Entry information : CarRboh01
Entry ID 16396
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CarRboh01
Name CarRboh01
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Cicer
Organism Cicer arietinum (chickpea)    [TaxId: 3827 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CarRboh01
start..stop
S start..stop
MtRboh04 1684 0 11..927 6..923
PsRboh02 1669 0 1..927 1..940
CausRboh02 1610 0 1..927 1..937
LjRboh01 1587 0 6..927 4..930
Literature and cross-references CarRboh01
Cluster/Prediction ref. Genebank:   101488328
Protein sequence: CarRboh01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   927
PWM (Da):   %s   104960.88  
PI (pH):   %s   9.23
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGATDDEAVY VSSQIHNQES DIELIQTLPH TTTSLSGPLN KRVVRKSSKL LNVSNSSSAI DLCQDEQEQD YVEITMDIQG DSVALHSVKP VTGNSNDRGE DEKLVLLGKG MEKKRSFGAS  FVRSASIRMK QVSQELKRLS SFAKQVGPEK VKYDRTKSAA SYALMGLKFI SQKTDGDKTD GGAGWFEVEK QFQILTSSND GLLHRSLFAK CIGMNKESEA FASELFDALS RRRNIHGDSI  NKAQLKDFWD QISDNSFDSR LRTFFDMVDK DADGRITEEE IKEIICLSAT TNKLSNIQKQ AEEYAALIME ELDPDDTGFI MVNDLEILLL HGPTHSTRGD SKYLSQMLSI KLKATYEHNP  VRKWYRDTMY FLQDNWKRTW ILVLWIGVMS GLFAYKFMQY RRKAAYDVMG HCVCMAKGAA ETLKLNMAII LLPVCRNTIT WLRNKTKLGI AVPFDDNLNF HKVIAVAISI GVGIHAIYHL  TCDFPRLLHA NSEKYKLMEP FFGKQPSNYW HFVKSWEGVT GIIMVVLMTI AFTLASPWFR RGRVKLPKPL DSLTGFNAFW YSHHLFVFVY ALLIVHGLKL YLTKEWYKKT TWMYLVIPII  IYALERLTRA LRSSIKPVRI LKVALYPGNV LALHMSKPQG FRYKSGQYMF VNCAAVSPFE WHPFSITSAP GDDYLSVHIR TLGDWTRSLR VKFSESCLPP THGKSGLLRV ECLQGDSSPS  TLPKVLIDGP YGAPAQDYKQ YEVVLLVGLG IGATPMISIL KDIVNNFKAI EDEEGSRASQ HKKNGLSNFK TKRAYFYWVT KEQGSFEWFK GVMNEVAEED HRGVIELHNY CTSVYEEGDA 
RSALIAMLQS LNHAKNGVDI VSGTRVKSHF AKPNWRSVYK RIALNHPQAR VGVFYCGLPA LAKELRQLAS DFSHNTTTKY DFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Position 775 "TIEEGTSSKS" is really missing no splicing error => mid of exon
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCTA CCGATGATGA AGCAGTTTAT GTTTCTTCAC AAATCCACAA TCAAGAATCA GATATTGAAC TCATTCAAAC GTTACCTCAC ACAACTACTT CACTCAGTGG ACCTTTGAAC  AAAAGGGTAG TTAGAAAAAG TTCCAAGTTA TTAAACGTTT CAAACTCAAG CTCTGCCATA GATCTCTGCC AAGATGAACA AGAACAAGAT TACGTTGAAA TCACTATGGA TATTCAAGGT  GATTCTGTTG CTTTACACAG TGTTAAACCT GTTACAGGAA ACAGTAACGA TCGTGGTGAA GATGAGAAAC TTGTTTTACT TGGTAAAGGA ATGGAAAAGA AAAGGTCTTT TGGTGCTTCT  TTTGTGAGAA GTGCTTCTAT TCGTATGAAG CAAGTTTCTC AGGAGCTGAA GCGTTTAAGT TCTTTTGCAA AACAAGTTGG ACCTGAGAAA GTCAAGTATG ATAGGACTAA GTCTGCAGCT  TCTTATGCAC TTATGGGACT CAAGTTTATC AGTCAGAAGA CTGATGGTGA CAAGACTGAT GGTGGTGCTG GATGGTTTGA GGTTGAGAAA CAGTTTCAGA TTCTTACTTC TTCAAATGAT  GGTTTGCTTC ATCGTTCTCT CTTTGCCAAA TGTATAGGTA TTGAAGAATT TAAATCAATT TTGTAATGTT TGTGTTTAGA GGTTTGTCTT GCTTGACTTA TAGGAGTTTT TTTTTCTTCT  GAAGTTTCTA CTGACATAAT TACTTGTGAG ACTGTTTGGA AGATCTTATT GAAACGGCTT ATAATATGTT CATAAGCTGT TTTTAATTTT TTTTTAGAAA TAGATTGTTC ATAAGCACTT  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TTTTCTCACA ACACTACCAC CAAATATGAT TTCCACAAAG AAAATTTCTA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCTA CCGATGATGA AGCAGTTTAT GTTTCTTCAC AAATCCACAA