Entry information : ClanRboh09(Citlan_Cla013274)
Entry ID 16359
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ClanRboh09(Citlan_Cla013274)
Name ClanRboh09(Citlan_Cla013274)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh09
start..stop
S start..stop
ClanRboh06 927 0 4..763 53..832
CsaRboh07 885 0 2..763 51..832
DgloRboh06 814 0 7..763 61..845
JregRboh08 811 0 2..763 17..803
Literature and cross-references ClanRboh09(Citlan_Cla013274)
Protein sequence: ClanRboh09(Citlan_Cla013274)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   763
PWM (Da):   %s   87950.51  
PI (pH):   %s   8.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKQNPALQP SPPIVGNKRE HKHFNILSFL NGSIAKSWEE VEKHFHKQVD HGKLFKENFG GCIGLDENSK YFADELFDVL SKRKKIEPEK GITLQQLKEF WEELRKDDLD TRLQIFFDLC  DKNDDNKISK EEVKTVLNWT ASANNLTKIE KHIESYASLI VKELDPDGNG FIEIEHLELL VKELWKSEEA KLLQRQDASA SNFVNETIEI IKDNRNKIWV LTLWLAINLV LFVWKFMEYK  EKETFELMGY CIGIAKGSAE TLKFNMGLIL FLVCRGALTK LRSTFLSSIF PFDDHIFFHM LVGLAISVAT FIHMAMHLGC GFPILATCLS NKLKEILGPS FESKQGSYFD LVSSVPGVTG  ILMFVIMAYS FILAIPLLRK SKKELQKAFH NLIGFNAFWY THHLLFLVYV LMIFHGYFKS LAWDWLNRTT WMYIAFPILL YARERLDTIF NERKHEVKVK KAVVYSRNEL VALYLTKPEG  FKYESGSYLY VKCKDISKFE WHPFSITSAP GDDYLSLHIR KAGDWTEELV NRFEKVCEEE EKTKRSGIIR QVSKNDWGAS DKYPQILIKG PYGAPSQNYK NYDILLLIGL GIGATPMISI  LKDVLNHSKT DAPKNTRKNS VHTDPAPKVP KRAYFYWVTK TQESFEWFKG VMNDAAEYDN GKEKVIEMHN HLSCIQKEGD ARSVFLTILQ NIQSDIDIIS GSRIRARYGR PDWERIFSDL 
KTNHQGCNIG VFYCGPTSLS ILSHLCRKYS HGSTKFHFHK ENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from SymDB (scaffold border + NN)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAC AAAATCCAGC ATTACAGCCT TCTCCACCCA TTGTTGGTAA TAAAAGAGAG CATAAACACT TTAACATTTT GAGTTTTTTG AATGGTTCCA TTGCCAAATC ATGGGAGGAA  GTTGAGAAGC ATTTTCACAA GCAAGTGGAC CATGGAAAAC TTTTCAAGGA AAATTTTGGA GGCTGCATTG GTGAAAATGA CATTCTTTCT TTTTCTATTT GATTAATCTC CATTTATTTG  CTAATAATAT TGTGGAATTT CCTGTTTGTT TGTCTCTGGT TTAGGCCTGG ATGAGAACTC AAAATACTTT GCCGATGAAC TGTTTGATGT ATTGTCAAAG AGAAAAAAGA TAGAGCCTGA  GAAAGGAATT ACTCTGCAAC