Entry information : ClanRboh04(Citlan_Cla001877)
Entry ID 16354
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ClanRboh04(Citlan_Cla001877)
Name ClanRboh04(Citlan_Cla001877)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh04
start..stop
S start..stop
CsaRboh05 1702 0 1..936 1..925
DgloRboh05 1363 0 1..936 1..927
AgluRboh05 1295 0 1..936 24..946
DtriRboh04 1293 0 7..936 5..950
Literature and cross-references ClanRboh04(Citlan_Cla001877)
Protein sequence: ClanRboh04(Citlan_Cla001877)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   936
PWM (Da):   %s   106197.22  
PI (pH):   %s   8.78
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTRSWSSFGI PNSNNSRRSS YTRRLGDADA DADADADDDV DGDCSHEDHT AQGMLPVFLN DLVNVNHQDF VELTLEVEDH SVLVRSIAPL PASSDLQDDA ALSITTRIRN KFPWLRSASS  RASTASSLDR DDMAAVSMSA RDARRLHAQL QRTRSRAQAA LRGLRFISNT TGASDANKLW QTVQSRFHSL AHAGLLARED FAQCIGMMDS KEFALRIFDA LARRKGLRIS KINVEELREF  WLKISDQSFD ARLQIFFDMA DSNEDGRITR DEVQELISLS ASANNLAKLK ERAEEYASLI MEELDPENLG YIELWQLETL LLQRDTYMNY SRPLSTATSV GWSQNLSLFN PKNIIKTATT  TLHSLIFQNW QRIWILFLWG STMAALFTWK FLQYKNKAAF DIMGYCLPTA KGAAETLKLN MALILLPVCR NTLTWLRSTA ARSVVPFDDN INFHKLIACF IAVGVAVHGG VHLVCDFPRL  TNSSPEEFEV ISSDFHNKKP SYKELLMSVE GVTGIVMVVL MGISFTLATR RFRRNVVRLP WLFNRLAGFN AFWYSHHLMG FVYLLLLVHG TFLFLAHNWT QKTTWVYVSF PLLLYLGERS  LRACRSEYYS VQILKVSVLP GNVFSLVMLK PRGFKYRSGQ YIFLQCPSIS QFEWHPFSIT SAPGDEYLSV HIRTVGDWTR ELKRVFTDHV NSKPVLARAK LGHLVNMERK SQPRLLVDGP  YGAPAQDYEN YDVLLLVGLG IGATPFVSIL KDLLNNSRTT EEQMPTESTT ETSRSEDSFG SLNTTPSGKR KLQSRMGTGR AQAYFYWVTR EASSLEWFKG VMDEVAEMDK KGQIELHNYL 
TSVYEESDAR STLITMVQAL NHAKHGVDIL SGTRARTHFA RPEWKEVFGR IASKHAYKTV GVFYCGMPML AKELKRLSLE FTRKTATRFE FHKEYF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGGT CTTGGTCCTC TTTTGGAATT CCCAACTCCA ATAACTCTCG CCGTTCGAGC TACACCCGCC GACTCGGGGA CGCAGACGCA GACGCAGACG CAGACGCAGA CGACGACGTG  GATGGTGATT GCAGCCATGA AGATCATACT GCACAAGGCA TGTTGCCAGT CTTCTTAAAT GACCTTGTTA ATGTTAATCA CCAAGACTTT GTGGAGCTCA