TCAAGAATCA GATATTGAAC TCATTCAAAC GTTACCTCAC ACAACTACTT CACTCAGTGG ACCTTTGAAC  AAAAGGGTAG TTAGAAAAAG TTCCAAGTTA TTAAACGTTT CAAACTCAAG CTCTGCCATA GATCTCTGCC AAGATGAACA AGAACAAGAT TACGTTGAAA TCACTATGGA TATTCAAGGT  GATTCTGTTG CTTTACACAG TGTTAAACCT GTTACAGGAA ACAGTAACGA TCGTGGTGAA GATGAGAAAC TTGTTTTACT TGGTAAAGGA ATGGAAAAGA AAAGGTCTTT TGGTGCTTCT  TTTGTGAGAA GTGCTTCTAT TCGTATGAAG CAAGTTTCTC AGGAGCTGAA GCGTTTAAGT TCTTTTGCAA AACAAGTTGG ACCTGAGAAA GTCAAGTATG ATAGGACTAA GTCTGCAGCT  TCTTATGCAC TTATGGGACT CAAGTTTATC AGTCAGAAGA CTGATGGTGA CAAGACTGAT GGTGGTGCTG GATGGTTTGA GGTTGAGAAA CAGTTTCAGA TTCTTACTTC TTCAAATGAT  GGTTTGCTTC ATCGTTCTCT CTTTGCCAAA TGTATAGGGA TGAACAAGGA GTCTGAGGCC TTTGCAAGTG AGCTATTTGA TGCTCTTTCT AGGAGGAGAA ATATTCATGG AGATTCAATT  AATAAGGCAC AGTTGAAGGA TTTTTGGGAC CAGATTTCGG ACAATAGTTT TGATTCTAGG CTCAGAACCT TCTTTGACAT GGTTGATAAA GACGCAGATG GAAGAATCAC AGAGGAAGAA  ATTAAAGAGA TTATTTGCCT TAGTGCCACT ACAAACAAAC TCTCAAACAT ACAGAAGCAG GCAGAGGAAT ATGCTGCTTT GATCATGGAA GAACTAGACC CTGATGACAC AGGATTTATC  ATGGTAAACG ACCTGGAAAT ACTTTTGTTG CATGGACCAA CTCATTCTAC AAGAGGAGAT AGCAAGTACC TAAGCCAAAT GCTAAGCATA AAGCTTAAGG CTACATATGA ACACAATCCT  GTTAGGAAGT GGTATAGAGA TACCATGTAC TTTCTGCAGG ACAATTGGAA AAGAACTTGG ATATTGGTAC TATGGATTGG TGTTATGTCA GGTCTATTTG CCTACAAATT CATGCAGTAT  AGAAGAAAAG CTGCTTATGA TGTAATGGGA CATTGTGTGT GCATGGCTAA AGGTGCAGCT GAGACACTCA AATTGAACAT GGCTATTATC TTGTTACCTG TTTGCCGAAA CACTATCACA  TGGCTTAGGA ACAAGACCAA ACTAGGCATT GCTGTTCCTT TTGATGACAA CCTCAACTTT CACAAGGTGA TAGCTGTGGC AATATCAATT GGAGTTGGTA TACATGCAAT TTATCATCTT  ACTTGTGACT TTCCTCGCCT TCTTCATGCA AACAGTGAAA AATACAAGCT CATGGAACCA TTTTTTGGAA AACAACCATC AAATTATTGG CATTTTGTGA AATCATGGGA AGGAGTAACA  GGGATTATAA TGGTTGTTTT AATGACAATA GCCTTCACAC TGGCTAGCCC TTGGTTCAGA AGAGGAAGGG TTAAACTACC TAAACCCCTC GATAGTCTAA CTGGTTTCAA TGCATTTTGG  TACTCCCATC ATCTCTTTGT ATTTGTCTAT GCCCTTTTGA TTGTGCATGG ACTCAAACTT TACTTGACTA AGGAATGGTA CAAGAAAACG ACCTGGATGT ATTTGGTTAT TCCTATCATC  ATTTATGCAT TGGAAAGATT GACTAGAGCA CTCAGATCAA GCATCAAGCC TGTGAGAATA TTAAAGGTGG CTCTTTATCC TGGAAATGTG TTGGCTCTTC ATATGTCAAA GCCTCAAGGA  TTTAGATACA AGAGTGGACA ATACATGTTT GTAAATTGTG CTGCTGTCTC TCCATTTGAA TGGCATCCAT TTTCCATAAC CTCAGCTCCA GGAGATGATT ACCTTAGTGT TCACATCAGA  ACATTAGGTG ACTGGACTAG GAGTCTCAGA GTCAAATTCT CAGAGAGTTG CCTTCCACCA ACACATGGGA AAAGTGGACT TCTAAGAGTT GAATGCTTGC AAGGGGATAG CAGCCCAAGT  ACGCTTCCTA AAGTTTTGAT TGATGGTCCA TATGGAGCAC CTGCACAAGA CTACAAACAA TATGAGGTAG TTTTACTTGT GGGCCTAGGA ATTGGGGCCA CCCCAATGAT AAGTATACTA  AAGGACATAG TAAATAATTT CAAGGCAATA GAAGATGAGG AAGGATCAAG AGCATCTCAA CACAAGAAAA ACGGTTTGAG TAATTTTAAA ACTAAGAGGG CTTATTTTTA TTGGGTGACA  AAGGAACAAG GTTCATTTGA GTGGTTTAAA GGAGTAATGA ATGAGGTGGC TGAAGAGGAC CATAGAGGAG TAATTGAGTT ACACAATTAT TGTACTAGTG TTTATGAAGA AGGTGATGCT  CGTTCTGCTC TTATTGCTAT GCTTCAATCA CTTAACCATG CTAAAAATGG TGTTGATATT GTCTCTGGAA CACGTGTTAA GTCTCACTTT GCTAAACCTA ATTGGCGTAG TGTCTACAAG  CGCATTGCAC TTAATCATCC ACAAGCTCGA GTTGGTGTAT TTTACTGTGG GCTACCAGCA CTTGCTAAAG AGCTTCGTCA ATTAGCTTCG GATTTTTCTC ACAACACTAC CACCAAATAT 
GATTTCCACA AAGAAAATTT CTAG 

Retrieve as FASTA