AATTGAAAGA GTTTTGGGAA GAATTGAGAA AAGATGATCT GGATACCAGG CTTCAGATTT TCTTCGACTT GTAAGCTTTC TCTTATGTAA ATCTTTCTTA  AATTCTCCCA AAATTGGCCA TAATATTTAT CCACTTAAGC TTCTCCGTGT TATAACGTTA GAATTTGTAA TTTGGAAGTG ATTTTAAATT AGTTAAAATC ATTTTGCTAT ATTCAAGAGT  GGTTGGCAAG AGGGGTGGGT GGGACTATGA GGGCATTCCC CATCCCGTCC CTACAAGGGA AATTAATCTC CATCACGGCC CTATCCTTTC CAATTGAAGG CAGAGACTAA TTTGGAAATT  AATCCCACCC CTATCCTCGT AAACTTTTTG AGTGTTGGAA TTTTCTTTAG GACATGTATT TGGAAGTGAT TTTAAAATGT TTAAAATTAC TTTTGCTATG TTCAAGATTG TTAGGTGCAA  ACAAAGAGAG ATCTATGGTA TTTAAATGAG AACAATATCT ATGGTATTTA AATGAGAACA ATATCATACT ATTGTGAAGA TAGGTGGAAC TTCTATTGCC TTTATCGATT AGTATCATAG  TCATGGTCTA AACCTAATTA TGTGAATGAA ATTCTTAGCG ATTTCAAACA AAAGTAGTGA GTGTTGTGGA TGGATTCCCA AATTGGACAA AAAGTGATTG AGATGCAACA AGTGCTCTCT  CAATTCAGGT GGATTTGGAT GGAGTAGATT TATCATGTCA GGTAGGCTAG TAGGAAAAGT ATATTTTTGG TCGAGGGGAT TAAGGGTGTG ATAGGTAGTT GACACCAAGT TTATTCTACA  AAAATGATCA TGGTTGTGCT CTATCTAGCT TTGCTTTAGA CCTTGATAAG AGCAAGCTCT TGTAGGCAGT CGGGAGTGAA CGGATGAAGG GAGACTTGAG TGGTACTTTG TTTTAAGAGA  GGATTGTTAG GTGCAAACAA AGTCCCAAAT CGGTTAGGAA AGGTTTAACA TTATTGTCAT ACAACTGAAA TAAAATTGAT TTTAAAGGAT TAGAAACACA TTTCAAAATA ATTATTAACA  TGACAAAAAT AATTTTACCT CTTTCAAAAT CACTCTCAAA TATCATTTTA TTCTTCGATT AATATTGAAT AAAGGTGAGA GGGTGTTAAA CATATGAATT AAAGATAACT TATTCAGTTA  GCTTTTGGAT TTAGTAGTGA TTTTGAGGTG CTTAAAATCA AATTTGTTTT AAGGTGTGAC AAGAATGATG ACAATAAGAT CTCAAAGGAA GAGGTGAAGA CCGTACTGAA TTGGACTGCT  TCTGCAAACA ATTTGACAAA GATTGAAAAA CATATTGAAT CCTACGCATC TCTGATCGTA AAAGAGCTTG ATCCAGACGG CAATGGGTTT ATTGAGGTAC TATTATAATA ATAATAATAA  TAATAACTTT TAACTTTCAT TTTTATTTCA TTTTCGTCAT ATTTGTTTCA TTTTAGTCTC TAAATTTTGG ATCATCATGT TGTATCCTAA GTCGAGGACA TTACAATTTA GTCGAGTAGA  TTACAATTTT AGTCTCAAAC TTTCAAAGAT CCTCCTCCCC CCCCCAAAAA AAAGGAATAA TTTAAACCTT TCCTCGTCAC TTAAACATTT ATCTGAAAGA ATTGATGTTT TGAACAGATT  GAGCACTTGG AACTTTTAGT TAAAGAACTG TGGAAATCTG AAGAAGCCAA ACTGTTGCAG AGGCAAGATG CATCAGCCAG CAATTTTGTG AACGAAACAA TAGAAATTAT CAAAGACAAC  AGGAACAAAA TCTGGGTTTT GACACTGTGG TTAGCCATAA ATTTGGTTCT GTTTGTTTGG