CATTGGAGGT TGAGGATCAT  TCTGTGTTGG TTCGCAGCAT TGCTCCTCTC CCTGCTTCTT CCGACCTACA AGATGACGCC GCTCTTTCCA TCACTACTAG AATCCGAAAC AAATTCCCTT GGCTCCGCTC TGCCTCTTCT  CGTGCCTCCA CCGCCTCGTC TCTCGATAGG GACGACATGG CGGCAGTATC CATGTCTGCC CGTGACGCCC GCCGCCTCCA TGCTCAGCTG CAGCGCACCC GATCCAGAGC CCAGGCTGCC  CTTCGAGGCC TCCGATTCAT TAGCAACACC ACTGGTGCCT CTGATGCGAA CAAGCTCTGG CAAACAGTCC AGTCCAGGTT CCATTCGTTG GCTCATGCTG GACTACTTGC CAGAGAAGAT  TTTGCTCAAT GCATTGGTGG GAGTTGAAAC AATGTGGCCC ACAGTTTTAA ACCGTATTTC AAATTTAAGT AATTTTTGAA TTTTTGACAG GAATGATGGA TTCAAAGGAG TTCGCGTTGA  GAATATTCGA TGCCTTAGCA AGAAGAAAAG GATTGAGGAT TTCGAAAATC AATGTGGAGG AGCTCCGTGA ATTTTGGTTG AAGATTTCGG ACCAAAGCTT CGACGCCCGC CTTCAAATCT  TTTTTGACAT GTAAGAGAGT GTTTCTCATT CATTCGTTCT CTCTCTTTCA CTATCTTTTG GAGTTTGTAA CACGAGTCAT TACATTCAAA ACAAACAGGG CTGACAGTAA CGAAGATGGT  CGGATTACAA GAGACGAAGT GCAGGAGCTA ATCTCGCTAA GCGCTTCTGC AAACAACCTT GCAAAACTCA AAGAGCGAGC TGAGGAATAC GCTTCCTTAA TCATGGAAGA ACTCGACCCC  GAAAACCTCG GATACATTGA GGTAAGATTT TGAATAATTT AACATGATGC CAGAACACAA CGATGAGGCG AGTTCCTTGG GAATCCTTAC AAGTTGTGAA ATGGATTGAT TGATTCAGCT  ATGGCAACTG GAGACTTTGC TTTTACAAAG GGACACATAC ATGAATTACA GCAGACCCTT AAGCACAGCA ACAAGTGTAG GATGGAGCCA AAATCTAAGC TTATTCAACC CCAAAAACAT  CATCAAAACA GCAACCACAA CACTCCACTC TCTAATATTC CAAAACTGGC AAAGAATTTG GATTCTTTTC CTTTGGGGAT CAACAATGGC AGCTCTGTTC ACATGGAAAT TCCTTCAATA  CAAAAACAAA GCAGCATTTG ACATAATGGG GTACTGCCTC CCGACAGCGA AAGGCGCTGC CGAGACTCTA AAGCTCAACA TGGCCTTAAT CCTCCTCCCT GTCTGCCGCA ACACTCTCAC  TTGGCTGCGT TCTACTGCAG CGAGATCGGT CGTCCCCTTT GACGACAACA TCAATTTTCA CAAGCTAATT GCGTGTTTCA TAGCTGTCGG GGTCGCCGTC CACGGTGGGG TTCATCTGGT  GTGCGACTTC CCGAGATTGA CGAATTCGTC GCCGGAGGAA TTTGAAGTGA TATCGAGTGA CTTTCACAAC AAGAAGCCAA GCTATAAGGA GCTTTTGATG AGTGTTGAAG GGGTAACAGG  GATTGTGATG GTGGTTTTGA TGGGGATTTC ATTTACACTT GCTACTCGTC GTTTTAGGAG GAATGTTGTG AGATTGCCTT GGTTGTTCAA CAGATTGGCA GGGTTTAATG CCTTTTGGTA  CTCTCATCAT CTTATGGGAT TTGTCTACCT TTTGCTTCTT GTTCATGGGA CTTTCTTGTT TCTTGCTCAT AACTGGACTC AAAAAACGGT AAGCCAAACC