Entry information : ClanRboh05(Citlan_Cla008273)
Entry ID 16355
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ClanRboh05(Citlan_Cla008273)
Name ClanRboh05(Citlan_Cla008273)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh05
start..stop
S start..stop
DgloRboh06 1248 0 1..836 1..845
AgluRboh06 1213 0 11..836 12..843
JregRboh08 1202 0 42..836 14..803
BfucRboh07 1195 0 1..836 1..842
Literature and cross-references ClanRboh05(Citlan_Cla008273)
Protein sequence: ClanRboh05(Citlan_Cla008273)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   836
PWM (Da):   %s   96009.9  
PI (pH):   %s   9.21
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB (splicing error)
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACAACT TGGACAACAT GAACAACAAT GGTGAAGACT CACAGAAATG GATTCTGGAT CCTAGTGAGA TCGATGTGAT TGTCGATGTA CCGATAGACG AAGGTGGTGG CGGCGGCGAC  AGAAATGGGA GCTTTAAAAG GAGGGATGAA GATCATGGGG TTTCAAGGGG TGGGATAAGG CTTGGAAGAA GGAAATCCAA AGCTGAAAGA GGGCTTAAGA GCTTGAGATT TCTGGATCGC  TCTGTAACTG GCAAGGAAGA CGATGCTTGG AGGGCAATTG AGAGCCGATT CCATCAACAT GCTATTGATG ATAGGCTTCC TAGAGATAAA TTTGGACTTT GCATCGGTAT GTTTTTTGGA  TTTCTGCGTT ATTGGTAATT ATCGGTTTTG TGTTTTTTGT TTAGTGGGTC TTGCATTGCA TTATCTTAGT TCAGATAAAG TTTCTATATC GTCCTATGCC TATTCAGTCC TTTTAAGGTT  TTAACAAGTC TAACATGCTA CGGTCCTAAG ATGTGTTTCT TTAGTTGTCG GTTTCTAGTC GGGTCTCTAT TTTATTTTCC GTGAAGCTTT TAATGTGTCT CATACATCTC TAGTTGTATC  TTGATTTTGT CTCCGTAAAG TTTTTAAAAG GTCTTACATT GCATTACCTT AGTATGTGAT AAAGATATTA GAGTTGTGCC TATTTAGTCC TTTAAAGTTT TTAACTAGTC TAACATGCTA  GAGTAGTCTT AGGTTGTGTC TCTTTAGTCG TCCGTGTAAT GTTTCTAATA AATAATATTG TATGCATGTG ACTGTCTCTA TTTACTCTTG GTAAAGTTTT TAATGTGTCA CATCGGTTTT  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CDS
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ATGAACAACT TGGACAACAT GAACAACAAT GGTGAAGACT CACAGAAATG GATTCTGGAT CCTAGTGAGA TCGATGTGAT TGTCGATGTA CCGATAGACG AAGGTGGTGG CGGCGGCGAC  AGAAATGGGA GCTTTAAAAG GAGGGATGAA GATCATGGGG TTTCAAGGGG TGGGATAAGG CTTGGAAGAA GGAAATCCAA AGCTGAAAGA GGGCTTAAGA GCTTGAGATT TCTGGATCGC  TCTGTAACTG GCAAGGAAGA CGATGCTTGG AGGGCAATTG AGAGCCGATT CCATCAACAT GCTATTGATG ATAGGCTTCC TAGAGATAAA TTTGGACTTT GCATCGGAAT GGGAGGAGAT  TCAAAGGACT TTGCAGGTGA ATTGTTTGAC ACATTGGTGA GGAGAAGAAG GCTATCTTCA GCAAATGGGA TTACAATAGA AGAATTACAT GGTTTTTGGG AAGACATAAC