AAATTCATGG AATACAAGGA GAAGGAGACA TTTGAACTGA TGGGTTATTG CATTGGTATT  GCAAAGGGAT CAGCTGAGAC TCTGAAATTC AATATGGGTC TGATTCTGTT TCTTGTTTGC AGAGGCGCTT TAACCAAACT TAGATCCACA TTTCTCAGCT CAATATTCCC TTTTGATGAT  CATATTTTCT TTCACATGCT GGTTGGATTA GCCATTTCAG TGGCCACTTT TATTCATATG GCTATGCATT TGGGATGTGG GTTTCCAATA TTGGCCACAT GCCTAAGCAA CAAACTCAAG  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ATAATATCGT ACCATTGTAG AGATGAGGAC ATCTTTGTTG TCTATAACAA GTACTATATA TCAGACCATG CCTTTACACT TAGTTGTGTC GGTGTGTTTA ATGACATAAT CATTATAATC  CATGGTTGAA CTAATAAGCA TGGAATTGGC TTCGATGACG AGGAGTTAGC CTGGTTTAAA GTGATTGCTC AAGAGCAAAC ATAGATGAAT TTGAGGAGAA GCTTTGGTGA TCCTTTGTTC  AAGGGGAAGA TTGTTGGAGT ACAATCAAAG TCTTGCATTG GCTAGATGAA GAGAAGATCT ATGGTAATAA GTGAGGACAA CTATTTCTAA TAGTATAAGG TCTTTTGGGT GAAACCAAAA  GCAAAGTCAC GAGGACTTGG AGAATATTAT ACTATTATGG AGATAGGTGC AAGTTCATTG ACAATGTTAA GGATGTTTTA TATTGGCAAA GGGCCTAGGA AAATTTCCTT TTCGAGAGAT  GAATGATTAA ATAGTCTTCT TTCACCTATT AGTTTTGGGT CAATCAACGA TTTAACATGA TATTGGCTAC TTGTTGGGTA TTCTAAATTT GTTTTCACTC ATCAGCTTAA TCTTTTGGAT  CAATTGACAA TTTAACATAA TCTTCTCTTA AAAGTGTTTT TGTCTCCTCT TTTGGGTTTC TCTCCATTTC TACATACTAA GGTCATGTTG ACTATTCCGT AATGAAAATT GTTGCAATCA  TAATGGATTA TTTTTTATTT TTCATAACTC AAATAATATT GTTAACTAGT TTTGTAGAAA TGTATTTAGA TGGACCCCAC TTTTCCTATT ACGAGTGATT GATTACGTTA AATGGAAAGG  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AGGTGTATTC TACTGTGGAC CAACCTCTTT AAGCATATTA TCTCATCTAT GCAGAAAATA TAGCCATGGT TCTACAAAAT TTCACTTCCA CAAGGAAAAC TTTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAC AAAATCCAGC ATTACAGCCT TCTCCACCCA TTGTTGGTAA TAAAAGAGAG CATAAACACT TTAACATTTT GAGTTTTTTG AATGGTTCCA TTGCCAAATC ATGGGAGGAA  GTTGAGAAGC ATTTTCACAA GCAAGTGGAC CATGGAAAAC TTTTCAAGGA AAATTTTGGA GGCTGCATTG GCCTGGATGA GAACTCAAAA TACTTTGCCG ATGAACTGTT TGATGTATTG  TCAAAGAGAA AAAAGATAGA GCCTGAGAAA GGAATTACTC TGCAACAATT GAAAGAGTTT TGGGAAGAAT TGAGAAAAGA TGATCTGGAT ACCAGGCTTC AGATTTTCTT CGACTTGTGT  GACAAGAATG ATGACAATAA GATCTCAAAG GAAGAGGTGA AGACCGTACT GAATTGGACT GCTTCTGCAA ACAATTTGAC AAAGATTGAA AAACATATTG AATCCTACGC