GCAACAATTC TCCACTTGTT  TCATAGCCAT TTGGTTTTTG TAAATTAAGT TTATACGTAC TACTCTCACT TGTGAGTTTT TTTGTTTTCT TATCAAGTTT TGAAAACTTT TAAAAGTATG TTTTTCTTAA TCTTATTATT  GAAATTTAGC TTAGAATTCA AATTCTACCT AGAGAAAGAT GAGACCGCTT GAAACAAAAT TGTGAGCTAA TAAGTACAAT CTTCAAAAAC AAAAAAGAAT CAAAAAGAAT CAAAAGTCAA  ATGGTTATCA AACAAGAAGA TCACTCGATC TTGTTTTTGT GTTTTTGAGT TTTGGTGCAA TGGAGTGAAA AGAGGATGAA TTTTTGGTGG TAGACTTGGG TGTACGTGTC TTTTCCTTTG  CTGCTGTATC TTGGGGAGAG GAGCCTCAGA GCCTGCAGAT CAGAGTATTA CTCTGTTCAG ATATTGAAGG TAATGTACTA TCTTTCATTT AGTTATTTCT TATTAGTATT TTTTTAATTG  TATCTATTTA GTTAAAAATT TTCATTCCTT GGTTGACATT TCTATTAACT TTCTTAGGTT AAAGTTCACT TGAGATGCTA TTGACTATGT TCAGCTTAAA TGAGCTTATT CGAGTATAGT  TTAGTGAATA AGAACCAGTT TTCGAGAAAT TGAGTGAGTG TGATTGAAGT GGAACAGGTT TCAGTACTAC CAGGGAATGT ATTCAGCTTG GTGATGTTGA AGCCTCGTGG GTTCAAATAC  AGAAGTGGAC AGTACATATT CCTTCAATGT CCTTCAATTT CCCAGTTTGA ATGGTAAGTT TTAAAAACTC CAAATCTTTT TGCTTCAAGA AAAGAGGGAA AAAAAGAAAG AAAATAAGAA  AAAAAAAAGC ATAACATTGA AAACAAACCT GCTCAGGCAC CCATTTTCTA TCACTTCAGC ACCAGGAGAT GAGTACCTGA GTGTGCATAT TAGGACCGTG GGGGATTGGA CAAGAGAACT  CAAACGTGTC TTCACTGACC ATGTCAACTC CAAACCTGTC CTTGCTAGAG CCAAATTAGG TCACTTGGTT AACATGGAAA GAAAAAGGTA ATTTGTCTTC CTCTATCTTT TCTTTTCAAG  TTTGTATCTA TTTAGTTTAT ATCTACTTTT AAGACCTTTT GATGGTTTGT TCAGTCAGCC GAGATTGCTG GTTGACGGGC CGTATGGAGC ACCTGCACAG GACTACGAAA ACTACGATGT  GCTTCTCCTT GTTGGACTTG GAATTGGAGC CACCCCCTTT GTTAGTATCC TCAAGGATCT TCTCAACAAC TCTAGAACCA CTGAAGAACA AATGCCAACG GTAAATTAAT AACTTATTTG  TAGGGAAnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn GTAGGGAAAA ACATGGTAAT TTGAACTTAT ACATACACGT  TTTCAAAAAC TTGTTTTAGT TTTAGATTTT GGCTAAGAAT CCAGTTGTTT CTTTAAGAGT TGTGAAAATA AACTACCATA AATAATAGAA AGTGTAAGAA AAGAAGCACA GTTCTGAAAA  ATAAAAAACT AAAAATGATA TTGTTAGAAA CAAGGTCTAA AGTTTACACA TTTTCTTACT AATGGCGTAG GAATCGACAA CGGAAACAAG TAGATCCGAA GACAGCTTTG GATCTTTAAA  CACGACGCCA AGTGGAAAGA GGAAGTTGCA AAGCAGGATG GGGACGGGAC GGGCACAAGC ATACTTCTAC TGGGTGACAA GGGAAGCTAG TTCCTTAGAG TGGTTCAAAG GGGTAATGGA  