTGC AGATGGCGGT AAGGAGTCAG ATCTCAGTTT TGGAAGCACG GATTCTTCCT CGTCTGCCAG GGTTTCTCCC AAGCGAAAGA AGATTTTGAA GACAACTAAT  GCTTACTTTT ACTGGGTAAC TAGGGAGCAG GGATCGTTTG ACTGGTTCAA AGGGGTCATG AATGAAGTCG CTGAGATGGA TCAAAGGGGT GTCATTGAGA TGCACAACTA CCTGACCAGT  GTGTACGAGG AAGGGGATGC TAGATCAGCC CTCATCACAA TGGTTCAAGC ACTAAATCAC GCAAAGAATG GAATGGATAT TGTTTCTGGC ACCAGGGTCA GAACTCATTT TGCAAGGCCC  AACTGGAAGA AAGTTTTCTC TAGAATTTGT TCGAAGCATT GTAATGCCAA AATAGGAGTA TTCTACTGTG GAGCACCAAT CCTTGCAAAA GAACTTAGCA ATCTCTGCTA TGAATTCAAT 
CAAAAGGGCC CAACTAAATT TGATTTTCAC AAGGAACACT TCTGA 

Retrieve as FASTA