ATCTCTGATC  GTAAAAGAGC TTGATCCAGA CGGCAATGGG TTTATTGAGA TTGAGCACTT GGAACTTTTA GTTAAAGAAC TGTGGAAATC TGAAGAAGCC AAACTGTTGC AGAGGCAAGA TGCATCAGCC  AGCAATTTTG TGAACGAAAC AATAGAAATT ATCAAAGACA ACAGGAACAA AATCTGGGTT TTGACACTGT GGTTAGCCAT AAATTTGGTT CTGTTTGTTT GGAAATTCAT GGAATACAAG  GAGAAGGAGA CATTTGAACT GATGGGTTAT TGCATTGGTA TTGCAAAGGG ATCAGCTGAG ACTCTGAAAT TCAATATGGG TCTGATTCTG TTTCTTGTTT GCAGAGGCGC TTTAACCAAA  CTTAGATCCA CATTTCTCAG CTCAATATTC CCTTTTGATG ATCATATTTT CTTTCACATG CTGGTTGGAT TAGCCATTTC AGTGGCCACT TTTATTCATA TGGCTATGCA TTTGGGATGT  GGGTTTCCAA TATTGGCCAC ATGCCTAAGC AACAAACTCA AGGAAATTCT TGGGCCAAGT TTTGAGTCCA AGCAAGGAAG TTATTTTGAT TTGGTTTCAA GTGTTCCTGG TGTTACTGGA  ATCCTCATGT TCGTTATAAT GGCTTACTCC TTCATACTTG CAATTCCTTT ACTTCGGAAG AGTAAGAAGG AGTTACAGAA AGCCTTTCAC AATTTGATTG GTTTCAATGC CTTCTGGTAT  ACTCATCATT TGCTTTTTCT GGTCTATGTC TTAATGATTT TCCATGGCTA CTTCAAGTCC CTAGCTTGGG ACTGGTTGAA CAGGACGACA TGGATGTACA TTGCATTCCC AATACTTCTA  TATGCAAGAG AGAGACTTGA TACAATATTC AACGAACGAA AACATGAAGT CAAAGTAAAA AAGGCAGTAG TATATAGTAG AAATGAGCTA GTAGCACTGT ACTTGACAAA ACCTGAAGGA  TTCAAGTACG AAAGTGGAAG TTATCTATAT GTGAAGTGCA AGGATATATC AAAATTTGAA TGGCATCCAT TTTCTATCAC TTCTGCACCT GGAGATGACT ATTTAAGTCT CCATATACGT  AAAGCAGGAG ATTGGACAGA AGAGCTCGTA AACAGATTTG AAAAGGTATG TGAAGAGGAA GAGAAAACAA AGAGAAGTGG AATAATTAGA CAAGTAAGCA AAAATGACTG GGGAGCAAGT  GATAAATATC CTCAAATTTT GATCAAAGGA CCATATGGAG CCCCATCACA AAATTACAAG AATTATGATA TTCTATTGCT CATAGGCCTT GGAATTGGGG CTACTCCAAT GATCAGCATT  TTGAAAGATG TATTAAACCA CAGCAAAACA GATGCCCCCA AAAATACAAG AAAGAACTCA GTGCATACCG ACCCTGCTCC AAAGGTTCCA AAGAGAGCAT ATTTCTATTG GGTGACAAAA  ACACAAGAAT CATTTGAATG GTTTAAAGGA GTCATGAATG ATGCGGCAGA ATACGATAAT GGAAAAGAGA AAGTAATTGA AATGCATAAC CATTTAAGTT GCATACAAAA GGAAGGAGAT  GCACGATCCG TCTTCCTTAC CATTTTGCAA AATATACAAA GTGATATTGA TATCATCTCT GGAAGCCGGA TAAGGGCTCG CTATGGAAGA CCGGATTGGG AAAGAATTTT CTCAGACTTA  AAAACTAACC ACCAAGGTTG TAACATAGGT GTATTCTACT GTGGACCAAC CTCTTTAAGC ATATTATCTC ATCTATGCAG AAAATATAGC CATGGTTCTA CAAAATTTCA CTTCCACAAG 
GAAAACTTTT AG 

Retrieve as FASTA