TGAAGTAGCA GAGATGGACA AGAAGGTAAG TAAACTTAAA ACTAAAACAA CGACATTAAA TCCATGGAAT GCTTTAGGAA AAAAAATGGA AGTCAAGCAA TTCAAGTAGT GAAATGAATG  AATAAATGAA TCAGGGGCAA ATTGAACTCC ACAACTACTT GACGAGTGTG TACGAAGAAA GTGATGCAAG GAGCACATTG ATCACAATGG TTCAAGCTTT GAACCATGCC AAGCATGGCG  TCGACATTCT CTCCGGCACA CGAGTAAGTA ACTACGCTAT CTTCGGCCTC TTTCATTCAT TTTCCTCTCT TAAGTGCCCT AATTACATTT GATCGGTCGG TTAAGCTTTT TTAAACAATA  GGATTAACAC CATCTAAGAC ATTGCAAGGA CTCACCTTAA TAAAATCATT CTTTAATTAC CAGTGATTTG TGATAACTTT ATTTCTTACA AACTTAAGCT TTTGAGTTTA GAGATTATTA  ACGCAATGGC GATGCAGGCA AGGACTCACT TCGCAAGGCC AGAATGGAAG GAGGTGTTCG GGCGAATTGC GTCGAAGCAT GCTTATAAGA CAGTGGGAGT GTTCTACTGT GGAATGCCAA 
TGCTGGCCAA AGAGCTCAAG AGGCTATCAC TAGAATTTAC TCGCAAGACT GCAACTAGAT TTGAGTTCCA TAAGGAATAT TTCTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGGT CTTGGTCCTC TTTTGGAATT CCCAACTCCA ATAACTCTCG CCGTTCGAGC TACACCCGCC GACTCGGGGA CGCAGACGCA GACGCAGACG CAGACGCAGA CGACGACGTG  GATGGTGATT GCAGCCATGA AGATCATACT GCACAAGGCA TGTTGCCAGT CTTCTTAAAT GACCTTGTTA ATGTTAATCA CCAAGACTTT GTGGAGCTCA CATTGGAGGT TGAGGATCAT  TCTGTGTTGG TTCGCAGCAT TGCTCCTCTC CCTGCTTCTT CCGACCTACA AGATGACGCC GCTCTTTCCA TCACTACTAG AATCCGAAAC AAATTCCCTT GGCTCCGCTC TGCCTCTTCT  CGTGCCTCCA CCGCCTCGTC TCTCGATAGG GACGACATGG CGGCAGTATC CATGTCTGCC CGTGACGCCC GCCGCCTCCA TGCTCAGCTG CAGCGCACCC GATCCAGAGC CCAGGCTGCC  CTTCGAGGCC TCCGATTCAT TAGCAACACC ACTGGTGCCT CTGATGCGAA CAAGCTCTGG CAAACAGTCC AGTCCAGGTT CCATTCGTTG GCTCATGCTG GACTACTTGC CAGAGAAGAT  TTTGCTCAAT GCATTGGAAT GATGGATTCA AAGGAGTTCG CGTTGAGAAT ATTCGATGCC TTAGCAAGAA GAAAAGGATT GAGGATTTCG AAAATCAATG TGGAGGAGCT CCGTGAATTT  TGGTTGAAGA TTTCGGACCA AAGCTTCGAC GCCCGCCTTC AAATCTTTTT TGACATGGCT GACAGTAACG AAGATGGTCG GATTACAAGA GACGAAGTGC AGGAGCTAAT CTCGCTAAGC  GCTTCTGCAA ACAACCTTGC AAAACTCAAA GAGCGAGCTG AGGAATACGC TTCCTTAATC ATGGAAGAAC TCGACCCCGA AAACCTCGGA TACATTGAGC TATGGCAACT GGAGACTTTG  CTTTTACAAA GGGACACATA CATGAATTAC AGCAGACCCT TAAGCACAGC AACAAGTGTA GGATGGAGCC AAAATCTAAG CTTATTCAAC CCCAAAAACA TCATCAAAAC