Entry information : ClanRboh07(Citlan_Cla000765)
Entry ID 16357
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ClanRboh07(Citlan_Cla000765)
Name ClanRboh07(Citlan_Cla000765)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh07
start..stop
S start..stop
CsaRboh04 1789 0 1..949 1..947
BfucRboh04 1511 0 1..949 1..947
CclRboh01 1510 0 1..949 1..946
DgloRboh04 1508 0 1..949 1..948
Literature and cross-references ClanRboh07(Citlan_Cla000765)
Protein sequence: ClanRboh07(Citlan_Cla000765)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   949
PWM (Da):   %s   108133.5  
PI (pH):   %s   9.19
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTTPEQDRR CGSDDITQLD TMIYGSSLGA QFGLTEEFVE VTLDVQENKT VVLRSVEPAT IINIDDGVSG GSGTPALTSA STSRSTSIKR SSSHRFRQFS QELKAEARAK AKHFSHELKT  EFRRFSWNRS HASRAFAASS SLSMNTNNAV GAENGMDSAL AARDLRRQRA KLDRTRSGAV KALHGLRFIS SNNKTTGIDT YSELESNFNK LSKDGFLSRA DFAQCIGMKD SKEFALELFD  ALSRRRRLNN SDQISRDDLF EFWLQISDQS FDSRLQIFFD MVDKNEDGHV TEEEVKEIIM LSASANKLSR LKEQAEEYAA LIMEELDPER LGYIELWQLE TLLLQKDTYM NYSRALSFTS  QALSQNLQGI RQRSPIKRLG TKVLYFLREN WRRIWVLTLW IMIMVGLFIW KFFQYKHKNA FRIMGYCLTT AKGAAETLKF NMALILLPVC RNTITWLRKT KIGYYVPFDD NINFHKMIAV  AIIVGIILHA GNHLACDFPR LLKSSEADYA YVIGDFGKIK PSYMDLVKGC EGVTGILMVI FMAIAFILAT RWFRRNLIKL PHPFDRLTGY NAFWYSHHLF ILVYILLIIH GVFLYLVHIW  YLMTTWMYIA VPVLLYAGER ILRFFRSGSY SVQIQKVAIY PGNVLKLQMF KPPQFHYKSG QYMFVQCPAV SPFEWHPFSI TSAPGDDYLS IHVRQLGDWT QELKRVFSEV CEPSVSGKSG  LLRADETTIK RLPKLSIDGP YGAPAQDYHK YDVLLLVGLG IGATPFISIL KDLLNNIVKM EEQDSPTDIS SLGDLSYANK DFHPPKRKNN LKTTNAYFYW VTREQGSFDW FKGVMNEISE 
QDQRGLIEMH NYLTSVYEEG DARSTLITMV QALNHAKNGV DIVSGTRVRT HFARPNWKKV LCKISSKHCG ARIGVFYCGA PVLAKELGQL CHEINQNGSA KLDFHKEHF 

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Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB (5' end is missing).
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCACGA CTCCGGAGCA GGATCGCCGA TGCGGATCGG ACGACATTAC ACAACTTGAC ACGATGATCT ATGGATCGTC GCTGGGAGCG CAGTTCGGCC TGACGGAGGA GTTTGTGGAG  GTGACGCTTG ATGTACAAGA AAACAAGACG GTCGTGCTTC GAAGTGTTGA GCCTGCGACT ATAATCAATA TCGACGATGG CGTCTCCGGT GGTTCTGGAA CGCCGGCCTT AACTTCTGCT  TCGACCTCCA GATCTACGTC GATTAAGCGG AGTTCGTCGC ATCGGTTTCG GCAATTCTCT CAGGAACTCA AGGCGGAAGC GAGAGCTAAG GCGAAGCATT TCTCGCACGA GTTAAAAACC  GAATTCAGGA GGTTCTCATG GAATAGGAGC CATGCTTCGC GAGCATTCGC GGCGTCCTCG TCATTATCTA TGAACACGAA CAATGCTGTT GGAGCAGAAA ACGGAATGGA TTCGGCATTA  GCTGCTAGAG ATTTGAGGAG GCAACGTGCA AAGCTTGATA GAACTCGTTC CGGCGCTGTT AAGGCTCTCC ATGGATTGAG ATTCATAAGC AGCAATAATA AAACCACTGG CATCGATACG  TATAGTGAAC TTGAGAGCAA TTTCAATAAG CTTTCCAAGG ACGGGTTTCT CAGCCGCGCC GATTTTGCGC AATGTATAGG TATATACTGG CCGCAAACAG GTAATTTCAG TATATTTTGG  GGAAACTTTT AACCGATTTC GTTGTTTTCC TTTTTTTTAA AAGGAATGAA AGATTCAAAA GAATTTGCTC TTGAGCTGTT TGATGCTCTA AGTCGGAGGC GAAGACTCAA TAACTCCGAT  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GCTCCAGTTT TGGCCAAAGA ACTTGGCCAA CTCTGCCATG AAATTAATCA AAACGGTTCA GCCAAGTTAG ATTTTCACAA GGAGCATTTT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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