TAGTCAAGAT  ATGGATTTTC GCCTACAAAT ATTCTTTGAA ATGTGTGACA AAAATGGTGA TGGGAAGCTT TCAGAGGCAG AAGTAAAGGA GGTGATAATC CTGAGTGCAT CTGCAAACAA GTTAGGAAAC  CTCAAAAGCC AAGCAGGTTA TTATGCATCA ATGATCATGG AAGAGCTTGA TCCAGACCAT CTTGGATATA TAGAGCTGTC ACAACTTGAG ACTCTATTGA GGGAAGTTAT GGTATTTGAT  CAAGATAACA ACAAGATTAT GACTAAGAAG ACATGTACTC TTACAAGAGC CATGATTCCT CAAAGATACC GAACTCCGGT GAGCCGAGTC GTGTCGAGGA CTGTCGAGCT CGTCCACGAT  AATTGGAAAA GGATATGGGT GATTGTAGCG TGGTTAGCGA TAAACGTGTC GTTATTCGTT TGGAAGTACA ATGAATACAA GAAAAGTAAG GCATTCAAAA TCATGGGATA TTGTGTTTGT  GTTGCAAAGG GTGGAGCTGA GATAACCAAA TTCAATATGG CTTTAATTCT ATTGCCAGTT TGTAGAAGTA CTCTCACAAG ACTTAGGTCA ACATTCCTAA GTAAAATCAT TGCTTTTGAT  GATAATATAA ACTTCCACAA AATAGTTTCA CTTGGGATAG TGATTGGGAC TTTTCTTCAT GTGTTTATGC ACGTATCTTG TGATTTTCCA AGGCTAATTA CATGCCCTAG ACAAAAATTT  ATGGTATATC TTGGGCCTAA TTTCAATTAC CGTCAGCCAA GTTATCAAGA TTTGGTGAGA AGTACACCTG GGGTTTCTGG GGCTTTAATG TTGATTATTA TGGGTTTTTC ATATGTTTTG  GCCTCACATC AATTCAGAAG AAATGTTATT AAGTTGCCTT CACCTCTTCA CCATTTGGCT GGCTTCAATG CATTTTGGTA CTCTCATCAT TTGCTTATTG TGGCCTATAT TCTCTTCATA  ATACATGGCT ATTACCTCTT CTTAGTCACC CAATGGTACG TCAAAACGAC ATGGATGTAT TTAGCAATGC CAATGTCTTT ATATGCTAGT GAGAGACTTC TTGCATCAGT GAATGAGCTC  AAGCATAGCG TTGACATTAT TAAGGCAGTG ATATATAAAG GCAATGTTCT TGCAATATAT ATGACAAAAC CTCAAGTATT CAGATATAAA AGTGGAATGT ATTTTTTTGT CAAGTGTCCA  GATATATCAA GTTTTGAATG GCATCCCTTC ACTATCACTT CTGCACCAGG GGATGACTAC TTGAGTTGTC ATATCAGAAC ATTAGGAGAT TGGACTGCAG AGCTTCATAA CAGGTTTAAA  AAGGTATGTG AGATGGAGAA TGCACAAGCA AGGAAGGGAA GTCTAGTTAG AATGGAAACT AAAGCATATA ATGGCAATAG CTATTCTCAA TTAAGATATC CAAGAATTCT CATCAAAGGG  CCATATGGTG CTCCAGCACA AGATTACAAA AAGTATGATA TTCTCTTCCT TATAGGGCTT GGTATTGGGG CAACTCCAAT GATCAGCATT ATAAAAGATG TTTTAAACTC CATCAAGCCA  ATTGACACTT ATAGTGATTC AGTACACAAA CATTCACTAG GAAACAGTAG GCGAGGCCCT GAAAGAACAT ACTTCTATTG GATTACAAGA GAGCAAGGCT CATTTGAGTG GTTCAAAGGT  GTTATGGATG ATATCTCTGA ATATGACCAT GATCATGTAA TAGAAATGCA TAATTACTTG ACTAGTGTTT ATGAGGAAGG AGATGTAAGA TCTGCCCTTA TAACCATGGT ACAAAAGCTC  CAACATGCTA GGAATGGAGT CGATGTTCTT TCTGAAAGTC GGATACGGAC TCATTTTGCT AGACCTAACT GGAGGAAGGT GTTCATGGAA TTGGCAAGTA ATCACATGGC TTCACGTATA 
GGGGTGTTTT ATTGTGGAAG TGCTACACTC ACCCAAACAT TAAGGAAATT ATGCCATGAA TTCAGCTTAA GCTCGACCAC TCGCTTTCAC TTTCATAAGG AGAACTTCTA G 

Retrieve as FASTA