AGCAACCACA  ACACTCCACT CTCTAATATT CCAAAACTGG CAAAGAATTT GGATTCTTTT CCTTTGGGGA TCAACAATGG CAGCTCTGTT CACATGGAAA TTCCTTCAAT ACAAAAACAA AGCAGCATTT  GACATAATGG GGTACTGCCT CCCGACAGCG AAAGGCGCTG CCGAGACTCT AAAGCTCAAC ATGGCCTTAA TCCTCCTCCC TGTCTGCCGC AACACTCTCA CTTGGCTGCG TTCTACTGCA  GCGAGATCGG TCGTCCCCTT TGACGACAAC ATCAATTTTC ACAAGCTAAT TGCGTGTTTC ATAGCTGTCG GGGTCGCCGT CCACGGTGGG GTTCATCTGG TGTGCGACTT CCCGAGATTG  ACGAATTCGT CGCCGGAGGA ATTTGAAGTG ATATCGAGTG ACTTTCACAA CAAGAAGCCA AGCTATAAGG AGCTTTTGAT GAGTGTTGAA GGGGTAACAG GGATTGTGAT GGTGGTTTTG  ATGGGGATTT CATTTACACT TGCTACTCGT CGTTTTAGGA GGAATGTTGT GAGATTGCCT TGGTTGTTCA ACAGATTGGC AGGGTTTAAT GCCTTTTGGT ACTCTCATCA TCTTATGGGA  TTTGTCTACC TTTTGCTTCT TGTTCATGGG ACTTTCTTGT TTCTTGCTCA TAACTGGACT CAAAAAACGA CTTGGGTGTA CGTGTCTTTT CCTTTGCTGC TGTATCTTGG GGAGAGGAGC  CTCAGAGCCT GCAGATCAGA GTATTACTCT GTTCAGATAT TGAAGGTTTC AGTACTACCA GGGAATGTAT TCAGCTTGGT GATGTTGAAG CCTCGTGGGT TCAAATACAG AAGTGGACAG  TACATATTCC TTCAATGTCC TTCAATTTCC CAGTTTGAAT GGCACCCATT TTCTATCACT TCAGCACCAG GAGATGAGTA CCTGAGTGTG CATATTAGGA CCGTGGGGGA TTGGACAAGA  GAACTCAAAC GTGTCTTCAC TGACCATGTC AACTCCAAAC CTGTCCTTGC TAGAGCCAAA TTAGGTCACT TGGTTAACAT GGAAAGAAAA AGTCAGCCGA GATTGCTGGT TGACGGGCCG  TATGGAGCAC CTGCACAGGA CTACGAAAAC TACGATGTGC TTCTCCTTGT TGGACTTGGA ATTGGAGCCA CCCCCTTTGT TAGTATCCTC AAGGATCTTC TCAACAACTC TAGAACCACT  GAAGAACAAA TGCCAACGGA ATCGACAACG GAAACAAGTA GATCCGAAGA CAGCTTTGGA TCTTTAAACA CGACGCCAAG TGGAAAGAGG AAGTTGCAAA GCAGGATGGG GACGGGACGG  GCACAAGCAT ACTTCTACTG GGTGACAAGG GAAGCTAGTT CCTTAGAGTG GTTCAAAGGG GTAATGGATG AAGTAGCAGA GATGGACAAG AAGGGGCAAA TTGAACTCCA CAACTACTTG  ACGAGTGTGT ACGAAGAAAG TGATGCAAGG AGCACATTGA TCACAATGGT TCAAGCTTTG AACCATGCCA AGCATGGCGT CGACATTCTC TCCGGCACAC GAGCAAGGAC TCACTTCGCA  AGGCCAGAAT GGAAGGAGGT GTTCGGGCGA ATTGCGTCGA AGCATGCTTA TAAGACAGTG GGAGTGTTCT ACTGTGGAAT GCCAATGCTG GCCAAAGAGC TCAAGAGGCT ATCACTAGAA 
TTTACTCGCA AGACTGCAAC TAGATTTGAG TTCCATAAGG AATATTTCTG A 

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